181 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_0553 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_0553  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 233 aa  466  9.999999999999999e-131  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2019  transcriptional regulator, TetR family  69.08 
 
 		 235 aa  317  1e-85  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3562  transcriptional regulator, TetR family  66.97 
 
 		 237 aa  313  1.9999999999999998e-84  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.108326  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1292  regulatory protein TetR  68.08 
 
 		 231 aa  309  2e-83  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.413674  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1454  transcriptional regulator, TetR family  67.61 
 
 		 231 aa  308  5.9999999999999995e-83  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.901974 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3728  TetR family transcriptional regulator  55.28 
 
 		 212 aa  237  1e-61  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.735281  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0951  transcriptional regulator, TetR family  53.59 
 
 		 242 aa  230  2e-59  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3163  transcriptional regulator, TetR family  51.4 
 
 		 242 aa  223  2e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3913  TetR family transcriptional regulator  46.98 
 
 		 239 aa  198  7.999999999999999e-50  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.20842  normal  0.141898 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4951  TetR family transcriptional regulator  43.9 
 
 		 239 aa  193  2e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.717286  normal  0.572747 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5643  TetR family transcriptional regulator  43.78 
 
 		 224 aa  179  2.9999999999999997e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.240264  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2950  TetR family transcriptional regulator  42.51 
 
 		 217 aa  177  2e-43  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000171699 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5853  TetR family transcriptional regulator  47.43 
 
 		 230 aa  171  6.999999999999999e-42  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00161572 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0522  TetR family transcriptional regulator  40.2 
 
 		 219 aa  157  1e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4199  TetR family transcriptional regulator  42.42 
 
 		 214 aa  151  8.999999999999999e-36  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.680761 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0081  TetR family transcriptional regulator  32.72 
 
 		 231 aa  115  3.9999999999999997e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.672358  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0649  TetR family transcriptional regulator  39.84 
 
 		 231 aa  86.7  3e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.899851  normal  0.251562 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0667  TetR family transcriptional regulator  25.2 
 
 		 200 aa  52  0.000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000042492  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28930  transcriptional regulator  44.26 
 
 		 205 aa  51.6  0.00001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.218384 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3038  transcriptional regulator  33.57 
 
 		 230 aa  51.6  0.00001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1459  transcriptional regulator, TetR family  38.18 
 
 		 187 aa  50.1  0.00003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1933  AcrR family transcriptional regulator  37.88 
 
 		 243 aa  50.1  0.00003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.189914  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0970  transcriptional regulator, TetR family  42.25 
 
 		 203 aa  49.3  0.00005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5076  TetR family transcriptional regulator  34.57 
 
 		 209 aa  49.3  0.00005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19820  transcriptional regulator  38.1 
 
 		 260 aa  49.3  0.00005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5784  TetR family transcriptional regulator  34.57 
 
 		 209 aa  49.3  0.00005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.907377 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4190  transcriptional regulator, TetR family  23.12 
 
 		 200 aa  49.3  0.00005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.378174  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4150  transcriptional regulator, TetR family  23.12 
 
 		 200 aa  49.3  0.00005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34550  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 215 aa  48.9  0.00007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  decreased coverage  0.00167706  normal  0.63182 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0067  TetR family transcriptional regulator  30.34 
 
 		 212 aa  47.8  0.0001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000826521  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4369  TetR family transcriptional regulator  39.62 
 
 		 204 aa  47.8  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.645452 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3702  TetR family transcriptional regulator  32.29 
 
 		 204 aa  47.8  0.0001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3252  TetR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 200 aa  47  0.0002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0787  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 192 aa  47  0.0003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0101484 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0871  TetR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 202 aa  47  0.0003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3151  TetR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 202 aa  47  0.0003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0265  TetR family transcriptional regulator  34.21 
 
 		 194 aa  47  0.0003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.250901  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0855  transcriptional regulator, TetR family  31.52 
 
 		 223 aa  46.6  0.0003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.835032 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1288  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 215 aa  47  0.0003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0315957  hitchhiker  0.00536276 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1537  TetR family transcriptional regulator  28.35 
 
 		 257 aa  46.6  0.0003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4972  transcriptional regulator, TetR family  42.86 
 
 		 317 aa  46.2  0.0004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.377224 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0401  transcriptional regulator, TetR family  30.77 
 
 		 245 aa  46.2  0.0004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0464223  normal  0.180866 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0740  TetR family transcriptional regulator  39.62 
 
 		 205 aa  46.2  0.0004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.891023  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6209  transcriptional regulator, TetR family  30.61 
 
 		 208 aa  46.2  0.0004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1537  TetR family transcriptional regulator  29.56 
 
 		 234 aa  46.2  0.0004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6198  transcriptional regulator, TetR family  33.85 
 
 		 193 aa  46.2  0.0005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.533125  normal  0.545762 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6374  putative transcriptional regulator, TetR family  31.25 
 
 		 191 aa  45.8  0.0005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.891873 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2468  TetR family transcriptional regulator  31.76 
 
 		 198 aa  46.2  0.0005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2515  TetR family transcriptional regulator  26.29 
 
