More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_5095 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



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Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_5095  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 200 aa  412  1e-114  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.666558  normal  0.638711 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2260  regulatory protein TetR  42.41 
 
 		 199 aa  169  3e-41  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.535255  normal  0.350629 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4298  TetR family transcriptional regulator  40.93 
 
 		 197 aa  148  5e-35  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2172  transcriptional regulator, TetR family  38.17 
 
 		 199 aa  134  7.000000000000001e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1375  regulatory protein TetR  38.22 
 
 		 199 aa  127  1.0000000000000001e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.852149 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1586  transcriptional regulator, TetR family  30.6 
 
 		 197 aa  92.4  4e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.66794  normal  0.155541 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1425  TetR family transcriptional regulator  29.55 
 
 		 208 aa  91.3  9e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0354  TetR family transcriptional regulator  32.94 
 
 		 214 aa  86.7  2e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.774788 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0242  transcriptional regulator, TetR family  26.55 
 
 		 197 aa  82.4  0.000000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6443  transcriptional regulator, TetR family  29.05 
 
 		 202 aa  78.6  0.00000000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2636  TetR family transcriptional regulator  31.79 
 
 		 196 aa  78.6  0.00000000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2681  TetR family transcriptional regulator  31.79 
 
 		 196 aa  78.6  0.00000000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.160159 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2665  TetR family transcriptional regulator  31.79 
 
 		 196 aa  78.6  0.00000000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0302  putative transcriptional regulator, TetR family  29.65 
 
 		 195 aa  77  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.475945  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5162  transcriptional regulator, TetR family  30.82 
 
 		 193 aa  76.3  0.0000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.134912  normal  0.642196 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0764  TetR family transcriptional regulator  25.13 
 
 		 203 aa  75.9  0.0000000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0005262  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2604  transcriptional regulator, TetR family  28.32 
 
 		 195 aa  75.5  0.0000000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1709  transcriptional regulator, TetR family  38.38 
 
 		 207 aa  75.1  0.0000000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.17641  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2974  TetR family transcriptional regulator  28.18 
 
 		 209 aa  75.1  0.0000000000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4024  TetR family transcriptional regulator  32.5 
 
 		 207 aa  74.3  0.000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.563014  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4491  transcriptional regulator, TetR family  33.63 
 
 		 209 aa  73.9  0.000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.573623 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5083  regulatory protein TetR  26.16 
 
 		 184 aa  72.8  0.000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.749425  normal  0.163121 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0827  transcriptional regulator, TetR family  30.16 
 
 		 200 aa  72  0.000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21120  transcriptional regulator  28.8 
 
 		 203 aa  71.6  0.000000000007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5283  transcriptional regulator, TetR family  30 
 
 		 184 aa  71.2  0.000000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.729406  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6011  transcriptional regulator, TetR family  31.48 
 
 		 203 aa  70.5  0.00000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1561  TetR family transcriptional regulator  32.04 
 
 		 219 aa  69.3  0.00000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2726  transcriptional regulator, TetR family  28.65 
 
 		 203 aa  69.3  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00544157 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0930  transcriptional regulator, TetR family  26.06 
 
 		 194 aa  68.6  0.00000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2539  transcriptional regulator, TetR family  30 
 
 		 196 aa  67.8  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0330  transcriptional regulator, TetR family  35.9 
 
 		 233 aa  67.8  0.0000000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2233  transcriptional regulator, TetR family  30.82 
 
 		 196 aa  65.5  0.0000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.943574  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3010  transcriptional regulator, TetR family  30.25 
 
 		 196 aa  64.7  0.0000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.798857 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2190  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 		 223 aa  64.7  0.000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3984  transcriptional regulator, TetR family  27.68 
 
 		 200 aa  64.7  0.000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.562971  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1405  transcriptional regulator, TetR family  34.96 
 
 		 212 aa  64.3  0.000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.408275 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4523  TetR family transcriptional regulator  28.67 
 
 		 216 aa  63.2  0.000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.382743 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1653  TetR family transcriptional regulator  28.11 
 
 		 248 aa  62.8  0.000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0999952  normal  0.0709901 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1537  TetR family transcriptional regulator  27.68 
 
 		 257 aa  63.2  0.000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0868  transcriptional regulator, TetR family  30.23 
 
 		 230 aa  62  0.000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.200185 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5718  transcriptional regulator, TetR family  32.73 
 
 		 212 aa  61.6  0.000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.283499  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0999  transcriptional regulator, TetR family  26.21 
 
 		 204 aa  60.1  0.00000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.372995  normal  0.0457994 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0420  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 215 aa  60.5  0.00000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0782  transcriptional regulator, TetR family  33.03 
 
 		 295 aa  60.5  0.00000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.876045  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1231  transcriptional regulator, TetR family  25.14 
 
 		 212 aa  59.7  0.00000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.814793  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2830  transcriptional regulator, TetR family  25.27 
 
 		 208 aa  59.7  0.00000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.514088 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3060  TetR family transcriptional regulator  29.46 
 
 		 203 aa  59.3  0.00000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3538  regulatory protein, TetR  27.12 
 
 		 200 aa  59.3  0.00000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0647727 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1741  transcriptional regulator, TetR family  32.74 
 
 		 307 aa  58.9  0.00000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2955  TetR family transcriptional regulator  31.87 
 
 		 203 aa  58.9  0.00000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5132  transcriptional regulator, TetR family  26.35 
 
 		 214 aa  57.8  0.0000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.493019  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2496  TetR family transcriptional regulator  33.03 
 
