More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_2235 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



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Plasmid unclonability p-value
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Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013739  Cwoe_2235  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 235 aa  466  9.999999999999999e-131  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.170733  normal  0.3149 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2233  transcriptional regulator, TetR family  69.03 
 
 		 246 aa  304  9.000000000000001e-82  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0329344  normal  0.539811 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33190  transcriptional regulator  39.66 
 
 		 202 aa  149  3e-35  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.284512  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4938  transcriptional regulator, TetR family  39.9 
 
 		 223 aa  127  2.0000000000000002e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.262917  normal  0.206147 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1958  TetR family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 251 aa  107  2e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.455038  normal  0.501183 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0806  transcriptional regulator, TetR family  35.26 
 
 		 202 aa  96.7  2e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.265645  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0772  transcriptional regulator, TetR family  31.69 
 
 		 223 aa  94  2e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1858  TetR family transcriptional regulator  31.18 
 
 		 234 aa  91.3  1e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.543066  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0452  regulatory protein TetR  34.04 
 
 		 221 aa  88.2  1e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2869  TetR family transcriptional regulator  29.94 
 
 		 285 aa  86.3  3e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2723  transcriptional regulator, TetR family  30.81 
 
 		 224 aa  85.9  6e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0252111  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1571  TetR family transcriptional regulator  29.29 
 
 		 201 aa  85.1  9e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.038411 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2785  TetR family transcriptional regulator  31.68 
 
 		 196 aa  84.7  0.000000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.256269 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2310  TetR family transcriptional regulator  32.45 
 
 		 220 aa  83.6  0.000000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.987325  decreased coverage  0.00710043 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0817  TetR family transcriptional regulator  33.16 
 
 		 210 aa  83.2  0.000000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.577348  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1827  regulatory protein, TetR  30.53 
 
 		 196 aa  83.2  0.000000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0117  transcriptional regulator, TetR family  32.54 
 
 		 225 aa  82  0.000000000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.678219 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16700  transcriptional regulator  33.33 
 
 		 211 aa  81.3  0.00000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2438  transcriptional regulator, TetR family  28.65 
 
 		 208 aa  81.3  0.00000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5488  TetR family transcriptional regulator  31.92 
 
 		 238 aa  80.9  0.00000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4897  TetR family transcriptional regulator  30.9 
 
 		 231 aa  79.7  0.00000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.043246  normal  0.757086 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3833  transcriptional regulator, TetR family  29.71 
 
 		 204 aa  80.1  0.00000000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2768  TetR family transcriptional regulator  34.46 
 
 		 224 aa  79.7  0.00000000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.379756  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0295  transcriptional regulator, TetR family  30.98 
 
 		 220 aa  79.3  0.00000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0107513  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4046  TetR family transcriptional regulator  30.06 
 
 		 212 aa  79  0.00000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0961065 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16730  transcriptional regulator, TetR family  34.97 
 
 		 213 aa  79.3  0.00000000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1145  TetR family transcriptional regulator  34.46 
 
 		 224 aa  79  0.00000000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.770966  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4128  TetR family transcriptional regulator  32.28 
 
 		 241 aa  79  0.00000000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.860792 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2924  TetR family transcriptional regulator  34.46 
 
 		 224 aa  79  0.00000000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.288766  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1844  transcriptional regulator, TetR family  26.97 
 
 		 214 aa  78.2  0.0000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2348  transcriptional regulator, TetR family  32.47 
 
 		 222 aa  77.8  0.0000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0187157  normal  0.0306872 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0110  transcriptional regulator, TetR family  31.36 
 
 		 225 aa  77.8  0.0000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0809  regulatory protein, TetR  29.94 
 
 		 200 aa  78.2  0.0000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.732229  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5283  TetR family transcriptional regulator  30.15 
 
 		 208 aa  77.8  0.0000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.261053 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0595  TetR family transcriptional regulator  31.71 
 
 		 204 aa  78.2  0.0000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2065  transcriptional regulator, TetR family  30.73 
 
 		 188 aa  77.4  0.0000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.704626  normal  0.605366 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0293  TetR family transcriptional regulator  32.77 
 
 		 226 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2200  transcriptional regulator, TetR family  33.52 
 
 		 203 aa  75.9  0.0000000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1804  transcriptional regulator, TetR family  28.65 
 
 		 189 aa  75.9  0.0000000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2271  transcriptional regulator  32.48 
 
 		 209 aa  75.9  0.0000000000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.850012 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1887  TetR family transcriptional regulator  28.16 
 
 		 202 aa  75.5  0.0000000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.943502 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3862  regulatory protein, TetR  32.35 
 
 		 202 aa  75.9  0.0000000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.07928  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0433  TetR family transcriptional regulator  32.52 
 
 		 204 aa  75.9  0.0000000000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.376909  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5076  TetR family transcriptional regulator  28.71 
 
 		 215 aa  75.5  0.0000000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.175697 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4691  TetR family transcriptional regulator  28.71 
 
 		 205 aa  75.5  0.0000000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.771858  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4777  TetR family transcriptional regulator  28.71 
 
 		 205 aa  75.5  0.0000000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.681727  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0402  TetR family transcriptional regulator  32.4 
 
 		 196 aa  74.7  0.000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.498778  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2055  TetR family transcriptional regulator  31.86 
 
 		 206 aa  74.7  0.000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1898  TetR family transcriptional regulator  31.79 
 
 		 239 aa  74.3  0.000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.643398 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0117  TetR family transcriptional regulator  29.44 
 
 		 208 aa  73.9  0.000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.966538  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2799  TetR family transcriptional regulator  30.46 
 
