216 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_1278 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008726  Mvan_1278  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 191 aa  390  1e-108  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.190846  normal  0.885926 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5079  TetR family transcriptional regulator  89.06 
 
 		 192 aa  352  2e-96  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.925622 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0983  TetR family transcriptional regulator  85.95 
 
 		 212 aa  330  6e-90  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1001  TetR family transcriptional regulator  85.95 
 
 		 212 aa  330  6e-90  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.735096  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1011  TetR family transcriptional regulator  85.95 
 
 		 212 aa  330  6e-90  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.632644 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10695  TetR family transcriptional regulator  80 
 
 		 218 aa  307  5.9999999999999995e-83  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3042  transcriptional regulator, TetR family  39.88 
 
 		 202 aa  99.8  2e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.578311 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5140  transcriptional regulator, putative  33.33 
 
 		 185 aa  95.9  4e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4831  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 185 aa  94.7  7e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4730  TetR family transcriptional regulator  33.14 
 
 		 182 aa  94.4  8e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4873  transcriptional regulator  33.33 
 
 		 182 aa  94  1e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4715  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 185 aa  94  1e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5244  transcriptional regulator  33.33 
 
 		 182 aa  94  1e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5113  putative transcriptional regulator  33.33 
 
 		 182 aa  94  1e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3147  regulatory protein TetR  33.55 
 
 		 183 aa  93.2  2e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5145  putative transcriptional regulator  32.72 
 
 		 182 aa  91.7  6e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.733226  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5151  transcriptional regulator, TetR family  32.72 
 
 		 185 aa  88.2  6e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.687993  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1142  transcriptional regulator, TetR family  33.54 
 
 		 206 aa  85.9  4e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.759817  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0714  transcriptional regulator, TetR family  38.75 
 
 		 197 aa  83.2  0.000000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.113218 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4405  hypothetical protein  32.93 
 
 		 205 aa  80.1  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00842342 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4461  transcriptional regulator, TetR family  38.41 
 
 		 183 aa  78.2  0.00000000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4231  regulatory protein TetR  31.14 
 
 		 188 aa  74.3  0.000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00970  transcriptional regulator, tetR family  31.74 
 
 		 195 aa  73.9  0.000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2788  transcriptional regulator, TetR family  30.34 
 
 		 191 aa  72.4  0.000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1480  hypothetical protein  29.76 
 
 		 190 aa  72  0.000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.473033  normal  0.172398 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0128  TetR family transcriptional regulator  27.47 
 
 		 191 aa  70.5  0.00000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5854  hypothetical protein  31.28 
 
 		 190 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2000  transcriptional regulator, TetR family  28.74 
 
 		 189 aa  68.9  0.00000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.564621  normal  0.698036 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19390  transcriptional regulator, tetR family  31.25 
 
 		 189 aa  68.2  0.00000000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0927  putative transcriptional regulator, TetR family  32.8 
 
 		 194 aa  68.2  0.00000000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.594816 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5162  transcriptional regulator, TetR family  30.41 
 
 		 193 aa  67.8  0.00000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.134912  normal  0.642196 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5284  hypothetical protein  31.33 
 
 		 189 aa  65.9  0.0000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.325627 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2085  regulatory protein TetR  29.03 
 
 		 194 aa  65.9  0.0000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0930  transcriptional regulator, TetR family  23.86 
 
 		 194 aa  62  0.000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0578  TetR family transcriptional regulator  44.16 
 
 		 267 aa  60.8  0.00000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5283  transcriptional regulator, TetR family  28.99 
 
 		 184 aa  59.7  0.00000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.729406  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2636  TetR family transcriptional regulator  31.29 
 
 		 196 aa  59.3  0.00000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2681  TetR family transcriptional regulator  31.29 
 
 		 196 aa  59.3  0.00000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.160159 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2665  TetR family transcriptional regulator  31.29 
 
 		 196 aa  59.3  0.00000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1945  putative transcriptional regulator, TetR family  38.38 
 
 		 268 aa  59.3  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.951149  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1793  TetR family transcriptional regulator  28.42 
 
 		 216 aa  58.9  0.00000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0468  putative transcriptional regulator, TetR family  30.23 
 
 		 319 aa  58.2  0.00000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7540  putative transcriptional regulator, TetR family  30 
 
 		 197 aa  57  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.739082 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3125  TetR family transcriptional regulator  26.86 
 
 		 202 aa  56.2  0.0000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.328687  normal  0.85949 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4198  TetR family transcriptional regulator  26.63 
 
 		 191 aa  56.2  0.0000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000131779  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6363  transcriptional regulator, TetR family  29.02 
 
 		 222 aa  55.5  0.0000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.318357 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4140  transcriptional regulator, TetR family  31.14 
 
 		 240 aa  55.1  0.0000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0827  transcriptional regulator, TetR family  29.53 
 
 		 200 aa  55.1  0.0000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0302  putative transcriptional regulator, TetR family  26.14 
 
 		 195 aa  55.1  0.0000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.475945  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6361  transcriptional regulator, TetR family  26.67 
 
 		 229 aa  54.7  0.0000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.529564  normal  0.439154 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6384  putative transcriptional regulator, TetR family  32.76 
 
 		 224 aa  53.9  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.317451  normal  0.404992 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5083  regulatory protein TetR  28.66 
 
