More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_4298 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009441  Fjoh_4298  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 197 aa  406  1e-113  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2260  regulatory protein TetR  56.06 
 
 		 199 aa  221  4e-57  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.535255  normal  0.350629 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1375  regulatory protein TetR  47.5 
 
 		 199 aa  160  1e-38  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.852149 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2172  transcriptional regulator, TetR family  43.78 
 
 		 199 aa  159  2e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5095  transcriptional regulator, TetR family  40.93 
 
 		 200 aa  132  1.9999999999999998e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.666558  normal  0.638711 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1425  TetR family transcriptional regulator  32.98 
 
 		 208 aa  113  2.0000000000000002e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1586  transcriptional regulator, TetR family  30.35 
 
 		 197 aa  109  2.0000000000000002e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.66794  normal  0.155541 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0242  transcriptional regulator, TetR family  30.46 
 
 		 197 aa  107  9.000000000000001e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4491  transcriptional regulator, TetR family  31.94 
 
 		 209 aa  92.8  3e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.573623 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5083  regulatory protein TetR  33.04 
 
 		 184 aa  84.7  8e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.749425  normal  0.163121 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2604  transcriptional regulator, TetR family  31.75 
 
 		 195 aa  80.1  0.00000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0764  TetR family transcriptional regulator  25.98 
 
 		 203 aa  79.3  0.00000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0005262  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0827  transcriptional regulator, TetR family  33.93 
 
 		 200 aa  78.2  0.00000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2636  TetR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 196 aa  78.2  0.00000000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2681  TetR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 196 aa  78.2  0.00000000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.160159 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2665  TetR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 196 aa  78.2  0.00000000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5162  transcriptional regulator, TetR family  30.71 
 
 		 193 aa  77.4  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.134912  normal  0.642196 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6443  transcriptional regulator, TetR family  28.42 
 
 		 202 aa  76.6  0.0000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1709  transcriptional regulator, TetR family  40.82 
 
 		 207 aa  77  0.0000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.17641  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0354  TetR family transcriptional regulator  29.14 
 
 		 214 aa  75.9  0.0000000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.774788 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1741  transcriptional regulator, TetR family  36.61 
 
 		 307 aa  75.1  0.0000000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0930  transcriptional regulator, TetR family  26.09 
 
 		 194 aa  75.1  0.0000000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2496  TetR family transcriptional regulator  36.61 
 
 		 333 aa  73.9  0.000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3984  transcriptional regulator, TetR family  34.82 
 
 		 200 aa  73.9  0.000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.562971  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1653  TetR family transcriptional regulator  27.57 
 
 		 248 aa  71.6  0.000000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0999952  normal  0.0709901 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0302  putative transcriptional regulator, TetR family  29.41 
 
 		 195 aa  70.9  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.475945  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0999  transcriptional regulator, TetR family  27.07 
 
 		 204 aa  70.1  0.00000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.372995  normal  0.0457994 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1537  TetR family transcriptional regulator  37.07 
 
 		 257 aa  70.5  0.00000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2190  TetR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 223 aa  68.6  0.00000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2633  transcriptional regulator, TetR family  27.04 
 
 		 204 aa  68.9  0.00000000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.487613  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21120  transcriptional regulator  31.43 
 
 		 203 aa  68.6  0.00000000006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4024  TetR family transcriptional regulator  27.38 
 
 		 207 aa  68.2  0.00000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.563014  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5283  transcriptional regulator, TetR family  28.66 
 
 		 184 aa  68.2  0.00000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.729406  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6011  transcriptional regulator, TetR family  27.43 
 
 		 203 aa  67.8  0.00000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2539  transcriptional regulator, TetR family  29.07 
 
 		 196 aa  66.2  0.0000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00482  NADH dehydrogenase  29.37 
 
 		 194 aa  63.9  0.000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4572  TetR family transcriptional regulator  36.54 
 
 		 234 aa  64.3  0.000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.224675 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2518  transcriptional regulator, TetR family  25.79 
 
 		 191 aa  63.2  0.000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0208752  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2233  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 196 aa  62.4  0.000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.943574  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1583  TetR family transcriptional regulator  23.53 
 
 		 198 aa  62.4  0.000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1929  TetR family transcriptional regulator  24.12 
 
 		 206 aa  62.4  0.000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20070  transcriptional regulator, TetR family  28.97 
 
 		 205 aa  62  0.000000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3929  TetR family transcriptional regulator  23.08 
 
 		 210 aa  61.6  0.000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.459326  normal  0.170288 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2726  transcriptional regulator, TetR family  31 
 
 		 203 aa  61.6  0.000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00544157 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4343  regulatory protein TetR  23.86 
 
 		 196 aa  61.6  0.000000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.817011  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001979  transcriptional regulator TetR family  28.23 
 
 		 193 aa  61.2  0.000000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.507988  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1473  transcriptional regulator, TetR family  25.77 
 
 		 207 aa  60.8  0.00000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.245471  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1032  transcriptional regulator, TetR family  25 
 
 		 207 aa  60.8  0.00000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5718  transcriptional regulator, TetR family  26.88 
 
 		 212 aa  60.8  0.00000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.283499  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2974  TetR family transcriptional regulator  25.77 
 
 		 209 aa  60.5  0.00000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0784  TetR family transcriptional regulator  32.04 
 
