40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lreu_1859 on replicon NC_009513
Organism: Lactobacillus reuteri DSM 20016



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009513  Lreu_1859  transcriptional regulator  100 
 
 		 179 aa  375  1e-103  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0733  transcriptional regulator  42.61 
 
 		 182 aa  130  9e-30  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1759  transcriptional regulator  42.69 
 
 		 173 aa  127  7.000000000000001e-29  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.0000000118855  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3834  TetR family transcriptional regulator  48.57 
 
 		 216 aa  74.3  0.0000000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000963392 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0969  TetR family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 216 aa  73.6  0.000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.19098 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4675  transcriptional regulator, TetR family  41.18 
 
 		 217 aa  66.6  0.0000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0688  transcriptional regulator  40.28 
 
 		 189 aa  65.9  0.0000000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03740  transcriptional regulator, TetR family  41.79 
 
 		 221 aa  63.9  0.000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1710  transcriptional regulator  40.28 
 
 		 214 aa  62.4  0.000000003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23280  transcriptional regulator, TetR family  40.3 
 
 		 225 aa  62.4  0.000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3140  TetR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 212 aa  58.9  0.00000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1584  transcriptional regulator, TetR family  25.95 
 
 		 211 aa  57.8  0.00000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3090  TetR family transcriptional regulator  26.37 
 
 		 218 aa  57.4  0.0000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.595832  hitchhiker  0.000923351 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0322  transcriptional regulator, TetR family  39.71 
 
 		 223 aa  56.2  0.0000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.541277 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03730  transcriptional regulator, TetR family  32.35 
 
 		 215 aa  52  0.000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3834  transcriptional regulator, TetR family  30.16 
 
 		 218 aa  48.9  0.00004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0191  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 210 aa  47.8  0.0001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1837  TetR family transcriptional regulator  32.61 
 
 		 202 aa  47.4  0.0001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3060  TetR family transcriptional regulator  29.85 
 
 		 230 aa  46.6  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0482313 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0393  TetR family transcriptional regulator  32.81 
 
 		 215 aa  46.6  0.0002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0455  TetR family transcriptional regulator  35.19 
 
 		 224 aa  45.1  0.0006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.366206  normal  0.106872 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1791  regulatory protein, TetR  28.42 
 
 		 246 aa  44.7  0.0007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00350194  normal  0.153158 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3295  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 208 aa  43.9  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3669  TetR family transcriptional regulator  28.87 
 
 		 243 aa  43.9  0.001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.433868  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5306  TetR family transcriptional regulator  27.55 
 
 		 219 aa  43.9  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.190126 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1692  transcriptional regulator, TetR family  34.33 
 
 		 224 aa  43.5  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3467  TetR family transcriptional regulator  29.85 
 
 		 228 aa  43.1  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.170203  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1946  transcriptional regulator, TetR family  32.81 
 
 		 191 aa  43.1  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.173435  hitchhiker  0.00972871 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4313  transcriptional regulator, TetR family  27 
 
 		 238 aa  42.7  0.003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4442  TetR family transcriptional regulator  29.85 
 
 		 229 aa  42.7  0.003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4281  TetR family transcriptional regulator  29.85 
 
 		 229 aa  42.7  0.003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.439471  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4215  TetR family transcriptional regulator  29.85 
 
 		 229 aa  42.7  0.003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.582437  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3783  TetR family transcriptional regulator  29.13 
 
 		 197 aa  42.4  0.004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.539516 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10234  TetR/AcrR family transcriptional regulator  26.87 
 
 		 229 aa  41.6  0.006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1592  transcriptional regulator, TetR family  40.91 
 
 		 198 aa  41.6  0.006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2041  TetR family transcriptional regulator  25.42 
 
 		 211 aa  41.2  0.007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0716  TetR family transcriptional regulator  27.96 
 
 		 211 aa  41.6  0.007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.281964  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4245  regulatory protein, TetR  30.51 
 
 		 221 aa  41.2  0.008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.933468  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1253  TetR family transcriptional regulator  25.93 
 
 		 200 aa  40.8  0.01  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000989157 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4654  transcriptional regulator, TetR family  31.13 
 
 		 199 aa  40.8  0.01  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.416931  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>