More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_5283 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_5283  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 184 aa  359  1e-98  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.729406  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0930  transcriptional regulator, TetR family  53.76 
 
 		 194 aa  184  9e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0302  putative transcriptional regulator, TetR family  59.46 
 
 		 195 aa  181  4.0000000000000006e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.475945  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2636  TetR family transcriptional regulator  52.66 
 
 		 196 aa  158  4e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2681  TetR family transcriptional regulator  52.66 
 
 		 196 aa  158  4e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.160159 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2665  TetR family transcriptional regulator  52.66 
 
 		 196 aa  158  4e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5083  regulatory protein TetR  49.46 
 
 		 184 aa  156  1e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.749425  normal  0.163121 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5162  transcriptional regulator, TetR family  48.17 
 
 		 193 aa  151  5.9999999999999996e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.134912  normal  0.642196 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0827  transcriptional regulator, TetR family  49.46 
 
 		 200 aa  141  7e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21120  transcriptional regulator  40.54 
 
 		 203 aa  134  6.0000000000000005e-31  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1425  TetR family transcriptional regulator  34.39 
 
 		 208 aa  90.5  1e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2604  transcriptional regulator, TetR family  34.66 
 
 		 195 aa  85.9  3e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0242  transcriptional regulator, TetR family  37.72 
 
 		 197 aa  84.7  7e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3984  transcriptional regulator, TetR family  30.46 
 
 		 200 aa  84  0.000000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.562971  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2172  transcriptional regulator, TetR family  26.84 
 
 		 199 aa  83.6  0.000000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5095  transcriptional regulator, TetR family  30.81 
 
 		 200 aa  81.3  0.000000000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.666558  normal  0.638711 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4523  TetR family transcriptional regulator  35.8 
 
 		 216 aa  80.5  0.00000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.382743 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6443  transcriptional regulator, TetR family  28.9 
 
 		 202 aa  79.3  0.00000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1375  regulatory protein TetR  30.65 
 
 		 199 aa  79  0.00000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.852149 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4298  TetR family transcriptional regulator  29.07 
 
 		 197 aa  79  0.00000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0999  transcriptional regulator, TetR family  30.51 
 
 		 204 aa  78.2  0.00000000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.372995  normal  0.0457994 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0868  transcriptional regulator, TetR family  36.36 
 
 		 230 aa  76.6  0.0000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.200185 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1653  TetR family transcriptional regulator  32.97 
 
 		 248 aa  75.9  0.0000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0999952  normal  0.0709901 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5132  transcriptional regulator, TetR family  34.66 
 
 		 214 aa  75.1  0.0000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.493019  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1586  transcriptional regulator, TetR family  26.04 
 
 		 197 aa  74.7  0.0000000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.66794  normal  0.155541 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2260  regulatory protein TetR  25.7 
 
 		 199 aa  74.3  0.0000000000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.535255  normal  0.350629 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4491  transcriptional regulator, TetR family  33.63 
 
 		 209 aa  72  0.000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.573623 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4024  TetR family transcriptional regulator  35.26 
 
 		 207 aa  70.1  0.00000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.563014  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2830  transcriptional regulator, TetR family  31.79 
 
 		 208 aa  69.3  0.00000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.514088 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3929  TetR family transcriptional regulator  32.8 
 
 		 210 aa  68.9  0.00000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.459326  normal  0.170288 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2496  TetR family transcriptional regulator  36.94 
 
 		 333 aa  68.6  0.00000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1741  transcriptional regulator, TetR family  36.94 
 
 		 307 aa  68.2  0.00000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6011  transcriptional regulator, TetR family  28.83 
 
 		 203 aa  67  0.0000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1062  TetR family transcriptional regulator  30.49 
 
 		 215 aa  66.2  0.0000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.453034  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2708  regulatory protein TetR  31.09 
 
 		 228 aa  65.1  0.0000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.855326  normal  0.333826 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3060  TetR family transcriptional regulator  29.38 
 
 		 203 aa  64.3  0.0000000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0420  TetR family transcriptional regulator  28.81 
 
 		 215 aa  64.7  0.0000000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1709  transcriptional regulator, TetR family  31.52 
 
 		 207 aa  64.3  0.0000000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.17641  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2935  transcriptional regulator, TetR family  30.57 
 
 		 208 aa  63.9  0.000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.309221  normal  0.0172625 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3010  transcriptional regulator, TetR family  30.95 
 
 		 196 aa  63.9  0.000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.798857 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4343  regulatory protein TetR  30.23 
 
 		 196 aa  63.5  0.000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.817011  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2539  transcriptional regulator, TetR family  31.43 
 
 		 196 aa  62.8  0.000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1369  TetR family transcriptional regulator  28.85 
 
 		 208 aa  62  0.000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1278  TetR family transcriptional regulator  29.24 
 
 		 191 aa  62  0.000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.190846  normal  0.885926 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0468  putative transcriptional regulator, TetR family  43.37 
 
 		 319 aa  62  0.000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0983  TetR family transcriptional regulator  28.07 
 
 		 212 aa  61.2  0.000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1001  TetR family transcriptional regulator  28.07 
 
 		 212 aa  61.2  0.000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.735096  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1011  TetR family transcriptional regulator  28.07 
 
 		 212 aa  61.2  0.000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.632644 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1561  TetR family transcriptional regulator  33.94 
 
