95 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_8740 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_8740  putative transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 226 aa  438  9.999999999999999e-123  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2624  transcriptional regulator, TetR family  46.39 
 
 		 210 aa  142  5e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.465145  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0808  transcriptional regulator, TetR family  41.46 
 
 		 222 aa  137  2e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0735  regulatory protein, TetR  41.45 
 
 		 204 aa  125  7e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6264  putative transcriptional regulator, TetR family  40.12 
 
 		 196 aa  90.9  1e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.085092 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1430  regulatory protein TetR  47.06 
 
 		 236 aa  90.9  1e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1125  transcriptional regulator, TetR family  44.14 
 
 		 210 aa  84.3  0.000000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3704  TetR family transcriptional regulator  39.76 
 
 		 202 aa  53.5  0.000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4199  TetR family transcriptional regulator  31.9 
 
 		 214 aa  50.4  0.00002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.680761 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0649  TetR family transcriptional regulator  34.74 
 
 		 231 aa  50.1  0.00003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.899851  normal  0.251562 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2823  TetR family transcriptional regulator  33.78 
 
 		 178 aa  49.7  0.00004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.335296  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0177  TetR family transcriptional regulator  36.96 
 
 		 208 aa  49.3  0.00004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.775643 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3394  transcriptional regulator, TetR family  36.84 
 
 		 220 aa  49.3  0.00005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.222962 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0692  TetR family transcriptional regulator  44.23 
 
 		 193 aa  49.3  0.00005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.253039  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0619  transcriptional regulator, TetR family  44.23 
 
 		 193 aa  49.3  0.00005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0676  TetR family transcriptional regulator  44.23 
 
 		 193 aa  48.9  0.00006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0323458  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0633  TetR family transcriptional regulator  44.23 
 
 		 193 aa  48.9  0.00006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4951  TetR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 239 aa  48.9  0.00007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.717286  normal  0.572747 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4542  transcriptional regulator, TetR family  30.77 
 
 		 201 aa  48.5  0.00008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.204937  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1684  transcriptional regulator, TetR family  41.38 
 
 		 202 aa  47.8  0.0001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25080  Transcriptional regulator, TetR family  49.02 
 
 		 191 aa  47  0.0002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1833  TetR family transcriptional regulator  41.38 
 
 		 202 aa  47.4  0.0002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.150168  normal  0.286062 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1076  TetR family transcriptional regulator  45.28 
 
 		 196 aa  47  0.0002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.581791 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0522  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 219 aa  47  0.0002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05370  transcriptional regulator, TetR family  31.25 
 
 		 205 aa  47.4  0.0002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000643211  n/a   
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3852  TetR family transcriptional regulator  34.44 
 
 		 202 aa  46.6  0.0003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1920  TetR family transcriptional regulator  34.44 
 
 		 202 aa  46.6  0.0003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3835  TetR family transcriptional regulator  34.44 
 
 		 202 aa  46.6  0.0003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1597  transcriptional regulator, TetR family  44 
 
 		 187 aa  46.6  0.0003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0577868  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5643  TetR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 224 aa  46.2  0.0004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.240264  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2786  transcriptional regulator, TetR family  36.84 
 
 		 190 aa  46.2  0.0004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.06199  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2878  TetR family transcriptional regulator  38.6 
 
 		 202 aa  46.2  0.0005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4148  TetR family transcriptional regulator  44 
 
 		 213 aa  45.8  0.0005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.677229  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1046  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 201 aa  45.4  0.0006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2968  TetR family transcriptional regulator  28.92 
 
 		 209 aa  45.4  0.0007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.305044  normal  0.85525 
 
 
-
 
NC_006663  SEA0016  TetR family transcriptional regulator  42.03 
 
 		 216 aa  45.4  0.0007  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2314  transcriptional regulator, TetR family  44.64 
 
 		 213 aa  45.4  0.0008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.251224 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1250  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 202 aa  45.1  0.0008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2353  TetR family transcriptional regulator  42.59 
 
 		 217 aa  44.3  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.384863  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1039  TetR family transcriptional regulator  44 
 
 		 190 aa  44.7  0.001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2686  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 202 aa  45.1  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0616794  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2282  TetR family transcriptional regulator  42.59 
 
 		 217 aa  44.3  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4369  TetR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 204 aa  44.3  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.645452 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1788  transcriptional regulator, TetR family  25.81 
 
 		 194 aa  44.3  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3436  transcriptional regulator, TetR family  40.68 
 
 		 194 aa  44.3  0.002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.262135  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2557  transcriptional regulator, TetR family  42.59 
 
 		 217 aa  43.5  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.15322e-23 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2815  transcriptional regulator, TetR family  42.59 
 
 		 217 aa  43.5  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000266483 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3509  TetR family transcriptional regulator  40.91 
 
 		 224 aa  43.9  0.002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0553  TetR family transcriptional regulator  30.48 
 
