179 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_1586 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_1586  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 197 aa  402  1e-111  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.66794  normal  0.155541 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0242  transcriptional regulator, TetR family  43.37 
 
 		 197 aa  174  9.999999999999999e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2172  transcriptional regulator, TetR family  35.32 
 
 		 199 aa  125  3e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4491  transcriptional regulator, TetR family  32.7 
 
 		 209 aa  113  2.0000000000000002e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.573623 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1375  regulatory protein TetR  30 
 
 		 199 aa  110  1.0000000000000001e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.852149 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4298  TetR family transcriptional regulator  30.35 
 
 		 197 aa  109  2.0000000000000002e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1425  TetR family transcriptional regulator  34.04 
 
 		 208 aa  109  3e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2260  regulatory protein TetR  33.33 
 
 		 199 aa  103  2e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.535255  normal  0.350629 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5095  transcriptional regulator, TetR family  30.6 
 
 		 200 aa  85.1  6e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.666558  normal  0.638711 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6443  transcriptional regulator, TetR family  36.28 
 
 		 202 aa  76.6  0.0000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5083  regulatory protein TetR  32.14 
 
 		 184 aa  74.7  0.0000000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.749425  normal  0.163121 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0930  transcriptional regulator, TetR family  28.82 
 
 		 194 aa  74.7  0.0000000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0302  putative transcriptional regulator, TetR family  34.02 
 
 		 195 aa  73.2  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.475945  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1653  TetR family transcriptional regulator  28.29 
 
 		 248 aa  71.6  0.000000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0999952  normal  0.0709901 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2636  TetR family transcriptional regulator  26.32 
 
 		 196 aa  71.2  0.000000000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2681  TetR family transcriptional regulator  26.32 
 
 		 196 aa  71.2  0.000000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.160159 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2665  TetR family transcriptional regulator  26.32 
 
 		 196 aa  71.2  0.000000000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0827  transcriptional regulator, TetR family  35.65 
 
 		 200 aa  69.7  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3984  transcriptional regulator, TetR family  33.93 
 
 		 200 aa  69.3  0.00000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.562971  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21120  transcriptional regulator  25.73 
 
 		 203 aa  68.6  0.00000000006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6011  transcriptional regulator, TetR family  27.03 
 
 		 203 aa  68.6  0.00000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1741  transcriptional regulator, TetR family  33.91 
 
 		 307 aa  67.8  0.00000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5283  transcriptional regulator, TetR family  25.66 
 
 		 184 aa  67.4  0.0000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.729406  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2496  TetR family transcriptional regulator  32.77 
 
 		 333 aa  67.4  0.0000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5162  transcriptional regulator, TetR family  32.41 
 
 		 193 aa  64.3  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.134912  normal  0.642196 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0688  TetR family transcriptional regulator  30.32 
 
 		 206 aa  62.8  0.000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.987458 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1709  transcriptional regulator, TetR family  35.05 
 
 		 207 aa  62  0.000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.17641  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0440  TetR/AcrR family transcriptional regulator  26.19 
 
 		 203 aa  61.2  0.000000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0420  TetR family transcriptional regulator  32.67 
 
 		 215 aa  60.8  0.00000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2604  transcriptional regulator, TetR family  28.32 
 
 		 195 aa  60.8  0.00000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0354  TetR family transcriptional regulator  32.71 
 
 		 214 aa  60.8  0.00000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.774788 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0999  transcriptional regulator, TetR family  32.2 
 
 		 204 aa  59.7  0.00000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.372995  normal  0.0457994 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3060  TetR family transcriptional regulator  34.4 
 
 		 203 aa  58.5  0.00000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20070  transcriptional regulator, TetR family  26.42 
 
 		 205 aa  58.5  0.00000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4024  TetR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 207 aa  57.4  0.0000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.563014  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1369  TetR family transcriptional regulator  32 
 
 		 208 aa  57.4  0.0000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004024  transcriptional regulator  23.78 
 
 		 196 aa  57.8  0.0000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000690924  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05540  transcriptional regulator  28.06 
 
 		 197 aa  56.2  0.0000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2190  TetR family transcriptional regulator  29.82 
 
 		 223 aa  55.5  0.0000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0855  transcriptional regulator, TetR family  24.83 
 
 		 244 aa  55.1  0.0000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01438  hypothetical protein  23.78 
 
 		 196 aa  55.1  0.0000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1314  TetR family transcriptional regulator  23.78 
 
 		 224 aa  54.7  0.0000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.6037  normal  0.969851 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0764  TetR family transcriptional regulator  31.48 
 
 		 203 aa  54.7  0.0000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0005262  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2539  transcriptional regulator, TetR family  28.28 
 
 		 196 aa  54.7  0.0000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2233  transcriptional regulator, TetR family  28.28 
 
 		 196 aa  54.7  0.0000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.943574  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0784  TetR family transcriptional regulator  30.19 
 
 		 204 aa  54.3  0.000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.42035  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3198  TetR family transcriptional regulator  27.67 
 
 		 215 aa  52.4  0.000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00193732  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4290  transcriptional regulator, TetR family  27.5 
 
 		 226 aa  52.4  0.000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.000567463  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1062  TetR family transcriptional regulator  42.19 
 
 		 215 aa  52  0.000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.453034  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3091  TetR family transcriptional regulator  31.48 
 
