66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_0714 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012669  Bcav_0714  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 197 aa  371  1e-102  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.113218 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3042  transcriptional regulator, TetR family  47.06 
 
 		 202 aa  142  4e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.578311 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3147  regulatory protein TetR  42.86 
 
 		 183 aa  136  2e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00970  transcriptional regulator, tetR family  42.78 
 
 		 195 aa  122  4e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2788  transcriptional regulator, TetR family  40.1 
 
 		 191 aa  115  3e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4461  transcriptional regulator, TetR family  43.23 
 
 		 183 aa  113  2.0000000000000002e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1142  transcriptional regulator, TetR family  41.4 
 
 		 206 aa  110  2.0000000000000002e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.759817  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2085  regulatory protein TetR  38.58 
 
 		 194 aa  106  2e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0927  putative transcriptional regulator, TetR family  45.55 
 
 		 194 aa  105  3e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.594816 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5140  transcriptional regulator, putative  32.45 
 
 		 185 aa  105  6e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4831  TetR family transcriptional regulator  31.41 
 
 		 185 aa  104  7e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4405  hypothetical protein  37.99 
 
 		 205 aa  103  1e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00842342 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2000  transcriptional regulator, TetR family  37.43 
 
 		 189 aa  103  1e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.564621  normal  0.698036 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5151  transcriptional regulator, TetR family  31.94 
 
 		 185 aa  102  4e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.687993  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4715  TetR family transcriptional regulator  31.41 
 
 		 185 aa  102  5e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5113  putative transcriptional regulator  31.91 
 
 		 182 aa  102  5e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4730  TetR family transcriptional regulator  31.38 
 
 		 182 aa  100  2e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5145  putative transcriptional regulator  31.38 
 
 		 182 aa  99.4  3e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.733226  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1278  TetR family transcriptional regulator  38.95 
 
 		 191 aa  99.8  3e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.190846  normal  0.885926 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4873  transcriptional regulator  31.38 
 
 		 182 aa  99  4e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5244  transcriptional regulator  31.38 
 
 		 182 aa  99  4e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5284  hypothetical protein  40.84 
 
 		 189 aa  97.8  9e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.325627 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1011  TetR family transcriptional regulator  37.3 
 
 		 212 aa  95.9  4e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.632644 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0983  TetR family transcriptional regulator  37.3 
 
 		 212 aa  95.9  4e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1001  TetR family transcriptional regulator  37.3 
 
 		 212 aa  95.9  4e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.735096  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5854  hypothetical protein  36.02 
 
 		 190 aa  94.7  7e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5079  TetR family transcriptional regulator  37.7 
 
 		 192 aa  93.6  1e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.925622 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10695  TetR family transcriptional regulator  38.41 
 
 		 218 aa  92.8  3e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4231  regulatory protein TetR  37.77 
 
 		 188 aa  91.7  6e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1480  hypothetical protein  33.33 
 
 		 190 aa  90.5  1e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.473033  normal  0.172398 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19390  transcriptional regulator, tetR family  38.1 
 
 		 189 aa  83.6  0.000000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0128  TetR family transcriptional regulator  24.46 
 
 		 191 aa  80.5  0.00000000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4198  TetR family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 191 aa  73.9  0.000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000131779  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2518  transcriptional regulator, TetR family  31.25 
 
 		 191 aa  55.1  0.0000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0208752  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2709  regulatory protein TetR  33.53 
 
 		 192 aa  53.5  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2637  putative transcriptional regulator, TetR family  30.67 
 
 		 220 aa  52.4  0.000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.000568428  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1793  TetR family transcriptional regulator  27.38 
 
 		 216 aa  50.1  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6361  transcriptional regulator, TetR family  29.23 
 
 		 229 aa  49.3  0.00004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.529564  normal  0.439154 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1631  transcriptional regulator  31.91 
 
 		 190 aa  46.6  0.0002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.0987628 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1382  TetR family transcriptional regulator  35.92 
 
 		 205 aa  45.1  0.0006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1596  hypothetical protein  31.25 
 
 		 205 aa  45.1  0.0006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0318645  normal  0.570188 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0092  transcriptional regulator, TetR family  42.42 
 
 		 210 aa  45.1  0.0007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.367108  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0073  TetR family transcriptional regulator  42.42 
 
 		 210 aa  44.7  0.0008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21120  transcriptional regulator  25.43 
 
 		 203 aa  44.7  0.001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1898  transcriptional regulator, TetR family  34.69 
 
 		 225 aa  43.9  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00182667  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2453  transcriptional regulator, TetR family  40.98 
 
 		 223 aa  43.9  0.001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.106386  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0240  TetR family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 281 aa  43.5  0.002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.679484 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6521  putative transcriptional regulator, TetR family  29.41 
 
 		 210 aa  43.5  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.177383 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6363  transcriptional regulator, TetR family  32.11 
 
 		 222 aa  43.5  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.318357 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0039  transcriptional regulator, TetR family  25.95 
 
 		 202 aa  42.7  0.003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2169  TetR family transcriptional regulator  32.08 
 
 		 205 aa  43.1  0.003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0813077  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0104  TetR family transcriptional regulator  33.66 
 
 		 207 aa  43.1  0.003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000192911 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0827  transcriptional regulator, TetR family  27.11 
 
 		 200 aa  42.7  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1243  TetR family transcriptional regulator  30.82 
 
 		 229 aa  42.4  0.004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.176443 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2089  transcriptional regulator, TetR family  34.69 
 
 		 220 aa  42.7  0.004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0021127  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3125  TetR family transcriptional regulator  26.92 
 
 		 202 aa  42.7  0.004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.328687  normal  0.85949 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3639  transcriptional regulator, TetR family  34.31 
 
 		 234 aa  42.4  0.004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0039  transcriptional regulator  28.66 
 
 		 233 aa  42.7  0.004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4938  regulatory protein, TetR  31.86 
 
 		 222 aa  42.7  0.004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  0.0214473 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3581  TetR family transcriptional regulator  30.88 
 
 		 209 aa  42.4  0.005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4140  transcriptional regulator, TetR family  37.25 
 
 		 240 aa  41.6  0.007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1643  TetR family transcriptional regulator  30.5 
 
 		 205 aa  41.6  0.008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.420046  normal  0.359135 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2830  transcriptional regulator, TetR family  31.37 
 
 		 208 aa  41.6  0.008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.514088 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2708  regulatory protein TetR  31.37 
 
 		 228 aa  41.6  0.008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.855326  normal  0.333826 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0730  TetR family transcriptional regulator  47.92 
 
 		 242 aa  41.6  0.008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00296779  normal  0.0851548 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0014  TetR family transcriptional regulator  30.5 
 
 		 205 aa  41.6  0.008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>