More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_0266 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_0266  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 207 aa  425  1e-118  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.437766  hitchhiker  0.000931508 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0269  TetR family transcriptional regulator  83.09 
 
 		 207 aa  355  1.9999999999999998e-97  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.60794  normal  0.358976 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2437  transcriptional regulator, TetR family  43.94 
 
 		 216 aa  132  3e-30  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000237388  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2441  TetR family transcriptional regulator  28.65 
 
 		 205 aa  77.8  0.0000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.21008  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2373  transcriptional regulator, TetR family  28.57 
 
 		 207 aa  77.4  0.0000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2242  TetR family transcriptional regulator  28.65 
 
 		 209 aa  76.6  0.0000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.640782  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2176  TetR family transcriptional regulator  28.65 
 
 		 209 aa  77.4  0.0000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000096918  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2162  TetR family transcriptional regulator  28.65 
 
 		 207 aa  76.6  0.0000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.116975  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2423  transcriptional regulator, TetR family  28.65 
 
 		 207 aa  77  0.0000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2406  TetR family transcriptional regulator  28.65 
 
 		 209 aa  76.6  0.0000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2506  transcriptional regulator, TetR family  28.09 
 
 		 205 aa  75.1  0.0000000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.733789  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2666  TetR family transcriptional regulator  27.92 
 
 		 213 aa  73.2  0.000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2959  transcriptional regulator, TetR family  27.53 
 
 		 207 aa  73.2  0.000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00177797 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0788  TetR family transcriptional regulator  33.58 
 
 		 221 aa  71.6  0.000000000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.796627 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0008  transcriptional regulator, TetR family  29.94 
 
 		 195 aa  68.6  0.00000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.643837 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2219  TetR family transcriptional regulator  27.07 
 
 		 207 aa  68.2  0.00000000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.23135  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0167  transcriptional regulator, TetR family  28.48 
 
 		 200 aa  66.6  0.0000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3827  transcriptional regulator, TetR family  28.03 
 
 		 190 aa  66.2  0.0000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2755  TetR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 200 aa  65.9  0.0000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0817  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 		 212 aa  65.9  0.0000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1011  TetR family transcriptional regulator  26.22 
 
 		 770 aa  65.9  0.0000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1775  transcriptional regulator, TetR family  27.67 
 
 		 207 aa  64.7  0.000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0750  transcriptional regulator, TetR family  24.82 
 
 		 236 aa  64.3  0.000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0322855 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0740  TetR family transcriptional regulator  26.21 
 
 		 205 aa  63.5  0.000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.891023  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5488  TetR family transcriptional regulator  28.76 
 
 		 238 aa  63.2  0.000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0265  TetR family transcriptional regulator  27.32 
 
 		 194 aa  63.2  0.000000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.250901  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2680  transcriptional regulator  28.15 
 
 		 198 aa  62.4  0.000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.291962  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1804  transcriptional regulator, TetR family  28.5 
 
 		 189 aa  62  0.000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2348  transcriptional regulator, TetR family  27.78 
 
 		 222 aa  62  0.000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0187157  normal  0.0306872 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1493  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 200 aa  60.8  0.00000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4369  TetR family transcriptional regulator  26.7 
 
 		 204 aa  61.2  0.00000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.645452 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0765  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 228 aa  61.2  0.00000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1603  transcriptional regulator, TetR family  29.75 
 
 		 189 aa  60.1  0.00000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0115969  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5286  TetR family transcriptional regulator  34.91 
 
 		 196 aa  60.1  0.00000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0166031 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2718  transcriptional regulator, TetR family domain protein  27.41 
 
 		 198 aa  60.1  0.00000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.087281  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2248  TetR family transcriptional regulator  40.7 
 
 		 222 aa  60.5  0.00000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0660336  normal  0.0152181 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4251  transcriptional regulator, TetR family  29.88 
 
 		 216 aa  60.5  0.00000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.22701  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1984  TetR family transcriptional regulator  28.17 
 
 		 196 aa  59.7  0.00000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4006  transcriptional regulator, TetR family  27.08 
 
 		 202 aa  59.3  0.00000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0670  transcriptional regulator, TetR family  32.62 
 
 		 227 aa  58.9  0.00000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.591564 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1461  putative transcriptional regulator  29.27 
 
 		 212 aa  58.9  0.00000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1971  transcriptional regulator, TetR family  25.74 
 
 		 196 aa  58.9  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0092  transcriptional regulator, TetR family  33.71 
 
 		 207 aa  58.5  0.00000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00302716  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0421  transcriptional regulator, TetR family  25.93 
 
 		 198 aa  58.5  0.00000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12528  TetR family transcriptional regulator  32.48 
 
 		 215 aa  58.5  0.00000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0275989 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11350  transcriptional regulator  45.07 
 
 		 220 aa  58.2  0.00000009  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3637  TetR family transcriptional regulator  30.2 
 
 		 207 aa  58.2  0.00000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.262942  normal  1 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5107  TetR family transcriptional regulator  58.33 
 
 		 225 aa  57.8  0.0000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.346129  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3632  TetR family transcriptional regulator  30.2 
 
 		 207 aa  57.8  0.0000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3705  TetR family transcriptional regulator  30.2 
 
 		 207 aa  57.8  0.0000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2292  TetR family transcriptional regulator  28.21 
 
