143 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_1125 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_1125  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 210 aa  426  1e-118  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6264  putative transcriptional regulator, TetR family  37.81 
 
 		 196 aa  109  3e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.085092 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0735  regulatory protein, TetR  38.07 
 
 		 204 aa  99.4  3e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0808  transcriptional regulator, TetR family  35.6 
 
 		 222 aa  90.5  2e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2624  transcriptional regulator, TetR family  34.02 
 
 		 210 aa  89  5e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.465145  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8740  putative transcriptional regulator, TetR family  35.2 
 
 		 226 aa  85.1  6e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1430  regulatory protein TetR  50.68 
 
 		 236 aa  67.4  0.0000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4369  TetR family transcriptional regulator  28.16 
 
 		 204 aa  55.8  0.0000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.645452 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0455  TetR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 224 aa  52  0.000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.366206  normal  0.106872 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3394  transcriptional regulator, TetR family  37.76 
 
 		 220 aa  50.4  0.00002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.222962 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1971  transcriptional regulator, TetR family  26.13 
 
 		 196 aa  50.1  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0740  TetR family transcriptional regulator  26.34 
 
 		 205 aa  49.7  0.00003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.891023  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13530  transcriptional regulator, TetR family  41.79 
 
 		 186 aa  48.5  0.00007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00114254  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0520  transcriptional regulator, TetR family  38.6 
 
 		 197 aa  48.5  0.00007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.711752  normal  0.521102 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2395  transcriptional regulator, TetR family  29.21 
 
 		 423 aa  48.5  0.00007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.764783 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3092  transcriptional regulator, TetR family  38.46 
 
 		 185 aa  47.8  0.0001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0725563 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1516  transcriptional regulator, TetR family  33.78 
 
 		 203 aa  47.8  0.0001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0973  TetR family transcriptional regulator  42.65 
 
 		 199 aa  47.8  0.0001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.342069 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3251  TetR family transcriptional regulator  36.96 
 
 		 219 aa  47  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.831278  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1076  TetR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 196 aa  47.4  0.0002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.581791 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1828  regulatory protein TetR  41.43 
 
 		 207 aa  47  0.0002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.790266  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1778  TetR family transcriptional regulator  34.94 
 
 		 199 aa  47  0.0002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0789135  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0196  transcriptional regulator, TetR family  38.46 
 
 		 200 aa  47.4  0.0002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3436  transcriptional regulator, TetR family  31.25 
 
 		 194 aa  47  0.0002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.262135  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0692  TetR family transcriptional regulator  31.31 
 
 		 193 aa  47.4  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.253039  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0619  transcriptional regulator, TetR family  31.31 
 
 		 193 aa  47.4  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2698  TetR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 203 aa  46.2  0.0003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2282  TetR family transcriptional regulator  41.38 
 
 		 217 aa  46.2  0.0003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1909  transcriptional regulator, TetR family  42.31 
 
 		 197 aa  46.2  0.0003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1359  TetR family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 218 aa  46.6  0.0003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2353  TetR family transcriptional regulator  41.38 
 
 		 217 aa  46.6  0.0003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.384863  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3517  transcriptional regulator protein  31 
 
 		 208 aa  45.8  0.0005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.873146  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0633  TetR family transcriptional regulator  31.31 
 
 		 193 aa  45.8  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0676  TetR family transcriptional regulator  31.31 
 
 		 193 aa  45.8  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0323458  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2545  TetR family transcriptional regulator  41.38 
 
 		 217 aa  45.4  0.0006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0577985  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5170  TetR family transcriptional regulator  28.73 
 
 		 195 aa  45.4  0.0006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5259  TetR family transcriptional regulator  28.73 
 
 		 195 aa  45.4  0.0006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.532008  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5551  TetR family transcriptional regulator  28.73 
 
 		 195 aa  45.4  0.0006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1639  TetR family transcriptional regulator  27.53 
 
 		 215 aa  45.4  0.0006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1071  TetR family transcriptional regulator  37.14 
 
 		 240 aa  45.4  0.0006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.457023 
 
 
-
 
NC_011730  PCC7424_5568  transcriptional regulator, TetR family  28.1 
 
 		 414 aa  45.4  0.0006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1592  transcriptional regulator, TetR family  35.48 
 
 		 198 aa  45.1  0.0007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0322  transcriptional regulator, TetR family  25.58 
 
 		 223 aa  45.1  0.0007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.541277 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2508  transcriptional regulator, TetR family  41.38 
 
 		 217 aa  45.1  0.0007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2815  transcriptional regulator, TetR family  41.38 
 
 		 217 aa  45.4  0.0007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000266483 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2366  TetR family transcriptional regulator  43.4 
 
 		 217 aa  45.1  0.0008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.711286  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2324  TetR family transcriptional regulator  43.4 
 
 		 217 aa  45.1  0.0008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000190708  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0464  TetR family transcriptional regulator  30.08 
 
 		 215 aa  45.1  0.0008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2543  TetR family transcriptional regulator  43.4 
 
