162 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_0547 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_0547  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 249 aa  487  1e-137  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3140  transcriptional regulator, TetR family  55.73 
 
 		 230 aa  191  8e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2221  transcriptional regulator, TetR family  41.6 
 
 		 264 aa  152  5.9999999999999996e-36  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.104647  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4942  transcriptional regulator, TetR family  43.68 
 
 		 247 aa  145  6e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.134742  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4005  TetR family transcriptional regulator  35.75 
 
 		 242 aa  120  1.9999999999999998e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3790  transcriptional regulator, TetR family  35.45 
 
 		 242 aa  119  3.9999999999999996e-26  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0136  transcriptional regulator, TetR family  44.02 
 
 		 243 aa  119  4.9999999999999996e-26  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.30147  normal  0.0856805 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3310  transcriptional regulator, TetR family  40.31 
 
 		 256 aa  112  4.0000000000000004e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000381613  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1892  TetR family transcriptional regulator  42.46 
 
 		 243 aa  112  4.0000000000000004e-24  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.717791  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3567  transcriptional regulator, TetR family  38.79 
 
 		 234 aa  103  3e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.409379  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0941  TetR family transcriptional regulator  34.97 
 
 		 239 aa  100  2e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0027  TetR family transcriptional regulator  32.78 
 
 		 191 aa  94  2e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.192036  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1231  transcriptional regulator, TetR family  33.06 
 
 		 212 aa  63.5  0.000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.814793  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10666  TetR family transcriptional regulator  34.09 
 
 		 231 aa  62  0.000000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000329516  normal  0.389268 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4343  regulatory protein TetR  33.14 
 
 		 196 aa  61.2  0.00000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.817011  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1958  putative transcriptional regulator, TetR family  29.63 
 
 		 208 aa  59.7  0.00000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.158698  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0197  putative transcriptional regulator, TetR family  35.85 
 
 		 212 aa  59.3  0.00000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2110  TetR family transcriptional regulator  36.79 
 
 		 218 aa  59.7  0.00000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.722857  normal  0.248102 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0917  TetR family transcriptional regulator  30.25 
 
 		 195 aa  59.3  0.00000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0208731 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2172  transcriptional regulator, TetR family  29.46 
 
 		 199 aa  58.9  0.00000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4241  hypothetical protein  37.11 
 
 		 206 aa  58.2  0.0000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.22168 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0910  TetR family transcriptional regulator  30.14 
 
 		 195 aa  57.4  0.0000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.843959  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3984  transcriptional regulator, TetR family  29.41 
 
 		 200 aa  57.8  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.562971  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0927  TetR family transcriptional regulator  30.14 
 
 		 195 aa  57.4  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4671  TetR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 206 aa  57.8  0.0000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.235627  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1036  TetR family transcriptional regulator  31.15 
 
 		 209 aa  57.8  0.0000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0478429 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1709  transcriptional regulator, TetR family  30.22 
 
 		 207 aa  57  0.0000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.17641  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5083  regulatory protein TetR  31.75 
 
 		 184 aa  56.2  0.0000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.749425  normal  0.163121 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4024  TetR family transcriptional regulator  29.44 
 
 		 207 aa  55.8  0.0000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.563014  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6428  transcriptional regulator, TetR family  30.15 
 
 		 217 aa  55.8  0.0000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3838  transcriptional regulator, TetR family  34.59 
 
 		 213 aa  55.1  0.0000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1741  transcriptional regulator, TetR family  29.25 
 
 		 307 aa  54.7  0.000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3060  TetR family transcriptional regulator  27.61 
 
 		 203 aa  54.7  0.000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0420  TetR family transcriptional regulator  25.71 
 
 		 215 aa  54.7  0.000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2496  TetR family transcriptional regulator  28.87 
 
 		 333 aa  53.9  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6443  transcriptional regulator, TetR family  25.35 
 
 		 202 aa  53.5  0.000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4298  TetR family transcriptional regulator  24.76 
 
 		 197 aa  53.5  0.000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0688  TetR family transcriptional regulator  36.45 
 
 		 206 aa  53.5  0.000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.987458 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0242  transcriptional regulator, TetR family  30.77 
 
 		 197 aa  53.1  0.000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4916  hypothetical protein  38.14 
 
 		 221 aa  53.1  0.000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.195255  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3164  transcriptional regulator, TetR family  31.58 
 
 		 208 aa  52.8  0.000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.859639  normal  0.0513104 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6361  transcriptional regulator, TetR family  29.73 
 
 		 229 aa  52.8  0.000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.529564  normal  0.439154 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1653  TetR family transcriptional regulator  27.35 
 
 		 248 aa  52.8  0.000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0999952  normal  0.0709901 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0999  transcriptional regulator, TetR family  26.17 
 
 		 204 aa  52.4  0.000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.372995  normal  0.0457994 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3894  regulatory protein TetR  30.69 
 
 		 206 aa  52.4  0.000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2260  regulatory protein TetR  25.24 
 
 		 199 aa  52  0.000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.535255  normal  0.350629 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6363  transcriptional regulator, TetR family  30.88 
 
 		 222 aa  51.2  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.318357 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2604  transcriptional regulator, TetR family  26.14 
 
