More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hore_03740 on replicon NC_011899
Organism: Halothermothrix orenii H 168



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011899  Hore_03740  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 221 aa  441  1e-123  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3834  TetR family transcriptional regulator  31.8 
 
 		 216 aa  135  7.000000000000001e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000963392 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03730  transcriptional regulator, TetR family  35.62 
 
 		 215 aa  125  5e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0969  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 216 aa  121  9e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.19098 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23280  transcriptional regulator, TetR family  34.67 
 
 		 225 aa  118  6e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4675  transcriptional regulator, TetR family  37.5 
 
 		 217 aa  110  2.0000000000000002e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3140  TetR family transcriptional regulator  28.89 
 
 		 212 aa  100  2e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1584  transcriptional regulator, TetR family  29.51 
 
 		 211 aa  92  7e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3090  TetR family transcriptional regulator  26.36 
 
 		 218 aa  86.3  4e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.595832  hitchhiker  0.000923351 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1444  transcriptional regulator, TetR family  28.38 
 
 		 225 aa  78.2  0.0000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0101817  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2592  transcriptional regulator, TetR family  28.14 
 
 		 205 aa  75.5  0.0000000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000712719  hitchhiker  0.00165626 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1710  transcriptional regulator  50 
 
 		 214 aa  73.6  0.000000000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2161  transcriptional regulator, TetR family  26.63 
 
 		 204 aa  73.9  0.000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0081  transcriptional regulator, TetR family  47.13 
 
 		 211 aa  73.2  0.000000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1692  transcriptional regulator, TetR family  36.13 
 
 		 224 aa  72.8  0.000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0322  transcriptional regulator, TetR family  47.76 
 
 		 223 aa  71.2  0.00000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.541277 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3293  transcriptional regulator, TetR family  27.57 
 
 		 200 aa  70.9  0.00000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000151669  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3467  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 228 aa  70.1  0.00000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.170203  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3834  transcriptional regulator, TetR family  27.65 
 
 		 218 aa  69.7  0.00000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3060  TetR family transcriptional regulator  25.64 
 
 		 230 aa  68.9  0.00000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0482313 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4215  TetR family transcriptional regulator  27.98 
 
 		 229 aa  67  0.0000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.582437  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4281  TetR family transcriptional regulator  27.98 
 
 		 229 aa  67  0.0000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.439471  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4442  TetR family transcriptional regulator  27.98 
 
 		 229 aa  67  0.0000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1837  TetR family transcriptional regulator  29.56 
 
 		 202 aa  67  0.0000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2456  transcriptional regulator, TetR family  48.48 
 
 		 211 aa  65.5  0.0000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0797268  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1859  transcriptional regulator  41.79 
 
 		 179 aa  63.9  0.000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1550  TetR family transcriptional regulator  25.25 
 
 		 214 aa  63.9  0.000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.147371  normal  0.894594 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04360  transcriptional regulator  45.31 
 
 		 194 aa  63.5  0.000000003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2120  transcriptional regulator, TetR family  23.78 
 
 		 198 aa  62.4  0.000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2816  hypothetical protein  25.57 
 
 		 222 aa  62  0.000000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0366008  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1759  transcriptional regulator  44.78 
 
 		 173 aa  61.6  0.000000009  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.0000000118855  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3295  transcriptional regulator, TetR family  43.94 
 
 		 208 aa  61.2  0.00000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3416  transcriptional regulator, TetR family  24.43 
 
 		 226 aa  61.6  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.180038  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1401  TetR family transcriptional regulator  22.6 
 
 		 222 aa  60.8  0.00000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.513329  normal  0.505278 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0109  TetR family transcriptional regulator  26.14 
 
 		 207 aa  60.8  0.00000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10234  TetR/AcrR family transcriptional regulator  26.42 
 
 		 229 aa  60.5  0.00000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3714  transcriptional regulator, TetR family  23.87 
 
 		 226 aa  58.9  0.00000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.576002 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1633  TetR family transcriptional regulator  48.33 
 
 		 210 aa  58.9  0.00000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.124131  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0536  transcriptional regulator, TetR family  38.89 
 
 		 204 aa  58.5  0.00000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.613933  normal  0.25181 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4231  transcriptional regulator, TetR family  39.02 
 
 		 191 aa  58.5  0.00000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0191  TetR family transcriptional regulator  34.02 
 
 		 210 aa  58.5  0.00000007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3293  TetR family transcriptional regulator  22.65 
 
 		 190 aa  58.5  0.00000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00124137 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4067  TetR family transcriptional regulator  40.91 
 
 		 191 aa  58.5  0.00000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.200915  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4114  TetR family transcriptional regulator  40.91 
 
 		 191 aa  58.5  0.00000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3955  TetR family transcriptional regulator  40.91 
 
 		 191 aa  58.5  0.00000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.915843  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4434  TetR family transcriptional regulator  40.91 
 
 		 191 aa  58.5  0.00000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1393  TetR family transcriptional regulator  24.34 
 
 		 234 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.733503 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2669  transcriptional regulator, TetR family  26.67 
 
 		 226 aa  57.8  0.0000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00411812  normal  0.199475 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0688  transcriptional regulator  37.5 
 
 		 189 aa  58.2  0.0000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4638  putative transcriptional regulator, TetR family  33.73 
 