 		 208 aa  57.4  0.0000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4505  regulatory protein TetR  25.49 
 
 		 390 aa  57  0.0000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.215764  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3720  transcriptional regulator, TetR family  26.67 
 
 		 225 aa  56.6  0.0000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.984063  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4073  TetR family transcriptional regulator  28.14 
 
 		 223 aa  57.4  0.0000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1397  TetR family transcriptional regulator  31.91 
 
 		 224 aa  56.6  0.0000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.515474  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0347  TetR family transcriptional regulator  26.26 
 
 		 200 aa  57  0.0000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0154637  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1415  TetR family transcriptional regulator  31.91 
 
 		 224 aa  56.6  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3838  transcriptional regulator TetR family  37.68 
 
 		 230 aa  57  0.0000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.606304  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6592  TetR family transcriptional regulator  30.29 
 
 		 225 aa  56.6  0.0000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.186395 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1987  TetR family transcriptional regulator  53.06 
 
 		 210 aa  57.4  0.0000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1451  TetR family transcriptional regulator  31.91 
 
 		 224 aa  57  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1252  TetR family transcriptional regulator  31.76 
 
 		 202 aa  56.2  0.0000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0581191  normal  0.11609 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1636  TetR family transcriptional regulator  41.51 
 
 		 200 aa  56.2  0.0000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0411  transcriptional regulator, TetR family  27.12 
 
 		 196 aa  56.2  0.0000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.3269  hitchhiker  0.00212654 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0265  TetR family transcriptional regulator  24.02 
 
 		 200 aa  56.2  0.0000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00630944 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1835  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 206 aa  55.8  0.0000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.214675  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3960  TetR family transcriptional regulator  32.28 
 
 		 201 aa  55.8  0.0000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.110455  normal  0.471806 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30260  transcriptional regulator  45.61 
 
 		 400 aa  56.2  0.0000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.473296 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1467  TetR family transcriptional regulator  27.81 
 
 		 192 aa  55.8  0.0000004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.861342  normal  0.113855 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16790  TetR family transcriptional regulator  29.49 
 
 		 212 aa  56.2  0.0000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.297454  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05345  transcriptional regulator, tetR family protein  23.57 
 
 		 190 aa  55.8  0.0000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  hitchhiker  0.00749651  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2948  TetR family transcriptional regulator  23.44 
 
 		 191 aa  55.8  0.0000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1866  TetR family transcriptional regulator  32.28 
 
 		 201 aa  55.8  0.0000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.115406 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8390  putative transcriptional regulator, TetR family  29.36 
 
 		 222 aa  55.8  0.0000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3416  transcriptional regulator, TetR family  40.58 
 
 		 226 aa  55.5  0.0000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.180038  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4225  TetR family transcriptional regulator  30.88 
 
 		 244 aa  55.5  0.0000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.127157  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0571  TetR family transcriptional regulator  41.51 
 
 		 200 aa  55.8  0.0000005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.530829  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3714  transcriptional regulator, TetR family  40.58 
 
 		 226 aa  55.5  0.0000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.576002 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4378  transcriptional regulator, TetR family  37.97 
 
 		 200 aa  55.5  0.0000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.136582 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2599  TetR family transcriptional regulator  25.88 
 
 		 233 aa  55.5  0.0000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.87329  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3148  transcriptional regulator, TetR family  35.21 
 
 		 310 aa  55.5  0.0000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1656  TetR family transcriptional regulator  32.32 
 
 		 196 aa  55.1  0.0000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0515046  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1061  transcriptional regulator, TetR family  32.89 
 
 		 196 aa  55.1  0.0000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0250707  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05020  transcriptional regulator, TetR family  27.08 
 
 		 194 aa  55.1  0.0000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3694  TetR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 201 aa  55.1  0.0000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.735281  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7147  transcriptional regulator, TetR family  52.08 
 
 		 179 aa  54.7  0.0000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0118  TetR family transcriptional regulator  29.85 
 
 		 247 aa  54.3  0.000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.211628  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0807  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 211 aa  53.9  0.000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.271007  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0376  TetR family transcriptional regulator  25.64 
 
 		 194 aa  54.3  0.000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2693  regulatory protein TetR  45.45 
 
 		 192 aa  54.3  0.000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0770653  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2402  TetR family transcriptional regulator  28.71 
 
 		 205 aa  54.7  0.000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.584484 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0477  TetR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 211 aa  53.9  0.000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.178939  normal  0.0289146 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16730  transcriptional regulator, TetR family  29.63 
 
 		 213 aa  54.3  0.000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5293  TetR family transcriptional regulator  35.63 
 
 		 210 aa  54.3  0.000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.199638  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0024  TetR family transcriptional regulator  41.56 
 
 		 193 aa  54.3  0.000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1958  TetR family transcriptional regulator  27.33 
 
 		 251 aa  54.3  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.455038  normal  0.501183 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4333  TetR family transcriptional regulator  39.24 
 
 		 212 aa  54.3  0.000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.771402  normal  0.443044 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1807  transcriptional regulator, TetR family  28.86 
 
 		 199 aa  54.7  0.000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.366594 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4672  TetR family transcriptional regulator  29.79 
 
 		 224 aa  54.3  0.000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.959951  normal  0.170381 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4931  TetR family transcriptional regulator  33.71 
 
 		 497 aa  54.7  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.475051  normal  0.080695 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>