More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_C5945 on replicon NC_007336
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007336  Reut_C5945  regulatory protein, TetR  100 
 
 		 216 aa  436  1e-121  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.542251  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3984  transcriptional regulator, TetR family  62.76 
 
 		 216 aa  258  6e-68  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.765993  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3581  TetR family transcriptional regulator  41.21 
 
 		 209 aa  151  8.999999999999999e-36  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0199  transcriptional regulator, TetR family  41.85 
 
 		 202 aa  134  9e-31  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.251087  normal  0.943452 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0651  TetR family transcriptional regulator  43.62 
 
 		 218 aa  132  3.9999999999999996e-30  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  decreased coverage  0.0025795  normal  0.249536 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3765  TetR family transcriptional regulator  41.05 
 
 		 213 aa  128  6e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0357958 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03806  transcriptional regulator, TetR family  42.33 
 
 		 206 aa  127  9.000000000000001e-29  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12440  AcrR family transcriptional regulator  38.73 
 
 		 215 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.446651  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1135  putative transcriptional regulator  39.57 
 
 		 215 aa  126  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.135048  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2697  transcriptional regulator, TetR family  40.33 
 
 		 195 aa  109  3e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0366203  normal  0.310239 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1018  transcriptional regulator, TetR family  34.2 
 
 		 205 aa  88.2  1e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6871  TetR family transcriptional regulator  32.64 
 
 		 224 aa  87  2e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.405099  normal  0.0580493 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1320  transcriptional regulator, TetR family  31.09 
 
 		 224 aa  86.7  3e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6435  TetR family transcriptional regulator  33.71 
 
 		 262 aa  85.1  7e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.253012  normal  0.0353997 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1826  TetR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 250 aa  81.6  0.000000000000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0995188  normal  0.24055 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4737  TetR family transcriptional regulator  32.11 
 
 		 224 aa  74.3  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2583  TetR family transcriptional regulator  32.12 
 
 		 226 aa  73.9  0.000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.176518 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4138  TetR family transcriptional regulator  31.1 
 
 		 224 aa  72  0.000000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3206  TetR family transcriptional regulator  31.4 
 
 		 227 aa  65.5  0.0000000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1381  transcriptional regulator, TetR family  26.04 
 
 		 184 aa  63.2  0.000000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.419771  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05020  transcriptional regulator, TetR family  54.72 
 
 		 194 aa  61.6  0.000000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3474  transcriptional regulator of TetR family protein  34.29 
 
 		 191 aa  61.6  0.000000009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.486624 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2755  TetR family transcriptional regulator  27.74 
 
 		 200 aa  60.1  0.00000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3500  TetR family transcriptional regulator  28.34 
 
 		 191 aa  59.3  0.00000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00541119  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2800  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 201 aa  58.9  0.00000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1014  TetR family transcriptional regulator  36.9 
 
 		 212 aa  58.5  0.00000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1848  transcriptional regulator, TetR family  35.24 
 
 		 190 aa  57.8  0.0000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00246548 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2293  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 204 aa  57.8  0.0000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2554  TetR family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 198 aa  57.8  0.0000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000394239  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4272  TetR family transcriptional regulator  28.48 
 
 		 191 aa  57.8  0.0000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.814005 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6580  transcriptional regulator, TetR family  43.55 
 
 		 242 aa  57  0.0000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.603144 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001979  transcriptional regulator TetR family  45.76 
 
 		 193 aa  56.6  0.0000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.507988  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0359  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 203 aa  56.2  0.0000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1634  TetR family transcriptional regulator  39.33 
 
 		 209 aa  55.5  0.0000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.681802  normal  0.225704 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2371  transcriptional regulator, TetR family  55.1 
 
 		 190 aa  55.8  0.0000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0185343  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2871  TetR family transcriptional regulator  41.1 
 
 		 213 aa  55.8  0.0000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3645  transcriptional regulator, TetR family  44.78 
 
 		 199 aa  55.5  0.0000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.529358  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2856  TetR family transcriptional regulator  34.04 
 
 		 194 aa  55.5  0.0000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.661308  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2301  transcriptional regulator, TetR family  47.06 
 
 		 197 aa  55.5  0.0000007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0091  HTH-type transcriptional regulator, TetR family  44.07 
 
 		 199 aa  55.1  0.0000007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.903201  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1401  TetR family transcriptional regulator  35.63 
 
 		 222 aa  55.1  0.0000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.513329  normal  0.505278 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2136  transcriptional regulator, TetR family  46 
 
 		 212 aa  55.1  0.0000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.547172  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0737  transcriptional regulator, TetR family  35 
 
 		 209 aa  55.1  0.0000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00482  NADH dehydrogenase  50 
 
 		 194 aa  54.7  0.000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3436  transcriptional regulator, TetR family  49.15 
 
 		 194 aa  54.3  0.000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.262135  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13607  TetR family transcriptional regulator  46 
 
 		 295 aa  53.9  0.000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.20276 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0332  TetR family transcriptional regulator  41.56 
 
 		 192 aa  53.9  0.000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00337125  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0881  regulatory protein TetR  37.36 
 
 		 219 aa  53.9  0.000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4581  TetR family transcriptional regulator  35.79 
 
 		 223 aa  53.9  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.19483 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04380  transcriptional regulator, TetR family  38.6 
 
