27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_6234 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_6234  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 214 aa  417  1e-116  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.662077  normal  0.711722 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2789  TetR family transcriptional regulator  37.63 
 
 		 203 aa  79  0.00000000000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.384058 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3112  TetR family transcriptional regulator  32.32 
 
 		 207 aa  69.3  0.00000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1922  transcriptional regulator, TetR family  24.73 
 
 		 210 aa  58.9  0.00000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0515657  normal  0.344284 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4739  TetR family transcriptional regulator  30.23 
 
 		 217 aa  58.5  0.00000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5857  TetR family transcriptional regulator  31.11 
 
 		 220 aa  49.7  0.00003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.664827  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4990  transcriptional regulator, TetR family  32.22 
 
 		 212 aa  48.9  0.00006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.613992  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2757  transcriptional regulator, TetR family  36.78 
 
 		 179 aa  48.5  0.00007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.331612  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0516  TetR family transcriptional regulator  27.88 
 
 		 378 aa  47.8  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.477479  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2102  TetR family transcriptional regulator  27.88 
 
 		 333 aa  47.8  0.0001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0307267  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0589  hypothetical protein  27.75 
 
 		 341 aa  47.4  0.0002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.684153  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1654  hypothetical protein  27.75 
 
 		 338 aa  47.4  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.900303  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2007  TetR family transcriptional regulator  27.88 
 
 		 341 aa  47.4  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.820101  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0699  hypothetical protein  27.75 
 
 		 338 aa  47.4  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.299256  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0885  TetR family transcriptional regulator  28.37 
 
 		 340 aa  47  0.0002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3517  transcriptional regulator protein  37.76 
 
 		 208 aa  45.8  0.0004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.873146  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1634  TetR family transcriptional regulator  40.79 
 
 		 209 aa  44.7  0.001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.681802  normal  0.225704 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0503  TetR family transcriptional regulator  21.7 
 
 		 376 aa  44.3  0.001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3011  TetR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 214 aa  43.5  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0859343 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2372  transcriptional regulator, TetR family  33.78 
 
 		 236 aa  43.5  0.003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0758.1  hypothetical protein  28.1 
 
 		 773 aa  43.5  0.003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3031  transcriptional regulator, TetR family  23.33 
 
 		 205 aa  42.7  0.004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5998  TetR family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 189 aa  42  0.006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000044097 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5597  TetR family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 189 aa  42  0.006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3760  TetR family transcriptional regulator  34.41 
 
 		 192 aa  41.6  0.009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.348424  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3415  transcriptional regulator, TetR family  25.95 
 
 		 209 aa  41.6  0.009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.52107  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0875  transcriptional regulator, TetR family  25.95 
 
 		 209 aa  41.6  0.01  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>