More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_6435 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_6435  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 262 aa  493  9.999999999999999e-139  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.253012  normal  0.0353997 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0199  transcriptional regulator, TetR family  42.6 
 
 		 202 aa  152  7e-36  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.251087  normal  0.943452 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03806  transcriptional regulator, TetR family  41.26 
 
 		 206 aa  130  2.0000000000000002e-29  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3581  TetR family transcriptional regulator  35.75 
 
 		 209 aa  130  2.0000000000000002e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2697  transcriptional regulator, TetR family  45 
 
 		 195 aa  117  3e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0366203  normal  0.310239 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3984  transcriptional regulator, TetR family  36.76 
 
 		 216 aa  108  1e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.765993  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1018  transcriptional regulator, TetR family  36.28 
 
 		 205 aa  105  8e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12440  AcrR family transcriptional regulator  37.63 
 
 		 215 aa  103  4e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.446651  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1135  putative transcriptional regulator  37.63 
 
 		 215 aa  102  6e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.135048  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0651  TetR family transcriptional regulator  34.09 
 
 		 218 aa  102  8e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  decreased coverage  0.0025795  normal  0.249536 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3765  TetR family transcriptional regulator  36.6 
 
 		 213 aa  102  9e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0357958 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1320  transcriptional regulator, TetR family  34.53 
 
 		 224 aa  86.3  4e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5945  regulatory protein, TetR  33.71 
 
 		 216 aa  84  0.000000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.542251  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2583  TetR family transcriptional regulator  36.49 
 
 		 226 aa  78.6  0.0000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.176518 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6871  TetR family transcriptional regulator  34.53 
 
 		 224 aa  78.6  0.0000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.405099  normal  0.0580493 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1826  TetR family transcriptional regulator  34.08 
 
 		 250 aa  74.7  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0995188  normal  0.24055 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4737  TetR family transcriptional regulator  34.23 
 
 		 224 aa  73.2  0.000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0810  TetR family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 437 aa  65.9  0.0000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4138  TetR family transcriptional regulator  34.53 
 
 		 224 aa  64.3  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33190  transcriptional regulator  29.25 
 
 		 202 aa  62.8  0.000000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.284512  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1848  TetR family transcriptional regulator  29.36 
 
 		 210 aa  62.4  0.000000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2659  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 418 aa  62  0.000000008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3206  TetR family transcriptional regulator  34.68 
 
 		 227 aa  58.5  0.0000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1623  transcriptional regulator, TetR family  25.41 
 
 		 205 aa  58.2  0.0000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7768  putative transcriptional regulator, TetR family  30.82 
 
 		 194 aa  58.2  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2778  TetR family transcriptional regulator  21.24 
 
 		 205 aa  57.8  0.0000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16700  transcriptional regulator  27.1 
 
 		 211 aa  54.7  0.000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6030  transcriptional regulator TetR family  26.06 
 
 		 222 aa  54.7  0.000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2807  regulatory protein TetR  32.41 
 
 		 202 aa  53.5  0.000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00102447  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4061  TetR family transcriptional regulator  23.56 
 
 		 240 aa  53.5  0.000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0792  TetR family transcriptional regulator  25.98 
 
 		 212 aa  53.9  0.000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3312  transcriptional regulator UidR  28.97 
 
 		 198 aa  53.5  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4348  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 174 aa  53.1  0.000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2666  TetR family transcriptional regulator  26.59 
 
 		 213 aa  52.8  0.000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1655  transcriptional regulator, TetR family  43.1 
 
 		 222 aa  52.8  0.000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.721526  normal  0.229233 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0027  TetR family transcriptional regulator  30.84 
 
 		 209 aa  52.8  0.000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.790094 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3508  regulatory protein, TetR  45 
 
 		 200 aa  52.8  0.000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0988004  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01051  transcriptional regulator TetR family  40.32 
 
 		 210 aa  52.4  0.000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.250197  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06115  transcriptional regulator TetR family  40.32 
 
 		 210 aa  52.4  0.000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.131749  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1610  TetR family transcriptional regulator  37.74 
 
 		 424 aa  52.4  0.000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2513  transcriptional regulator, TetR family  39.34 
 
 		 199 aa  51.2  0.00001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1858  TetR family transcriptional regulator  24.4 
 
 		 234 aa  51.2  0.00001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.543066  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5197  transcriptional regulator, TetR family  31.58 
 
 		 211 aa  51.6  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.128867  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0511  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 194 aa  51.6  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3938  transcriptional regulator, TetR family  37.84 
 
 		 231 aa  50.8  0.00002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.00284915  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3825  regulatory protein TetR  40.58 
 
 		 203 aa  51.2  0.00002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.141016  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2192  TetR family transcriptional regulator  36.59 
 
 		 225 aa  51.2  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4298  transcriptional regulator, TetR family  38.04 
 
 		 233 aa  50.8  0.00002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.530374  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1683  TetR family transcriptional regulator  25.7 
 
 		 227 aa  51.2  0.00002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4215  TetR family transcriptional regulator  30.94 
 
 		 269 aa  50.8  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.261755 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0106  TetR family transcriptional regulator  27.91 
 
 		 214 aa  50.8  0.00002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.156451  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16730  transcriptional regulator, TetR family  26.58 
 
