More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_3834 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013510  Tcur_3834  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 218 aa  449  1e-125  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3060  TetR family transcriptional regulator  47.87 
 
 		 230 aa  195  5.000000000000001e-49  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0482313 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4442  TetR family transcriptional regulator  47.39 
 
 		 229 aa  191  7e-48  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4215  TetR family transcriptional regulator  47.39 
 
 		 229 aa  191  8e-48  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.582437  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4281  TetR family transcriptional regulator  47.39 
 
 		 229 aa  191  8e-48  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.439471  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10234  TetR/AcrR family transcriptional regulator  47.87 
 
 		 229 aa  186  2e-46  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3467  TetR family transcriptional regulator  47.87 
 
 		 228 aa  175  5e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.170203  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03730  transcriptional regulator, TetR family  31.25 
 
 		 215 aa  83.2  0.000000000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3140  TetR family transcriptional regulator  30.86 
 
 		 212 aa  78.6  0.00000000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3090  TetR family transcriptional regulator  27.88 
 
 		 218 aa  77.8  0.0000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.595832  hitchhiker  0.000923351 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03740  transcriptional regulator, TetR family  27.54 
 
 		 221 aa  73.6  0.000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1837  TetR family transcriptional regulator  32.8 
 
 		 202 aa  68.6  0.00000000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23280  transcriptional regulator, TetR family  25.79 
 
 		 225 aa  67  0.0000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0322  transcriptional regulator, TetR family  43.08 
 
 		 223 aa  63.9  0.000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.541277 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2628  transcriptional regulator, TetR family  27.56 
 
 		 194 aa  63.2  0.000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00732346  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3466  TetR family transcriptional regulator  27.44 
 
 		 200 aa  63.2  0.000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1692  transcriptional regulator, TetR family  43.33 
 
 		 224 aa  63.2  0.000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4675  transcriptional regulator, TetR family  34.15 
 
 		 217 aa  62.8  0.000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3834  TetR family transcriptional regulator  46.03 
 
 		 216 aa  62.4  0.000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000963392 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3295  transcriptional regulator, TetR family  37.66 
 
 		 208 aa  62.4  0.000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0969  TetR family transcriptional regulator  45.31 
 
 		 216 aa  61.6  0.00000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.19098 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1090  transcriptional regulator, TetR family  24.47 
 
 		 204 aa  59.3  0.00000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.141216  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2488  TetR family transcriptional regulator  25.86 
 
 		 201 aa  57.8  0.0000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0524247 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2696  TetR family transcriptional regulator  26.79 
 
 		 196 aa  57.4  0.0000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.834085 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3714  transcriptional regulator, TetR family  27.54 
 
 		 226 aa  56.6  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.576002 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1778  TetR family transcriptional regulator  31.07 
 
 		 199 aa  56.2  0.0000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0789135  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3838  transcriptional regulator TetR family  34.85 
 
 		 230 aa  55.8  0.0000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.606304  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0081  transcriptional regulator, TetR family  32.46 
 
 		 211 aa  56.2  0.0000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0698  putative transcription regulator protein  26.34 
 
 		 264 aa  55.8  0.0000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00682473  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1052  TetR family transcriptional regulator  28.39 
 
 		 215 aa  55.8  0.0000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.857726  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2233  TetR family transcriptional regulator  33.06 
 
 		 187 aa  55.8  0.0000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.749736  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0018  TetR family transcriptional regulator  26.82 
 
 		 196 aa  55.5  0.0000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1584  transcriptional regulator, TetR family  24.56 
 
 		 211 aa  55.5  0.0000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5607  transcriptional regulator, TetR family  36.17 
 
 		 209 aa  55.1  0.0000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.897418  normal  0.557491 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4464  TetR family transcriptional regulator  24.58 
 
 		 204 aa  55.1  0.0000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0680244 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2115  TetR family transcriptional regulator  38.16 
 
 		 213 aa  55.1  0.0000008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.00202765  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3416  transcriptional regulator, TetR family  32.32 
 
 		 226 aa  55.1  0.0000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.180038  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4652  TetR family transcriptional regulator  23.6 
 
 		 195 aa  54.3  0.000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4421  TetR family transcriptional regulator  23.6 
 
 		 195 aa  54.3  0.000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4260  transcriptional regulator  23.6 
 
 		 195 aa  54.3  0.000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4272  transcriptional regulator  23.6 
 
 		 195 aa  54.3  0.000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4762  TetR family transcriptional regulator  23.6 
 
 		 195 aa  54.3  0.000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4353  TetR family transcriptional regulator  23.6 
 
 		 195 aa  54.7  0.000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4637  transcriptional regulator, TetR family  23.6 
 
 		 195 aa  54.3  0.000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2161  transcriptional regulator, TetR family  38.46 
 
 		 204 aa  54.7  0.000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1720  TetR family transcriptional regulator  31.07 
 
 		 200 aa  54.3  0.000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6189  TetR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 210 aa  54.3  0.000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.304814  normal  0.805788 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4104  TetR family transcriptional regulator  29.75 
 
 		 438 aa  54.3  0.000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2456  transcriptional regulator, TetR family  37.1 
 
 		 211 aa  53.9  0.000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0797268  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4635  regulatory protein, TetR  28.15 
 
 		 226 aa  53.5  0.000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4306  TetR family transcriptional regulator  31.63 
 
