More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_33190 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



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Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_33190  transcriptional regulator  100 
 
 		 202 aa  411  1e-114  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.284512  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4938  transcriptional regulator, TetR family  46.7 
 
 		 223 aa  159  2e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.262917  normal  0.206147 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2235  transcriptional regulator, TetR family  39.66 
 
 		 235 aa  149  2e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.170733  normal  0.3149 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2233  transcriptional regulator, TetR family  38.38 
 
 		 246 aa  142  4e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0329344  normal  0.539811 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4046  TetR family transcriptional regulator  32.64 
 
 		 212 aa  121  6e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0961065 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1858  TetR family transcriptional regulator  36.13 
 
 		 234 aa  120  9.999999999999999e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.543066  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0772  transcriptional regulator, TetR family  37.57 
 
 		 223 aa  115  5e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0806  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 202 aa  114  1.0000000000000001e-24  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.265645  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1827  regulatory protein, TetR  34.59 
 
 		 196 aa  112  5e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3862  regulatory protein, TetR  38.17 
 
 		 202 aa  111  7.000000000000001e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.07928  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5475  putative transcriptional regulator, TetR family  35.11 
 
 		 232 aa  108  4.0000000000000004e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0120226 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1887  TetR family transcriptional regulator  33.88 
 
 		 202 aa  108  4.0000000000000004e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.943502 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1958  TetR family transcriptional regulator  33.15 
 
 		 251 aa  105  4e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.455038  normal  0.501183 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1571  TetR family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 201 aa  105  6e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.038411 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2785  TetR family transcriptional regulator  28.73 
 
 		 196 aa  101  1e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.256269 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0295  transcriptional regulator, TetR family  30.43 
 
 		 220 aa  100  2e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0107513  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2310  TetR family transcriptional regulator  31.11 
 
 		 220 aa  99.8  3e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.987325  decreased coverage  0.00710043 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0835  TetR family transcriptional regulator  33.51 
 
 		 201 aa  99.4  3e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.861936  normal  0.897725 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16700  transcriptional regulator  32.65 
 
 		 211 aa  97.8  1e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0433  TetR family transcriptional regulator  32.2 
 
 		 204 aa  97.1  2e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.376909  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0817  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 210 aa  96.7  2e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.577348  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0595  TetR family transcriptional regulator  32.2 
 
 		 204 aa  95.9  4e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0913  TetR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 195 aa  95.1  7e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.269174  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1833  regulatory protein, TetR  33.33 
 
 		 236 aa  94.7  8e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0347  TetR family transcriptional regulator  34.22 
 
 		 200 aa  94.4  1e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0154637  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2055  TetR family transcriptional regulator  30.81 
 
 		 206 aa  92.4  4e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2869  TetR family transcriptional regulator  28.65 
 
 		 285 aa  91.3  9e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0402  TetR family transcriptional regulator  30.81 
 
 		 196 aa  90.1  2e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.498778  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4711  TetR family transcriptional regulator  30.89 
 
 		 228 aa  88.6  6e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.133874 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5488  TetR family transcriptional regulator  30.39 
 
 		 238 aa  87.4  1e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2996  TetR family transcriptional regulator  29.73 
 
 		 193 aa  87.8  1e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.542374  normal  0.411304 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1867  transcriptional regulator, TetR family  30.98 
 
 		 201 aa  87.4  1e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.129849  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0117  TetR family transcriptional regulator  31.12 
 
 		 208 aa  86.7  2e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.966538  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2723  transcriptional regulator, TetR family  28.18 
 
 		 224 aa  86.7  2e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0252111  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2438  transcriptional regulator, TetR family  26.18 
 
 		 208 aa  87  2e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1844  transcriptional regulator, TetR family  26.52 
 
 		 214 aa  85.5  4e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1851  transcriptional regulator, TetR family  32.8 
 
 		 201 aa  85.1  6e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.144681  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4520  regulatory protein TetR  29.11 
 
 		 228 aa  84  0.000000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7768  putative transcriptional regulator, TetR family  30.98 
 
 		 194 aa  84  0.000000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2065  transcriptional regulator, TetR family  27.32 
 
 		 188 aa  83.2  0.000000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.704626  normal  0.605366 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2162  TetR family transcriptional regulator  28.8 
 
 		 209 aa  82.8  0.000000000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0662359 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2055  putative transcriptional regulator, TetR family  30.77 
 
 		 229 aa  82.4  0.000000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0410393  normal  0.8778 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4073  TetR family transcriptional regulator  28.72 
 
 		 223 aa  80.9  0.00000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4897  TetR family transcriptional regulator  29.83 
 
 		 231 aa  80.5  0.00000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.043246  normal  0.757086 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2696  TetR family transcriptional regulator  29.57 
 
 		 196 aa  79.3  0.00000000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.834085 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16730  transcriptional regulator, TetR family  30.27 
 
 		 213 aa  79  0.00000000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0231  transcriptional regulator, TetR family  32.22 
 
 		 200 aa  79.3  0.00000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.336394 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2499  transcriptional regulator, TetR family  26.24 
 
 		 208 aa  78.6  0.00000000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5283  TetR family transcriptional regulator  27.51 
 
 		 208 aa  78.6  0.00000000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.261053 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4074  TetR family transcriptional regulator  28.42 
 
 		 194 aa  78.2  0.00000000000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.137574 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4824  TetR family transcriptional regulator  28.06 
 
 		 228 aa  77.8  0.00000000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0452  regulatory protein TetR  30.73 
 
