More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_A4951 on replicon NC_007510
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007510  Bcep18194_A4951  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 239 aa  481  1e-135  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.717286  normal  0.572747 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5643  TetR family transcriptional regulator  63.21 
 
 		 224 aa  280  1e-74  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.240264  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3163  transcriptional regulator, TetR family  48.07 
 
 		 242 aa  212  2.9999999999999995e-54  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0951  transcriptional regulator, TetR family  48.37 
 
 		 242 aa  211  1e-53  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0522  TetR family transcriptional regulator  47.22 
 
 		 219 aa  205  5e-52  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3913  TetR family transcriptional regulator  47.96 
 
 		 239 aa  204  1e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.20842  normal  0.141898 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2019  transcriptional regulator, TetR family  44.95 
 
 		 235 aa  196  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0553  TetR family transcriptional regulator  43.9 
 
 		 233 aa  193  2e-48  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3562  transcriptional regulator, TetR family  40.79 
 
 		 237 aa  190  2e-47  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.108326  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1454  transcriptional regulator, TetR family  44.19 
 
 		 231 aa  186  2e-46  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.901974 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1292  regulatory protein TetR  44.19 
 
 		 231 aa  186  2e-46  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.413674  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2950  TetR family transcriptional regulator  45.1 
 
 		 217 aa  176  2e-43  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000171699 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5853  TetR family transcriptional regulator  43.35 
 
 		 230 aa  170  2e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00161572 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3728  TetR family transcriptional regulator  42.63 
 
 		 212 aa  167  1e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.735281  normal  1 
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4199  TetR family transcriptional regulator  40.29 
 
 		 214 aa  160  2e-38  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.680761 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0081  TetR family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 231 aa  103  2e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.672358  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0649  TetR family transcriptional regulator  35.43 
 
 		 231 aa  95.5  6e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.899851  normal  0.251562 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0103  TetR family transcriptional regulator  31.43 
 
 		 190 aa  57  0.0000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0986  TetR family transcriptional regulator  30.47 
 
 		 197 aa  56.6  0.0000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0104  TetR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 190 aa  55.1  0.000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19820  transcriptional regulator  35.8 
 
 		 260 aa  53.9  0.000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0074  TetR/AcrR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 196 aa  53.5  0.000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4369  TetR family transcriptional regulator  29.32 
 
 		 204 aa  53.5  0.000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.645452 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0667  TetR family transcriptional regulator  38.33 
 
 		 200 aa  53.5  0.000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000042492  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4153  TetR family transcriptional regulator  36.04 
 
 		 234 aa  53.1  0.000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0196  transcriptional regulator, TetR family  35.16 
 
 		 200 aa  52.8  0.000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2285  TetR family transcriptional regulator  27.57 
 
 		 233 aa  52  0.000008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.522027  normal  0.380806 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1244  TetR family transcriptional regulator  34.29 
 
 		 206 aa  52  0.000008  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3035  transcriptional regulator, TetR family  36.75 
 
 		 225 aa  52  0.000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.489456  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1436  TetR family transcriptional regulator  31.76 
 
 		 125 aa  51.2  0.00001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.0000772402  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3290  transcriptional regulator, TetR family  36.75 
 
 		 225 aa  51.6  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.413178  normal  0.0802991 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3709  TetR family transcriptional regulator  34.41 
 
 		 221 aa  51.6  0.00001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0975739  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19890  transcriptional regulator  39.66 
 
 		 346 aa  51.6  0.00001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.403358  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0710  transcriptional regulator, TetR family  46.43 
 
 		 248 aa  50.8  0.00002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3149  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 233 aa  50.8  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1537  TetR family transcriptional regulator  33.04 
 
 		 257 aa  50.8  0.00002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28930  transcriptional regulator  45.45 
 
 		 205 aa  50.4  0.00003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.218384 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1459  transcriptional regulator, TetR family  43.4 
 
 		 187 aa  49.7  0.00004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0636  TetR family transcriptional regulator  38.67 
 
 		 250 aa  49.7  0.00004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0304513 
 
 
-
 
NC_003296  RS05498  putative transcription regulator protein  36 
 
 		 197 aa  49.3  0.00005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.806773 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5593  TetR family transcriptional regulator  35.45 
 
 		 233 aa  49.7  0.00005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.531399  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1218  transcriptional regulator, TetR family  28.21 
 
 		 206 aa  49.3  0.00005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4146  transcriptional regulator, TetR family  45.45 
 
 		 246 aa  48.9  0.00006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1933  AcrR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 243 aa  48.9  0.00006  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.189914  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3038  transcriptional regulator  37.68 
 
 		 230 aa  49.3  0.00006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1496  transcriptional regulator, TetR family  45.76 
 
 		 206 aa  49.3  0.00006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2977  transcriptional regulator, TetR family  32.41 
 
 		 196 aa  48.9  0.00007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0808  transcriptional regulator, TetR family  32.99 
 
 		 222 aa  48.9  0.00007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3720  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 200 aa  48.9  0.00007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.91394  normal  0.0177543 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0905  transcriptional regulator, TetR family  38.89 
 
