190 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_4608 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008726  Mvan_4608  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 206 aa  408  1e-113  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.198377  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2097  TetR family transcriptional regulator  78.69 
 
 		 186 aa  293  1e-78  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.191848  normal  0.237667 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2807  regulatory protein TetR  43.08 
 
 		 202 aa  122  5e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00102447  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4117  TetR family transcriptional regulator  35.15 
 
 		 210 aa  71.6  0.000000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4631  TetR family transcriptional regulator  33.17 
 
 		 230 aa  70.9  0.00000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3998  transcriptional regulator, TetR family  33.76 
 
 		 205 aa  57.4  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0825494  normal  0.0160725 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3299  transcriptional regulator, TetR family  32.35 
 
 		 307 aa  56.2  0.0000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1987  TetR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 210 aa  55.5  0.0000006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3195  transcriptional regulator, TetR family  29.9 
 
 		 200 aa  54.3  0.000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3021  regulatory protein, TetR  26.02 
 
 		 205 aa  52.8  0.000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.84883  normal  0.636371 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3554  transcriptional regulator, TetR family  33.87 
 
 		 219 aa  52.4  0.000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.725934  normal  0.0606309 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3148  transcriptional regulator, TetR family  30.69 
 
 		 310 aa  52.4  0.000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2257  TetR family transcriptional regulator  27 
 
 		 202 aa  51.6  0.000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.92818  normal  0.36633 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1710  transcriptional regulator, TetR family  22.47 
 
 		 200 aa  51.6  0.000009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000037358  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2431  TetR family transcriptional regulator  25.62 
 
 		 214 aa  50.8  0.00001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0857946 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4225  TetR family transcriptional regulator  29.15 
 
 		 244 aa  50.8  0.00001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.127157  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0962  TetR family transcriptional regulator  24.08 
 
 		 200 aa  50.8  0.00001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3354  transcriptional regulator, TetR family  32.14 
 
 		 210 aa  50.4  0.00002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.216649  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0865  TetR family transcriptional regulator  37.11 
 
 		 211 aa  50.8  0.00002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2373  TetR family transcriptional regulator  38.36 
 
 		 205 aa  50.4  0.00002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1100  TetR family transcriptional regulator  35.06 
 
 		 194 aa  49.7  0.00003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0669836  normal  0.61487 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0147  transcriptional regulator, TetR family  35.56 
 
 		 217 aa  49.3  0.00004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1666  transcriptional regulator, TetR family  28.95 
 
 		 209 aa  48.9  0.00005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.40268  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3806  TetR family transcriptional regulator  29.07 
 
 		 238 aa  48.5  0.00006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.65239  normal  0.316965 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0512  TetR family transcriptional regulator  30.46 
 
 		 201 aa  48.9  0.00006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6328  transcriptional regulator, TetR family  27.96 
 
 		 199 aa  48.5  0.00006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00138827  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0919  TetR family transcriptional regulator  28.49 
 
 		 215 aa  48.9  0.00006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.563199 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4146  transcriptional regulator, TetR family  40.24 
 
 		 246 aa  48.5  0.00006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4300  transcriptional regulator  31.29 
 
 		 225 aa  48.5  0.00007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12440  AcrR family transcriptional regulator  28.29 
 
 		 215 aa  48.1  0.00008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.446651  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6078  TetR family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 190 aa  48.5  0.00008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0977252 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1135  putative transcriptional regulator  29.76 
 
 		 215 aa  48.1  0.00008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.135048  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1941  transcriptional regulator, TetR family  28.28 
 
 		 189 aa  47.8  0.0001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.842083  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0908  TetR family transcriptional regulator  24.4 
 
 		 200 aa  47.4  0.0001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.376971  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0627  transcriptional regulator, TetR family  35.06 
 
 		 191 aa  47.8  0.0001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11503  transcriptional regulator  32.61 
 
 		 187 aa  47.8  0.0001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.243571 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03806  transcriptional regulator, TetR family  26.34 
 
 		 206 aa  47  0.0002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3088  transcriptional regulator of TetR family protein  22.15 
 
 		 198 aa  47  0.0002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.119848 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0665  TetR family transcriptional regulator  24.14 
 
 		 195 aa  47.4  0.0002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4838  transcriptional regulator, TetR family  31.82 
 
 		 217 aa  47  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3782  TetR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 179 aa  46.6  0.0002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.59056  normal  0.419733 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2319  putative transcriptional regulator, TetR family  39.51 
 
 		 236 aa  47  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22630  transcriptional regulator  28.24 
 
 		 202 aa  46.2  0.0003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1807  transcriptional regulator, TetR family  31.91 
 
 		 199 aa  46.2  0.0003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.366594 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3227  transcriptional regulator, TetR family  38.24 
 
 		 204 aa  46.2  0.0003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1053  transcriptional regulator, TetR family  23.29 
 
 		 193 aa  46.2  0.0003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3870  transcriptional regulator, TetR family  29.21 
 
 		 208 aa  46.6  0.0003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0541518  normal  0.262725 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3827  transcriptional regulator, TetR family  24.74 
 
 		 190 aa  46.2  0.0003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1541  TetR family transcriptional regulator  42.42 
 
 		 179 aa  46.6  0.0003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.932149  normal  0.0804871 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1978  TetR family transcriptional regulator  40.28 
 