 		 202 aa  53.9  0.000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.651969  normal  0.688785 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1936  transcriptional regulator, TetR family  29.47 
 
 		 193 aa  53.9  0.000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3407  TetR family transcriptional regulator  40.68 
 
 		 218 aa  53.9  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0155576  normal  0.84746 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0976  regulatory protein TetR  32.08 
 
 		 204 aa  53.9  0.000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  decreased coverage  0.00018682  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3330  TetR family transcriptional regulator  27.89 
 
 		 225 aa  53.5  0.000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.648103  normal  0.907597 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1940  TetR family transcriptional regulator  26.19 
 
 		 198 aa  53.1  0.000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.688335  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2214  transcriptional regulator, TetR family  28.12 
 
 		 201 aa  53.1  0.000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000301704  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4653  transcriptional regulator, TetR family  22.98 
 
 		 195 aa  53.1  0.000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4633  transcriptional regulator, TetR family  22.98 
 
 		 195 aa  53.1  0.000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.169287  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0955  TetR family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 218 aa  53.1  0.000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1550  TetR family transcriptional regulator  32.94 
 
 		 214 aa  52.8  0.000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.147371  normal  0.894594 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1049  TetR family transcriptional regulator  41.89 
 
 		 230 aa  52.8  0.000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0599696  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2669  transcriptional regulator, TetR family  44.23 
 
 		 226 aa  52.8  0.000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00411812  normal  0.199475 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1045  TetR family transcriptional regulator  26.61 
 
 		 226 aa  52.8  0.000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.446098  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1944  TetR family transcriptional regulator  37.88 
 
 		 234 aa  52.8  0.000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.358022  decreased coverage  0.0015067 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0602  transcriptional regulator, TetR family  22.98 
 
 		 195 aa  52.4  0.000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4112  TetR family transcriptional regulator  30.26 
 
 		 183 aa  52.8  0.000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0592835  normal  0.670519 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0646  TetR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 213 aa  52.4  0.000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.545029 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_5999  transcriptional regulator, TetR family  39.06 
 
 		 215 aa  52.4  0.000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2034  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 216 aa  52  0.000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.480509  normal  0.0875613 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0688  transcriptional regulator  23.81 
 
 		 189 aa  52.4  0.000006  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4638  putative transcriptional regulator, TetR family  26.06 
 
 		 196 aa  52  0.000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.856697 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0118  TetR family transcriptional regulator  39.29 
 
 		 247 aa  52  0.000007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.211628  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0654  transcriptional regulator, TetR family  32.81 
 
 		 185 aa  52  0.000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1592  transcriptional regulator, TetR family  28.1 
 
 		 198 aa  52  0.000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0109  TetR family transcriptional regulator  39.29 
 
 		 247 aa  52  0.000007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1768  TetR family transcriptional regulator  27.43 
 
 		 211 aa  52  0.000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.570427  normal  0.275415 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1444  transcriptional regulator, TetR family  39.62 
 
 		 225 aa  52  0.000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0101817  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1756  transcriptional regulator, TetR family  32.84 
 
 		 205 aa  51.6  0.000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000229906 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0648  transcriptional regulator, TetR family  26.2 
 
 		 247 aa  52  0.000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0672593 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2504  putative transcriptional regulator, TetR family  34 
 
 		 188 aa  51.6  0.000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.228654 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2704  TetR family transcriptional regulator  32.61 
 
 		 203 aa  51.6  0.000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.187148 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1965  TetR family transcriptional regulator  25.48 
 
 		 206 aa  51.6  0.000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0526053  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4225  TetR family transcriptional regulator  39.29 
 
 		 244 aa  51.2  0.00001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.127157  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0828  transcriptional regulator, TetR family  23.81 
 
 		 195 aa  51.2  0.00001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0092  transcriptional regulator, TetR family  26.54 
 
 		 210 aa  51.2  0.00001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.367108  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0286  TetR family transcriptional regulator  28.87 
 
 		 186 aa  50.8  0.00001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0607  transcriptional regulator, TetR family  26.2 
 
 		 255 aa  51.2  0.00001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.118397  normal  0.590685 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5412  TetR family transcriptional regulator  28.89 
 
 		 212 aa  51.2  0.00001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00435132  normal  0.234222 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1620  TetR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 196 aa  50.8  0.00001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.0021024  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0652  transcriptional regulator, TetR family  23.46 
 
 		 190 aa  50.8  0.00001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00127288  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1633  TetR family transcriptional regulator  30.33 
 
 		 210 aa  50.8  0.00001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.124131  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0665  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 		 195 aa  51.2  0.00001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5356  transcriptional regulator, TetR family  30.19 
 
 		 201 aa  51.2  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3377  transcriptional regulator, TetR family  35.53 
 
 		 197 aa  50.8  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.27921  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04380  transcriptional regulator, TetR family  38.18 
 
 		 72 aa  50.4  0.00002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2602  transcriptional regulator, TetR family  27.53 
 
 		 214 aa  50.1  0.00002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.157273  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1012  transcriptional regulator, TetR family  37.93 
 
 		 212 aa  50.4  0.00002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.156612  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2367  TetR family transcriptional regulator  36.23 
 
 		 202 aa  50.4  0.00002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.445055  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4014  transcriptional regulator, TetR family  28.74 
 
 		 225 aa  50.1  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>