243 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_3140 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_3140  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 230 aa  449  1e-125  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0547  transcriptional regulator, TetR family  51.69 
 
 		 249 aa  200  1.9999999999999998e-50  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2221  transcriptional regulator, TetR family  45.3 
 
 		 264 aa  184  1.0000000000000001e-45  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.104647  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0136  transcriptional regulator, TetR family  50 
 
 		 243 aa  174  9e-43  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.30147  normal  0.0856805 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4942  transcriptional regulator, TetR family  42.8 
 
 		 247 aa  170  2e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.134742  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1892  TetR family transcriptional regulator  50.28 
 
 		 243 aa  151  7e-36  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.717791  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3310  transcriptional regulator, TetR family  44.17 
 
 		 256 aa  144  1e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000381613  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3790  transcriptional regulator, TetR family  40.38 
 
 		 242 aa  142  3e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4005  TetR family transcriptional regulator  40.19 
 
 		 242 aa  141  9.999999999999999e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3567  transcriptional regulator, TetR family  39.59 
 
 		 234 aa  114  1.0000000000000001e-24  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.409379  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0941  TetR family transcriptional regulator  33.91 
 
 		 239 aa  106  4e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0027  TetR family transcriptional regulator  39.72 
 
 		 191 aa  96.7  2e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.192036  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3894  regulatory protein TetR  35.92 
 
 		 206 aa  73.6  0.000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2110  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 218 aa  69.7  0.00000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.722857  normal  0.248102 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3091  TetR family transcriptional regulator  27.75 
 
 		 224 aa  65.9  0.0000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1537  TetR family transcriptional regulator  26.96 
 
 		 257 aa  62.8  0.000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2591  transcriptional regulator, TetR family  34.62 
 
 		 192 aa  62.4  0.000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.266738 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4298  TetR family transcriptional regulator  26.05 
 
 		 197 aa  59.7  0.00000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4186  TetR family transcriptional regulator  30.39 
 
 		 195 aa  58.2  0.0000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2496  TetR family transcriptional regulator  31.37 
 
 		 333 aa  57  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6361  transcriptional regulator, TetR family  31.61 
 
 		 229 aa  57.4  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.529564  normal  0.439154 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1741  transcriptional regulator, TetR family  31.37 
 
 		 307 aa  56.6  0.0000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3984  transcriptional regulator, TetR family  29.03 
 
 		 200 aa  55.5  0.0000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.562971  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1231  transcriptional regulator, TetR family  28.16 
 
 		 212 aa  55.5  0.0000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.814793  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4572  TetR family transcriptional regulator  37.84 
 
 		 234 aa  55.1  0.0000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.224675 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1709  transcriptional regulator, TetR family  32.65 
 
 		 207 aa  54.7  0.000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.17641  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0354  TetR family transcriptional regulator  27.43 
 
 		 214 aa  55.1  0.000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.774788 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6011  transcriptional regulator, TetR family  32.98 
 
 		 203 aa  53.5  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2132  TetR family transcriptional regulator  37.27 
 
 		 231 aa  53.9  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.273159  normal  0.36697 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0688  TetR family transcriptional regulator  40.79 
 
 		 206 aa  53.5  0.000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.987458 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3060  TetR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 203 aa  53.5  0.000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1036  TetR family transcriptional regulator  30.09 
 
 		 209 aa  52.8  0.000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0478429 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2955  TetR family transcriptional regulator  29.31 
 
 		 203 aa  52.4  0.000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2190  TetR family transcriptional regulator  30.19 
 
 		 223 aa  52.8  0.000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10666  TetR family transcriptional regulator  32.11 
 
 		 231 aa  52.8  0.000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000329516  normal  0.389268 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2539  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 196 aa  52  0.000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0784  transcriptional regulator, TetR family  37.37 
 
 		 197 aa  52  0.000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4343  regulatory protein TetR  32.99 
 
 		 196 aa  52  0.000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.817011  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3613  putative transcriptional regulator, TetR family  32.2 
 
 		 221 aa  52  0.000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4105  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 232 aa  51.2  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4024  TetR family transcriptional regulator  31.37 
 
 		 207 aa  51.2  0.00001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.563014  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5073  transcriptional regulator TetR family  42.31 
 
 		 227 aa  51.6  0.00001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.479761  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2655  TetR family transcriptional regulator  27.88 
 
 		 226 aa  51.2  0.00001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0784  TetR family transcriptional regulator  30.47 
 
 		 204 aa  50.8  0.00002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.42035  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1653  TetR family transcriptional regulator  31.07 
 
 		 248 aa  50.4  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0999952  normal  0.0709901 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3164  transcriptional regulator, TetR family  34.69 
 
 		 208 aa  50.4  0.00002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.859639  normal  0.0513104 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1456  transcriptional regulator, TetR family  37.5 
 
 		 211 aa  50.8  0.00002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2214  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 195 aa  50.4  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6428  transcriptional regulator, TetR family  30.36 
 
 		 217 aa  50.4  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0655  TetR family transcriptional regulator  32.74 
 
