More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_1909 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_1909  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 209 aa  410  1e-114  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0574085  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4066  transcriptional regulator, TetR family  67.91 
 
 		 211 aa  258  4e-68  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26580  transcriptional regulator, TetR family  62.38 
 
 		 205 aa  252  2.0000000000000002e-66  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0994293 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3049  transcriptional regulator, TetR family  55.22 
 
 		 214 aa  215  2.9999999999999998e-55  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3248  TetR family transcriptional regulator  55.44 
 
 		 201 aa  200  9.999999999999999e-51  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1436  TetR family transcriptional regulator  56.11 
 
 		 197 aa  189  2.9999999999999997e-47  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6181  transcriptional regulator, TetR family  52.88 
 
 		 202 aa  178  5.999999999999999e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.685616  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20320  transcriptional regulator, TetR family  47.18 
 
 		 203 aa  164  1.0000000000000001e-39  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2483  transcriptional regulator, TetR family  51 
 
 		 217 aa  162  5.0000000000000005e-39  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000117416  hitchhiker  0.00899265 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3836  TetR family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 246 aa  110  2.0000000000000002e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.487675  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2747  TetR family transcriptional regulator  32.24 
 
 		 233 aa  97.4  1e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.02505  normal  0.237475 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0033  TetR family transcriptional regulator  29.3 
 
 		 256 aa  94.4  1e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0117  TetR family transcriptional regulator  34.57 
 
 		 208 aa  92.8  4e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.966538  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2065  transcriptional regulator, TetR family  32.42 
 
 		 188 aa  91.7  7e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.704626  normal  0.605366 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4061  TetR family transcriptional regulator  29.69 
 
 		 240 aa  90.9  1e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1934  TetR family transcriptional regulator  30.85 
 
 		 202 aa  90.5  2e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0322407  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16730  transcriptional regulator, TetR family  31.69 
 
 		 213 aa  84  0.000000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1768  TetR family transcriptional regulator  28.64 
 
 		 211 aa  84  0.000000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.570427  normal  0.275415 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4464  TetR family transcriptional regulator  27.59 
 
 		 204 aa  83.6  0.000000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0680244 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0832  transcriptional regulator, TetR family  29.56 
 
 		 211 aa  83.2  0.000000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.933061 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0306  TetR family transcriptional regulator  26.22 
 
 		 219 aa  82  0.000000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0641939  normal  0.172302 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2499  transcriptional regulator, TetR family  26.34 
 
 		 208 aa  81.6  0.000000000000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4711  TetR family transcriptional regulator  29.1 
 
 		 228 aa  80.9  0.00000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.133874 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3604  TetR family transcriptional regulator  31.72 
 
 		 207 aa  80.9  0.00000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.461648 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0370  TetR family transcriptional regulator  30.6 
 
 		 223 aa  80.9  0.00000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0234884  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1844  transcriptional regulator, TetR family  23.44 
 
 		 214 aa  80.5  0.00000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7312  TetR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 210 aa  79.3  0.00000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1471  TetR family transcriptional regulator  25.58 
 
 		 219 aa  79.3  0.00000000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2438  transcriptional regulator, TetR family  27.75 
 
 		 208 aa  79.7  0.00000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5076  TetR family transcriptional regulator  27.08 
 
 		 215 aa  79  0.00000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.175697 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4691  TetR family transcriptional regulator  27.08 
 
 		 205 aa  79  0.00000000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.771858  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4777  TetR family transcriptional regulator  27.08 
 
 		 205 aa  79  0.00000000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.681727  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2696  TetR family transcriptional regulator  28.96 
 
 		 196 aa  78.2  0.00000000000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.834085 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2723  transcriptional regulator, TetR family  25.67 
 
 		 224 aa  77.8  0.0000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0252111  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0806  transcriptional regulator, TetR family  26.6 
 
 		 202 aa  76.6  0.0000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.265645  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5283  TetR family transcriptional regulator  28.8 
 
 		 208 aa  77  0.0000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.261053 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3721  transcriptional regulator, TetR family  25.54 
 
 		 260 aa  75.5  0.0000000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.249433  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4073  TetR family transcriptional regulator  25.54 
 
 		 223 aa  75.5  0.0000000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1775  transcriptional regulator, TetR family  23.44 
 
 		 207 aa  75.9  0.0000000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2799  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 217 aa  75.1  0.0000000000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.364827  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4824  TetR family transcriptional regulator  25.39 
 
 		 228 aa  74.7  0.0000000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2755  TetR family transcriptional regulator  28.8 
 
 		 200 aa  74.3  0.000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0452  regulatory protein TetR  27 
 
 		 221 aa  73.9  0.000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2922  transcriptional regulator, TetR family  30.27 
 
 		 204 aa  73.6  0.000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.404278 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13590  TetR family transcriptional regulator  27.07 
 
 		 200 aa  73.9  0.000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.332381  normal  0.0844747 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3449  TetR family transcriptional regulator  27.03 
 
 		 209 aa  73.2  0.000000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.772262  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0231  transcriptional regulator, TetR family  30.68 
 
 		 200 aa  72.4  0.000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.336394 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0347  TetR family transcriptional regulator  27.96 
 
 		 200 aa  72  0.000000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0154637  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3594  TetR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 210 aa  72  0.000000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2358  transcriptional regulator, TetR family  30.43 
 
 		 216 aa  72  0.000000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0281012 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0281  transcriptional regulator, TetR family  32.47 
 