 		 179 aa  46.2  0.0004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0203016  normal  0.0208763 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5790  transcriptional regulator, TetR family  25.77 
 
 		 220 aa  46.2  0.0004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0399068 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63880  putative transcriptional regulator  31 
 
 		 186 aa  46.2  0.0004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1958  TetR family transcriptional regulator  26.47 
 
 		 251 aa  46.2  0.0004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.455038  normal  0.501183 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1509  TetR family transcriptional regulator  40.91 
 
 		 179 aa  46.2  0.0004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0671702  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1374  transcriptional regulator, TetR family  26.09 
 
 		 225 aa  45.4  0.0005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.181966  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0167  transcriptional regulator, TetR family  25.4 
 
 		 200 aa  45.4  0.0005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36300  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 		 194 aa  45.4  0.0005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.564712  normal  0.0790295 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3938  transcriptional regulator, TetR family  32.91 
 
 		 231 aa  45.8  0.0005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.00284915  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3581  TetR family transcriptional regulator  32.91 
 
 		 209 aa  45.4  0.0006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4442  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 192 aa  45.4  0.0006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.75286  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3330  TetR family transcriptional regulator  25.75 
 
 		 225 aa  45.4  0.0006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.648103  normal  0.907597 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6222  transcriptional regulator, TetR family  25.56 
 
 		 186 aa  45.1  0.0007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.366462  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0873  TetR family transcriptional regulator  27.18 
 
 		 196 aa  45.1  0.0007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.682179 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2444  transcriptional regulator, TetR family  27.46 
 
 		 211 aa  45.1  0.0008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0505938 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0622  TetR family transcriptional regulator  31.33 
 
 		 216 aa  45.1  0.0008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35560  transcriptional regulator  27.55 
 
 		 200 aa  45.1  0.0008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4395  transcriptional regulator, TetR family  32.84 
 
 		 196 aa  44.7  0.0009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.724029  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0228  TetR family transcriptional regulator  32.98 
 
 		 201 aa  44.3  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.527328  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2564  TetR family transcriptional regulator  24.39 
 
 		 214 aa  44.3  0.001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.454515 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7816  transcriptional regulator, TetR family  27.69 
 
 		 216 aa  44.3  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0331  transcriptional regulator, TetR family  30 
 
 		 209 aa  44.3  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3089  TetR family transcriptional regulator  28.87 
 
 		 194 aa  44.7  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.544244  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6341  TetR family transcriptional regulator  29.05 
 
 		 206 aa  44.3  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0497044  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1751  TetR family transcriptional regulator  29.05 
 
 		 206 aa  44.3  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1738  TetR family transcriptional regulator  29.05 
 
 		 206 aa  44.3  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4014  transcriptional regulator, TetR family  26.06 
 
 		 225 aa  44.3  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1104  AcrR family transcriptional regulator  29.36 
 
 		 243 aa  44.3  0.001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1921  transcriptional regulator, TetR family  27.69 
 
 		 197 aa  44.7  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0409606  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0239  transcriptional regulator, TetR family  32.98 
 
 		 201 aa  44.7  0.001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0220692  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2628  transcriptional regulator, TetR family  21.99 
 
 		 194 aa  44.3  0.001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00732346  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2574  transcriptional regulator, TetR family  26.83 
 
 		 204 aa  44.3  0.001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3111  TetR family transcriptional regulator  32.63 
 
 		 210 aa  44.3  0.001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0170  transcriptional regulator, TetR family  27.32 
 
 		 201 aa  44.3  0.001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.307357  hitchhiker  0.00190078 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0551  transcriptional regulator, TetR family  28.57 
 
 		 213 aa  44.7  0.001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16730  transcriptional regulator, TetR family  30.46 
 
 		 213 aa  44.3  0.001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2422  transcriptional regulator, TetR family  30.14 
 
 		 197 aa  43.9  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000265027  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3742  transcriptional regulator, TetR family  31.48 
 
 		 192 aa  43.9  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0828  transcriptional regulator, TetR family  22.54 
 
 		 195 aa  43.5  0.002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0743  TetR family transcriptional regulator  28.03 
 
 		 216 aa  43.9  0.002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28270  transcriptional regulator  36.92 
 
 		 205 aa  43.9  0.002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.188874 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0051  transcriptional regulator, TetR family  31.65 
 
 		 250 aa  43.5  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0250  transcriptional regulator, TetR family  32.61 
 
 		 201 aa  43.9  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.804071  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0054  transcriptional regulator, TetR family  31.65 
 
 		 250 aa  43.5  0.002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2626  TetR family transcriptional regulator  24.26 
 
 		 188 aa  43.9  0.002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6580  transcriptional regulator, TetR family  25.68 
 
 		 242 aa  43.5  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.603144 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2209  TetR family transcriptional regulator  26.23 
 
 		 205 aa  43.5  0.002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.539658  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4773  TetR family transcriptional regulator  25.68 
 
 		 212 aa  43.5  0.002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000164473  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2689  TetR family transcriptional regulator  40.85 
 
 		 230 aa  43.5  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0452  TetR family transcriptional regulator  28.16 
 
 		 212 aa  43.9  0.002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.681881  decreased coverage  0.00000297509 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4348  TetR family transcriptional regulator  29.07 
 
 		 174 aa  43.5  0.002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>