 		 219 aa  60.5  0.00000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2518  transcriptional regulator, TetR family  34.81 
 
 		 191 aa  59.7  0.00000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0208752  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1242  TetR family transcriptional regulator  29.9 
 
 		 212 aa  59.7  0.00000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000053734  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2716  TetR family transcriptional regulator  30.93 
 
 		 212 aa  59.7  0.00000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.448471  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20170  hypothetical protein  35.48 
 
 		 108 aa  59.3  0.00000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0847124  normal  0.0246462 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0764  TetR family transcriptional regulator  28.16 
 
 		 203 aa  58.9  0.00000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0005262  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6361  transcriptional regulator, TetR family  30.18 
 
 		 229 aa  58.9  0.00000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.529564  normal  0.439154 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2974  TetR family transcriptional regulator  28.35 
 
 		 209 aa  57.8  0.00000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2448  TetR family transcriptional regulator  23.84 
 
 		 204 aa  57.4  0.0000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0199857  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0845  regulatory protein, TetR  35.06 
 
 		 188 aa  57.4  0.0000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.864607  normal  0.151441 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4105  transcriptional regulator, TetR family  31.93 
 
 		 232 aa  57.4  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4916  hypothetical protein  34.01 
 
 		 221 aa  57.4  0.0000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.195255  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3198  TetR family transcriptional regulator  26.24 
 
 		 215 aa  56.6  0.0000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00193732  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5699  TetR family transcriptional regulator  35.03 
 
 		 206 aa  56.6  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.393579  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10695  TetR family transcriptional regulator  27.49 
 
 		 218 aa  56.6  0.0000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2233  transcriptional regulator, TetR family  29.89 
 
 		 196 aa  57  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.943574  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0855  transcriptional regulator, TetR family  34.26 
 
 		 244 aa  56.6  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0688  TetR family transcriptional regulator  33.75 
 
 		 206 aa  56.2  0.0000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.987458 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2994  TetR family transcriptional regulator  27.59 
 
 		 197 aa  55.8  0.0000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.383158  normal  0.27329 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0170  TetR family transcriptional regulator  26.74 
 
 		 203 aa  56.2  0.0000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2190  TetR family transcriptional regulator  24.74 
 
 		 223 aa  56.2  0.0000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1231  transcriptional regulator, TetR family  32.81 
 
 		 212 aa  55.8  0.0000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.814793  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0174  TetR family transcriptional regulator  27.16 
 
 		 203 aa  55.5  0.0000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.22854 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1537  TetR family transcriptional regulator  28.42 
 
 		 257 aa  55.5  0.0000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0262  transcriptional regulator, TetR family  29.89 
 
 		 199 aa  55.5  0.0000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.670528 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0325  TetR family transcriptional regulator  28.07 
 
 		 237 aa  54.7  0.0000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4185  TetR family transcriptional regulator  26.74 
 
 		 203 aa  54.7  0.0000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5079  TetR family transcriptional regulator  27.49 
 
 		 192 aa  54.7  0.0000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.925622 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1596  hypothetical protein  31.4 
 
 		 205 aa  53.9  0.000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0318645  normal  0.570188 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0354  TetR family transcriptional regulator  35.24 
 
 		 214 aa  53.9  0.000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.774788 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1929  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 206 aa  53.9  0.000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4250  transcriptional regulator, TetR family  32.77 
 
 		 194 aa  53.1  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.229004  normal  0.19782 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1405  transcriptional regulator, TetR family  33.75 
 
 		 212 aa  53.5  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.408275 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1336  TetR family transcriptional regulator  22.56 
 
 		 200 aa  53.1  0.000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00010036 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5718  transcriptional regulator, TetR family  30.68 
 
 		 212 aa  53.1  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.283499  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3204  TetR family transcriptional regulator  32.03 
 
 		 211 aa  53.1  0.000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.109794  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6363  transcriptional regulator, TetR family  31.93 
 
 		 222 aa  52.8  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.318357 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0395  transcriptional regulator  29.27 
 
 		 175 aa  52.8  0.000003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6428  transcriptional regulator, TetR family  30.54 
 
 		 217 aa  52.8  0.000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2900  transcriptional regulator, TetR family  29.59 
 
 		 201 aa  52.4  0.000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4675  regulatory protein TetR  29.89 
 
 		 190 aa  52.4  0.000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4083  transcriptional regulator, TetR family  26.16 
 
 		 203 aa  52  0.000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4671  TetR family transcriptional regulator  33.57 
 
 		 206 aa  52  0.000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.235627  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1597  putative transcriptional regulator, TetR family  31.61 
 
 		 174 aa  52  0.000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2955  TetR family transcriptional regulator  25.61 
 
 		 203 aa  52  0.000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1958  putative transcriptional regulator, TetR family  27.38 
 
 		 208 aa  52  0.000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.158698  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4558  TetR family transcriptional regulator  27.5 
 
 		 184 aa  51.6  0.000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2655  TetR family transcriptional regulator  25.86 
 
 		 226 aa  51.6  0.000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4646  TetR family transcriptional regulator  27.5 
 
 		 184 aa  51.6  0.000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.874384  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0252  transcriptional regulator  29.12 
 
 		 224 aa  51.6  0.000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2354  TetR family transcriptional regulator  30.23 
 
 		 205 aa  51.6  0.000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0147944  normal  0.332572 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3091  TetR family transcriptional regulator  35 
 
 		 224 aa  51.6  0.000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>