119 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_2624 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_2624  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 210 aa  410  1e-114  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.465145  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0735  regulatory protein, TetR  50 
 
 		 204 aa  159  2e-38  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8740  putative transcriptional regulator, TetR family  46.39 
 
 		 226 aa  142  4e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0808  transcriptional regulator, TetR family  35.64 
 
 		 222 aa  112  4.0000000000000004e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1125  transcriptional regulator, TetR family  34.02 
 
 		 210 aa  83.6  0.000000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6264  putative transcriptional regulator, TetR family  41.75 
 
 		 196 aa  73.6  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.085092 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1430  regulatory protein TetR  42 
 
 		 236 aa  65.1  0.0000000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1456  transcriptional regulator, TetR family  43.48 
 
 		 211 aa  55.8  0.0000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3704  TetR family transcriptional regulator  44 
 
 		 202 aa  53.9  0.000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1684  transcriptional regulator, TetR family  45.21 
 
 		 202 aa  53.5  0.000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6680  transcriptional regulator, TetR family  36.36 
 
 		 176 aa  53.5  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.933684  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1833  TetR family transcriptional regulator  45.21 
 
 		 202 aa  53.1  0.000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.150168  normal  0.286062 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0081  TetR family transcriptional regulator  31.43 
 
 		 231 aa  49.3  0.00004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.672358  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6452  transcriptional regulator, TetR family  30.77 
 
 		 264 aa  48.9  0.00005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6854  TetR family transcriptional regulator  31.36 
 
 		 224 aa  48.9  0.00005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.101929  normal  1 
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4199  TetR family transcriptional regulator  30.25 
 
 		 214 aa  48.5  0.00007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.680761 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1459  transcriptional regulator, TetR family  31.58 
 
 		 187 aa  48.5  0.00007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3835  TetR family transcriptional regulator  36.73 
 
 		 202 aa  47.8  0.0001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3852  TetR family transcriptional regulator  36.73 
 
 		 202 aa  47.8  0.0001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1920  TetR family transcriptional regulator  36.73 
 
 		 202 aa  47.8  0.0001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25080  Transcriptional regulator, TetR family  36.26 
 
 		 191 aa  47.4  0.0001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2120  TetR family transcriptional regulator  26.63 
 
 		 195 aa  47  0.0002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1076  TetR family transcriptional regulator  41.07 
 
 		 196 aa  47  0.0002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.581791 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1942  TetR family transcriptional regulator  37.97 
 
 		 253 aa  47  0.0002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.338038  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1828  regulatory protein TetR  41.94 
 
 		 207 aa  47  0.0002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.790266  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1250  TetR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 202 aa  46.2  0.0003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2686  TetR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 202 aa  46.2  0.0003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0616794  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3431  transcriptional regulator, TetR family  30.14 
 
 		 189 aa  46.6  0.0003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3313  transcriptional regulator, TetR family  24.87 
 
 		 209 aa  46.6  0.0003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0137945 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4478  transcriptional regulator, TetR family  37.1 
 
 		 211 aa  46.2  0.0003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4437  TetR family transcriptional regulator  23.38 
 
 		 192 aa  46.2  0.0004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8100  transcriptional regulator, TetR family  40.3 
 
 		 218 aa  45.8  0.0005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.978856  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1468  transcriptional regulator, TetR family  36.05 
 
 		 190 aa  45.8  0.0005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4951  TetR family transcriptional regulator  29.67 
 
 		 239 aa  45.4  0.0006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.717286  normal  0.572747 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4300  TetR family transcriptional regulator  30.91 
 
 		 190 aa  45.4  0.0006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2708  TetR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 266 aa  45.4  0.0006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2194  regulatory protein, TetR  26.13 
 
 		 218 aa  45.4  0.0006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3562  transcriptional regulator, TetR family  28.8 
 
 		 237 aa  45.4  0.0006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.108326  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0633  TetR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 193 aa  45.4  0.0006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0692  TetR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 193 aa  45.4  0.0006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.253039  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0619  transcriptional regulator, TetR family  35.71 
 
 		 193 aa  45.4  0.0006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0676  TetR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 193 aa  45.4  0.0006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0323458  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2282  TetR family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 217 aa  45.1  0.0008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2609  TetR family transcriptional regulator  35.66 
 
 		 194 aa  45.1  0.0008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000163063  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2557  transcriptional regulator, TetR family  45.45 
 
 		 217 aa  45.1  0.0008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.15322e-23 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0767  transcriptional regulator, TetR family  40.35 
 
 		 227 aa  45.1  0.0008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.148012 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2545  TetR family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 217 aa  44.7  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0577985  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2366  TetR family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 217 aa  44.7  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.711286  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2324  TetR family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 217 aa  44.7  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000190708  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2543  TetR family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 217 aa  44.7  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2226  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 210 aa  44.7  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2353  TetR family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 217 aa  44.7  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.384863  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5292  TetR family transcriptional regulator  53.85 
 