 		 213 aa  50.4  0.00002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4414  transcriptional regulator, TetR family  31.21 
 
 		 419 aa  50.8  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.617294  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7205  transcriptional regulator, TetR family  29.07 
 
 		 188 aa  50.1  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.61042  normal  0.776649 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1070  TetR family transcriptional regulator  35.8 
 
 		 229 aa  50.1  0.00003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6699  transcriptional regulator, TetR family  38.67 
 
 		 207 aa  50.1  0.00004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.678516  normal  0.427356 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5299  TetR family transcriptional regulator  35.05 
 
 		 227 aa  50.1  0.00004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2507  TetR family transcriptional regulator  29.06 
 
 		 211 aa  50.1  0.00004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00142913 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0433  TetR family transcriptional regulator  27.97 
 
 		 204 aa  50.1  0.00004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.376909  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1987  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 210 aa  49.7  0.00004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2732  TetR family transcriptional regulator  45.28 
 
 		 179 aa  49.3  0.00006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.748169 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1334  TetR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 201 aa  49.3  0.00006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.180708  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8267  putative transcriptional regulator, TetR family  34.52 
 
 		 209 aa  49.3  0.00006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.124724 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2116  transcriptional regulator, TetR family  32.28 
 
 		 192 aa  49.3  0.00006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1904  transcriptional regulator, TetR family  25.26 
 
 		 225 aa  49.3  0.00006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.550528  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4973  TetR family transcriptional regulator  38.67 
 
 		 201 aa  49.3  0.00006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0231413  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5351  TetR family transcriptional regulator  30.18 
 
 		 195 aa  48.9  0.00007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0124857 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4171  TetR family transcriptional regulator  29.55 
 
 		 203 aa  49.3  0.00007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0201849  hitchhiker  0.000462956 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4520  regulatory protein TetR  27.1 
 
 		 228 aa  49.3  0.00007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2779  transcriptional regulator, TetR family  43.64 
 
 		 185 aa  49.3  0.00007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.441306  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1649  TetR family transcriptional regulator  47.06 
 
 		 233 aa  49.3  0.00007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.617035  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1086  transcriptional regulator, TetR family  45.61 
 
 		 239 aa  49.3  0.00007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.566372  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0543  TetR family transcriptional regulator  43.55 
 
 		 203 aa  49.3  0.00007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.889127 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0662  TetR family transcriptional regulator  39.34 
 
 		 205 aa  48.9  0.00007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0153  TetR family transcriptional regulator  41.82 
 
 		 205 aa  49.3  0.00007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.10564  normal  0.9984 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1119  TetR family transcriptional regulator  29.07 
 
 		 213 aa  49.3  0.00007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1879  TetR family transcriptional regulator  36.99 
 
 		 179 aa  48.9  0.00008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5974  TetR family transcriptional regulator  35.07 
 
 		 227 aa  48.9  0.00008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0426648  hitchhiker  0.00085933 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6827  putative transcriptional regulator, TetR family  25.31 
 
 		 200 aa  48.9  0.00009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0995041 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2195  TetR family transcriptional regulator  25.24 
 
 		 220 aa  48.9  0.00009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5020  putative transcriptional regulator, TetR family  30.39 
 
 		 196 aa  48.9  0.00009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0294081  normal  0.0543061 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2922  transcriptional regulator, TetR family  42.42 
 
 		 204 aa  48.1  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.404278 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0820  putative transcription regulator protein  30.67 
 
 		 225 aa  48.5  0.0001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3533  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 237 aa  48.1  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0909277  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9154  putative transcriptional regulator, TetR family  42.59 
 
 		 226 aa  48.5  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.231214  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1792  regulatory protein, TetR  34.81 
 
 		 238 aa  48.5  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1261  TetR family transcriptional regulator  30.59 
 
 		 214 aa  48.5  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.100849  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3651  TetR family transcriptional regulator  37.14 
 
 		 233 aa  48.1  0.0001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.496262 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5790  transcriptional regulator, TetR family  35.06 
 
 		 220 aa  48.5  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0399068 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4304  TetR family transcriptional regulator  28.41 
 
 		 202 aa  48.5  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.148025  normal  0.676238 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5494  transcriptional regulator, TetR family  43.14 
 
 		 141 aa  48.1  0.0001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.769028  normal  0.39499 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1808  TetR family transcriptional regulator  38.57 
 
 		 233 aa  48.1  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2701  TetR family transcriptional regulator  34.94 
 
 		 239 aa  48.5  0.0001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5280  TetR family transcriptional regulator  39.44 
 
 		 175 aa  48.5  0.0001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0726  regulatory protein TetR  39.51 
 
 		 200 aa  48.1  0.0001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1963  transcriptional regulator, TetR family  36.51 
 
 		 201 aa  48.5  0.0001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000168283 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3407  TetR family transcriptional regulator  31.21 
 
 		 422 aa  48.5  0.0001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.282297 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0184  TetR family transcriptional regulator  32.94 
 
 		 335 aa  48.5  0.0001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000505732  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1553  TetR family transcriptional regulator  31.71 
 
 		 194 aa  47.4  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1590  TetR family transcriptional regulator  23.37 
 
 		 192 aa  47.8  0.0002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>