223 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd703_1597 on replicon NC_012880
Organism: Dickeya dadantii Ech703



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012880  Dd703_1597  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 187 aa  379  1e-104  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0577868  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4300  TetR family transcriptional regulator  40.64 
 
 		 190 aa  131  5e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1039  TetR family transcriptional regulator  38.5 
 
 		 190 aa  119  1.9999999999999998e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0676  TetR family transcriptional regulator  43.66 
 
 		 193 aa  112  3e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0323458  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0633  TetR family transcriptional regulator  43.66 
 
 		 193 aa  112  3e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0692  TetR family transcriptional regulator  43.66 
 
 		 193 aa  112  4.0000000000000004e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.253039  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0619  transcriptional regulator, TetR family  43.66 
 
 		 193 aa  112  4.0000000000000004e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4864  TetR family transcriptional regulator  40.86 
 
 		 192 aa  107  1e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.935636  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5456  TetR family transcriptional regulator  40.86 
 
 		 192 aa  107  1e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5406  TetR family transcriptional regulator  40.86 
 
 		 192 aa  107  1e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.313854  normal  0.0102978 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1076  TetR family transcriptional regulator  35.64 
 
 		 196 aa  107  1e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.581791 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5292  TetR family transcriptional regulator  38.17 
 
 		 192 aa  103  1e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.505597 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0243  TetR family transcriptional regulator  38.17 
 
 		 192 aa  103  2e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4747  TetR family transcriptional regulator  38.17 
 
 		 192 aa  103  2e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.931681 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1459  transcriptional regulator, TetR family  33.86 
 
 		 187 aa  101  5e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25080  Transcriptional regulator, TetR family  35.42 
 
 		 191 aa  99  4e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0077  TetR family transcriptional regulator  31.75 
 
 		 183 aa  86.7  2e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.234691  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0787  TetR family transcriptional regulator  38.79 
 
 		 192 aa  70.1  0.00000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0101484 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4065  TetR family transcriptional regulator  33.61 
 
 		 193 aa  68.9  0.00000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2698  TetR family transcriptional regulator  35.61 
 
 		 203 aa  67.8  0.00000000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3717  TetR family transcriptional regulator  34.43 
 
 		 191 aa  67.8  0.00000000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3684  TetR family transcriptional regulator  34.17 
 
 		 202 aa  67.4  0.0000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1288  TetR family transcriptional regulator  29.38 
 
 		 215 aa  66.6  0.0000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0315957  hitchhiker  0.00536276 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3358  TetR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 190 aa  65.5  0.0000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3436  transcriptional regulator, TetR family  35.85 
 
 		 194 aa  65.5  0.0000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.262135  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3500  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 191 aa  65.1  0.0000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00541119  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1461  TetR family transcriptional regulator  27.37 
 
 		 197 aa  64.3  0.0000000009  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.0279876 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0332  TetR family transcriptional regulator  34.82 
 
 		 192 aa  63.9  0.000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00337125  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1006  TetR family transcriptional regulator  29.95 
 
 		 189 aa  63.9  0.000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1456  transcriptional regulator, TetR family  28.57 
 
 		 203 aa  63.2  0.000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3151  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 202 aa  63.2  0.000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2983  TetR family transcriptional regulator  33.91 
 
 		 190 aa  63.5  0.000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0270  TetR family transcriptional regulator  33.62 
 
 		 192 aa  63.2  0.000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.522665  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0871  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 202 aa  62.4  0.000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2856  TetR family transcriptional regulator  35.59 
 
 		 194 aa  62.4  0.000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.661308  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0808  TetR family transcriptional regulator  35.24 
 
 		 191 aa  62.4  0.000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.287096 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1027  transcriptional regulator, TetR family  28.88 
 
 		 201 aa  61.6  0.000000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1039  TetR family transcriptional regulator  28.34 
 
 		 201 aa  61.2  0.000000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.747573 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3252  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 200 aa  61.2  0.000000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3333  TetR family transcriptional regulator  28.34 
 
 		 201 aa  61.2  0.000000009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0974  regulatory protein, TetR  33.64 
 
 		 205 aa  60.8  0.00000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3431  transcriptional regulator, TetR family  32.09 
 
 		 189 aa  57.4  0.0000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0286  TetR family transcriptional regulator  29.35 
 
 		 186 aa  57.4  0.0000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1236  TetR family transcriptional regulator  26.77 
 
 		 196 aa  56.6  0.0000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0369519 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3104  TetR family transcriptional regulator  36.63 
 
 		 194 aa  55.8  0.0000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.428011 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3443  TetR family transcriptional regulator  43.06 
 
 		 212 aa  55.1  0.0000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.61751 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2991  TetR family transcriptional regulator  29.24 
 
 		 188 aa  53.9  0.000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0384605  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2742  TetR family transcriptional regulator  33.96 
 
 		 188 aa  54.3  0.000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.845467  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2997  transcriptional regulator, TetR family  29.24 
 
 		 188 aa  53.9  0.000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000711023  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2692  TetR family transcriptional regulator  33.96 
 
 		 188 aa  54.3  0.000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0469224  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2671  TetR family transcriptional regulator  33.96 
 