 		 218 aa  71.6  0.000000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.645912  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7768  putative transcriptional regulator, TetR family  28.42 
 
 		 194 aa  71.2  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7113  TetR family transcriptional regulator  27.23 
 
 		 240 aa  70.9  0.00000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5293  TetR family transcriptional regulator  29.12 
 
 		 210 aa  70.9  0.00000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.199638  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0153  TetR family transcriptional regulator  30.37 
 
 		 210 aa  70.5  0.00000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1603  transcriptional regulator, TetR family  27.72 
 
 		 189 aa  70.1  0.00000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0115969  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1483  TetR family transcriptional regulator  26.78 
 
 		 197 aa  70.5  0.00000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2216  TetR family transcriptional regulator  25.13 
 
 		 189 aa  69.7  0.00000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.191802  normal  0.0189795 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4304  TetR family transcriptional regulator  28.95 
 
 		 202 aa  70.1  0.00000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.148025  normal  0.676238 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1867  transcriptional regulator, TetR family  31.28 
 
 		 201 aa  69.7  0.00000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.129849  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0516  TetR family transcriptional regulator  26.34 
 
 		 195 aa  69.3  0.00000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3950  TetR family transcriptional regulator  29.77 
 
 		 212 aa  69.3  0.00000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.390353  normal  0.629082 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3833  transcriptional regulator, TetR family  30.16 
 
 		 204 aa  69.3  0.00000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1571  TetR family transcriptional regulator  25.68 
 
 		 201 aa  68.9  0.00000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.038411 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3457  TetR family transcriptional regulator  30.89 
 
 		 238 aa  68.9  0.00000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3352  transcriptional regulator, TetR family  25.79 
 
 		 183 aa  68.9  0.00000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0512596  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2348  transcriptional regulator, TetR family  27.27 
 
 		 222 aa  68.2  0.00000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0187157  normal  0.0306872 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3944  TetR family transcriptional regulator  28.65 
 
 		 215 aa  67.8  0.0000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0293  TetR family transcriptional regulator  26.5 
 
 		 226 aa  67  0.0000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2800  TetR family transcriptional regulator  28.64 
 
 		 224 aa  67  0.0000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.697977  decreased coverage  0.000162176 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2109  TetR family transcriptional regulator  24.74 
 
 		 206 aa  66.6  0.0000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.901149 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0433  TetR family transcriptional regulator  24.04 
 
 		 204 aa  67.4  0.0000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.376909  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0684  TetR family transcriptional regulator  30.93 
 
 		 213 aa  66.2  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.974708 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2055  putative transcriptional regulator, TetR family  25.27 
 
 		 229 aa  66.2  0.0000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0410393  normal  0.8778 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2997  transcriptional regulator, TetR family  31.72 
 
 		 213 aa  65.9  0.0000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2768  TetR family transcriptional regulator  25.58 
 
 		 224 aa  65.9  0.0000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.379756  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4079  TetR family transcriptional regulator  25.81 
 
 		 244 aa  65.9  0.0000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.780842  normal  0.246764 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0194  transcriptional regulator, TetR family  31.36 
 
 		 225 aa  65.1  0.0000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1253  transcriptional regulator, TetR family  29.5 
 
 		 210 aa  64.7  0.0000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0477994 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4171  TetR family transcriptional regulator  26.77 
 
 		 203 aa  64.3  0.000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0201849  hitchhiker  0.000462956 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1804  transcriptional regulator, TetR family  22.46 
 
 		 189 aa  64.3  0.000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1145  TetR family transcriptional regulator  25.5 
 
 		 224 aa  64.3  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.770966  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2924  TetR family transcriptional regulator  25.5 
 
 		 224 aa  64.3  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.288766  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2688  TetR family transcriptional regulator  26.97 
 
 		 207 aa  64.7  0.000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.357002  normal  0.760245 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26760  putative transcriptional regulator  26.34 
 
 		 198 aa  64.3  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0571  TetR family transcriptional regulator  29.21 
 
 		 219 aa  64.7  0.000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.22949  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2734  transcriptional regulator, TetR family  47.06 
 
 		 225 aa  64.7  0.000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1011  TetR family transcriptional regulator  27.91 
 
 		 770 aa  63.2  0.000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2628  transcriptional regulator, TetR family  24.26 
 
 		 194 aa  63.9  0.000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00732346  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2801  TetR family transcriptional regulator  25.14 
 
 		 209 aa  63.9  0.000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0110  transcriptional regulator, TetR family  24.52 
 
 		 225 aa  63.2  0.000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1958  TetR family transcriptional regulator  26.84 
 
 		 251 aa  62.8  0.000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.455038  normal  0.501183 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5488  TetR family transcriptional regulator  30.11 
 
 		 238 aa  62.4  0.000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6295  transcriptional regulator, TetR family  23.83 
 
 		 212 aa  62.8  0.000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.100221  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1594  TetR family transcriptional regulator  27.93 
 
 		 210 aa  62.4  0.000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.000000000148614  unclonable  0.000000209189 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1061  transcriptional regulator, TetR family  26.67 
 
 		 196 aa  62.8  0.000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0250707  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0557  TetR family transcriptional regulator  26.42 
 
 		 297 aa  62.8  0.000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3836  transcriptional regulator, TetR family  30 
 
 		 211 aa  62.8  0.000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0043  regulatory protein, TetR  29.89 
 
 		 211 aa  62.4  0.000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0117  transcriptional regulator, TetR family  24.27 
 
 		 225 aa  61.6  0.000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.678219 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>