More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_0203 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_0203  regulatory protein TetR  100 
 
 		 186 aa  355  9.999999999999999e-98  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.041689  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1927  TetR family transcriptional regulator  52.15 
 
 		 198 aa  162  4.0000000000000004e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3652  regulatory protein TetR  48.9 
 
 		 188 aa  139  3e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2375  TetR family transcriptional regulator  51.23 
 
 		 191 aa  129  4.0000000000000003e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.826028  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2422  TetR family transcriptional regulator  51.23 
 
 		 191 aa  129  4.0000000000000003e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.04833  normal  0.11925 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2416  TetR family transcriptional regulator  51.23 
 
 		 191 aa  129  4.0000000000000003e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.112157  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7494  transcriptional regulator, TetR family  41.99 
 
 		 188 aa  127  1.0000000000000001e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2298  TetR family transcriptional regulator  50.62 
 
 		 207 aa  126  2.0000000000000002e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1650  regulatory protein TetR  50.9 
 
 		 203 aa  121  4e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0671734  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5390  transcriptional regulator, TetR family  45.73 
 
 		 202 aa  121  6e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1572  regulatory protein TetR  47.57 
 
 		 208 aa  118  3.9999999999999996e-26  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4347  transcriptional regulator, TetR family  40.84 
 
 		 191 aa  111  5e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.685734 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5330  transcriptional regulator, TetR family  45.4 
 
 		 190 aa  107  8.000000000000001e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4559  transcriptional regulator, TetR family  41.07 
 
 		 192 aa  104  7e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.685616  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4794  transcriptional regulator, TetR family  42.68 
 
 		 187 aa  103  1e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2116  transcriptional regulator, TetR family  42.7 
 
 		 192 aa  102  3e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14390  transcriptional regulator, tetR family  37.57 
 
 		 183 aa  85.1  6e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0243  transcriptional regulator  31.67 
 
 		 181 aa  85.1  6e-16  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3700  transcriptional regulator, TetR family  33.52 
 
 		 186 aa  82  0.000000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4596  TetR family transcriptional regulator  32.79 
 
 		 204 aa  79.7  0.00000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.887184 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14590  transcriptional regulator, tetR family  32.97 
 
 		 200 aa  73.9  0.000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0635  transcription regulator protein  31.32 
 
 		 216 aa  72.8  0.000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1291  transcriptional regulator, TetR family  39.39 
 
 		 190 aa  72.4  0.000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.170651  normal  0.326718 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2372  transcriptional regulator, TetR family  30.86 
 
 		 236 aa  68.6  0.00000000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0103  transcriptional regulator, TetR family  35.37 
 
 		 210 aa  68.2  0.00000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6173  transcriptional regulator, TetR family  29.55 
 
 		 202 aa  62.4  0.000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1028  regulatory protein TetR  37.8 
 
 		 262 aa  61.6  0.000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.190494  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4583  putative transcriptional regulator, TetR family  48.72 
 
 		 200 aa  61.2  0.000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.181423  normal  0.302497 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3839  TetR family transcriptional regulator  31.53 
 
 		 251 aa  61.2  0.000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.275978 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1989  transcriptional regulator, TetR family  42.68 
 
 		 216 aa  60.1  0.00000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0780  transcriptional regulator, TetR family  31.25 
 
 		 205 aa  59.3  0.00000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00331259  decreased coverage  0.000414604 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4877  transcriptional regulator, TetR family  52.73 
 
 		 201 aa  56.2  0.0000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.268958  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1646  TetR family transcriptional regulator  34.26 
 
 		 233 aa  55.8  0.0000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3949  transcriptional regulator, TetR family  35.45 
 
 		 210 aa  55.8  0.0000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0865952  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0989  TetR family transcriptional regulator  36.79 
 
 		 199 aa  55.5  0.0000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0113  transcriptional regulator, TetR family  31.28 
 
 		 211 aa  55.1  0.0000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.987214  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4838  transcriptional regulator, TetR family  40.28 
 
 		 217 aa  54.7  0.0000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2987  hypothetical protein  30.5 
 
 		 219 aa  54.7  0.0000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3834  TetR family transcriptional regulator  36.62 
 
 		 216 aa  54.7  0.0000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000963392 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1013  TetR family transcriptional regulator  42.62 
 
 		 209 aa  54.3  0.000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.421012  normal  0.993866 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0257  transcriptional regulator, TetR family  36.94 
 
 		 183 aa  53.1  0.000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.115958 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12230  transcriptional regulator  45.76 
 
 		 199 aa  53.1  0.000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1045  transcriptional regulator, TetR family  34.04 
 
 		 203 aa  53.1  0.000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00830488  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1551  TetR family transcriptional regulator  31.95 
 
 		 227 aa  52.8  0.000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.386957  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3008  transcriptional regulator, TetR family  34.59 
 
 		 280 aa  52.8  0.000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1711  putative transcriptional regulator, TetR family  33.53 
 
 		 208 aa  52.8  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.195446 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3152  transcriptional regulator, TetR family  48.21 
 
 		 248 aa  52.8  0.000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.262017  normal  0.121031 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3153  transcriptional regulator, TetR family  38.52 
 
 		 243 aa  52  0.000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.12439 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0772  transcriptional regulator, TetR family  29.34 
 
