More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_3834 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_3834  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 216 aa  444  1.0000000000000001e-124  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000963392 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0969  TetR family transcriptional regulator  81.02 
 
 		 216 aa  366  1e-100  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.19098 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03740  transcriptional regulator, TetR family  31.8 
 
 		 221 aa  135  7.000000000000001e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23280  transcriptional regulator, TetR family  42.17 
 
 		 225 aa  121  7e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4675  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 217 aa  107  1e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3140  TetR family transcriptional regulator  29.36 
 
 		 212 aa  107  2e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3090  TetR family transcriptional regulator  31.94 
 
 		 218 aa  101  7e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.595832  hitchhiker  0.000923351 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03730  transcriptional regulator, TetR family  27.98 
 
 		 215 aa  95.9  4e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1584  transcriptional regulator, TetR family  28.12 
 
 		 211 aa  79.7  0.00000000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1859  transcriptional regulator  48.57 
 
 		 179 aa  74.3  0.000000000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0322  transcriptional regulator, TetR family  34.4 
 
 		 223 aa  72  0.000000000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.541277 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1759  transcriptional regulator  48.57 
 
 		 173 aa  70.5  0.00000000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.0000000118855  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2161  transcriptional regulator, TetR family  26.97 
 
 		 204 aa  69.3  0.00000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1640  TetR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 216 aa  68.2  0.0000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.305588 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2456  transcriptional regulator, TetR family  27.68 
 
 		 211 aa  67  0.0000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0797268  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0688  transcriptional regulator  37.23 
 
 		 189 aa  65.5  0.0000000005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0081  transcriptional regulator, TetR family  42.86 
 
 		 211 aa  65.5  0.0000000007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1837  TetR family transcriptional regulator  31.73 
 
 		 202 aa  63.2  0.000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3834  transcriptional regulator, TetR family  46.03 
 
 		 218 aa  62.4  0.000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0733  transcriptional regulator  41.18 
 
 		 182 aa  61.2  0.00000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1710  transcriptional regulator  47.69 
 
 		 214 aa  60.8  0.00000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0815  transcriptional regulator, TetR family  30.34 
 
 		 207 aa  60.5  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1692  transcriptional regulator, TetR family  40.62 
 
 		 224 aa  60.8  0.00000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1444  transcriptional regulator, TetR family  42.03 
 
 		 225 aa  58.5  0.00000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0101817  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2521  TetR family transcriptional regulator  26.63 
 
 		 200 aa  57  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1550  TetR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 214 aa  57  0.0000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.147371  normal  0.894594 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3467  TetR family transcriptional regulator  29.45 
 
 		 228 aa  57.4  0.0000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.170203  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2592  transcriptional regulator, TetR family  34.48 
 
 		 205 aa  57  0.0000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000712719  hitchhiker  0.00165626 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1061  transcriptional regulator, TetR family  26.92 
 
 		 196 aa  56.2  0.0000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0250707  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0281  transcriptional regulator, TetR family  25.16 
 
 		 218 aa  56.2  0.0000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.645912  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1633  TetR family transcriptional regulator  28.45 
 
 		 210 aa  56.2  0.0000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.124131  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3060  TetR family transcriptional regulator  26.26 
 
 		 230 aa  55.5  0.0000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0482313 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13324  TetR family transcriptional regulator  30.26 
 
 		 221 aa  55.1  0.0000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.119785  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3330  TetR family transcriptional regulator  28.95 
 
 		 225 aa  54.3  0.000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.648103  normal  0.907597 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0203  regulatory protein TetR  36.62 
 
 		 186 aa  54.3  0.000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.041689  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0393  TetR family transcriptional regulator  36.51 
 
 		 215 aa  53.9  0.000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1255  TetR family transcriptional regulator  33.67 
 
 		 200 aa  54.3  0.000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0536  transcriptional regulator, TetR family  40.62 
 
 		 204 aa  53.9  0.000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.613933  normal  0.25181 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4215  TetR family transcriptional regulator  36 
 
 		 229 aa  53.9  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.582437  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4281  TetR family transcriptional regulator  36 
 
 		 229 aa  53.9  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.439471  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4442  TetR family transcriptional regulator  36 
 
 		 229 aa  54.3  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1867  transcriptional regulator, TetR family  25.15 
 
 		 201 aa  52.4  0.000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.129849  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0515  transcriptional regulator, TetR family  25.32 
 
 		 211 aa  52  0.000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3153  transcriptional regulator, TetR family  29.23 
 
 		 243 aa  52  0.000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.12439 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17960  transcriptional regulator, TetR family  29.11 
 
 		 208 aa  52.4  0.000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.134645  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4533  transcriptional regulator, TetR family  26.06 
 
 		 197 aa  52  0.000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0585795  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7494  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 188 aa  51.6  0.000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1314  transcriptional regulator, TetR family  48.84 
 
 		 201 aa  51.2  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.2142  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10234  TetR/AcrR family transcriptional regulator  27.54 
 
 		 229 aa  51.6  0.00001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0199  transcriptional regulator, TetR family  24.53 
 
 		 202 aa  50.8  0.00001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.251087  normal  0.943452 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04360  transcriptional regulator  23.73 
 
 		 194 aa  51.2  0.00001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4802  TetR family transcriptional regulator  29.46 
 
