More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maqu_3581 on replicon NC_008740
Organism: Marinobacter aquaeolei VT8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008740  Maqu_3581  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 209 aa  427  1e-119  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0199  transcriptional regulator, TetR family  42.65 
 
 		 202 aa  164  1.0000000000000001e-39  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.251087  normal  0.943452 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3765  TetR family transcriptional regulator  44.55 
 
 		 213 aa  161  6e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0357958 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12440  AcrR family transcriptional regulator  45.63 
 
 		 215 aa  160  1e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.446651  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1135  putative transcriptional regulator  45.63 
 
 		 215 aa  160  2e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.135048  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3984  transcriptional regulator, TetR family  40.59 
 
 		 216 aa  155  5.0000000000000005e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.765993  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1018  transcriptional regulator, TetR family  40.1 
 
 		 205 aa  149  3e-35  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03806  transcriptional regulator, TetR family  39.71 
 
 		 206 aa  148  5e-35  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0651  TetR family transcriptional regulator  40.89 
 
 		 218 aa  143  2e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  decreased coverage  0.0025795  normal  0.249536 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2697  transcriptional regulator, TetR family  42.02 
 
 		 195 aa  139  3e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0366203  normal  0.310239 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5945  regulatory protein, TetR  41.21 
 
 		 216 aa  137  2e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.542251  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6435  TetR family transcriptional regulator  34.39 
 
 		 262 aa  115  6e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.253012  normal  0.0353997 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1320  transcriptional regulator, TetR family  33.82 
 
 		 224 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1826  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 250 aa  95.1  7e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0995188  normal  0.24055 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6871  TetR family transcriptional regulator  32.84 
 
 		 224 aa  92.8  3e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.405099  normal  0.0580493 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4737  TetR family transcriptional regulator  33.01 
 
 		 224 aa  89.4  4e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4138  TetR family transcriptional regulator  33.82 
 
 		 224 aa  82.8  0.000000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2583  TetR family transcriptional regulator  32.6 
 
 		 226 aa  82  0.000000000000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.176518 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3206  TetR family transcriptional regulator  32.23 
 
 		 227 aa  76.3  0.0000000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16270  transcriptional regulator  27.95 
 
 		 287 aa  64.3  0.000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1381  transcriptional regulator, TetR family  26.88 
 
 		 184 aa  62.4  0.000000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.419771  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2628  transcriptional regulator, TetR family  26.88 
 
 		 194 aa  62.4  0.000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00732346  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1592  transcriptional regulator, TetR family  26.7 
 
 		 198 aa  61.2  0.00000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1401  TetR family transcriptional regulator  23.81 
 
 		 222 aa  60.8  0.00000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.513329  normal  0.505278 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0828  transcriptional regulator, TetR family  26.19 
 
 		 195 aa  60.5  0.00000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6365  putative transcriptional regulator, TetR family  39.33 
 
 		 210 aa  60.5  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.277737  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1623  transcriptional regulator, TetR family  20.59 
 
 		 205 aa  58.9  0.00000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2036  regulatory protein, TetR  37.08 
 
 		 206 aa  58.9  0.00000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.284785 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3500  TetR family transcriptional regulator  23.59 
 
 		 191 aa  58.9  0.00000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00541119  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1848  TetR family transcriptional regulator  27.62 
 
 		 210 aa  58.9  0.00000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3431  transcriptional regulator, TetR family  27.54 
 
 		 189 aa  57.8  0.0000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3022  TetR family transcriptional regulator  26.46 
 
 		 233 aa  57  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0873  TetR family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 196 aa  57  0.0000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.682179 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6580  transcriptional regulator, TetR family  32.58 
 
 		 242 aa  57  0.0000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.603144 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3221  TetR family transcriptional regulator  23.68 
 
 		 232 aa  56.6  0.0000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1515  putative transcriptional regulator, TetR family  28.4 
 
 		 219 aa  56.2  0.0000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.254086  hitchhiker  0.00363064 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6827  putative transcriptional regulator, TetR family  28.36 
 
 		 200 aa  55.8  0.0000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0995041 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1591  TetR family transcriptional regulator  27.16 
 
 		 215 aa  55.1  0.0000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.194821 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3748  TetR family transcriptional regulator  25.93 
 
 		 275 aa  55.1  0.0000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1848  transcriptional regulator, TetR family  36.25 
 
 		 190 aa  55.1  0.0000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00246548 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1571  TetR family transcriptional regulator  24.7 
 
 		 201 aa  55.1  0.0000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.038411 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11350  transcriptional regulator  30 
 
 		 220 aa  55.1  0.0000008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1941  transcriptional regulator, TetR family  24.74 
 
 		 194 aa  54.7  0.0000009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000874649  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3836  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 		 246 aa  54.7  0.000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.487675  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4353  TetR family transcriptional regulator  24.2 
 
 		 195 aa  54.3  0.000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0184  TetR family transcriptional regulator  32.39 
 
 		 335 aa  53.9  0.000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000505732  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1428  TetR family transcriptional regulator  28.97 
 
 		 204 aa  54.3  0.000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.530378  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4533  TetR family transcriptional regulator  25.71 
 