 		 192 aa  44.3  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.505597 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2508  transcriptional regulator, TetR family  45.45 
 
 		 217 aa  44.7  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2815  transcriptional regulator, TetR family  45.45 
 
 		 217 aa  44.7  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000266483 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3170  transcriptional regulator, TetR family  41.82 
 
 		 216 aa  44.7  0.001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8507  putative transcriptional regulator, TetR family  32.17 
 
 		 199 aa  44.7  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.899046 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3625  regulatory protein TetR  30.51 
 
 		 191 aa  44.7  0.001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5643  TetR family transcriptional regulator  28.43 
 
 		 224 aa  43.5  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.240264  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02720  transcriptional regulator, tetR family  30.08 
 
 		 211 aa  43.5  0.002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.460979  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1039  TetR family transcriptional regulator  39.68 
 
 		 190 aa  43.9  0.002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2223  TetR family transcriptional regulator  40.58 
 
 		 200 aa  43.5  0.002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.360909  normal  0.0579313 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1022  transcriptional regulator, TetR family  37.33 
 
 		 202 aa  43.9  0.002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21000  transcriptional regulator, tetR family  43.64 
 
 		 199 aa  43.5  0.002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0917166  normal  0.198219 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0243  TetR family transcriptional regulator  52.63 
 
 		 192 aa  43.1  0.003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1121  TetR family transcriptional regulator  36.49 
 
 		 210 aa  43.1  0.003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0496337  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0553  TetR family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 233 aa  42.7  0.003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5419  TetR family transcriptional regulator  32.62 
 
 		 211 aa  43.1  0.003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.752491  normal  0.799332 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2600  transcriptional regulator, TetR family  43.64 
 
 		 217 aa  43.1  0.003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3720  transcriptional regulator, TetR family  35.14 
 
 		 225 aa  43.1  0.003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.984063  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3163  putative transcriptional regulator, TetR family  30.09 
 
 		 223 aa  42.7  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4446  TetR family transcriptional regulator  34.44 
 
 		 210 aa  42.7  0.004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0077  TetR family transcriptional regulator  38.18 
 
 		 183 aa  42.7  0.004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.234691  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5456  TetR family transcriptional regulator  52.63 
 
 		 192 aa  42.7  0.004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4747  TetR family transcriptional regulator  51.28 
 
 		 192 aa  42.4  0.004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.931681 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5406  TetR family transcriptional regulator  52.63 
 
 		 192 aa  42.7  0.004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.313854  normal  0.0102978 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0455  TetR family transcriptional regulator  34.44 
 
 		 224 aa  42.7  0.004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.366206  normal  0.106872 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1926  TetR family transcriptional regulator  35.38 
 
 		 224 aa  42.7  0.004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.857726  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4864  TetR family transcriptional regulator  52.63 
 
 		 192 aa  42.7  0.004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.935636  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0257  TetR family transcriptional regulator  43.75 
 
 		 201 aa  42.7  0.004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.837987 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0607  transcriptional regulator, TetR family  30.85 
 
 		 255 aa  42.7  0.004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.118397  normal  0.590685 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1283  regulatory protein TetR  32.38 
 
 		 205 aa  42.7  0.004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2823  TetR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 178 aa  42.4  0.005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.335296  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3709  TetR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 221 aa  42.4  0.005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0975739  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0512  TetR family transcriptional regulator  25.38 
 
 		 201 aa  42.4  0.005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1046  TetR family transcriptional regulator  39.47 
 
 		 201 aa  42.4  0.005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2896  TetR family transcriptional regulator  32.88 
 
 		 150 aa  42.4  0.005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000335686 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0648  transcriptional regulator, TetR family  31.82 
 
 		 247 aa  42.4  0.005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0672593 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2402  transcriptional regulator, TetR family  42.31 
 
 		 259 aa  42.4  0.005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0404395  hitchhiker  0.00830545 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2411  transcriptional regulator, TetR family  30.77 
 
 		 205 aa  42.4  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.147912 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6450  putative transcriptional regulator, TetR family  41.82 
 
 		 188 aa  42  0.006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.000363867  normal  0.0147922 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2272  TetR family transcriptional regulator  26.83 
 
 		 211 aa  42  0.006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000566042  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2226  TetR family transcriptional regulator  26.83 
 
 		 211 aa  42  0.006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0397604  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0286  TetR family transcriptional regulator  39.24 
 
 		 186 aa  42  0.006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2500  transcriptional regulator, TetR family  26.83 
 
 		 211 aa  42  0.006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0259  transcriptional regulator, TetR family  36.92 
 
 		 195 aa  42  0.006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3140  transcriptional regulator, TetR family  29.75 
 
 		 230 aa  42.4  0.006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2304  TetR family transcriptional regulator  26.83 
 
 		 211 aa  42  0.007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.373552  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2276  TetR family transcriptional regulator  43.08 
 
 		 403 aa  42  0.007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.276985  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0144  TetR family transcriptional regulator  36.25 
 
 		 202 aa  42  0.007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>