 		 215 aa  51.6  0.00001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.96494  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3721  transcriptional regulator, TetR family  24.75 
 
 		 260 aa  51.6  0.00001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.249433  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3293  transcriptional regulator, TetR family  35 
 
 		 200 aa  51.2  0.00001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000151669  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2755  TetR family transcriptional regulator  26.88 
 
 		 200 aa  50.4  0.00002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4449  TetR family transcriptional regulator  25.58 
 
 		 237 aa  50.1  0.00002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4838  transcriptional regulator, TetR family  31.58 
 
 		 217 aa  50.1  0.00003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3295  transcriptional regulator, TetR family  34.85 
 
 		 208 aa  50.1  0.00003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1603  transcriptional regulator, TetR family  25.68 
 
 		 189 aa  50.1  0.00003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0115969  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2996  TetR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 193 aa  50.1  0.00003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.542374  normal  0.411304 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1458  TetR family transcriptional regulator  28.69 
 
 		 209 aa  49.7  0.00003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.121951 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4343  transcriptional regulator, TetR family  30.68 
 
 		 225 aa  49.3  0.00004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0349599  decreased coverage  0.000000750918 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5197  transcriptional regulator, TetR family  25.51 
 
 		 211 aa  49.7  0.00004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.128867  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1745  TetR family transcriptional regulator  27.01 
 
 		 195 aa  49.7  0.00004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0399082  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5087  TetR family transcriptional regulator  32.02 
 
 		 259 aa  49.3  0.00004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5773  TetR family transcriptional regulator  32.02 
 
 		 259 aa  49.3  0.00004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.669739 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2444  transcriptional regulator, TetR family  27.81 
 
 		 211 aa  49.7  0.00004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0505938 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3545  transcriptional regulator, TetR family  30.51 
 
 		 192 aa  48.9  0.00005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5345  transcriptional regulator, TetR family  52.38 
 
 		 196 aa  49.3  0.00005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.745934  normal  0.0675507 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0795  TetR family transcriptional regulator  31.18 
 
 		 199 aa  49.3  0.00005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00985009  normal  0.205797 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1963  transcriptional regulator, TetR family  27.01 
 
 		 201 aa  48.9  0.00005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000168283 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2014  TetR family transcriptional regulator  22.09 
 
 		 196 aa  48.9  0.00006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0449612  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1968  TetR family transcriptional regulator  22.09 
 
 		 196 aa  48.9  0.00006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0105465  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4588  transcriptional regulator, TetR family  30.51 
 
 		 206 aa  48.9  0.00006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.112472 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2169  TetR family transcriptional regulator  22.09 
 
 		 196 aa  48.9  0.00006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000817381  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3540  TetR family transcriptional regulator  39.06 
 
 		 250 aa  48.9  0.00006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1778  TetR family transcriptional regulator  22.6 
 
 		 199 aa  48.5  0.00007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0789135  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0521  putative transcriptional regulator, TetR family  45.28 
 
 		 215 aa  48.5  0.00009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5281  TetR family transcriptional regulator  40.68 
 
 		 257 aa  48.1  0.00009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0239  TetR family transcriptional regulator  32.88 
 
 		 229 aa  48.1  0.00009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2312  transcriptional regulator, TetR family  22.09 
 
 		 196 aa  47.8  0.0001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000153851  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03806  transcriptional regulator, TetR family  24.53 
 
 		 206 aa  48.1  0.0001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4804  transcriptional regulator, TetR family  33.78 
 
 		 201 aa  47.8  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.120851  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3299  transcriptional regulator, TetR family  23.42 
 
 		 201 aa  47.8  0.0001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.0000000002111  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2229  TetR family transcriptional regulator  22.67 
 
 		 196 aa  48.1  0.0001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00028806  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35560  transcriptional regulator  25.73 
 
 		 200 aa  47.8  0.0001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1986  TetR family transcriptional regulator  22.09 
 
 		 196 aa  47.8  0.0001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000218655  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4405  TetR family transcriptional regulator  31.46 
 
 		 259 aa  48.1  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.630882  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6288  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 237 aa  47.8  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2639  transcriptional regulator, TetR family  37.25 
 
 		 196 aa  48.1  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.302097  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3836  transcriptional regulator, TetR family  27.97 
 
 		 192 aa  47.8  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.410307  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3225  TetR family transcriptional regulator  23.49 
 
 		 195 aa  47.8  0.0001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0994  transcriptional regulator, TetR family  23.26 
 
 		 214 aa  47.8  0.0001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.146386  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3815  regulatory protein, TetR  23.5 
 
 		 252 aa  47.8  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00651597  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4014  transcriptional regulator, TetR family  29.55 
 
 		 225 aa  47.8  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3506  TetR family transcriptional regulator  30.38 
 
 		 199 aa  48.1  0.0001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0158634  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16730  transcriptional regulator, TetR family  26.53 
 
 		 213 aa  47.8  0.0001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3405  TetR family transcriptional regulator  35.16 
 
 		 207 aa  47.8  0.0001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0751749 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0340  transcriptional regulator, TetR family  35.21 
 
 		 388 aa  47.8  0.0001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3703  DNA-binding transcriptional regulator EnvR  24.06 
 
 		 215 aa  47.8  0.0001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.83778 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>