 		 221 aa  77.4  0.0000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2799  TetR family transcriptional regulator  28.18 
 
 		 217 aa  77.4  0.0000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.364827  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5076  TetR family transcriptional regulator  27.23 
 
 		 215 aa  77.4  0.0000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.175697 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4691  TetR family transcriptional regulator  27.23 
 
 		 205 aa  77.4  0.0000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.771858  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3352  transcriptional regulator, TetR family  29.82 
 
 		 183 aa  77.8  0.0000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0512596  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3999  transcriptional regulator, TetR family  35 
 
 		 207 aa  77.4  0.0000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4777  TetR family transcriptional regulator  27.23 
 
 		 205 aa  77.4  0.0000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.681727  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2755  TetR family transcriptional regulator  29.35 
 
 		 200 aa  76.6  0.0000000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0293  TetR family transcriptional regulator  30.65 
 
 		 226 aa  75.9  0.0000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3548  TetR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 216 aa  74.7  0.0000000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1898  TetR family transcriptional regulator  27.22 
 
 		 239 aa  74.7  0.0000000000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.643398 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2109  TetR family transcriptional regulator  25.97 
 
 		 206 aa  73.9  0.000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.901149 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26760  putative transcriptional regulator  27.01 
 
 		 198 aa  73.9  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2768  TetR family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 224 aa  73.6  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.379756  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1145  TetR family transcriptional regulator  29.78 
 
 		 224 aa  73.2  0.000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.770966  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2924  TetR family transcriptional regulator  29.78 
 
 		 224 aa  72.8  0.000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.288766  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2269  putative transcriptional regulator  25.41 
 
 		 207 aa  73.2  0.000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.629172  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1483  TetR family transcriptional regulator  26.04 
 
 		 197 aa  72.8  0.000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2922  transcriptional regulator, TetR family  29.84 
 
 		 204 aa  72.4  0.000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.404278 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0445  transcriptional regulator, TetR family  28.27 
 
 		 209 aa  72.8  0.000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.740524  decreased coverage  0.00376288 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0370  TetR family transcriptional regulator  25.27 
 
 		 223 aa  72  0.000000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0234884  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2271  transcriptional regulator  28.09 
 
 		 209 aa  71.6  0.000000000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.850012 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2688  TetR family transcriptional regulator  27.01 
 
 		 207 aa  71.2  0.000000000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.357002  normal  0.760245 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2767  TetR family transcriptional regulator  28.35 
 
 		 225 aa  70.9  0.00000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.284138 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1775  transcriptional regulator, TetR family  24.04 
 
 		 207 aa  70.5  0.00000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30540  transcriptional regulator, TetR family  29.57 
 
 		 195 aa  70.1  0.00000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0832  transcriptional regulator, TetR family  27.18 
 
 		 211 aa  70.1  0.00000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.933061 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3944  TetR family transcriptional regulator  28.74 
 
 		 215 aa  69.7  0.00000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0626  TetR family transcriptional regulator  34.06 
 
 		 215 aa  70.5  0.00000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3836  TetR family transcriptional regulator  26.02 
 
 		 246 aa  70.5  0.00000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.487675  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1920  TetR family transcriptional regulator  28.09 
 
 		 213 aa  70.1  0.00000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2747  TetR family transcriptional regulator  26.06 
 
 		 233 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.02505  normal  0.237475 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0043  regulatory protein, TetR  29.41 
 
 		 211 aa  69.7  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2103  TetR family transcriptional regulator  35.21 
 
 		 239 aa  70.5  0.00000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4061  TetR family transcriptional regulator  25.56 
 
 		 240 aa  69.7  0.00000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4009  transcriptional regulator, TetR family  26.04 
 
 		 217 aa  69.7  0.00000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2216  TetR family transcriptional regulator  26.02 
 
 		 189 aa  69.3  0.00000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.191802  normal  0.0189795 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0175  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 203 aa  68.9  0.00000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009565  TBFG_13590  TetR family transcriptional regulator  26.86 
 
 		 200 aa  68.9  0.00000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.332381  normal  0.0844747 
 
 
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NC_014158  Tpau_3833  transcriptional regulator, TetR family  30.54 
 
 		 204 aa  68.9  0.00000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013093  Amir_1603  transcriptional regulator, TetR family  27.27 
 
 		 189 aa  68.2  0.00000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0115969  n/a   
 
 
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NC_007643  Rru_A1934  TetR family transcriptional regulator  28.33 
 
 		 202 aa  68.2  0.00000000009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0322407  n/a   
 
 
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NC_013501  Rmar_2200  transcriptional regulator, TetR family  28.48 
 
 		 203 aa  67.8  0.0000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011370  Rleg2_6295  transcriptional regulator, TetR family  24.18 
 
 		 212 aa  67.8  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.100221  normal  1 
 
 
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NC_011004  Rpal_3721  transcriptional regulator, TetR family  25.99 
 
 		 260 aa  67.4  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.249433  n/a   
 
 
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NC_013131  Caci_4378  transcriptional regulator, TetR family  30.56 
 
 		 200 aa  67.4  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.136582 
 
 
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NC_013159  Svir_17960  transcriptional regulator, TetR family  30.57 
 
 		 208 aa  66.6  0.0000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.134645  normal  1 
 
 
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NC_013739  Cwoe_0836  transcriptional regulator, TetR family  30.43 
 
 		 203 aa  67  0.0000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.177404  normal  1 
 
 
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NC_009427  Saro_3449  TetR family transcriptional regulator  26.88 
 
 		 209 aa  66.6  0.0000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.772262  n/a   
 
 
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