 		 196 aa  57  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.856697 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3438  transcriptional regulator, TetR family  22.94 
 
 		 190 aa  56.6  0.0000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.547681  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2120  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 		 234 aa  56.6  0.0000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.249669 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0910  transcriptional regulator, TetR family  39.39 
 
 		 191 aa  55.8  0.0000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00546748  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4323  transcriptional regulator, TetR family  39.39 
 
 		 191 aa  55.8  0.0000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4287  TetR family transcriptional regulator  39.39 
 
 		 191 aa  55.8  0.0000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3966  TetR family transcriptional regulator  39.39 
 
 		 191 aa  55.8  0.0000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2903  TetR family transcriptional regulator  39.39 
 
 		 191 aa  55.8  0.0000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.281452  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4342  transcriptional regulator, TetR family  39.39 
 
 		 191 aa  55.8  0.0000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3066  TetR family transcriptional regulator  22.65 
 
 		 190 aa  55.8  0.0000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.122558 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1778  TetR family transcriptional regulator  30.1 
 
 		 199 aa  55.5  0.0000007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0789135  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0733  transcriptional regulator  38.81 
 
 		 182 aa  55.1  0.0000008  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1709  transcriptional regulator, TetR family  32.69 
 
 		 203 aa  55.1  0.0000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.922562  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1061  transcriptional regulator, TetR family  25.64 
 
 		 196 aa  54.3  0.000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0250707  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0828  transcriptional regulator, TetR family  26.97 
 
 		 195 aa  54.7  0.000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1231  TetR family transcriptional regulator  40.62 
 
 		 289 aa  53.5  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00074883  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1515  putative transcriptional regulator, TetR family  25 
 
 		 219 aa  54.3  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.254086  hitchhiker  0.00363064 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0255  transcriptional regulator, TetR family  21.76 
 
 		 243 aa  53.9  0.000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.540416  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1039  TetR family transcriptional regulator  34.29 
 
 		 213 aa  53.9  0.000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0390412  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4802  TetR family transcriptional regulator  26.26 
 
 		 215 aa  53.5  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.96494  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5949  transcriptional regulator TetR family  35.21 
 
 		 250 aa  53.5  0.000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1720  TetR family transcriptional regulator  25.77 
 
 		 200 aa  53.1  0.000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14850  transcriptional regulator  22.27 
 
 		 224 aa  53.1  0.000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.126744 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0432  transcriptional regulator, TetR family  21.76 
 
 		 214 aa  53.5  0.000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0796504  hitchhiker  0.00000000967411 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1592  transcriptional regulator, TetR family  22.46 
 
 		 198 aa  53.1  0.000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0111  transcriptional regulator, TetR family  25.15 
 
 		 207 aa  52.8  0.000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.482364  normal  0.0755622 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0422  TetR family transcriptional regulator  20.73 
 
 		 248 aa  52.8  0.000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4533  transcriptional regulator, TetR family  38.46 
 
 		 197 aa  52.8  0.000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0585795  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3241  TetR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 221 aa  52.4  0.000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3647  DNA-binding transcriptional regulator EnvR  20.5 
 
 		 220 aa  52.4  0.000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0126984  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3838  transcriptional regulator TetR family  20.38 
 
 		 230 aa  52.4  0.000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.606304  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0167  TetR family transcriptional regulator  35.59 
 
 		 213 aa  52.4  0.000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6222  transcriptional regulator, TetR family  40.3 
 
 		 186 aa  52.4  0.000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.366462  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22500  transcriptional regulator, TetR family  24.6 
 
 		 199 aa  52.4  0.000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.589103  normal  0.921764 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0184  TetR family transcriptional regulator  37.93 
 
 		 335 aa  52.4  0.000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000505732  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1346  TetR family transcriptional regulator  37.93 
 
 		 209 aa  52.4  0.000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1640  TetR family transcriptional regulator  25.25 
 
 		 216 aa  52.4  0.000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.305588 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00350  transcriptional regulator  30 
 
 		 199 aa  52.4  0.000006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3666  TetR family transcriptional regulator  23.57 
 
 		 187 aa  52  0.000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.356922  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1941  transcriptional regulator, TetR family  34.29 
 
 		 189 aa  51.6  0.000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.842083  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0541  TetR family transcriptional regulator  27.33 
 
 		 220 aa  51.6  0.000009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0457  TetR family transcriptional regulator  40.26 
 
 		 189 aa  50.8  0.00001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0455  TetR family transcriptional regulator  42.59 
 
 		 224 aa  51.2  0.00001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.366206  normal  0.106872 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0801  TetR family transcriptional regulator  20.73 
 
 		 254 aa  51.2  0.00001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1255  TetR family transcriptional regulator  31.08 
 
 		 200 aa  50.8  0.00001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1071  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  26.42 
 
 		 213 aa  51.2  0.00001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0117133  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0655  TetR family transcriptional regulator  20.73 
 
 		 254 aa  51.2  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.64003  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2057  TetR family transcriptional regulator  20.73 
 
 		 254 aa  51.2  0.00001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.649855  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1961  TetR family transcriptional regulator  20.73 
 
 		 254 aa  51.2  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.140222  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1609  TetR family transcriptional regulator  20.73 
 
 		 254 aa  51.2  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2113  transcriptional regulator, TetR family  42.11 
 
 		 207 aa  50.8  0.00001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.918403  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>