More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_B5643 on replicon NC_007348
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007348  Reut_B5643  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 224 aa  457  9.999999999999999e-129  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.240264  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4951  TetR family transcriptional regulator  61.36 
 
 		 239 aa  283  1.0000000000000001e-75  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.717286  normal  0.572747 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3913  TetR family transcriptional regulator  52.31 
 
 		 239 aa  216  2e-55  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.20842  normal  0.141898 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3163  transcriptional regulator, TetR family  52.4 
 
 		 242 aa  213  2.9999999999999995e-54  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0522  TetR family transcriptional regulator  47.85 
 
 		 219 aa  205  5e-52  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5853  TetR family transcriptional regulator  43.32 
 
 		 230 aa  187  1e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00161572 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0951  transcriptional regulator, TetR family  42.79 
 
 		 242 aa  186  3e-46  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2019  transcriptional regulator, TetR family  42.31 
 
 		 235 aa  185  4e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0553  TetR family transcriptional regulator  44.17 
 
 		 233 aa  184  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3562  transcriptional regulator, TetR family  42.65 
 
 		 237 aa  183  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.108326  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1292  regulatory protein TetR  42.16 
 
 		 231 aa  178  5.999999999999999e-44  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.413674  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1454  transcriptional regulator, TetR family  42.16 
 
 		 231 aa  177  9e-44  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.901974 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2950  TetR family transcriptional regulator  44.33 
 
 		 217 aa  176  3e-43  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000171699 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3728  TetR family transcriptional regulator  41.54 
 
 		 212 aa  169  4e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.735281  normal  1 
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4199  TetR family transcriptional regulator  41.75 
 
 		 214 aa  155  6e-37  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.680761 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0081  TetR family transcriptional regulator  34.27 
 
 		 231 aa  109  4.0000000000000004e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.672358  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0649  TetR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 231 aa  90.1  3e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.899851  normal  0.251562 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1537  TetR family transcriptional regulator  31.47 
 
 		 257 aa  57  0.0000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2914  transcriptional regulator, TetR family  29.13 
 
 		 202 aa  54.3  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2995  TetR family transcriptional regulator  37.65 
 
 		 211 aa  54.3  0.000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.428403  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3709  TetR family transcriptional regulator  37.23 
 
 		 221 aa  53.9  0.000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0975739  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2755  TetR family transcriptional regulator  38.16 
 
 		 200 aa  51.2  0.00001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2017  transcriptional regulator, TetR family  30.7 
 
 		 236 aa  50.8  0.00002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3149  TetR family transcriptional regulator  32.08 
 
 		 233 aa  50.4  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2922  transcriptional regulator, TetR family  33.66 
 
 		 204 aa  50.4  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.404278 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2696  TetR family transcriptional regulator  34.57 
 
 		 196 aa  50.4  0.00002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.834085 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19820  transcriptional regulator  26.56 
 
 		 260 aa  50.1  0.00003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4778  TetR family transcriptional regulator  36.04 
 
 		 217 aa  50.1  0.00003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0067  TetR family transcriptional regulator  36.14 
 
 		 212 aa  49.7  0.00004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000826521  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5086  transcriptional regulator, TetR family  25.5 
 
 		 210 aa  49.7  0.00004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.423561  normal  0.0707297 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28930  transcriptional regulator  43.1 
 
 		 205 aa  49.3  0.00005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.218384 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0667  TetR family transcriptional regulator  28.3 
 
 		 200 aa  49.3  0.00005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000042492  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0125  transcriptional regulator, TetR family  28.83 
 
 		 204 aa  48.9  0.00006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.247519  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2411  transcriptional regulator, TetR family  29.82 
 
 		 236 aa  48.5  0.00007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1493  TetR family transcriptional regulator  46.94 
 
 		 200 aa  48.9  0.00007  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3548  TetR family transcriptional regulator  31.07 
 
 		 207 aa  48.5  0.00008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.842454  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7768  putative transcriptional regulator, TetR family  34.57 
 
 		 194 aa  48.5  0.00008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0377  TetR family transcriptional regulator  28.38 
 
 		 224 aa  47.8  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.528926  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2338  transcriptional regulator, TetR family  43.64 
 
 		 213 aa  48.1  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.857275  normal  0.161469 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2016  TetR family transcriptional regulator  39.66 
 
 		 194 aa  47.8  0.0001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0982631  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7113  TetR family transcriptional regulator  32 
 
 		 240 aa  47.8  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0191  transcriptional regulator, TetR family  30.33 
 
 		 243 aa  47.4  0.0002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.00113557  decreased coverage  0.000257741 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0424  transcriptional regulator, TetR family  35.96 
 
 		 201 aa  47.4  0.0002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.315635  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0103  TetR family transcriptional regulator  32.94 
 
 		 190 aa  47  0.0002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2365  TetR family transcriptional regulator  42.62 
 
 		 213 aa  47.4  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.227272  normal  0.96994 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1496  transcriptional regulator, TetR family  41.94 
 
 		 206 aa  47.8  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1430  regulatory protein TetR  34.44 
 
 		 236 aa  46.6  0.0003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6291  TetR family transcriptional regulator  32.95 
 