 		 184 aa  53.9  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.749425  normal  0.163121 
 
 
-
 
NC_009341  Mflv_5603  TetR family transcriptional regulator  28.05 
 
 		 231 aa  53.1  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.011293  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0039  transcriptional regulator, TetR family  36.17 
 
 		 202 aa  53.1  0.000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1243  TetR family transcriptional regulator  32.5 
 
 		 229 aa  52.8  0.000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.176443 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2879  regulatory protein TetR  35.85 
 
 		 226 aa  53.1  0.000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6218  TetR family transcriptional regulator  40.51 
 
 		 278 aa  52.8  0.000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.480822 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3462  regulatory protein TetR  42.25 
 
 		 221 aa  52.4  0.000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0249959  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21120  transcriptional regulator  26.88 
 
 		 203 aa  51.6  0.000006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4098  TetR family transcriptional regulator  46.27 
 
 		 315 aa  52  0.000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0408  transcriptional regulator, TetR family  46.94 
 
 		 212 aa  51.6  0.000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.431467 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6521  putative transcriptional regulator, TetR family  37 
 
 		 210 aa  51.6  0.000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.177383 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2337  transcriptional regulator, TetR family  38.53 
 
 		 218 aa  51.6  0.000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6164  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 285 aa  51.6  0.000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.406893 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1898  transcriptional regulator, TetR family  26.75 
 
 		 225 aa  50.8  0.00001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00182667  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6464  putative transcriptional regulator, TetR family  44.62 
 
 		 245 aa  50.4  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0682753 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0701  TetR family transcriptional regulator  27.62 
 
 		 261 aa  49.3  0.00003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.684816  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1119  transcriptional regulator, TetR family  31.63 
 
 		 211 aa  49.3  0.00003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.335801 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0017  TetR family transcriptional regulator  24.67 
 
 		 235 aa  49.7  0.00003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.731504 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0837  transcriptional regulator, TetR family  33.65 
 
 		 238 aa  49.3  0.00003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.895795  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2172  transcriptional regulator, TetR family  21.67 
 
 		 199 aa  49.3  0.00003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2285  transcriptional regulator, TetR family  29 
 
 		 213 aa  48.9  0.00004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1997  TetR family transcriptional regulator  33.67 
 
 		 250 aa  48.5  0.00005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.354177  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2539  transcriptional regulator, TetR family  25.95 
 
 		 196 aa  48.9  0.00005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2637  putative transcriptional regulator, TetR family  32.35 
 
 		 220 aa  48.5  0.00006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.000568428  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10666  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 		 231 aa  48.1  0.00007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000329516  normal  0.389268 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4523  TetR family transcriptional regulator  26.38 
 
 		 216 aa  48.1  0.00007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.382743 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19280  transcriptional regulator  45.45 
 
 		 235 aa  48.1  0.00008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.28299  normal  0.286722 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8893  transcriptional regulator, TetR family  40.58 
 
 		 272 aa  48.1  0.00008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2394  transcriptional regulator, TetR family  26.39 
 
 		 235 aa  47.8  0.00009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0168964  decreased coverage  0.00129293 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3200  TetR family transcriptional regulator  25.37 
 
 		 232 aa  47.8  0.00009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2840  transcriptional regulator, TetR family  24.52 
 
 		 238 aa  47.8  0.00009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1314  TetR family transcriptional regulator  22.64 
 
 		 224 aa  47.8  0.0001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.6037  normal  0.969851 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5476  TetR family transcriptional regulator  26.9 
 
 		 240 aa  47.4  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7060  tetracycline repressor domain-containing protein  53.49 
 
 		 203 aa  47.4  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0598818  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2572  transcriptional regulator, TetR family  29.82 
 
 		 239 aa  47.8  0.0001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.314261  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0628  transcriptional regulator, TetR family  34.38 
 
 		 218 aa  47.8  0.0001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.504351 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0252  transcriptional regulator, TetR family  46.15 
 
 		 221 aa  47  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4938  regulatory protein, TetR  28.03 
 
 		 222 aa  47  0.0002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  0.0214473 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7073  transcriptional regulator, TetR family  30.43 
 
 		 248 aa  47  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.672487  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3927  transcriptional regulator, TetR family  28.25 
 
 		 218 aa  46.6  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.69466  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2480  transcriptional regulator, TetR family  34.72 
 
 		 221 aa  47  0.0002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0883171  normal  0.233137 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35360  transcriptional regulator  25.36 
 
 		 250 aa  46.6  0.0002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4294  transcriptional regulator, GntR family  47.06 
 
 		 343 aa  46.6  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.806766 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2683  TetR family transcriptional regulator  37.7 
 
 		 218 aa  47  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3164  transcriptional regulator, TetR family  25.75 
 
 		 208 aa  46.6  0.0002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.859639  normal  0.0513104 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2190  TetR family transcriptional regulator  21.35 
 
 		 223 aa  46.6  0.0002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3892  transcriptional regulator, TetR family  26.43 
 
 		 211 aa  46.6  0.0002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0036  putative transcriptional regulator, TetR family  29.17 
 
 		 234 aa  46.2  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.940738 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2110  TetR family transcriptional regulator  25.86 
 
 		 218 aa  45.8  0.0003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.722857  normal  0.248102 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>