 		 253 aa  48.9  0.00007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.938127  normal  0.145255 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1166  TetR family transcriptional regulator  47.37 
 
 		 278 aa  48.5  0.00008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0604682  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6363  transcriptional regulator, TetR family  25.84 
 
 		 222 aa  48.9  0.00008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.318357 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1088  transcriptional regulator, TetR family  33.75 
 
 		 193 aa  48.5  0.00008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8740  putative transcriptional regulator, TetR family  31.58 
 
 		 226 aa  48.9  0.00008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8390  putative transcriptional regulator, TetR family  30.77 
 
 		 222 aa  48.5  0.00009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2995  TetR family transcriptional regulator  36.71 
 
 		 211 aa  48.5  0.00009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.428403  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6560  transcriptional regulator, TetR family  48.94 
 
 		 203 aa  48.5  0.00009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2741  TetR family transcriptional regulator  51.02 
 
 		 215 aa  48.1  0.0001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3702  TetR family transcriptional regulator  39.39 
 
 		 204 aa  48.1  0.0001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1957  transcriptional regulator, TetR family  38.98 
 
 		 194 aa  47.8  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.292651 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3598  TetR family transcriptional regulator  32.95 
 
 		 227 aa  48.1  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.646734  normal  0.699465 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2402  TetR family transcriptional regulator  31.96 
 
 		 205 aa  48.1  0.0001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.584484 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2365  TetR family transcriptional regulator  45.31 
 
 		 213 aa  48.1  0.0001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.227272  normal  0.96994 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2017  transcriptional regulator, TetR family  35.44 
 
 		 236 aa  48.1  0.0001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0191  TetR family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 210 aa  48.1  0.0001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27670  transcriptional regulator  40 
 
 		 254 aa  48.1  0.0001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.208365 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3160  TetR family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 205 aa  47.8  0.0001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000883166 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1137  transcriptional regulator, TetR family  33.75 
 
 		 193 aa  47.4  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4217  transcriptional regulator, TetR family  33.75 
 
 		 193 aa  47.4  0.0002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.152492 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1156  TetR family transcriptional regulator  33.75 
 
 		 193 aa  47.4  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.813518  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4972  transcriptional regulator, TetR family  39.62 
 
 		 317 aa  47  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.377224 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0982  TetR family transcriptional regulator  33.75 
 
 		 193 aa  47.8  0.0002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0971  TetR family transcriptional regulator  33.75 
 
 		 193 aa  47.8  0.0002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0971  TetR family transcriptional regulator  33.75 
 
 		 193 aa  47.8  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2993  TetR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 206 aa  47.4  0.0002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0518  TetR family transcriptional regulator  28.12 
 
 		 206 aa  47  0.0002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.290772  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0452  TetR family transcriptional regulator  31.43 
 
 		 212 aa  47.4  0.0002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.681881  decreased coverage  0.00000297509 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3836  transcriptional regulator, TetR family  41.67 
 
 		 211 aa  47.4  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1052  TetR family transcriptional regulator  33.75 
 
 		 193 aa  47.8  0.0002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0974  TetR family transcriptional regulator  33.75 
 
 		 194 aa  47.8  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1649  TetR family transcriptional regulator  32.88 
 
 		 233 aa  47.4  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.617035  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4024  TetR family transcriptional regulator  40.98 
 
 		 199 aa  47.4  0.0002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.497962  normal  0.530155 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2701  TetR family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 239 aa  47.8  0.0002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3796  TetR family transcriptional regulator  47.37 
 
 		 275 aa  47  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.323175 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2041  TetR family transcriptional regulator  39.74 
 
 		 211 aa  47.8  0.0002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2338  transcriptional regulator, TetR family  43.64 
 
 		 213 aa  47.4  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.857275  normal  0.161469 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3277  TetR family transcriptional regulator  51.11 
 
 		 275 aa  47.4  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5181  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 190 aa  47.8  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.752009  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1217  transcriptional regulator, TetR family  33.75 
 
 		 193 aa  47.8  0.0002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1988  TetR family transcriptional regulator  53.33 
 
 		 208 aa  47.8  0.0002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2735  TetR family transcriptional regulator  47.83 
 
 		 201 aa  47  0.0003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1007  transcription regulator protein  32.56 
 
 		 239 aa  47  0.0003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.605979  normal  0.178446 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5607  transcriptional regulator, TetR family  41.07 
 
 		 209 aa  46.6  0.0003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.897418  normal  0.557491 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0557  regulatory protein TetR  30.77 
 
 		 251 aa  46.6  0.0003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7965  transcriptional regulator, TetR family  43.28 
 
 		 192 aa  47  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28300  transcriptional regulator  35.14 
 
 		 280 aa  46.6  0.0003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0265  TetR family transcriptional regulator  41.27 
 
 		 194 aa  46.6  0.0003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.250901  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2094  transcriptional regulator, TetR family  32.5 
 
 		 186 aa  47  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000324065 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2129  TetR family transcriptional regulator  34.29 
 
 		 210 aa  46.6  0.0003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0109  TetR family transcriptional regulator  31.52 
 
 		 207 aa  46.6  0.0003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>