 		 224 aa  52  0.000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5699  TetR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 206 aa  51.6  0.000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.393579  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3204  TetR family transcriptional regulator  23.88 
 
 		 211 aa  51.6  0.000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.109794  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0907  transcriptional regulator, TetR family  25.19 
 
 		 202 aa  51.6  0.000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4343  regulatory protein TetR  25.42 
 
 		 196 aa  51.6  0.000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.817011  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6428  transcriptional regulator, TetR family  24.42 
 
 		 217 aa  51.2  0.000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0778  TetR family transcriptional regulator  25.81 
 
 		 200 aa  51.2  0.00001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1823  TetR family transcriptional regulator  26.43 
 
 		 222 aa  50.4  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.331222  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1551  hypothetical protein  21.3 
 
 		 196 aa  50.8  0.00001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.494685  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3642  TetR family transcriptional regulator  26.09 
 
 		 227 aa  50.4  0.00002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.494269 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2726  transcriptional regulator, TetR family  27.17 
 
 		 203 aa  50.1  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00544157 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2221  transcriptional regulator, TetR family  28.12 
 
 		 264 aa  49.7  0.00003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.104647  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3010  transcriptional regulator, TetR family  24.67 
 
 		 196 aa  49.3  0.00004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.798857 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0262  transcriptional regulator, TetR family  23.73 
 
 		 199 aa  49.3  0.00004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.670528 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1331  transcriptional regulator, TetR family  30.61 
 
 		 201 aa  49.3  0.00004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2358  transcriptional regulator, TetR family  24.7 
 
 		 216 aa  49.3  0.00004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0281012 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0910  TetR family transcriptional regulator  29.36 
 
 		 195 aa  48.9  0.00005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.843959  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2765  regulatory protein, TetR  29.35 
 
 		 210 aa  48.9  0.00005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.267077  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0927  TetR family transcriptional regulator  29.36 
 
 		 195 aa  48.9  0.00005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3154  transcriptional regulator, TetR family  28.67 
 
 		 200 aa  48.9  0.00005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0917  TetR family transcriptional regulator  29.36 
 
 		 195 aa  48.5  0.00006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0208731 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2109  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 206 aa  48.1  0.00007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.901149 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2830  transcriptional regulator, TetR family  21.35 
 
 		 208 aa  48.5  0.00007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.514088 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4198  TetR family transcriptional regulator  28.26 
 
 		 191 aa  48.1  0.00009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000131779  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2464  transcriptional regulator, TetR family  26.63 
 
 		 193 aa  48.1  0.00009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.943089 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2799  TetR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 217 aa  47.4  0.0001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.364827  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01162  transcription regulator, TetR family protein  29 
 
 		 201 aa  47.8  0.0001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3140  transcriptional regulator, TetR family  29.13 
 
 		 230 aa  47.4  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7086  transcriptional regulator TetR family  25 
 
 		 241 aa  47.4  0.0001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.546749  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3938  transcriptional regulator, TetR family  28.57 
 
 		 231 aa  47.4  0.0001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.00284915  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0167  TetR family transcriptional regulator  23.53 
 
 		 203 aa  46.6  0.0002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.266146 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4005  TetR family transcriptional regulator  32.56 
 
 		 242 aa  47  0.0002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37020  transcriptional regulator, TetR family  26.12 
 
 		 276 aa  46.6  0.0002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.016957 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1609  transcriptional regulator, TetR family  25 
 
 		 239 aa  46.6  0.0002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2575  transcriptional regulator, TetR family  28.42 
 
 		 183 aa  46.6  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3613  putative transcriptional regulator, TetR family  26.95 
 
 		 221 aa  46.2  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1427  TetR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 204 aa  46.2  0.0003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.286714  hitchhiker  0.000126282 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1838  TetR family transcriptional regulator  45 
 
 		 195 aa  46.6  0.0003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0119  TetR family transcriptional regulator  30.51 
 
 		 201 aa  46.2  0.0003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  decreased coverage  0.00000000566826  decreased coverage  0.00000000000241144 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6231  transcriptional regulator, TetR family  30.77 
 
 		 197 aa  46.2  0.0003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1929  TetR family transcriptional regulator  25.71 
 
 		 206 aa  45.8  0.0004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2155  TetR family transcriptional regulator  29.81 
 
 		 195 aa  45.8  0.0004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2716  TetR family transcriptional regulator  32.22 
 
 		 212 aa  45.8  0.0004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.448471  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0868  transcriptional regulator, TetR family  25.42 
 
 		 230 aa  45.8  0.0004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.200185 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5606  putative transcriptional regulator, TetR family  27.88 
 
 		 189 aa  45.4  0.0005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0377477  normal  0.125627 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2228  TetR family transcriptional regulator  28.48 
 
 		 190 aa  45.4  0.0005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.112072 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4572  TetR family transcriptional regulator  26.29 
 
 		 234 aa  45.4  0.0005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.224675 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1336  TetR family transcriptional regulator  28.81 
 
 		 200 aa  45.4  0.0005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00010036 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4538  putative transcriptional regulator, TetR family  30.48 
 
 		 243 aa  45.1  0.0006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.530779  normal  0.432727 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0817  TetR family transcriptional regulator  24.49 
 
 		 212 aa  45.4  0.0006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3444  transcriptional regulator, TetR family  39.19 
 
 		 200 aa  45.1  0.0006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.700957 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>