More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_B5488 on replicon NC_007348
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



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Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007348  Reut_B5488  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 238 aa  485  1e-136  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4128  TetR family transcriptional regulator  53.68 
 
 		 241 aa  216  2.9999999999999998e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.860792 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4897  TetR family transcriptional regulator  46.35 
 
 		 231 aa  203  2e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.043246  normal  0.757086 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4824  TetR family transcriptional regulator  31.15 
 
 		 228 aa  113  3e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4061  TetR family transcriptional regulator  32.06 
 
 		 240 aa  107  1e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6295  transcriptional regulator, TetR family  30.32 
 
 		 212 aa  101  9e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.100221  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0033  TetR family transcriptional regulator  31.1 
 
 		 256 aa  100  2e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3836  TetR family transcriptional regulator  28.81 
 
 		 246 aa  99.4  4e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.487675  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0832  transcriptional regulator, TetR family  31.05 
 
 		 211 aa  96.3  3e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.933061 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2799  TetR family transcriptional regulator  34.04 
 
 		 217 aa  95.9  5e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.364827  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2233  transcriptional regulator, TetR family  32.11 
 
 		 246 aa  95.9  5e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0329344  normal  0.539811 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1775  transcriptional regulator, TetR family  25.81 
 
 		 207 aa  94.4  1e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7113  TetR family transcriptional regulator  28.42 
 
 		 240 aa  91.7  9e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3548  TetR family transcriptional regulator  31.73 
 
 		 216 aa  91.7  9e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3721  transcriptional regulator, TetR family  30.1 
 
 		 260 aa  90.1  3e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.249433  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3604  TetR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 207 aa  89.7  4e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.461648 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1571  TetR family transcriptional regulator  32.09 
 
 		 201 aa  88.2  1e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.038411 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1011  TetR family transcriptional regulator  30.65 
 
 		 770 aa  88.2  1e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33190  transcriptional regulator  30.39 
 
 		 202 aa  87.4  2e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.284512  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3815  regulatory protein, TetR  28.71 
 
 		 252 aa  87.4  2e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00651597  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2499  transcriptional regulator, TetR family  25 
 
 		 208 aa  85.9  5e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6231  transcriptional regulator, TetR family  31.22 
 
 		 197 aa  85.9  5e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30540  transcriptional regulator, TetR family  33.89 
 
 		 195 aa  85.5  7e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4079  TetR family transcriptional regulator  29.05 
 
 		 244 aa  84.7  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.780842  normal  0.246764 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4073  TetR family transcriptional regulator  27.87 
 
 		 223 aa  84.7  0.000000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0126  TetR family transcriptional regulator  29.74 
 
 		 224 aa  84.3  0.000000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2438  transcriptional regulator, TetR family  30.05 
 
 		 208 aa  84  0.000000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16730  transcriptional regulator, TetR family  31.5 
 
 		 213 aa  83.6  0.000000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0098  TetR family transcriptional regulator  30.98 
 
 		 219 aa  83.2  0.000000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.31231  normal  0.349087 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0108  TetR family transcriptional regulator  30.98 
 
 		 219 aa  83.2  0.000000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.244027  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0117  TetR family transcriptional regulator  30.98 
 
 		 219 aa  83.2  0.000000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0523426 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2696  TetR family transcriptional regulator  29.15 
 
 		 196 aa  82.8  0.000000000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.834085 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0719  TetR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 209 aa  82  0.000000000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0117  TetR family transcriptional regulator  30.69 
 
 		 208 aa  82  0.000000000000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.966538  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0370  TetR family transcriptional regulator  28.49 
 
 		 223 aa  82  0.000000000000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0234884  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3449  TetR family transcriptional regulator  31.38 
 
 		 209 aa  81.6  0.000000000000009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.772262  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0571  TetR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 219 aa  80.9  0.00000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.22949  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2723  transcriptional regulator, TetR family  28.73 
 