 		 333 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20070  transcriptional regulator, TetR family  23.36 
 
 		 205 aa  57.4  0.0000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1929  TetR family transcriptional regulator  29.27 
 
 		 206 aa  57  0.0000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2655  TetR family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 226 aa  57  0.0000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1866  transcriptional regulator, TetR family  26.35 
 
 		 199 aa  56.2  0.0000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.922935  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5392  transcriptional regulator, TetR family protein  25.41 
 
 		 190 aa  56.2  0.0000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7086  transcriptional regulator TetR family  27.11 
 
 		 241 aa  56.2  0.0000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.546749  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0688  TetR family transcriptional regulator  27.59 
 
 		 206 aa  56.6  0.0000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.987458 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2448  TetR family transcriptional regulator  24.31 
 
 		 204 aa  55.8  0.0000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0199857  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2633  transcriptional regulator, TetR family  26.09 
 
 		 204 aa  55.8  0.0000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.487613  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0194  transcriptional regulator, TetR family  29.92 
 
 		 225 aa  55.8  0.0000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01162  transcription regulator, TetR family protein  30.84 
 
 		 201 aa  55.5  0.0000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0758  transcriptional regulator, TetR family  27.49 
 
 		 229 aa  55.5  0.0000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.685577  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0262  transcriptional regulator, TetR family  24.16 
 
 		 199 aa  55.1  0.0000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.670528 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1336  TetR family transcriptional regulator  24.55 
 
 		 200 aa  54.7  0.000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00010036 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7473  TetR family transcriptional regulator  28 
 
 		 217 aa  53.9  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1331  transcriptional regulator, TetR family  27.27 
 
 		 201 aa  54.3  0.000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2708  regulatory protein TetR  27.78 
 
 		 228 aa  54.3  0.000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.855326  normal  0.333826 
 
 
-
 
NC_003296  RS03880  putative transcription regulator protein  28.72 
 
 		 214 aa  53.5  0.000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.778917  normal  0.557481 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1309  TetR family transcriptional regulator  25.64 
 
 		 222 aa  53.5  0.000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.488116  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0017  TetR family transcriptional regulator  27.22 
 
 		 235 aa  53.1  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.731504 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0677  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 238 aa  53.9  0.000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2935  transcriptional regulator, TetR family  27.78 
 
 		 208 aa  53.1  0.000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.309221  normal  0.0172625 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1369  TetR family transcriptional regulator  24.57 
 
 		 208 aa  53.5  0.000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2974  TetR family transcriptional regulator  27.42 
 
 		 225 aa  53.9  0.000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.995598  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1958  putative transcriptional regulator, TetR family  29.59 
 
 		 208 aa  53.1  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.158698  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4343  regulatory protein TetR  29.63 
 
 		 196 aa  53.1  0.000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.817011  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5699  TetR family transcriptional regulator  28.31 
 
 		 206 aa  52.8  0.000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.393579  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4073  TetR family transcriptional regulator  28.32 
 
 		 223 aa  53.1  0.000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4572  TetR family transcriptional regulator  32.1 
 
 		 234 aa  52.8  0.000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.224675 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0547  transcriptional regulator, TetR family  28.7 
 
 		 249 aa  53.1  0.000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3038  TetR family transcriptional regulator  27.12 
 
 		 186 aa  53.1  0.000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.815569  n/a   
 
 
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NC_007498  Pcar_0440  TetR/AcrR family transcriptional regulator  25.93 
 
 		 203 aa  52.4  0.000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1427  TetR family transcriptional regulator  26.6 
 
 		 204 aa  52.4  0.000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.286714  hitchhiker  0.000126282 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4769  TetR family transcriptional regulator  28.49 
 
 		 219 aa  52.4  0.000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013595  Sros_5606  putative transcriptional regulator, TetR family  29.46 
 
 		 189 aa  52.8  0.000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0377477  normal  0.125627 
 
 
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NC_013093  Amir_4105  transcriptional regulator, TetR family  26.19 
 
 		 232 aa  52.8  0.000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009485  BBta_5476  TetR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 240 aa  51.6  0.000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008726  Mvan_4092  TetR family transcriptional regulator  29.09 
 
 		 206 aa  51.6  0.000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_007912  Sde_1314  TetR family transcriptional regulator  22.03 
 
 		 224 aa  51.6  0.000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.6037  normal  0.969851 
 
 
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NC_013131  Caci_6363  transcriptional regulator, TetR family  25 
 
 		 222 aa  51.6  0.000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.318357 
 
 
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NC_010803  Clim_0043  transcriptional regulator, TetR family  30.51 
 
 		 244 aa  51.2  0.000009  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.343495  n/a   
 
 
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NC_013510  Tcur_0564  transcriptional regulator, TetR family  29.32 
 
 		 203 aa  51.6  0.000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008541  Arth_1216  TetR family transcriptional regulator  25.69 
 
 		 204 aa  50.8  0.00001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013595  Sros_3613  putative transcriptional regulator, TetR family  26.22 
 
 		 221 aa  50.8  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008228  Patl_4186  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 195 aa  50.4  0.00002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008321  Shewmr4_0172  TetR family transcriptional regulator  24.56 
 
 		 203 aa  50.1  0.00002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008322  Shewmr7_0167  TetR family transcriptional regulator  23.67 
 
 		 203 aa  50.4  0.00002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.266146 
 
 
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NC_008347  Mmar10_1062  TetR family transcriptional regulator  25.86 
 
 		 215 aa  50.1  0.00002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.453034  normal  1 
 
 
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