More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_3206 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007964  Nham_3206  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 227 aa  431  1e-120  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2583  TetR family transcriptional regulator  86.73 
 
 		 226 aa  330  9e-90  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.176518 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1320  transcriptional regulator, TetR family  84.75 
 
 		 224 aa  325  3e-88  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6871  TetR family transcriptional regulator  83.41 
 
 		 224 aa  321  7e-87  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.405099  normal  0.0580493 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1826  TetR family transcriptional regulator  85.2 
 
 		 250 aa  307  6.999999999999999e-83  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0995188  normal  0.24055 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4737  TetR family transcriptional regulator  84.75 
 
 		 224 aa  303  1.0000000000000001e-81  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4138  TetR family transcriptional regulator  83.41 
 
 		 224 aa  279  2e-74  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03806  transcriptional regulator, TetR family  37.13 
 
 		 206 aa  113  3e-24  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3984  transcriptional regulator, TetR family  36.68 
 
 		 216 aa  108  7.000000000000001e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.765993  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0651  TetR family transcriptional regulator  38.16 
 
 		 218 aa  108  1e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  decreased coverage  0.0025795  normal  0.249536 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3581  TetR family transcriptional regulator  33.49 
 
 		 209 aa  107  2e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0199  transcriptional regulator, TetR family  34.98 
 
 		 202 aa  98.6  7e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.251087  normal  0.943452 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2697  transcriptional regulator, TetR family  43.9 
 
 		 195 aa  97.1  2e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0366203  normal  0.310239 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1018  transcriptional regulator, TetR family  33.99 
 
 		 205 aa  89.4  4e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6435  TetR family transcriptional regulator  36.49 
 
 		 262 aa  85.9  5e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.253012  normal  0.0353997 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12440  AcrR family transcriptional regulator  31.88 
 
 		 215 aa  85.1  7e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.446651  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1135  putative transcriptional regulator  31.88 
 
 		 215 aa  84.7  0.000000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.135048  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5945  regulatory protein, TetR  33.53 
 
 		 216 aa  82.8  0.000000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.542251  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3765  TetR family transcriptional regulator  32.95 
 
 		 213 aa  77  0.0000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0357958 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2778  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 		 205 aa  76.6  0.0000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1848  TetR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 210 aa  73.6  0.000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2656  transcriptional regulator, TetR family  26.17 
 
 		 212 aa  68.2  0.0000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000478919  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3641  TetR family transcriptional regulator  24.2 
 
 		 200 aa  58.5  0.00000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.798229 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25080  Transcriptional regulator, TetR family  39.71 
 
 		 191 aa  57  0.0000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2871  TetR family transcriptional regulator  39.47 
 
 		 213 aa  56.2  0.0000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2368  TetR family transcriptional regulator  26.71 
 
 		 197 aa  55.5  0.0000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000142624 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0281  transcriptional regulator, TetR family  35.76 
 
 		 218 aa  54.7  0.000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.645912  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3645  transcriptional regulator, TetR family  56 
 
 		 199 aa  54.7  0.000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.529358  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1623  transcriptional regulator, TetR family  23.53 
 
 		 205 aa  54.3  0.000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1941  transcriptional regulator, TetR family  21.86 
 
 		 194 aa  54.7  0.000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000874649  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4533  transcriptional regulator, TetR family  35.16 
 
 		 197 aa  53.9  0.000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0585795  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1763  TetR family transcriptional regulator  33.5 
 
 		 221 aa  54.3  0.000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0297  TetR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 203 aa  54.3  0.000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2800  TetR family transcriptional regulator  53.23 
 
 		 201 aa  53.9  0.000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3609  transcriptional regulator, TetR family  38.3 
 
 		 228 aa  53.5  0.000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8200  putative transcriptional regulator, TetR family  51.85 
 
 		 237 aa  53.1  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.53611  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5312  TetR family transcriptional regulator  46.15 
 
 		 235 aa  52.8  0.000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0775512 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17960  transcriptional regulator, TetR family  30.5 
 
 		 208 aa  52.4  0.000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.134645  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1381  transcriptional regulator, TetR family  18.9 
 
 		 184 aa  52.4  0.000006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.419771  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7736  putative transcriptional regulator, TetR family  34.83 
 
 		 205 aa  52.4  0.000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.97147  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1312  TetR family transcriptional regulator  31.4 
 
 		 206 aa  52.4  0.000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.278349  normal  0.387509 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4713  TetR family transcriptional regulator  50.75 
 
 		 218 aa  52  0.000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0292  TetR family transcriptional regulator  30.17 
 
 		 203 aa  52  0.000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000414466 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0292  TetR family transcriptional regulator  30.17 
 
 		 203 aa  52  0.000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000945067 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4799  TetR family transcriptional regulator  50.75 
 
 		 218 aa  52  0.000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5098  TetR family transcriptional regulator  50.75 
 
 		 218 aa  52  0.000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.11151 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1681  TetR family transcriptional regulator  35 
 
 		 216 aa  52  0.000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.977422 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0881  regulatory protein TetR  48.53 
 
 		 219 aa  52  0.000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13607  TetR family transcriptional regulator  49.25 
 
 		 295 aa  51.6  0.000009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.20276 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2507  TetR family transcriptional regulator  31.48 
 
 		 211 aa  51.6  0.000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00142913 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1313  transcriptional regulator TetR family  34.07 
 