 		 218 aa  54.7  0.000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.505005  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2723  transcriptional regulator, TetR family  27.18 
 
 		 224 aa  53.9  0.000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0252111  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4652  TetR family transcriptional regulator  25.64 
 
 		 195 aa  53.9  0.000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0808  TetR family transcriptional regulator  25.87 
 
 		 191 aa  53.5  0.000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.287096 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3412  TetR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 206 aa  53.5  0.000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.430092  normal  0.661157 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2565  transcriptional regulator, TetR family  36.36 
 
 		 248 aa  53.5  0.000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000000672076  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3059  TetR family transcriptional regulator  23.47 
 
 		 205 aa  53.5  0.000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4633  transcriptional regulator, TetR family  24.2 
 
 		 195 aa  53.1  0.000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.169287  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4421  TetR family transcriptional regulator  24.2 
 
 		 195 aa  53.1  0.000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4260  transcriptional regulator  24.2 
 
 		 195 aa  53.1  0.000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4272  transcriptional regulator  24.2 
 
 		 195 aa  53.1  0.000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4762  TetR family transcriptional regulator  24.2 
 
 		 195 aa  53.1  0.000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4637  transcriptional regulator, TetR family  24.2 
 
 		 195 aa  53.1  0.000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011721  PCC8801_4458  transcriptional regulator, TetR family  25.45 
 
 		 195 aa  52.8  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4653  transcriptional regulator, TetR family  24.2 
 
 		 195 aa  53.1  0.000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0602  transcriptional regulator, TetR family  24.05 
 
 		 195 aa  52.8  0.000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0053  transcriptional regulator, TetR family  29.41 
 
 		 188 aa  52.4  0.000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.573004  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6064  TetR family transcriptional regulator  34.44 
 
 		 192 aa  52.4  0.000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0944  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  38.1 
 
 		 217 aa  52.4  0.000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3225  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 195 aa  52.4  0.000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3459  TetR family transcriptional regulator  41.38 
 
 		 324 aa  52.8  0.000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000855252 
 
 
-
 
NC_003296  RS01892  transcription regulator protein  29.2 
 
 		 207 aa  52.4  0.000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00576188  normal  0.449964 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2367  TetR family transcriptional regulator  27.69 
 
 		 202 aa  52.4  0.000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.445055  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2807  regulatory protein TetR  24.64 
 
 		 202 aa  52.4  0.000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00102447  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1909  transcriptional regulator, TetR family  25.29 
 
 		 197 aa  52.4  0.000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2169  transcriptional regulator, TetR family  36.05 
 
 		 207 aa  52.4  0.000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.821962  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1006  TetR family transcriptional regulator  27.52 
 
 		 189 aa  52  0.000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0370  TetR family transcriptional regulator  23.28 
 
 		 223 aa  52.4  0.000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0234884  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4327  regulatory protein, TetR  31.9 
 
 		 182 aa  52  0.000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.809003  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2332  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 		 202 aa  52  0.000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0318  TetR family transcriptional regulator  27.89 
 
 		 198 aa  51.6  0.000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.701446 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1697  hypothetical protein  30.05 
 
 		 199 aa  52  0.000007  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.280342 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2656  transcriptional regulator, TetR family  24.53 
 
 		 212 aa  51.6  0.000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000478919  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0537  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  36.51 
 
 		 217 aa  51.6  0.000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.355505  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4414  transcriptional regulator, TetR family  31.29 
 
 		 419 aa  51.6  0.000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.617294  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0580  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  36.51 
 
 		 217 aa  51.6  0.000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0809226  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3604  TetR family transcriptional regulator  22.64 
 
 		 207 aa  51.6  0.000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.461648 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0754  TetR family transcriptional regulator  27.93 
 
 		 273 aa  51.6  0.000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1791  regulatory protein, TetR  34.15 
 
 		 246 aa  51.6  0.000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00350194  normal  0.153158 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0527  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  36.51 
 
 		 217 aa  51.6  0.000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0518  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  36.51 
 
 		 217 aa  51.6  0.000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.35266  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1039  TetR family transcriptional regulator  32.11 
 
 		 201 aa  51.6  0.000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.747573 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2698  TetR family transcriptional regulator  24.08 
 
 		 203 aa  51.2  0.00001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0737  transcriptional regulator, TetR family  35.56 
 
 		 209 aa  50.8  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0331  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 195 aa  50.8  0.00001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4666  TetR family transcriptional regulator  44.07 
 
 		 214 aa  50.8  0.00001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.441468  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0452  transcriptional regulator, TetR family  22.87 
 
 		 207 aa  50.8  0.00001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2109  TetR family transcriptional regulator  25.12 
 
 		 206 aa  51.2  0.00001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.901149 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3333  TetR family transcriptional regulator  28.19 
 
 		 201 aa  51.2  0.00001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0320  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 195 aa  50.8  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4589  TetR family transcriptional regulator  27.89 
 
 		 198 aa  51.2  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.447268  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1014  TetR family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 212 aa  51.2  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4024  TetR family transcriptional regulator  36.59 
 
 		 199 aa  51.2  0.00001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.497962  normal  0.530155 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>