 		 72 aa  53.1  0.000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1848  TetR family transcriptional regulator  26.78 
 
 		 210 aa  53.1  0.000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8200  putative transcriptional regulator, TetR family  52.08 
 
 		 237 aa  53.5  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.53611  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00530  transcriptional regulator  27.27 
 
 		 212 aa  53.1  0.000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1623  transcriptional regulator, TetR family  27.45 
 
 		 205 aa  53.1  0.000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0373  TetR family transcriptional regulator  39.66 
 
 		 188 aa  52.4  0.000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_6137  TetR family transcriptional regulator  41.54 
 
 		 207 aa  52  0.000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.150449  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0808  TetR family transcriptional regulator  28.06 
 
 		 191 aa  52  0.000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.287096 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4533  transcriptional regulator, TetR family  28.3 
 
 		 197 aa  52.4  0.000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0585795  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2507  TetR family transcriptional regulator  41.54 
 
 		 207 aa  52  0.000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.881075  normal  0.842438 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0392  transcriptional regulator, TetR family  35.54 
 
 		 201 aa  52  0.000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.022112  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0880  transcriptional regulator, TetR family  43.55 
 
 		 212 aa  52  0.000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.987052  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3126  TetR family transcriptional regulator  36.47 
 
 		 207 aa  51.6  0.000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.333802  hitchhiker  0.00150199 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2574  transcriptional regulator, TetR family  46.3 
 
 		 204 aa  51.6  0.000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1592  transcriptional regulator, TetR family  25.24 
 
 		 198 aa  51.2  0.00001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2698  TetR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 203 aa  51.2  0.00001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1526  TetR family transcriptional regulator  45.16 
 
 		 208 aa  51.2  0.00001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0534186  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4326  TetR family transcriptional regulator  36.92 
 
 		 202 aa  51.2  0.00001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0414  TetR family transcriptional regulator  21.58 
 
 		 202 aa  51.2  0.00001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0543  TetR family transcriptional regulator  40.62 
 
 		 203 aa  50.8  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.889127 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1936  transcriptional regulator, TetR family  24.84 
 
 		 193 aa  51.2  0.00001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2922  transcriptional regulator, TetR family  29.27 
 
 		 204 aa  50.8  0.00001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.404278 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4713  TetR family transcriptional regulator  38.98 
 
 		 218 aa  50.8  0.00001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3459  TetR family transcriptional regulator  51.02 
 
 		 324 aa  50.8  0.00001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000855252 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4300  transcriptional regulator  27.86 
 
 		 225 aa  50.8  0.00001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4148  TetR family transcriptional regulator  43.64 
 
 		 213 aa  51.2  0.00001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.677229  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4799  TetR family transcriptional regulator  38.98 
 
 		 218 aa  50.8  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2314  transcriptional regulator, TetR family  25.9 
 
 		 213 aa  51.2  0.00001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.251224 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5312  TetR family transcriptional regulator  44 
 
 		 235 aa  50.8  0.00001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0775512 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4191  TetR family transcriptional regulator  27.38 
 
 		 236 aa  51.2  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.513173  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1965  TetR family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 206 aa  51.2  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0526053  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5098  TetR family transcriptional regulator  38.98 
 
 		 218 aa  50.8  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.11151 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1459  TetR family transcriptional regulator  44 
 
 		 223 aa  51.2  0.00001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.568759  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08440  transcriptional regulator, TetR family  30.77 
 
 		 190 aa  50.4  0.00002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4421  TetR family transcriptional regulator  27.11 
 
 		 195 aa  50.1  0.00002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4260  transcriptional regulator  27.11 
 
 		 195 aa  50.1  0.00002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3788  transcriptional regulator, TetR family  38.36 
 
 		 208 aa  50.4  0.00002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2109  TetR family transcriptional regulator  35.37 
 
 		 206 aa  50.1  0.00002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.901149 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4633  transcriptional regulator, TetR family  27.11 
 
 		 195 aa  50.1  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.169287  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4762  TetR family transcriptional regulator  27.11 
 
 		 195 aa  50.1  0.00002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0612  TetR family transcriptional regulator  41.54 
 
 		 202 aa  50.4  0.00002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.136679  normal  0.487596 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0557  regulatory protein TetR  32.88 
 
 		 251 aa  50.4  0.00002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2823  TetR family transcriptional regulator  51.11 
 
 		 206 aa  50.4  0.00002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.133482  normal  0.0456725 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4653  transcriptional regulator, TetR family  27.11 
 
 		 195 aa  50.1  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2625  regulatory protein, TetR  44.44 
 
 		 206 aa  50.8  0.00002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.232365  normal  0.311906 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4839  TetR family transcriptional regulator  42.59 
 
 		 223 aa  50.4  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.370984  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1173  TetR family transcriptional regulator  33.7 
 
 		 218 aa  50.4  0.00002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4927  TetR family transcriptional regulator  42.59 
 
 		 223 aa  50.4  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.398632  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7768  putative transcriptional regulator, TetR family  27.27 
 
 		 194 aa  50.1  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37080  transcriptional regulator  44.44 
 
 		 212 aa  50.4  0.00002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4637  transcriptional regulator, TetR family  27.11 
 
 		 195 aa  50.1  0.00002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>