More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_4464 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_4464  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 204 aa  417  1e-116  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0680244 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7312  TetR family transcriptional regulator  64.29 
 
 		 210 aa  255  4e-67  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5293  TetR family transcriptional regulator  37.7 
 
 		 210 aa  152  4e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.199638  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1768  TetR family transcriptional regulator  35.26 
 
 		 211 aa  146  2.0000000000000003e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.570427  normal  0.275415 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2767  TetR family transcriptional regulator  32.98 
 
 		 225 aa  130  9e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.284138 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0516  TetR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 195 aa  95.9  4e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3508  TetR family transcriptional regulator  33.5 
 
 		 227 aa  92.4  4e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.343043  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0433  TetR family transcriptional regulator  28.08 
 
 		 204 aa  88.2  7e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.376909  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2109  TetR family transcriptional regulator  27.37 
 
 		 206 aa  87.4  1e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.901149 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0293  TetR family transcriptional regulator  31.74 
 
 		 226 aa  87  2e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6181  transcriptional regulator, TetR family  32.63 
 
 		 202 aa  85.9  4e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.685616  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0595  TetR family transcriptional regulator  26 
 
 		 204 aa  85.5  5e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1145  TetR family transcriptional regulator  31.14 
 
 		 224 aa  85.1  7e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.770966  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2924  TetR family transcriptional regulator  31.14 
 
 		 224 aa  84.7  7e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.288766  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5045  TetR family transcriptional regulator  28.65 
 
 		 197 aa  84.7  8e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.820553  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2768  TetR family transcriptional regulator  31.14 
 
 		 224 aa  84.7  8e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.379756  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1898  TetR family transcriptional regulator  31.38 
 
 		 239 aa  84  0.000000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.643398 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4066  transcriptional regulator, TetR family  27.27 
 
 		 211 aa  81.6  0.000000000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2065  transcriptional regulator, TetR family  29.03 
 
 		 188 aa  80.1  0.00000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.704626  normal  0.605366 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2696  TetR family transcriptional regulator  28.78 
 
 		 196 aa  80.5  0.00000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.834085 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0110  transcriptional regulator, TetR family  27.78 
 
 		 225 aa  79  0.00000000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2055  putative transcriptional regulator, TetR family  30.09 
 
 		 229 aa  78.6  0.00000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0410393  normal  0.8778 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0043  regulatory protein, TetR  31.55 
 
 		 211 aa  78.6  0.00000000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3049  transcriptional regulator, TetR family  32.28 
 
 		 214 aa  78.2  0.00000000000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2765  regulatory protein, TetR  30.89 
 
 		 210 aa  78.2  0.00000000000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.267077  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2348  transcriptional regulator, TetR family  29.9 
 
 		 222 aa  77.4  0.0000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0187157  normal  0.0306872 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26580  transcriptional regulator, TetR family  28.11 
 
 		 205 aa  76.6  0.0000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0994293 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5076  TetR family transcriptional regulator  27.98 
 
 		 215 aa  76.6  0.0000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.175697 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4691  TetR family transcriptional regulator  27.98 
 
 		 205 aa  76.6  0.0000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.771858  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1909  transcriptional regulator, TetR family  27.59 
 
 		 209 aa  77  0.0000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0574085  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4777  TetR family transcriptional regulator  27.98 
 
 		 205 aa  76.6  0.0000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.681727  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5283  TetR family transcriptional regulator  29.31 
 
 		 208 aa  76.6  0.0000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.261053 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3248  TetR family transcriptional regulator  31.75 
 
 		 201 aa  76.3  0.0000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1571  TetR family transcriptional regulator  24.6 
 
 		 201 aa  76.3  0.0000000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.038411 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1436  TetR family transcriptional regulator  31.35 
 
 		 197 aa  75.9  0.0000000000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0281  transcriptional regulator, TetR family  33.84 
 
 		 218 aa  75.1  0.0000000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.645912  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3920  TetR family transcriptional regulator  29.8 
 
 		 227 aa  75.1  0.0000000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.62554  normal  0.13671 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3833  transcriptional regulator, TetR family  26.96 
 
 		 204 aa  75.1  0.0000000000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0117  transcriptional regulator, TetR family  26.77 
 
 		 225 aa  74.3  0.000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.678219 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13590  TetR family transcriptional regulator  29.59 
 
 		 200 aa  74.3  0.000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.332381  normal  0.0844747 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4378  transcriptional regulator, TetR family  28.42 
 
 		 200 aa  74.3  0.000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.136582 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2495  transcriptional regulator, TetR family  29.9 
 
 		 287 aa  73.9  0.000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0937177  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16730  transcriptional regulator, TetR family  25 
 
 		 213 aa  73.9  0.000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0806  transcriptional regulator, TetR family  26.32 
 
 		 202 aa  73.2  0.000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.265645  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4938  transcriptional regulator, TetR family  25.27 
 
 		 223 aa  72.8  0.000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.262917  normal  0.206147 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1603  transcriptional regulator, TetR family  28.26 
 
 		 189 aa  73.2  0.000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0115969  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3352  transcriptional regulator, TetR family  32.82 
 
 		 183 aa  72.8  0.000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0512596  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1471  TetR family transcriptional regulator  29.91 
 
 		 219 aa  72.4  0.000000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0117  TetR family transcriptional regulator  28.19 
 
 		 208 aa  72  0.000000000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.966538  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7768  putative transcriptional regulator, TetR family  27.41 
 
 		 194 aa  71.2  0.000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3991  regulatory protein TetR  28.95 
 
