51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_4990 on replicon NC_012848
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012848  Rleg_4990  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 212 aa  422  1e-117  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.613992  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5857  TetR family transcriptional regulator  83.49 
 
 		 220 aa  327  1.0000000000000001e-88  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.664827  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3415  transcriptional regulator, TetR family  51.28 
 
 		 209 aa  197  1.0000000000000001e-49  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.52107  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0875  transcriptional regulator, TetR family  50.77 
 
 		 209 aa  194  1e-48  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3031  transcriptional regulator, TetR family  48.97 
 
 		 205 aa  189  2.9999999999999997e-47  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4006  TetR family transcriptional regulator  47.29 
 
 		 228 aa  180  1e-44  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0546  TetR family transcriptional regulator  47.29 
 
 		 228 aa  180  1e-44  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.62495  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0210  TetR family transcriptional regulator  48.47 
 
 		 221 aa  180  1e-44  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4739  TetR family transcriptional regulator  48.21 
 
 		 217 aa  179  2e-44  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1654  hypothetical protein  47.92 
 
 		 338 aa  176  3e-43  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.900303  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0699  hypothetical protein  47.92 
 
 		 338 aa  176  3e-43  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.299256  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0589  hypothetical protein  47.92 
 
 		 341 aa  176  3e-43  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.684153  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0758.1  hypothetical protein  47.92 
 
 		 773 aa  175  5e-43  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0516  TetR family transcriptional regulator  47.62 
 
 		 378 aa  173  9.999999999999999e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.477479  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2102  TetR family transcriptional regulator  47.62 
 
 		 333 aa  173  1.9999999999999998e-42  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0307267  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2007  TetR family transcriptional regulator  47.62 
 
 		 341 aa  173  1.9999999999999998e-42  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.820101  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0885  TetR family transcriptional regulator  48.04 
 
 		 340 aa  169  3e-41  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2789  TetR family transcriptional regulator  36.22 
 
 		 203 aa  96.7  2e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.384058 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3112  TetR family transcriptional regulator  32.7 
 
 		 207 aa  87.4  1e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1922  transcriptional regulator, TetR family  25.13 
 
 		 210 aa  66.2  0.0000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0515657  normal  0.344284 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2776  transcriptional regulator, TetR family  44.83 
 
 		 206 aa  50.1  0.00003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.205598  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6234  transcriptional regulator, TetR family  32.22 
 
 		 214 aa  49.3  0.00005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.662077  normal  0.711722 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3690  transcriptional regulator, TetR family  41.54 
 
 		 191 aa  48.1  0.00009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.225915 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5092  transcriptional regulator, TetR family  37.5 
 
 		 209 aa  46.6  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.193405 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2537  TetR family transcriptional regulator  31.08 
 
 		 87 aa  45.4  0.0006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3660  resolvase domain-containing protein  26.87 
 
 		 203 aa  44.7  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3286  transcriptional regulator, TetR family  30.47 
 
 		 192 aa  44.7  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0257  transcriptional regulator, TetR family  36.14 
 
 		 188 aa  43.9  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1129  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 231 aa  43.9  0.002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4330  TetR family transcriptional regulator  38.57 
 
 		 235 aa  43.5  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05498  putative transcription regulator protein  28.5 
 
 		 197 aa  43.5  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.806773 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0403  TetR family transcriptional regulator  28.78 
 
 		 195 aa  43.9  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1049  TetR family transcriptional regulator  37.7 
 
 		 230 aa  43.5  0.002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0599696  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0291  putative transcriptional regulator, TetR family  60.61 
 
 		 212 aa  43.1  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13072  TetR family transcriptional regulator  44.26 
 
 		 204 aa  43.1  0.003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.483288 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2242  TetR family transcriptional regulator  28.79 
 
 		 209 aa  42.4  0.005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.640782  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2095  transcriptional regulator, TetR family  37.88 
 
 		 194 aa  42.4  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.546455  normal  0.514839 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3959  transcriptional regulator, TetR family  24.06 
 
 		 204 aa  42.4  0.005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00461459  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1173  regulatory protein, TetR  30.63 
 
 		 202 aa  42.4  0.005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.959952 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2406  TetR family transcriptional regulator  28.79 
 
 		 209 aa  42.4  0.005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2176  TetR family transcriptional regulator  28.79 
 
 		 209 aa  42.4  0.005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000096918  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4931  TetR family transcriptional regulator  42.42 
 
 		 497 aa  42.4  0.006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.475051  normal  0.080695 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8965  putative transcriptional regulator, TetR family  36.51 
 
 		 173 aa  42  0.006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0208  transcriptional regulator, TetR family  38.57 
 
 		 193 aa  42.4  0.006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.168668  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2647  transcriptional regulator, TetR family  39.06 
 
 		 217 aa  42  0.007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4478  transcriptional regulator, TetR family  39.74 
 
 		 211 aa  42  0.008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2990  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 288 aa  41.6  0.009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.989251  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3058  transcriptional regulator, TetR family  25 
 
 		 204 aa  41.6  0.009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000151008  decreased coverage  0.0000000705144 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1035  TetR family transcriptional regulator  42.65 
 
 		 214 aa  41.6  0.009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4951  TetR family transcriptional regulator  26.8 
 
 		 239 aa  41.6  0.009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.717286  normal  0.572747 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4400  regulatory protein TetR  36.11 
 
 		 184 aa  41.6  0.01  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>