 		 224 aa  80.1  0.00000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0252111  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2235  transcriptional regulator, TetR family  31.92 
 
 		 235 aa  80.9  0.00000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.170733  normal  0.3149 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10159  TetR family transcriptional regulator  29.79 
 
 		 214 aa  80.5  0.00000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2402  TetR family transcriptional regulator  30.81 
 
 		 205 aa  80.1  0.00000000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.584484 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4066  transcriptional regulator, TetR family  32.28 
 
 		 211 aa  79  0.00000000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1844  transcriptional regulator, TetR family  26.88 
 
 		 214 aa  77  0.0000000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2997  transcriptional regulator, TetR family  29.15 
 
 		 213 aa  76.3  0.0000000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007953  Bxe_C0306  TetR family transcriptional regulator  31.15 
 
 		 219 aa  76.3  0.0000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0641939  normal  0.172302 
 
 
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NC_008825  Mpe_A0913  TetR family transcriptional regulator  31.37 
 
 		 195 aa  76.3  0.0000000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.269174  normal  1 
 
 
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NC_008699  Noca_0809  regulatory protein, TetR  29.35 
 
 		 200 aa  76.3  0.0000000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.732229  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1804  transcriptional regulator, TetR family  24.31 
 
 		 189 aa  75.5  0.0000000000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
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NC_007794  Saro_1034  TetR family transcriptional regulator  34.41 
 
 		 204 aa  75.1  0.0000000000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2162  TetR family transcriptional regulator  30.61 
 
 		 209 aa  75.5  0.0000000000008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0662359 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2248  TetR family transcriptional regulator  31.79 
 
 		 222 aa  75.1  0.000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0660336  normal  0.0152181 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0806  transcriptional regulator, TetR family  26.4 
 
 		 202 aa  75.1  0.000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.265645  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4711  TetR family transcriptional regulator  28.42 
 
 		 228 aa  74.7  0.000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.133874 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3260  putative transcriptional regulator, TetR family  27.6 
 
 		 309 aa  74.7  0.000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.235559  hitchhiker  0.000147183 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1958  TetR family transcriptional regulator  29.28 
 
 		 251 aa  74.3  0.000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.455038  normal  0.501183 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1372  transcriptional regulator, TetR family  32.43 
 
 		 210 aa  74.3  0.000000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.487007  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0433  TetR family transcriptional regulator  30.85 
 
 		 204 aa  74.3  0.000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.376909  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1887  TetR family transcriptional regulator  28.99 
 
 		 202 aa  73.6  0.000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.943502 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2747  TetR family transcriptional regulator  30.05 
 
 		 233 aa  72.8  0.000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.02505  normal  0.237475 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7768  putative transcriptional regulator, TetR family  28.72 
 
 		 194 aa  72.4  0.000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2155  TetR family transcriptional regulator  32.45 
 
 		 195 aa  72.4  0.000000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4092  TetR family transcriptional regulator  29.38 
 
 		 206 aa  72  0.000000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3508  TetR family transcriptional regulator  31.46 
 
 		 227 aa  71.6  0.000000000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.343043  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1867  transcriptional regulator, TetR family  29.61 
 
 		 201 aa  71.2  0.00000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.129849  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0760  TetR family transcriptional regulator  30.89 
 
 		 192 aa  71.2  0.00000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0913287  normal  0.16222 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2213  putative transcription regulator transcription regulator protein  27.18 
 
 		 236 aa  70.5  0.00000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1768  TetR family transcriptional regulator  28.92 
 
 		 211 aa  70.5  0.00000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.570427  normal  0.275415 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3950  TetR family transcriptional regulator  28.93 
 
 		 212 aa  70.9  0.00000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.390353  normal  0.629082 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1851  transcriptional regulator, TetR family  26.94 
 
 		 201 aa  70.9  0.00000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.144681  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0817  TetR family transcriptional regulator  28.28 
 
 		 210 aa  70.9  0.00000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.577348  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0231  transcriptional regulator, TetR family  28.28 
 