 		 205 aa  46.6  0.0003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.170422  normal  0.0225355 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2213  putative transcription regulator transcription regulator protein  32.94 
 
 		 236 aa  46.6  0.0003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2732  transcriptional regulator, TetR family  39.68 
 
 		 208 aa  46.6  0.0003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.498805  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1404  transcriptional regulator, TetR family  36.79 
 
 		 193 aa  47  0.0003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2434  transcriptional regulator, TetR family  23.83 
 
 		 211 aa  47  0.0003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0986  TetR family transcriptional regulator  28.12 
 
 		 197 aa  47  0.0003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1139  TetR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 193 aa  46.6  0.0003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.564798  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3016  transcriptional regulator, TetR family  28.4 
 
 		 209 aa  46.6  0.0003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.150997  normal  0.125451 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5635  transcriptional regulator, TetR family  28.67 
 
 		 203 aa  47  0.0003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0445849  normal  0.712508 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30540  transcriptional regulator, TetR family  36.21 
 
 		 195 aa  46.6  0.0003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2041  TetR family transcriptional regulator  40.98 
 
 		 211 aa  46.6  0.0003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6577  TetR family transcriptional regulator  32.95 
 
 		 205 aa  46.6  0.0003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1129  TetR family transcriptional regulator  31.63 
 
 		 231 aa  46.6  0.0003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0633  TetR family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 193 aa  46.2  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2510  TetR family transcriptional regulator  24.72 
 
 		 209 aa  46.2  0.0004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00262483  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0104  TetR family transcriptional regulator  32.93 
 
 		 190 aa  46.2  0.0004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6231  transcriptional regulator, TetR family  33.9 
 
 		 197 aa  46.2  0.0004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0676  TetR family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 193 aa  46.2  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0323458  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2190  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 277 aa  46.2  0.0004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.168858  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0692  TetR family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 193 aa  46.2  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.253039  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0905  transcriptional regulator, TetR family  38.24 
 
 		 253 aa  46.2  0.0004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.938127  normal  0.145255 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0196  transcriptional regulator, TetR family  30.53 
 
 		 200 aa  46.2  0.0004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0619  transcriptional regulator, TetR family  37.04 
 
 		 193 aa  46.2  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4153  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 234 aa  46.2  0.0004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4824  TetR family transcriptional regulator  22.68 
 
 		 228 aa  45.8  0.0005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2740  TetR family transcriptional regulator  40.35 
 
 		 230 aa  45.8  0.0005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0291953  hitchhiker  0.000390237 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2285  TetR family transcriptional regulator  30.84 
 
 		 233 aa  45.8  0.0005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.522027  normal  0.380806 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1778  transcriptional regulator, TetR family  44.23 
 
 		 211 aa  45.8  0.0005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.261512  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1848  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 210 aa  45.8  0.0005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0408  transcriptional regulator, TetR family  38.33 
 
 		 212 aa  45.8  0.0005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.431467 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1000  transcriptional regulator, TetR family  37.5 
 
 		 202 aa  45.8  0.0005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0808  transcriptional regulator, TetR family  37.5 
 
 		 222 aa  46.2  0.0005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1436  TetR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 125 aa  45.4  0.0006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.0000772402  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5104  TetR family transcriptional regulator  35.38 
 
 		 205 aa  45.4  0.0006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1978  transcriptional regulator, TetR family  45.83 
 
 		 195 aa  45.4  0.0006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000952091  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2799  TetR family transcriptional regulator  29.09 
 
 		 217 aa  45.8  0.0006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.364827  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8740  putative transcriptional regulator, TetR family  32.14 
 
 		 226 aa  45.4  0.0006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4128  TetR family transcriptional regulator  29.35 
 
 		 241 aa  45.4  0.0006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.860792 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1756  transcriptional regulator, TetR family  38.1 
 
 		 205 aa  45.4  0.0006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000229906 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1933  AcrR family transcriptional regulator  36.51 
 
 		 243 aa  45.8  0.0006  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.189914  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1218  transcriptional regulator, TetR family  27.48 
 
 		 206 aa  45.8  0.0006  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0822  transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 205 aa  45.4  0.0007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.752802  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1298  transcriptional regulator TetR family  32.09 
 
 		 235 aa  45.4  0.0007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3310  transcriptional regulator, TetR family  29.41 
 
 		 256 aa  45.4  0.0007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000381613  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0081  transcriptional regulator, TetR family  38.81 
 
 		 211 aa  45.4  0.0007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3448  TetR family transcriptional regulator  27.7 
 
 		 240 aa  45.4  0.0007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2481  TetR family transcriptional regulator  31.68 
 
 		 206 aa  45.4  0.0008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.685434 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4024  TetR family transcriptional regulator  40.74 
 
 		 199 aa  45.4  0.0008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.497962  normal  0.530155 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3836  transcriptional regulator, TetR family  37.1 
 
 		 211 aa  45.1  0.0008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2441  TetR family transcriptional regulator  35.85 
 
 		 193 aa  45.4  0.0008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.264842  normal  0.509096 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05370  transcriptional regulator, TetR family  29.11 
 
 		 205 aa  45.1  0.0009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000643211  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3625  TetR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 278 aa  45.1  0.0009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.662049  normal  0.863638 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3902  TetR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 278 aa  45.1  0.0009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>