 		 188 aa  54.3  0.000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.083497  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2951  TetR family transcriptional regulator  33.96 
 
 		 188 aa  54.3  0.000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0936  transcriptional regulator, TetR family protein  31.09 
 
 		 206 aa  53.9  0.000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2951  transcriptional regulator, TetR family  33.96 
 
 		 188 aa  54.3  0.000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.418779999999999e-31 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4471  transcriptional regulator, TetR family  39.51 
 
 		 220 aa  53.5  0.000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4464  transcriptional regulator, TetR family  32.35 
 
 		 188 aa  53.1  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.129958  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2286  transcriptional regulator, TetR family  30 
 
 		 188 aa  52.4  0.000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000280215 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4585  transcriptional regulator, TetR family  39.77 
 
 		 220 aa  52.4  0.000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.448621  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1848  transcriptional regulator, TetR family  36.79 
 
 		 190 aa  52.4  0.000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00246548 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4103  regulatory protein TetR  39.51 
 
 		 220 aa  52.4  0.000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.557347 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2743  TetR family transcriptional regulator  29.58 
 
 		 188 aa  52.4  0.000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.673676  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2954  transcriptional regulator, TetR family  30 
 
 		 188 aa  51.6  0.000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.68265  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3558  TetR family transcriptional regulator  37.63 
 
 		 190 aa  51.6  0.000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.410356 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2221  transcriptional regulator, TetR family  31.82 
 
 		 264 aa  51.2  0.000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.104647  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2371  transcriptional regulator, TetR family  34.29 
 
 		 190 aa  50.4  0.00001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0185343  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6562  TetR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 210 aa  50.4  0.00001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.67895  normal  0.0476005 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0081  transcriptional regulator, TetR family  42.65 
 
 		 211 aa  50.4  0.00001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6768  transcriptional regulator, TetR family  40.28 
 
 		 221 aa  50.1  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.357314  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05790  transcriptional regulator  31.11 
 
 		 215 aa  49.7  0.00002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.415819 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0850  TetR family transcriptional regulator  29.03 
 
 		 209 aa  49.3  0.00003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0204358 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3501  TetR family transcriptional regulator  28.39 
 
 		 209 aa  49.7  0.00003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.191946  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4865  TetR family transcriptional regulator  28.39 
 
 		 209 aa  49.7  0.00003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1778  TetR family transcriptional regulator  35.44 
 
 		 199 aa  49.7  0.00003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0789135  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5420  TetR family transcriptional regulator  28.39 
 
 		 202 aa  48.5  0.00006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.66162  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1473  transcriptional regulator, TetR family  35.05 
 
 		 207 aa  47.8  0.00008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.245471  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3474  transcriptional regulator of TetR family protein  42.62 
 
 		 191 aa  47.8  0.00008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.486624 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0179  TetR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 193 aa  47.8  0.00009  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0807108  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0987  TetR family transcriptional regulator  34.69 
 
 		 195 aa  47.4  0.0001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.995143  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5683  TetR family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 189 aa  47.4  0.0001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.17527  hitchhiker  0.003772 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3352  TetR family transcriptional regulator  37.08 
 
 		 211 aa  47.8  0.0001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.586652  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2554  TetR family transcriptional regulator  40.85 
 
 		 198 aa  47.4  0.0001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000394239  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1986  TetR family transcriptional regulator  29.81 
 
 		 218 aa  46.6  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0191052  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0196  transcriptional regulator, TetR family  35.9 
 
 		 200 aa  46.6  0.0002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1516  transcriptional regulator, TetR family  46.3 
 
 		 203 aa  46.6  0.0002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05370  transcriptional regulator, TetR family  33.67 
 
 		 205 aa  47  0.0002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000643211  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0735  regulatory protein, TetR  44.64 
 
 		 204 aa  47  0.0002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8740  putative transcriptional regulator, TetR family  44 
 
 		 226 aa  46.6  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0651  TetR family transcriptional regulator  33.7 
 
 		 218 aa  47  0.0002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  decreased coverage  0.0025795  normal  0.249536 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0868  transcriptional regulator, TetR family  32.09 
 
 		 222 aa  45.8  0.0003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000000486929  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1079  TetR family transcriptional regulator  44.78 
 
 		 215 aa  46.2  0.0003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2779  transcriptional regulator, TetR family  32.94 
 
 		 185 aa  45.8  0.0003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.441306  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2228  TetR family transcriptional regulator  28.85 
 
 		 190 aa  46.2  0.0003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.112072 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1759  transcriptional regulator, TetR family  56 
 
 		 217 aa  46.2  0.0003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05498  putative transcription regulator protein  32.89 
 
 		 197 aa  45.8  0.0004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.806773 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5643  TetR family transcriptional regulator  26.09 
 
 		 224 aa  45.4  0.0004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.240264  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0808  transcriptional regulator, TetR family  29.07 
 
 		 222 aa  45.8  0.0004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6264  putative transcriptional regulator, TetR family  33.78 
 
 		 196 aa  45.8  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.085092 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1461  putative transcriptional regulator  42.11 
 
 		 212 aa  45.8  0.0004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2798  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 251 aa  45.4  0.0005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.358212  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16790  TetR family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 212 aa  45.4  0.0005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.297454  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>