 		 200 aa  69.7  0.00000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.336394 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0110  transcriptional regulator, TetR family  29.76 
 
 		 225 aa  69.7  0.00000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2065  transcriptional regulator, TetR family  30.85 
 
 		 188 aa  69.3  0.00000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.704626  normal  0.605366 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2995  TetR family transcriptional regulator  28.79 
 
 		 211 aa  69.3  0.00000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.428403  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0421  transcriptional regulator, TetR family  27.92 
 
 		 198 aa  69.3  0.00000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1240  transcriptional regulator, TetR family  28.34 
 
 		 211 aa  69.3  0.00000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.567777  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4464  TetR family transcriptional regulator  28.64 
 
 		 204 aa  69.3  0.00000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0680244 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0595  TetR family transcriptional regulator  28.35 
 
 		 204 aa  68.9  0.00000000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6181  transcriptional regulator, TetR family  27.87 
 
 		 202 aa  68.9  0.00000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.685616  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2551  TetR family transcriptional regulator  29.94 
 
 		 206 aa  68.6  0.00000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.48532  normal  0.51431 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0295  transcriptional regulator, TetR family  26.37 
 
 		 220 aa  68.6  0.00000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0107513  n/a   
 
 
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NC_012856  Rpic12D_2017  transcriptional regulator, TetR family  26.77 
 
 		 236 aa  67.8  0.0000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0153  TetR family transcriptional regulator  28.49 
 
 		 210 aa  68.2  0.0000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011830  Dhaf_1623  transcriptional regulator, TetR family  28.49 
 
 		 205 aa  68.2  0.0000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_014210  Ndas_2922  transcriptional regulator, TetR family  27.41 
 
 		 204 aa  68.2  0.0000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.404278 
 
 
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NC_009077  Mjls_5076  TetR family transcriptional regulator  29.36 
 
 		 215 aa  67.8  0.0000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.175697 
 
 
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NC_013595  Sros_5475  putative transcriptional regulator, TetR family  32.22 
 
 		 232 aa  67  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0120226 
 
 
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NC_008786  Veis_1684  TetR family transcriptional regulator  27.18 
 
 		 228 aa  67.4  0.0000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.828148  normal  1 
 
 
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NC_010682  Rpic_2411  transcriptional regulator, TetR family  26.7 
 
 		 236 aa  67.8  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_007333  Tfu_2755  TetR family transcriptional regulator  25.48 
 
 		 200 aa  66.6  0.0000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008825  Mpe_A0992  putative transcriptional regulator of paa operon  28.65 
 
 		 208 aa  67  0.0000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.332152  normal  1 
 
 
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NC_007794  Saro_2454  TetR family transcriptional regulator  29.03 
 
 		 216 aa  66.6  0.0000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008531  LEUM_0265  TetR family transcriptional regulator  25.37 
 
 		 194 aa  66.6  0.0000000004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.250901  n/a   
 
 
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NC_010622  Bphy_2863  TetR family transcriptional regulator  28.28 
 
 		 204 aa  65.9  0.0000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000603343 
 
 
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NC_007347  Reut_A3212  TetR family transcriptional regulator  27.41 
 
 		 211 aa  65.9  0.0000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013739  Cwoe_0445  transcriptional regulator, TetR family  26.18 
 
 		 209 aa  65.9  0.0000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.740524  decreased coverage  0.00376288 
 
 
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NC_013441  Gbro_3991  regulatory protein TetR  27.08 
 
 		 197 aa  65.9  0.0000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008146  Mmcs_4691  TetR family transcriptional regulator  29.72 
 
 		 205 aa  65.9  0.0000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.771858  n/a   
 
 
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NC_008705  Mkms_4777  TetR family transcriptional regulator  29.72 
 
 		 205 aa  65.9  0.0000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.681727  normal  1 
 
 
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NC_010814  Glov_0167  transcriptional regulator, TetR family  30.11 
 
 		 200 aa  65.5  0.0000000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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