 		 195 aa  52  0.00001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4105  transcriptional regulator, TetR family  29.69 
 
 		 232 aa  51.2  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3613  putative transcriptional regulator, TetR family  32.99 
 
 		 221 aa  50.8  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2655  TetR family transcriptional regulator  27.36 
 
 		 226 aa  51.2  0.00002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5699  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 206 aa  51.2  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.393579  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6011  transcriptional regulator, TetR family  30.3 
 
 		 203 aa  50.1  0.00003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2591  transcriptional regulator, TetR family  29.59 
 
 		 192 aa  50.1  0.00003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.266738 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1062  TetR family transcriptional regulator  25.73 
 
 		 215 aa  49.7  0.00004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.453034  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1166  TetR family transcriptional regulator  30.07 
 
 		 278 aa  49.7  0.00004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0604682  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1142  transcriptional regulator, TetR family  30.47 
 
 		 260 aa  49.7  0.00004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2575  transcriptional regulator, TetR family  29.77 
 
 		 183 aa  49.3  0.00005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5476  TetR family transcriptional regulator  34.69 
 
 		 240 aa  49.3  0.00005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01162  transcription regulator, TetR family protein  30.39 
 
 		 201 aa  49.3  0.00006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2726  transcriptional regulator, TetR family  31.91 
 
 		 203 aa  48.9  0.00007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00544157 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4538  putative transcriptional regulator, TetR family  27.41 
 
 		 243 aa  48.9  0.00008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.530779  normal  0.432727 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2597  putative transcriptional regulator, TetR family  44.44 
 
 		 195 aa  48.1  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.607466 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0758  transcriptional regulator, TetR family  28.7 
 
 		 229 aa  48.5  0.0001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.685577  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00523  transcriptional regulator, TetR family protein  27.4 
 
 		 200 aa  48.5  0.0001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2464  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 193 aa  48.5  0.0001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.943089 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2636  TetR family transcriptional regulator  34.74 
 
 		 196 aa  47.8  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2681  TetR family transcriptional regulator  34.74 
 
 		 196 aa  47.8  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.160159 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4572  TetR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 234 aa  47.4  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.224675 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2665  TetR family transcriptional regulator  34.74 
 
 		 196 aa  47.8  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3200  TetR family transcriptional regulator  23.08 
 
 		 232 aa  47.4  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7950  putative transcriptional regulator, TetR family  30.56 
 
 		 218 aa  47  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0325  TetR family transcriptional regulator  32.73 
 
 		 237 aa  47  0.0003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3205  TetR family transcriptional regulator  34.88 
 
 		 197 aa  47  0.0003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0060  TetR family transcriptional regulator  25.47 
 
 		 247 aa  47  0.0003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3267  TetR family transcriptional regulator  34.88 
 
 		 197 aa  47  0.0003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0261097  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3216  TetR family transcriptional regulator  34.88 
 
 		 197 aa  47  0.0003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.278224  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2132  TetR family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 231 aa  47  0.0003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.273159  normal  0.36697 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2955  TetR family transcriptional regulator  31.07 
 
 		 203 aa  47  0.0003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0424  TetR family transcriptional regulator  29.1 
 
 		 200 aa  46.6  0.0003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0868  transcriptional regulator, TetR family  27.71 
 
 		 230 aa  46.6  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.200185 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23170  transcriptional regulator, TetR family  30.81 
 
 		 206 aa  46.6  0.0004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.946487  normal  0.100375 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2214  transcriptional regulator, TetR family  35.35 
 
 		 195 aa  46.6  0.0004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4596  transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 421 aa  46.2  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.227831  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2539  transcriptional regulator, TetR family  30.33 
 
 		 196 aa  46.2  0.0005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3038  TetR family transcriptional regulator  33.93 
 
 		 186 aa  45.8  0.0006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.815569  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0017  TetR family transcriptional regulator  32.76 
 
 		 235 aa  46.2  0.0006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.731504 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21120  transcriptional regulator  28.43 
 
 		 203 aa  45.8  0.0006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2610  TetR family transcriptional regulator  39.29 
 
 		 207 aa  45.8  0.0007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.965658  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2654  TetR family transcriptional regulator  39.29 
 
 		 207 aa  45.8  0.0007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.569555  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2640  TetR family transcriptional regulator  39.29 
 
 		 207 aa  45.8  0.0007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0005  TetR family transcriptional regulator  33.77 
 
 		 195 aa  45.4  0.0008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0931339  normal  0.381518 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1053  TetR family transcriptional regulator  39.29 
 
 		 255 aa  45.4  0.0008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.65463  normal  0.0546108 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1856  transcriptional regulator, TetR family  34 
 
 		 222 aa  45.4  0.0008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.906441  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3240  TetR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 209 aa  45.4  0.0009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4146  transcriptional regulator, TetR family  29.5 
 
 		 246 aa  45.4  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5107  TetR family transcriptional regulator  33.75 
 
 		 225 aa  45.4  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.346129  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3296  transcriptional regulator, TetR family  38.89 
 
 		 200 aa  44.7  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.791383 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5718  transcriptional regulator, TetR family  34.69 
 
 		 212 aa  45.1  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.283499  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2596  transcriptional regulator, TetR family  29.36 
 
 		 221 aa  45.1  0.001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.269859  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>