 		 254 aa  50.8  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2444  transcriptional regulator, TetR family  27.36 
 
 		 211 aa  50.1  0.00003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0505938 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0658  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 211 aa  50.1  0.00003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0683  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 211 aa  50.1  0.00003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0817  TetR family transcriptional regulator  38.81 
 
 		 212 aa  50.1  0.00003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0910  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 195 aa  49.7  0.00004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.843959  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0927  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 195 aa  49.7  0.00004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3965  transcriptional regulator, TetR family  32.11 
 
 		 208 aa  49.3  0.00004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2172  transcriptional regulator, TetR family  29.52 
 
 		 199 aa  49.7  0.00004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4241  hypothetical protein  33.33 
 
 		 206 aa  49.7  0.00004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.22168 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4675  regulatory protein TetR  32.29 
 
 		 190 aa  49.3  0.00005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0420  TetR family transcriptional regulator  29.91 
 
 		 215 aa  49.3  0.00005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2575  transcriptional regulator, TetR family  27.7 
 
 		 183 aa  49.3  0.00006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1887  TetR family transcriptional regulator  28.03 
 
 		 202 aa  48.9  0.00006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.943502 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5527  transcriptional regulator, TetR family  29.41 
 
 		 203 aa  48.9  0.00007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2815  TetR family transcriptional regulator  28.3 
 
 		 242 aa  48.9  0.00007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.106176  normal  0.623336 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0917  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 195 aa  48.9  0.00007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0208731 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2233  transcriptional regulator, TetR family  31.53 
 
 		 196 aa  48.5  0.00009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.943574  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4538  putative transcriptional regulator, TetR family  30.69 
 
 		 243 aa  48.5  0.00009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.530779  normal  0.432727 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00523  transcriptional regulator, TetR family protein  43.33 
 
 		 200 aa  48.5  0.00009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19500  transcriptional regulator, tetR family  32.28 
 
 		 181 aa  48.5  0.00009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.64021  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3851  TetR family transcriptional regulator  48.15 
 
 		 210 aa  48.1  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.197556  normal  0.870182 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2597  putative transcriptional regulator, TetR family  45.76 
 
 		 195 aa  48.1  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.607466 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3566  transcriptional regulator, TetR family  38.89 
 
 		 225 aa  48.1  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3205  TetR family transcriptional regulator  30.36 
 
 		 197 aa  48.1  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3267  TetR family transcriptional regulator  30.36 
 
 		 197 aa  48.1  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0261097  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05540  transcriptional regulator  26.89 
 
 		 197 aa  48.1  0.0001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3216  TetR family transcriptional regulator  30.36 
 
 		 197 aa  48.1  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.278224  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0411  transcriptional regulator, TetR family  46.3 
 
 		 196 aa  48.1  0.0001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.3269  hitchhiker  0.00212654 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4004  TetR family transcriptional regulator  48 
 
 		 196 aa  47  0.0002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.638592  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0732  TetR family transcriptional regulator  48.15 
 
 		 210 aa  47.8  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0242  transcriptional regulator, TetR family  28.16 
 
 		 197 aa  47  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6363  transcriptional regulator, TetR family  28.68 
 
 		 222 aa  47.4  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.318357 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0279  TetR family transcriptional regulator  48.15 
 
 		 210 aa  47.8  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01162  transcription regulator, TetR family protein  29.73 
 
 		 201 aa  47.8  0.0002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0763  TetR family transcriptional regulator  48.15 
 
 		 210 aa  47.8  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.756053  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0999  transcriptional regulator, TetR family  28.28 
 
 		 204 aa  47.4  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.372995  normal  0.0457994 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2464  transcriptional regulator, TetR family  28.57 
 
 		 193 aa  47.4  0.0002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.943089 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1586  transcriptional regulator, TetR family  29.13 
 
 		 197 aa  47.4  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.66794  normal  0.155541 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3010  transcriptional regulator, TetR family  35.35 
 
 		 196 aa  47.4  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.798857 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30540  transcriptional regulator, TetR family  30.39 
 
 		 195 aa  47.4  0.0002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6137  transcriptional regulator, TetR family  25.65 
 
 		 196 aa  47.4  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.780623 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5107  TetR family transcriptional regulator  35.44 
 
 		 225 aa  47  0.0003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.346129  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1142  transcriptional regulator, TetR family  30.63 
 
 		 260 aa  47  0.0003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3195  transcriptional regulator, TetR family  27.41 
 
 		 200 aa  46.6  0.0003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5699  TetR family transcriptional regulator  30.26 
 
 		 206 aa  47  0.0003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.393579  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1369  TetR family transcriptional regulator  27 
 
 		 208 aa  47  0.0003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3937  transcriptional regulator, TetR family  30.21 
 
 		 187 aa  46.6  0.0003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00797355  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0408  transcriptional regulator, TetR family  49.06 
 
 		 212 aa  46.6  0.0003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.431467 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1828  regulatory protein TetR  33.75 
 
 		 207 aa  47  0.0003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.790266  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2330  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 225 aa  47  0.0003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.389066  normal  0.980038 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>