 		 233 aa  43.9  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5811  transcriptional regulator, TetR family  30.86 
 
 		 222 aa  43.9  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.78864  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1926  transcriptional regulator, TetR family  37.93 
 
 		 202 aa  43.5  0.002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.930045  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1909  transcriptional regulator, TetR family  40.38 
 
 		 197 aa  43.9  0.002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8507  putative transcriptional regulator, TetR family  36.11 
 
 		 199 aa  43.9  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.899046 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0081  TetR family transcriptional regulator  30.89 
 
 		 231 aa  44.3  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.672358  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2543  TetR family transcriptional regulator  42.59 
 
 		 217 aa  43.9  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2324  TetR family transcriptional regulator  42.59 
 
 		 217 aa  43.9  0.002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000190708  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2366  TetR family transcriptional regulator  42.59 
 
 		 217 aa  43.9  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.711286  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1986  TetR family transcriptional regulator  39.62 
 
 		 218 aa  43.9  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0191052  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1459  transcriptional regulator, TetR family  35.9 
 
 		 187 aa  43.1  0.003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08440  transcriptional regulator, TetR family  27.83 
 
 		 190 aa  43.5  0.003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2545  TetR family transcriptional regulator  42.59 
 
 		 217 aa  43.5  0.003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0577985  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2358  transcriptional regulator, TetR family  39.34 
 
 		 216 aa  43.5  0.003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0281012 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3341  TetR family transcriptional regulator  30.11 
 
 		 210 aa  43.5  0.003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.113479  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1149  transcriptional regulator, TetR family protein  28.48 
 
 		 226 aa  43.5  0.003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2194  regulatory protein, TetR  30.77 
 
 		 218 aa  43.5  0.003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2508  transcriptional regulator, TetR family  42.59 
 
 		 217 aa  43.5  0.003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6374  putative transcriptional regulator, TetR family  31.75 
 
 		 191 aa  42.7  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.891873 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6363  transcriptional regulator, TetR family  41.94 
 
 		 222 aa  43.1  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.318357 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0740  TetR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 205 aa  42.7  0.005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.891023  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1283  transcriptional regulator, TetR family  38.46 
 
 		 199 aa  42.7  0.005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.255686  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0970  transcriptional regulator, TetR family  38.3 
 
 		 203 aa  42.7  0.005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0626  TetR family transcriptional regulator  32.98 
 
 		 199 aa  42.7  0.005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0022  transcriptional regulator, TetR family  52 
 
 		 224 aa  42.7  0.005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3251  TetR family transcriptional regulator  28.95 
 
 		 219 aa  42.4  0.006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.831278  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0974  regulatory protein, TetR  37.1 
 
 		 205 aa  42.4  0.006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1456  transcriptional regulator, TetR family  30.09 
 
 		 211 aa  42.4  0.006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3929  TetR family transcriptional regulator  40.35 
 
 		 210 aa  42.4  0.006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.459326  normal  0.170288 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0868  transcriptional regulator, TetR family  36.92 
 
 		 222 aa  42.4  0.006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000000486929  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3111  TetR family transcriptional regulator  32.84 
 
 		 210 aa  42.4  0.006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2757  transcriptional regulator, TetR family  27.87 
 
 		 179 aa  42  0.007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.331612  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2600  transcriptional regulator, TetR family  40.74 
 
 		 217 aa  42  0.007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3684  TetR family transcriptional regulator  42.31 
 
 		 202 aa  42.4  0.007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1719  transcriptional regulator, TetR family  38.89 
 
 		 196 aa  42  0.007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0542  transcriptional regulator, TetR family  41.82 
 
 		 210 aa  42  0.008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.669667 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0599  TetR family transcriptional regulator  40.91 
 
 		 200 aa  42  0.008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.000153581  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1827  TetR family transcriptional regulator  39.58 
 
 		 246 aa  42  0.008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4065  TetR family transcriptional regulator  42.31 
 
 		 193 aa  42  0.008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2341  TetR family transcriptional regulator  32.2 
 
 		 206 aa  42  0.008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.554096 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1874  TetR family transcriptional regulator  39.58 
 
 		 246 aa  42  0.008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0418563  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1808  TetR family transcriptional regulator  39.58 
 
 		 246 aa  42  0.008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.229482  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1292  regulatory protein TetR  26.61 
 
 		 231 aa  42  0.008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.413674  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2823  transcriptional regulator, TetR family  36 
 
 		 208 aa  41.6  0.01  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  hitchhiker  0.00548665  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1759  transcriptional regulator, TetR family  30.63 
 
 		 217 aa  41.6  0.01  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2936  transcriptional regulator, TetR family  41.67 
 
 		 266 aa  41.6  0.01  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.273782 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13440  transcriptional regulator  39.06 
 
 		 188 aa  41.6  0.01  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.651829 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>