33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_1922 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_1922  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 210 aa  434  1e-121  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0515657  normal  0.344284 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1760  TetR family transcriptional regulator  52.24 
 
 		 138 aa  141  7e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.255484  normal  0.206425 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2789  TetR family transcriptional regulator  26.09 
 
 		 203 aa  83.6  0.000000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.384058 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3112  TetR family transcriptional regulator  26.8 
 
 		 207 aa  68.6  0.00000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4990  transcriptional regulator, TetR family  25.13 
 
 		 212 aa  66.2  0.0000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.613992  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3031  transcriptional regulator, TetR family  25.71 
 
 		 205 aa  63.9  0.000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3415  transcriptional regulator, TetR family  27.27 
 
 		 209 aa  61.6  0.000000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.52107  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0875  transcriptional regulator, TetR family  25.94 
 
 		 209 aa  61.2  0.00000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6234  transcriptional regulator, TetR family  24.58 
 
 		 214 aa  57.8  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.662077  normal  0.711722 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4739  TetR family transcriptional regulator  24.64 
 
 		 217 aa  57.8  0.0000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0758.1  hypothetical protein  24.37 
 
 		 773 aa  54.3  0.000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1654  hypothetical protein  24.1 
 
 		 338 aa  53.5  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.900303  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2007  TetR family transcriptional regulator  24.1 
 
 		 341 aa  53.9  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.820101  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2102  TetR family transcriptional regulator  24.1 
 
 		 333 aa  53.9  0.000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0307267  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0699  hypothetical protein  24.1 
 
 		 338 aa  53.5  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.299256  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0516  TetR family transcriptional regulator  24.23 
 
 		 378 aa  53.9  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.477479  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0589  hypothetical protein  24.1 
 
 		 341 aa  53.5  0.000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.684153  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0885  TetR family transcriptional regulator  24.73 
 
 		 340 aa  52.8  0.000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5857  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 		 220 aa  50.4  0.00002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.664827  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3558  TetR family transcriptional regulator  31.4 
 
 		 202 aa  46.2  0.0003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.267611  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1515  TetR family transcriptional regulator  28.7 
 
 		 213 aa  46.2  0.0003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4208  TetR family transcriptional regulator  28.7 
 
 		 213 aa  46.6  0.0003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.826614 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3626  TetR family transcriptional regulator  31.4 
 
 		 202 aa  46.2  0.0003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.757995 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3553  TetR family transcriptional regulator  31.4 
 
 		 202 aa  46.2  0.0003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.500909  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1119  TetR family transcriptional regulator  28.97 
 
 		 213 aa  45.1  0.0008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4103  TetR family transcriptional regulator  28.97 
 
 		 209 aa  44.3  0.001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4956  TetR family transcriptional regulator  30.88 
 
 		 197 aa  42  0.007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0932682 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3973  regulatory protein TetR  30.86 
 
 		 204 aa  42  0.007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.425796  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4573  TetR family transcriptional regulator  30.88 
 
 		 197 aa  41.6  0.008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4661  TetR family transcriptional regulator  30.88 
 
 		 197 aa  41.6  0.008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.227652  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0703  transcriptional regulator, TetR family  33.87 
 
 		 216 aa  41.6  0.008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0354  hypothetical protein  32.26 
 
 		 230 aa  41.6  0.008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0313675 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8756  transcriptional regulator, TetR family  31.82 
 
 		 217 aa  41.6  0.01  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.387077  normal  0.0874834 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>