 		 197 aa  69.3  0.00000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5488  TetR family transcriptional regulator  28.64 
 
 		 238 aa  69.3  0.00000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20320  transcriptional regulator, TetR family  32.54 
 
 		 203 aa  68.9  0.00000000004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2233  transcriptional regulator, TetR family  26.77 
 
 		 246 aa  68.6  0.00000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0329344  normal  0.539811 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1483  TetR family transcriptional regulator  28.92 
 
 		 197 aa  68.2  0.00000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2922  transcriptional regulator, TetR family  26.57 
 
 		 204 aa  67.4  0.0000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.404278 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0306  TetR family transcriptional regulator  25.82 
 
 		 219 aa  67.4  0.0000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0641939  normal  0.172302 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4073  TetR family transcriptional regulator  27.84 
 
 		 223 aa  66.6  0.0000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1958  TetR family transcriptional regulator  28.65 
 
 		 251 aa  67  0.0000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.455038  normal  0.501183 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0370  TetR family transcriptional regulator  28.96 
 
 		 223 aa  67  0.0000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0234884  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2801  TetR family transcriptional regulator  27.75 
 
 		 209 aa  66.6  0.0000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33190  transcriptional regulator  26.63 
 
 		 202 aa  66.2  0.0000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.284512  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0906  transcriptional regulator, TetR family  48.44 
 
 		 232 aa  66.2  0.0000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.052988  normal  0.0196 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0809  regulatory protein, TetR  28.89 
 
 		 200 aa  65.9  0.0000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.732229  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2799  TetR family transcriptional regulator  26.02 
 
 		 217 aa  65.5  0.0000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.364827  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4091  TetR family transcriptional regulator  30.96 
 
 		 222 aa  65.5  0.0000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0267897 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2800  TetR family transcriptional regulator  27.96 
 
 		 224 aa  65.1  0.0000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.697977  decreased coverage  0.000162176 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1867  transcriptional regulator, TetR family  25.25 
 
 		 201 aa  64.7  0.0000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.129849  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6560  transcriptional regulator, TetR family  49.23 
 
 		 203 aa  63.9  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2601  regulatory protein, TetR  26.32 
 
 		 224 aa  63.9  0.000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.354794  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4897  TetR family transcriptional regulator  26.56 
 
 		 231 aa  63.5  0.000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.043246  normal  0.757086 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0626  TetR family transcriptional regulator  29.67 
 
 		 215 aa  63.5  0.000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0231  transcriptional regulator, TetR family  27.37 
 
 		 200 aa  62.8  0.000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.336394 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1515  putative transcriptional regulator, TetR family  27.13 
 
 		 219 aa  62  0.000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.254086  hitchhiker  0.00363064 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0008  transcriptional regulator, TetR family  43.59 
 
 		 195 aa  62  0.000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.643837 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3221  TetR family transcriptional regulator  25.37 
 
 		 232 aa  62  0.000000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2688  TetR family transcriptional regulator  25.52 
 
 		 207 aa  61.6  0.000000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.357002  normal  0.760245 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0347  TetR family transcriptional regulator  29.57 
 
 		 200 aa  61.2  0.000000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0154637  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2628  transcriptional regulator, TetR family  22.99 
 
 		 194 aa  61.2  0.00000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00732346  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2269  putative transcriptional regulator  28.87 
 
 		 207 aa  61.2  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.629172  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0033  TetR family transcriptional regulator  28.04 
 
 		 256 aa  60.5  0.00000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12528  TetR family transcriptional regulator  30.59 
 
 		 215 aa  60.1  0.00000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0275989 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3944  TetR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 215 aa  60.1  0.00000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0817  TetR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 332 aa  60.1  0.00000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14200  transcriptional regulator, TetR family  41.33 
 
 		 227 aa  60.1  0.00000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.0000918467  decreased coverage  0.00704922 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5720  TetR family transcriptional regulator  35.92 
 
 		 291 aa  60.5  0.00000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.649137  normal  0.760569 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26760  putative transcriptional regulator  29.95 
 
 		 198 aa  60.1  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0832  transcriptional regulator, TetR family  25.12 
 
 		 211 aa  60.1  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.933061 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2483  transcriptional regulator, TetR family  25.74 
 
 		 217 aa  60.1  0.00000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000117416  hitchhiker  0.00899265 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2755  TetR family transcriptional regulator  28.05 
 
 		 200 aa  59.3  0.00000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1393  TetR family transcriptional regulator  26.15 
 
 		 234 aa  59.7  0.00000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.733503 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3710  regulatory protein, TetR  30.15 
 
 		 230 aa  59.3  0.00000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4599  TetR family transcriptional regulator  28 
 
 		 220 aa  58.9  0.00000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9308  putative transcriptional regulator, TetR family  50.98 
 
 		 231 aa  58.9  0.00000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0733541  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1076  transcriptional regulator, TetR family  39.47 
 
 		 220 aa  58.5  0.00000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.66869  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4896  transcriptional regulator, TetR family  32.43 
 
 		 222 aa  58.5  0.00000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1592  transcriptional regulator, TetR family  25.77 
 
 		 198 aa  58.5  0.00000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0772  transcriptional regulator, TetR family  25.57 
 
 		 223 aa  58.5  0.00000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0092  transcriptional regulator, TetR family  27.18 
 
 		 207 aa  58.5  0.00000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00302716  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2195  transcriptional regulator, TetR family  28.57 
 
 		 189 aa  58.5  0.00000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>