 		 212 aa  52.4  0.000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2993  TetR family transcriptional regulator  31.76 
 
 		 206 aa  52.4  0.000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1709  transcriptional regulator, TetR family  24.73 
 
 		 193 aa  52.4  0.000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3410  TetR family transcriptional regulator  30.08 
 
 		 196 aa  52.4  0.000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000655293  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4029  TetR family transcriptional regulator  50.98 
 
 		 196 aa  52.4  0.000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1275  transcriptional regulator, TetR family  22.83 
 
 		 200 aa  52  0.000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8390  putative transcriptional regulator, TetR family  30.64 
 
 		 222 aa  51.6  0.000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5885  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 203 aa  51.6  0.000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.687121 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2350  transcriptional regulator, TetR family  32.53 
 
 		 230 aa  51.2  0.000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000443807  hitchhiker  0.00368666 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4936  TetR family transcriptional regulator  41.54 
 
 		 211 aa  51.2  0.000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4604  transcriptional regulator, TetR family  42.11 
 
 		 255 aa  51.2  0.000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0257  TetR family transcriptional regulator  35.04 
 
 		 201 aa  51.2  0.000009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.837987 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4864  transcriptional regulator, TetR family  32.85 
 
 		 236 aa  50.4  0.00001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2355  transcriptional regulator, TetR family  41.18 
 
 		 204 aa  50.8  0.00001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.284642  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2434  TetR family transcriptional regulator  48.98 
 
 		 188 aa  50.8  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7136  transcriptional regulator, TetR family  32.33 
 
 		 237 aa  50.1  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00720754  normal  0.217815 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5720  TetR family transcriptional regulator  39.02 
 
 		 291 aa  49.7  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.649137  normal  0.760569 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4572  transcriptional regulator, TetR family  37.5 
 
 		 200 aa  50.1  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.209013  normal  0.793533 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0274  transcriptional regulator, TetR family  43.75 
 
 		 192 aa  50.1  0.00002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.160629  normal  0.0104752 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1436  TetR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 197 aa  50.1  0.00002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0969  TetR family transcriptional regulator  43.48 
 
 		 216 aa  50.1  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.19098 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23110  transcriptional regulator  34.88 
 
 		 203 aa  50.1  0.00002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2883  transcriptional regulator, TetR family  39.77 
 
 		 195 aa  50.4  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.256454  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6254  putative transcriptional regulator, TetR family  46.88 
 
 		 208 aa  49.3  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.170118  normal  0.0153866 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4691  TetR family transcriptional regulator  35.09 
 
 		 205 aa  49.3  0.00003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.771858  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5861  transcriptional regulator, TetR family  32.2 
 
 		 197 aa  49.7  0.00003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.356858 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6158  TetR family transcriptional regulator  35.35 
 
 		 212 aa  49.3  0.00003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.488727  normal  0.104212 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0865  TetR family transcriptional regulator  49.02 
 
 		 211 aa  49.3  0.00003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5197  transcriptional regulator, TetR family  35.79 
 
 		 211 aa  49.3  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.128867  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4777  TetR family transcriptional regulator  35.09 
 
 		 205 aa  49.3  0.00003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.681727  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2282  TetR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 217 aa  49.3  0.00004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2557  TetR family transcriptional regulator  39.68 
 
 		 250 aa  48.9  0.00004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.705718  normal  0.759568 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0172  TetR family transcriptional regulator  46.03 
 
 		 208 aa  49.3  0.00004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.143032  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3781  regulatory protein TetR  28.06 
 
 		 209 aa  48.9  0.00004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0489772  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2353  TetR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 217 aa  49.3  0.00004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.384863  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0196  transcriptional regulator, TetR family  29.46 
 
 		 200 aa  49.3  0.00004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5076  TetR family transcriptional regulator  35.09 
 
 		 215 aa  48.9  0.00004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.175697 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3846  transcriptional regulator, TetR family  32.14 
 
 		 206 aa  48.9  0.00004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.213396  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0951  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 196 aa  48.9  0.00005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2085  transcriptional regulator, TetR family  44.9 
 
 		 210 aa  48.5  0.00005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3328  TetR family transcriptional regulator  29.48 
 
 		 226 aa  48.5  0.00005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.524569 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2878  TetR family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 202 aa  48.5  0.00005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3466  TetR family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 200 aa  48.5  0.00005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4216  transcriptional regulator, TetR family  35.44 
 
 		 215 aa  48.9  0.00005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0223  transcriptional regulator, TetR family  35.23 
 
 		 195 aa  48.5  0.00005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000853805  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1971  transcriptional regulator, TetR family  36.23 
 
 		 196 aa  48.9  0.00005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3316  transcriptional regulator, TetR family  37.68 
 
 		 249 aa  48.9  0.00005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.655704  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16700  transcriptional regulator  44.23 
 
 		 211 aa  48.1  0.00006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2366  transcriptional regulator, TetR family  42.11 
 
 		 211 aa  48.1  0.00007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000270806  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2488  transcriptional regulator, TetR family  49.02 
 
 		 215 aa  48.1  0.00007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.930531  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8507  putative transcriptional regulator, TetR family  42.22 
 
 		 199 aa  48.1  0.00007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.899046 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1676  TetR family transcriptional regulator  48.08 
 
 		 201 aa  48.1  0.00007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.257121  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>