More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_03806 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010717  PXO_03806  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 206 aa  401  1e-111  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0199  transcriptional regulator, TetR family  67.16 
 
 		 202 aa  255  4e-67  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.251087  normal  0.943452 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3581  TetR family transcriptional regulator  39.71 
 
 		 209 aa  160  2e-38  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3984  transcriptional regulator, TetR family  44.21 
 
 		 216 aa  153  2e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.765993  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3765  TetR family transcriptional regulator  42.45 
 
 		 213 aa  136  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0357958 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12440  AcrR family transcriptional regulator  41.35 
 
 		 215 aa  135  4e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.446651  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1135  putative transcriptional regulator  41.35 
 
 		 215 aa  135  5e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.135048  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0651  TetR family transcriptional regulator  41.95 
 
 		 218 aa  135  6.0000000000000005e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  decreased coverage  0.0025795  normal  0.249536 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6435  TetR family transcriptional regulator  41.26 
 
 		 262 aa  134  9.999999999999999e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.253012  normal  0.0353997 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2697  transcriptional regulator, TetR family  46.56 
 
 		 195 aa  132  3.9999999999999996e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0366203  normal  0.310239 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5945  regulatory protein, TetR  42.33 
 
 		 216 aa  127  9.000000000000001e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.542251  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6871  TetR family transcriptional regulator  39.02 
 
 		 224 aa  114  8.999999999999998e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.405099  normal  0.0580493 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1320  transcriptional regulator, TetR family  37.56 
 
 		 224 aa  111  6e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1018  transcriptional regulator, TetR family  37.5 
 
 		 205 aa  109  3e-23  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2583  TetR family transcriptional regulator  39.3 
 
 		 226 aa  104  1e-21  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.176518 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1826  TetR family transcriptional regulator  35.78 
 
 		 250 aa  102  5e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0995188  normal  0.24055 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4737  TetR family transcriptional regulator  37.07 
 
 		 224 aa  97.1  2e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4138  TetR family transcriptional regulator  36.27 
 
 		 224 aa  87.4  1e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1623  transcriptional regulator, TetR family  27.8 
 
 		 205 aa  77  0.0000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3206  TetR family transcriptional regulator  35.63 
 
 		 227 aa  76.6  0.0000000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1987  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 210 aa  73.2  0.000000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2778  TetR family transcriptional regulator  23.27 
 
 		 205 aa  65.9  0.0000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1941  transcriptional regulator, TetR family  25.68 
 
 		 194 aa  65.5  0.0000000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000874649  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16730  transcriptional regulator, TetR family  33.99 
 
 		 213 aa  63.9  0.000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5159  transcriptional regulator, TetR family  34.36 
 
 		 202 aa  62.4  0.000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0104  TetR family transcriptional regulator  27.23 
 
 		 190 aa  60.8  0.00000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0170  transcriptional regulator, TetR family  29.27 
 
 		 201 aa  61.2  0.00000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.307357  hitchhiker  0.00190078 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0103  TetR family transcriptional regulator  26.8 
 
 		 190 aa  60.8  0.00000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3806  TetR family transcriptional regulator  30.81 
 
 		 238 aa  60.8  0.00000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.65239  normal  0.316965 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0177  TetR family transcriptional regulator  35.63 
 
 		 190 aa  60.8  0.00000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2666  TetR family transcriptional regulator  28.03 
 
 		 213 aa  59.3  0.00000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2109  TetR family transcriptional regulator  33.67 
 
 		 206 aa  58.2  0.00000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.901149 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1218  TetR family transcriptional regulator  29.45 
 
 		 206 aa  58.2  0.00000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4633  transcriptional regulator, TetR family  27.71 
 
 		 195 aa  58.2  0.00000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.169287  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4653  transcriptional regulator, TetR family  27.71 
 
 		 195 aa  58.2  0.00000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4421  TetR family transcriptional regulator  27.71 
 
 		 195 aa  58.2  0.0000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4260  transcriptional regulator  27.71 
 
 		 195 aa  58.2  0.0000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4272  transcriptional regulator  27.71 
 
 		 195 aa  58.2  0.0000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2922  transcriptional regulator, TetR family  31.13 
 
 		 204 aa  58.2  0.0000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.404278 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4762  TetR family transcriptional regulator  27.71 
 
 		 195 aa  58.2  0.0000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1014  TetR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 212 aa  57.8  0.0000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0602  transcriptional regulator, TetR family  27.71 
 
 		 195 aa  57.8  0.0000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4637  transcriptional regulator, TetR family  27.71 
 
 		 195 aa  58.2  0.0000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4353  TetR family transcriptional regulator  27.71 
 
 		 195 aa  57.4  0.0000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1844  transcriptional regulator, TetR family  24.87 
 
 		 214 aa  57  0.0000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3827  transcriptional regulator, TetR family  24.69 
 
 		 190 aa  57  0.0000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4378  transcriptional regulator, TetR family  31.85 
 
 		 200 aa  57  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.136582 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1835  TetR family transcriptional regulator  26.32 
 
 		 206 aa  57.4  0.0000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.214675  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3240  putative transcriptional regulator, TetR family  30.77 
 
 		 201 aa  57.4  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00194759  normal  0.442697 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1984  TetR family transcriptional regulator  30.72 
 