 		 213 aa  51.6  0.000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1459  TetR family transcriptional regulator  56.25 
 
 		 223 aa  51.6  0.000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.568759  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0652  transcriptional regulator, TetR family  27.22 
 
 		 190 aa  51.2  0.00001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00127288  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1788  TetR family transcriptional regulator  25.85 
 
 		 195 aa  51.6  0.00001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000202922  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4064  regulatory protein TetR  34.95 
 
 		 190 aa  51.2  0.00001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.3318 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1927  TetR family transcriptional regulator  25.85 
 
 		 195 aa  51.6  0.00001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00399738  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2625  regulatory protein, TetR  53.33 
 
 		 206 aa  50.8  0.00001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.232365  normal  0.311906 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0170  transcriptional regulator, TetR family  32.09 
 
 		 201 aa  51.2  0.00001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.307357  hitchhiker  0.00190078 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10078  transcriptional regulator  33.86 
 
 		 201 aa  50.4  0.00002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.105796 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0270  TetR family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 192 aa  50.8  0.00002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.522665  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1098  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 209 aa  50.4  0.00002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0976848 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1745  TetR family transcriptional regulator  26.53 
 
 		 195 aa  50.4  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0399082  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0179  TetR family transcriptional regulator  44.07 
 
 		 193 aa  50.8  0.00002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0807108  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2136  transcriptional regulator, TetR family  49.06 
 
 		 212 aa  50.8  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.547172  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1045  TetR family transcriptional regulator  36.9 
 
 		 226 aa  50.4  0.00002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.446098  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0467  TetR family transcriptional regulator  39.66 
 
 		 198 aa  49.7  0.00003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6487  transcriptional regulator, TetR family  44.12 
 
 		 195 aa  49.7  0.00004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001979  transcriptional regulator TetR family  42.11 
 
 		 193 aa  49.7  0.00004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.507988  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3727  TetR family transcriptional regulator  29.05 
 
 		 203 aa  49.3  0.00004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000227076 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1461  TetR family transcriptional regulator  35.59 
 
 		 197 aa  49.3  0.00004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.0279876 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1218  TetR family transcriptional regulator  32.29 
 
 		 206 aa  49.7  0.00004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2823  TetR family transcriptional regulator  51.67 
 
 		 206 aa  49.3  0.00005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.133482  normal  0.0456725 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4148  TetR family transcriptional regulator  40.35 
 
 		 213 aa  49.3  0.00005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.677229  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5570  transcriptional regulator, TetR family  30.11 
 
 		 198 aa  48.9  0.00006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0787  TetR family transcriptional regulator  36.51 
 
 		 192 aa  48.9  0.00006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0101484 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3474  transcriptional regulator of TetR family protein  37.88 
 
 		 191 aa  48.9  0.00006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.486624 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0833  TetR family transcriptional regulator  24.03 
 
 		 190 aa  48.9  0.00007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2385  transcriptional regulator, TetR family  42.62 
 
 		 176 aa  48.5  0.00007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000106592  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0880  transcriptional regulator, TetR family  37.18 
 
 		 212 aa  48.9  0.00007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.987052  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1479  TetR family transcriptional regulator  29.9 
 
 		 231 aa  48.9  0.00007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3548  TetR family transcriptional regulator  24.18 
 
 		 216 aa  48.9  0.00007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4194  transcriptional regulator, TetR family  25.81 
 
 		 190 aa  48.5  0.00008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1963  transcriptional regulator, TetR family  25.17 
 
 		 201 aa  48.5  0.00008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000168283 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3594  TetR family transcriptional regulator  32.04 
 
 		 210 aa  48.5  0.00008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1856  TetR family transcriptional regulator  32.81 
 
 		 185 aa  48.5  0.00008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1112  transcriptional regulator, TetR family  25.81 
 
 		 190 aa  48.5  0.00008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1211  transcriptional regulator, TetR family  25.79 
 
 		 227 aa  48.5  0.00009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4823  transcriptional regulator, TetR family  50.98 
 
 		 219 aa  48.5  0.00009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05020  transcriptional regulator, TetR family  26.88 
 
 		 194 aa  48.5  0.00009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4338  transcriptional regulator, TetR family  38.27 
 
 		 231 aa  47.8  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8507  putative transcriptional regulator, TetR family  34.51 
 
 		 199 aa  48.1  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.899046 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0737  transcriptional regulator, TetR family  36.14 
 
 		 209 aa  48.1  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3788  transcriptional regulator, TetR family  40.79 
 
 		 208 aa  48.1  0.0001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0444  TetR family transcriptional regulator  29.33 
 
 		 220 aa  48.1  0.0001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.275459  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3943  transcriptional regulator, TetR family  35.53 
 
 		 218 aa  48.1  0.0001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.938406  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2602  transcriptional regulator, TetR family  30.57 
 
 		 214 aa  48.1  0.0001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.157273  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0995  TetR family transcriptional regulator  25.81 
 
 		 190 aa  47.4  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3709  TetR family transcriptional regulator  26.21 
 
 		 221 aa  47  0.0002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0975739  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1049  TetR family transcriptional regulator  32 
 
 		 230 aa  47  0.0002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0599696  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5949  transcriptional regulator TetR family  34.94 
 
 		 250 aa  47.4  0.0002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>