 		 202 aa  46.2  0.0005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.326335 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1076  TetR family transcriptional regulator  33.75 
 
 		 196 aa  45.8  0.0005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.581791 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3695  transcriptional regulator, TetR family  36.23 
 
 		 218 aa  45.8  0.0006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.551475  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3937  transcriptional regulator, TetR family  42.11 
 
 		 187 aa  45.8  0.0006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00797355  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1496  transcriptional regulator, TetR family  37.29 
 
 		 206 aa  45.8  0.0006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0676  TetR family transcriptional regulator  34.55 
 
 		 193 aa  45.8  0.0006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0323458  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4481  transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 216 aa  45.8  0.0006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.918639  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0633  TetR family transcriptional regulator  34.55 
 
 		 193 aa  45.8  0.0006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2914  transcriptional regulator, TetR family  28.71 
 
 		 202 aa  45.4  0.0007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0619  transcriptional regulator, TetR family  34.55 
 
 		 193 aa  45.4  0.0007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1461  TetR family transcriptional regulator  33.96 
 
 		 197 aa  45.4  0.0007  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.0279876 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0692  TetR family transcriptional regulator  34.55 
 
 		 193 aa  45.4  0.0007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.253039  normal  1 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5130  TetR family transcriptional regulator  35.94 
 
 		 203 aa  45.4  0.0007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.943479  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2878  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 202 aa  45.4  0.0008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2696  TetR family transcriptional regulator  35.44 
 
 		 196 aa  45.4  0.0008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.834085 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5134  transcriptional regulator, TetR family  34.09 
 
 		 197 aa  45.4  0.0008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2959  transcriptional regulator, TetR family  22.05 
 
 		 207 aa  45.1  0.0009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00177797 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3286  transcriptional regulator, TetR family  25 
 
 		 192 aa  44.7  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5175  putative transcriptional regulator, TetR family  42 
 
 		 205 aa  45.1  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0125916  hitchhiker  0.00846982 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6679  transcriptional regulator, TetR family  25.45 
 
 		 209 aa  44.7  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.874837  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1283  transcriptional regulator, TetR family  28.57 
 
 		 199 aa  45.1  0.001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.255686  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13530  transcriptional regulator, TetR family  22.42 
 
 		 186 aa  45.1  0.001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00114254  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1430  regulatory protein TetR  39.13 
 
 		 236 aa  45.1  0.001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3709  TetR family transcriptional regulator  30.11 
 
 		 221 aa  45.1  0.001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0975739  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0986  TetR family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 197 aa  45.1  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19890  transcriptional regulator  36.73 
 
 		 346 aa  44.7  0.001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.403358  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1173  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 218 aa  44.7  0.001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0270  TetR family transcriptional regulator  33.93 
 
 		 192 aa  45.1  0.001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.522665  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1353  regulatory protein TetR  28.57 
 
 		 210 aa  44.3  0.001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.273808  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0166  TetR family transcriptional regulator  30.59 
 
 		 193 aa  44.7  0.001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.141555  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0626  TetR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 199 aa  44.7  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1039  TetR family transcriptional regulator  20.81 
 
 		 201 aa  44.7  0.001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.747573 
 
 
-
 
NC_003296  RS05498  putative transcription regulator protein  28.86 
 
 		 197 aa  43.9  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.806773 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0560  transcriptional regulator, TetR family  27.78 
 
 		 208 aa  44.3  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0074  TetR/AcrR family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 196 aa  43.9  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2495  transcriptional regulator, TetR family  37.74 
 
 		 287 aa  43.9  0.002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0937177  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2419  transcriptional regulator, TetR family  40.43 
 
 		 212 aa  43.9  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.47163  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26580  transcriptional regulator, TetR family  37.88 
 
 		 205 aa  43.9  0.002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0994293 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28300  transcriptional regulator  37.7 
 
 		 280 aa  44.3  0.002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3558  TetR family transcriptional regulator  38.18 
 
 		 190 aa  43.9  0.002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.410356 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7073  transcriptional regulator, TetR family  30.38 
 
 		 248 aa  44.3  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.672487  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2669  transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 226 aa  43.9  0.002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00411812  normal  0.199475 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4153  TetR family transcriptional regulator  35.62 
 
 		 234 aa  43.9  0.002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2507  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 207 aa  44.3  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.881075  normal  0.842438 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12528  TetR family transcriptional regulator  32.46 
 
 		 215 aa  44.3  0.002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0275989 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13440  transcriptional regulator  35.62 
 
 		 188 aa  44.3  0.002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.651829 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7768  putative transcriptional regulator, TetR family  35.44 
 
 		 194 aa  43.9  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2219  TetR family transcriptional regulator  24.44 
 
 		 207 aa  43.9  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.23135  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1052  TetR family transcriptional regulator  35.53 
 
 		 215 aa  43.9  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.857726  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4394  TetR family transcriptional regulator  34.67 
 
 		 198 aa  43.9  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2369  transcriptional regulator, TetR family  40.43 
 
 		 212 aa  43.9  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2563  TetR family transcriptional regulator  29.03 
 
 		 192 aa  43.9  0.002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.227827  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>