 		 217 aa  45.1  0.0008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0117  transcriptional regulator, TetR family  36.36 
 
 		 225 aa  45.1  0.0008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.678219 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2314  transcriptional regulator, TetR family  46.43 
 
 		 213 aa  45.1  0.0008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.251224 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1845  TetR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 237 aa  45.1  0.0009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0132  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 222 aa  45.1  0.0009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0305  transcriptional regulator, TetR family  37.88 
 
 		 215 aa  44.3  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.437849  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3466  TetR family transcriptional regulator  36.51 
 
 		 200 aa  44.7  0.001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0607  transcriptional regulator, TetR family  37.66 
 
 		 255 aa  44.7  0.001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.118397  normal  0.590685 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3692  TetR family transcriptional regulator  26.7 
 
 		 244 aa  44.7  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.674174  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0332  TetR family transcriptional regulator  38.98 
 
 		 192 aa  44.3  0.001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00337125  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1720  TetR family transcriptional regulator  38.78 
 
 		 200 aa  44.3  0.001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1461  TetR family transcriptional regulator  37.65 
 
 		 197 aa  44.3  0.001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.0279876 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8965  putative transcriptional regulator, TetR family  41.82 
 
 		 173 aa  44.7  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1039  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 190 aa  44.3  0.001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4148  TetR family transcriptional regulator  40.38 
 
 		 213 aa  44.3  0.001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.677229  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1942  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 253 aa  44.3  0.001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.338038  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0118  TetR family transcriptional regulator  38.57 
 
 		 222 aa  44.3  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4165  TetR family transcriptional regulator  26.7 
 
 		 232 aa  44.7  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.367589  normal  0.612517 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0648  transcriptional regulator, TetR family  31.25 
 
 		 247 aa  44.7  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0672593 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2557  transcriptional regulator, TetR family  41.38 
 
 		 217 aa  44.3  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.15322e-23 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08440  transcriptional regulator, TetR family  24.75 
 
 		 190 aa  43.5  0.002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1597  transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 187 aa  43.5  0.002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0577868  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3298  TetR family transcriptional regulator  38.03 
 
 		 222 aa  43.5  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1459  transcriptional regulator, TetR family  42 
 
 		 187 aa  43.9  0.002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4300  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 190 aa  43.9  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0306  TetR family transcriptional regulator  36.78 
 
 		 219 aa  43.9  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0641939  normal  0.172302 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0301  transcriptional regulator, TetR family  45.61 
 
 		 199 aa  43.9  0.002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0864199  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0290  TetR family transcriptional regulator  36.49 
 
 		 198 aa  43.9  0.002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4087  transcriptional regulator, TetR family  35.63 
 
 		 228 aa  43.5  0.002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.98142 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1218  TetR family transcriptional regulator  40.35 
 
 		 206 aa  43.9  0.002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2600  transcriptional regulator, TetR family  39.66 
 
 		 217 aa  43.9  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1456  transcriptional regulator, TetR family  26.6 
 
 		 211 aa  43.9  0.002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4596  transcriptional regulator, TetR family  26.83 
 
 		 421 aa  43.5  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.227831  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0951  TetR family transcriptional regulator  42.59 
 
 		 196 aa  43.1  0.003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2276  TetR family transcriptional regulator  27.36 
 
 		 403 aa  42.7  0.003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.276985  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0976  regulatory protein TetR  37.93 
 
 		 204 aa  43.1  0.003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  decreased coverage  0.00018682  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0868  transcriptional regulator, TetR family  41.51 
 
 		 222 aa  43.1  0.003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000000486929  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2757  transcriptional regulator, TetR family  27.91 
 
 		 179 aa  43.1  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.331612  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2937  TetR family transcriptional regulator  38.57 
 
 		 222 aa  43.1  0.003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0108  TetR family transcriptional regulator  38.57 
 
 		 222 aa  43.1  0.003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0118  TetR family transcriptional regulator  38.57 
 
 		 222 aa  43.1  0.003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.980303  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1759  transcriptional regulator, TetR family  41.51 
 
 		 217 aa  43.5  0.003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2827  transcriptional regulator, TetR family  38.57 
 
 		 186 aa  43.1  0.003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.05215  normal  0.803833 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6443  transcriptional regulator, TetR family  31.87 
 
 		 202 aa  43.1  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5370  TetR family transcriptional regulator  31.68 
 
 		 187 aa  43.1  0.003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6854  TetR family transcriptional regulator  29.44 
 
 		 224 aa  43.1  0.003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.101929  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0467  TetR family transcriptional regulator  32.93 
 
 		 198 aa  43.1  0.003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1844  TetR family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 242 aa  43.1  0.003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000808903 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2871  TetR family transcriptional regulator  31.62 
 
 		 213 aa  42.7  0.003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2732  transcriptional regulator, TetR family  26.83 
 
 		 208 aa  43.1  0.003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.498805  normal  1 
 
 
-
 
NC_006663  SEA0016  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 216 aa  42.4  0.004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0640  TetR family transcriptional regulator  32.31 
 
 		 235 aa  42.7  0.004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.346756  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>