 		 196 aa  56.6  0.0000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2750  TetR family transcriptional regulator  35.22 
 
 		 205 aa  56.2  0.0000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.172363  normal  0.153941 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3833  transcriptional regulator, TetR family  28.97 
 
 		 204 aa  56.6  0.0000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1768  TetR family transcriptional regulator  26.26 
 
 		 211 aa  55.8  0.0000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.570427  normal  0.275415 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35560  transcriptional regulator  26.26 
 
 		 200 aa  55.8  0.0000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1017  repressor protein  28.57 
 
 		 211 aa  55.8  0.0000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2800  TetR family transcriptional regulator  28.19 
 
 		 201 aa  55.5  0.0000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0852  multidrug efflux pump repressor protein BpeR  28.57 
 
 		 211 aa  55.8  0.0000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0857  multidrug efflux pump repressor protein BpeR  28.57 
 
 		 211 aa  55.8  0.0000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0314  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 211 aa  55.5  0.0000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0679  TetR family transcriptional regulator  28.99 
 
 		 211 aa  55.5  0.0000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0057  multidrug efflux pump repressor protein BpeR  28.57 
 
 		 211 aa  55.5  0.0000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0609  multidrug efflux pump repressor protein BpeR  28.57 
 
 		 211 aa  55.5  0.0000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.780096  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2443  multidrug efflux pump repressor protein BpeR  28.57 
 
 		 211 aa  55.5  0.0000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1848  TetR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 210 aa  55.1  0.0000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2871  TetR family transcriptional regulator  33.96 
 
 		 213 aa  55.1  0.0000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0106  TetR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 214 aa  55.1  0.0000007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.156451  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0557  regulatory protein TetR  30.3 
 
 		 251 aa  55.1  0.0000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2696  TetR family transcriptional regulator  27.96 
 
 		 196 aa  55.1  0.0000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.834085 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0027  TetR family transcriptional regulator  27.98 
 
 		 209 aa  54.7  0.0000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.790094 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0919  TetR family transcriptional regulator  29.05 
 
 		 215 aa  55.1  0.0000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.563199 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4652  TetR family transcriptional regulator  26.22 
 
 		 195 aa  54.7  0.0000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0806  transcriptional regulator, TetR family  27.41 
 
 		 202 aa  54.3  0.000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.265645  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3195  transcriptional regulator, TetR family  26.44 
 
 		 200 aa  54.3  0.000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2293  TetR family transcriptional regulator  31.07 
 
 		 204 aa  54.3  0.000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0266  TetR family transcriptional regulator  27.75 
 
 		 207 aa  53.9  0.000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.437766  hitchhiker  0.000931508 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2680  transcriptional regulator  27.14 
 
 		 198 aa  53.5  0.000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.291962  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2556  transcriptional regulator, TetR family  31.33 
 
 		 208 aa  53.9  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00000000489141  normal  0.182844 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3944  TetR family transcriptional regulator  28.89 
 
 		 215 aa  53.1  0.000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8200  putative transcriptional regulator, TetR family  29.38 
 
 		 237 aa  53.5  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.53611  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2628  transcriptional regulator, TetR family  27.5 
 
 		 194 aa  53.5  0.000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00732346  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2718  transcriptional regulator, TetR family domain protein  27.14 
 
 		 198 aa  53.5  0.000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.087281  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2583  TetR family transcriptional regulator  51.92 
 
 		 184 aa  53.9  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2846  regulatory protein, TetR  32.23 
 
 		 227 aa  53.5  0.000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1507  TetR family transcriptional regulator  32.94 
 
 		 224 aa  53.5  0.000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0289697  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13607  TetR family transcriptional regulator  31.34 
 
 		 295 aa  53.5  0.000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.20276 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2444  transcriptional regulator, TetR family  27.4 
 
 		 211 aa  53.1  0.000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0505938 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3759  transcriptional regulator, TetR family  26.2 
 
 		 202 aa  53.1  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.341264  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4377  transcriptional regulator, TetR family  32.08 
 
 		 205 aa  52.8  0.000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.314155  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2314  transcriptional regulator, TetR family  28.57 
 
 		 213 aa  52.8  0.000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.251224 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0282  TetR family transcriptional regulator  19.87 
 
 		 201 aa  53.1  0.000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.356366  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2560  transcriptional regulator, TetR family  37.14 
 
 		 196 aa  52.8  0.000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.199189  normal  0.158626 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3225  TetR family transcriptional regulator  25.61 
 
 		 195 aa  52.8  0.000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2438  transcriptional regulator, TetR family  24.75 
 
 		 208 aa  53.1  0.000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4608  TetR family transcriptional regulator  26.34 
 
 		 206 aa  53.1  0.000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.198377  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4414  transcriptional regulator, TetR family  35.07 
 
 		 419 aa  53.1  0.000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.617294  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0370  TetR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 223 aa  52.8  0.000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0234884  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25250  transcriptional regulator  31.5 
 
 		 190 aa  52.4  0.000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.862967  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3407  TetR family transcriptional regulator  35.82 
 
 		 422 aa  52.8  0.000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.282297 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3834  TetR family transcriptional regulator  24.53 
 
 		 216 aa  52.8  0.000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000963392 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4215  TetR family transcriptional regulator  25.91 
 
 		 269 aa  52.4  0.000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.261755 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>