 		 204 aa  59.3  0.00000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.42035  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3140  transcriptional regulator, TetR family  26.05 
 
 		 230 aa  59.7  0.00000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1561  TetR family transcriptional regulator  22.83 
 
 		 219 aa  58.9  0.00000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5606  putative transcriptional regulator, TetR family  35.64 
 
 		 189 aa  58.5  0.00000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0377477  normal  0.125627 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2132  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 231 aa  58.5  0.00000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.273159  normal  0.36697 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0810  transcriptional regulator  30.69 
 
 		 206 aa  58.2  0.00000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.490663  normal  0.19914 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0758  transcriptional regulator, TetR family  32.38 
 
 		 229 aa  57.8  0.00000009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.685577  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0420  TetR family transcriptional regulator  29.46 
 
 		 215 aa  57.8  0.0000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2994  TetR family transcriptional regulator  23.98 
 
 		 197 aa  57.8  0.0000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.383158  normal  0.27329 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2955  TetR family transcriptional regulator  25.97 
 
 		 203 aa  57.8  0.0000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5863  transcriptional regulator, TetR family  24.6 
 
 		 222 aa  57.8  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2830  transcriptional regulator, TetR family  22.22 
 
 		 208 aa  57.4  0.0000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.514088 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3538  regulatory protein, TetR  25.75 
 
 		 200 aa  56.6  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0647727 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0917  TetR family transcriptional regulator  27.1 
 
 		 195 aa  57  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0208731 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1613  regulatory protein TetR  23.02 
 
 		 221 aa  56.6  0.0000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5392  transcriptional regulator, TetR family protein  27.16 
 
 		 190 aa  56.2  0.0000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6428  transcriptional regulator, TetR family  20.61 
 
 		 217 aa  56.2  0.0000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1551  hypothetical protein  25.99 
 
 		 196 aa  55.8  0.0000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.494685  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7086  transcriptional regulator TetR family  27.78 
 
 		 241 aa  55.5  0.0000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.546749  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3060  TetR family transcriptional regulator  31.86 
 
 		 203 aa  55.1  0.0000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0677  transcriptional regulator, TetR family  30.53 
 
 		 238 aa  55.1  0.0000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05540  transcriptional regulator  27.55 
 
 		 197 aa  55.1  0.0000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0910  TetR family transcriptional regulator  26.17 
 
 		 195 aa  55.1  0.0000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.843959  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0927  TetR family transcriptional regulator  26.17 
 
 		 195 aa  55.1  0.0000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3091  TetR family transcriptional regulator  27.44 
 
 		 224 aa  54.7  0.0000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6363  transcriptional regulator, TetR family  26.21 
 
 		 222 aa  54.3  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.318357 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2591  transcriptional regulator, TetR family  26.67 
 
 		 192 aa  54.3  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.266738 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0091  HTH-type transcriptional regulator, TetR family  30 
 
 		 199 aa  54.3  0.000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.903201  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3010  transcriptional regulator, TetR family  23.78 
 
 		 196 aa  53.9  0.000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.798857 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1118  transcriptional regulator, TetR family  22.84 
 
 		 201 aa  53.1  0.000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00548751  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2221  transcriptional regulator, TetR family  27.35 
 
 		 264 aa  53.5  0.000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.104647  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0330  transcriptional regulator, TetR family  27.45 
 
 		 233 aa  53.1  0.000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05790  transcriptional regulator  29.25 
 
 		 215 aa  53.9  0.000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.415819 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0778  TetR family transcriptional regulator  23.85 
 
 		 200 aa  53.5  0.000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0868  transcriptional regulator, TetR family  29.13 
 
 		 230 aa  53.9  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.200185 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01162  transcription regulator, TetR family protein  34.58 
 
 		 201 aa  53.1  0.000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2775  TetR family transcriptional regulator  22.14 
 
 		 228 aa  53.9  0.000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0212844  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1336  TetR family transcriptional regulator  25.42 
 
 		 200 aa  53.9  0.000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00010036 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5135  TetR family transcriptional regulator  30.48 
 
 		 192 aa  53.9  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0547  transcriptional regulator, TetR family  24.76 
 
 		 249 aa  53.5  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2708  regulatory protein TetR  22.54 
 
 		 228 aa  53.5  0.000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.855326  normal  0.333826 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2214  transcriptional regulator, TetR family  23.93 
 
 		 195 aa  53.5  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0468  putative transcriptional regulator, TetR family  32.26 
 
 		 319 aa  52.8  0.000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3845  transcriptional regulator, TetR family  23.56 
 
 		 209 aa  52.4  0.000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00359694  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0440  TetR/AcrR family transcriptional regulator  28.43 
 
 		 203 aa  52.4  0.000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1405  transcriptional regulator, TetR family  29.25 
 
 		 212 aa  52.4  0.000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.408275 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1866  transcriptional regulator, TetR family  25.48 
 
 		 199 aa  52  0.000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.922935  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2554  TetR family transcriptional regulator  26.95 
 
 		 198 aa  51.6  0.000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000394239  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3014  TetR family transcriptional regulator  32.04 
 
 		 258 aa  51.6  0.000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00422654  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1609  transcriptional regulator, TetR family  26.9 
 
 		 239 aa  51.6  0.000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>