 		 217 aa  73.6  0.000000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.364827  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4520  regulatory protein TetR  29.19 
 
 		 228 aa  73.6  0.000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13590  TetR family transcriptional regulator  28.14 
 
 		 200 aa  73.2  0.000000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.332381  normal  0.0844747 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0913  TetR family transcriptional regulator  28.65 
 
 		 195 aa  73.2  0.000000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.269174  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2755  TetR family transcriptional regulator  29.21 
 
 		 200 aa  72.8  0.000000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4824  TetR family transcriptional regulator  25.14 
 
 		 228 aa  72.8  0.000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2109  TetR family transcriptional regulator  25.53 
 
 		 206 aa  72.8  0.000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.901149 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0832  transcriptional regulator, TetR family  30.91 
 
 		 211 aa  72.4  0.000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.933061 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1851  transcriptional regulator, TetR family  30.93 
 
 		 201 aa  72  0.000000000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.144681  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2696  TetR family transcriptional regulator  31.32 
 
 		 196 aa  71.2  0.00000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.834085 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2688  TetR family transcriptional regulator  28.74 
 
 		 207 aa  71.6  0.00000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.357002  normal  0.760245 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1483  TetR family transcriptional regulator  26.57 
 
 		 197 aa  71.2  0.00000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6580  transcriptional regulator, TetR family  33.58 
 
 		 242 aa  71.2  0.00000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.603144 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5475  putative transcriptional regulator, TetR family  33.51 
 
 		 232 aa  70.5  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0120226 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0835  TetR family transcriptional regulator  34.1 
 
 		 201 aa  70.9  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.861936  normal  0.897725 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2996  TetR family transcriptional regulator  33.53 
 
 		 193 aa  70.9  0.00000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.542374  normal  0.411304 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2767  TetR family transcriptional regulator  29.23 
 
 		 225 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.284138 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3999  transcriptional regulator, TetR family  33.71 
 
 		 207 aa  70.5  0.00000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7768  putative transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 194 aa  69.3  0.00000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1867  transcriptional regulator, TetR family  29.95 
 
 		 201 aa  69.3  0.00000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.129849  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2499  transcriptional regulator, TetR family  27.81 
 
 		 208 aa  69.3  0.00000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1934  TetR family transcriptional regulator  33.16 
 
 		 202 aa  68.9  0.00000000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0322407  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0828  transcriptional regulator, TetR family  27.15 
 
 		 195 aa  68.2  0.00000000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10159  TetR family transcriptional regulator  31.31 
 
 		 214 aa  68.2  0.0000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1775  transcriptional regulator, TetR family  25 
 
 		 207 aa  68.2  0.0000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3508  TetR family transcriptional regulator  30.98 
 
 		 227 aa  67.4  0.0000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.343043  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2162  TetR family transcriptional regulator  31.36 
 
 		 209 aa  67.4  0.0000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0662359 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4711  TetR family transcriptional regulator  26.78 
 
 		 228 aa  67.4  0.0000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.133874 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0231  transcriptional regulator, TetR family  32.99 
 
 		 200 aa  67.4  0.0000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.336394 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05345  transcriptional regulator, tetR family protein  22.89 
 
 		 190 aa  67  0.0000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  hitchhiker  0.00749651  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4061  TetR family transcriptional regulator  28.78 
 
 		 240 aa  66.2  0.0000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2269  putative transcriptional regulator  28.9 
 
 		 207 aa  65.9  0.0000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.629172  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2765  regulatory protein, TetR  27.23 
 
 		 210 aa  65.9  0.0000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.267077  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3944  TetR family transcriptional regulator  27.54 
 
 		 215 aa  65.9  0.0000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4073  TetR family transcriptional regulator  29.5 
 
 		 223 aa  65.5  0.0000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3920  TetR family transcriptional regulator  29.35 
 
 		 227 aa  65.1  0.0000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.62554  normal  0.13671 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2628  transcriptional regulator, TetR family  26.87 
 
 		 194 aa  65.1  0.0000000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00732346  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3566  regulatory protein TetR  30.81 
 
 		 205 aa  65.1  0.0000000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2155  TetR family transcriptional regulator  33.81 
 
 		 195 aa  64.7  0.000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6231  transcriptional regulator, TetR family  31.69 
 
 		 197 aa  64.7  0.000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7113  TetR family transcriptional regulator  22.61 
 
 		 240 aa  64.7  0.000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008463  PA14_26760  putative transcriptional regulator  26.95 
 
 		 198 aa  64.7  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_012793  GWCH70_3148  transcriptional regulator, TetR family  26.55 
 
 		 310 aa  63.9  0.000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007958  RPD_0043  regulatory protein, TetR  29.88 
 
 		 211 aa  64.3  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008541  Arth_1384  TetR family transcriptional regulator  31.13 
 
 		 225 aa  63.5  0.000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00670258  n/a   
 
 
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NC_009953  Sare_0030  TetR family transcriptional regulator  35.56 
 
 		 193 aa  63.5  0.000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.19641  normal  1 
 
 
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NC_013739  Cwoe_0445  transcriptional regulator, TetR family  27.66 
 
 		 209 aa  63.5  0.000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.740524  decreased coverage  0.00376288 
 
 
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NC_013739  Cwoe_0836  transcriptional regulator, TetR family  35.4 
 
 		 203 aa  63.2  0.000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.177404  normal  1 
 
 
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NC_013441  Gbro_3991  regulatory protein TetR  29.19 
 
 		 197 aa  62.8  0.000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010002  Daci_0033  TetR family transcriptional regulator  40.96 
 
 		 256 aa  62.4  0.000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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