More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_2103 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009720  Xaut_2103  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 239 aa  479  1e-134  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4449  TetR family transcriptional regulator  63.76 
 
 		 237 aa  259  2e-68  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1920  TetR family transcriptional regulator  44.23 
 
 		 213 aa  175  6e-43  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1858  TetR family transcriptional regulator  34.59 
 
 		 234 aa  79.3  0.00000000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.543066  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33190  transcriptional regulator  35.21 
 
 		 202 aa  70.5  0.00000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.284512  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0880  transcriptional regulator, TetR family  26.11 
 
 		 212 aa  67  0.0000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.987052  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2925  regulatory protein TetR  26.23 
 
 		 224 aa  63.9  0.000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4046  TetR family transcriptional regulator  31.45 
 
 		 212 aa  64.3  0.000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0961065 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4300  transcriptional regulator  27.27 
 
 		 225 aa  63.5  0.000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2189  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 222 aa  62  0.000000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1571  TetR family transcriptional regulator  30.86 
 
 		 201 aa  61.6  0.00000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.038411 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2162  TetR family transcriptional regulator  30.23 
 
 		 209 aa  60.8  0.00000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0662359 
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6485  regulatory protein, TetR  25 
 
 		 278 aa  60.1  0.00000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.521213  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2200  transcriptional regulator, TetR family  32.63 
 
 		 203 aa  59.7  0.00000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0291  TetR family transcriptional regulator  26.28 
 
 		 205 aa  59.3  0.00000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3862  regulatory protein, TetR  31.13 
 
 		 202 aa  58.9  0.00000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.07928  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2723  transcriptional regulator, TetR family  29.2 
 
 		 224 aa  58.9  0.00000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0252111  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0117  TetR family transcriptional regulator  29.2 
 
 		 208 aa  57.8  0.0000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.966538  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2438  transcriptional regulator, TetR family  30 
 
 		 208 aa  57.4  0.0000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2065  transcriptional regulator, TetR family  31.08 
 
 		 188 aa  57.4  0.0000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.704626  normal  0.605366 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2055  TetR family transcriptional regulator  31.48 
 
 		 206 aa  57.4  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16700  transcriptional regulator  26.99 
 
 		 211 aa  57.8  0.0000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0347  TetR family transcriptional regulator  32.32 
 
 		 200 aa  56.6  0.0000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0154637  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2628  transcriptional regulator, TetR family  23.56 
 
 		 194 aa  56.6  0.0000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00732346  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5489  transcriptional regulator, TetR family  23.19 
 
 		 209 aa  56.2  0.0000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.152228  hitchhiker  8.2338e-23 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1844  transcriptional regulator, TetR family  32.39 
 
 		 214 aa  56.2  0.0000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7768  putative transcriptional regulator, TetR family  31.29 
 
 		 194 aa  56.2  0.0000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1709  transcriptional regulator, TetR family  30 
 
 		 207 aa  56.2  0.0000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.17641  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3449  transcriptional regulator, TetR family  28.05 
 
 		 210 aa  55.1  0.0000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0772  transcriptional regulator, TetR family  29.05 
 
 		 223 aa  55.1  0.0000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3340  transcriptional regulator, TetR family  26.67 
 
 		 210 aa  54.3  0.000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4074  TetR family transcriptional regulator  27.95 
 
 		 194 aa  54.7  0.000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.137574 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5138  TetR family transcriptional regulator  23.36 
 
 		 209 aa  54.7  0.000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5471  TetR family transcriptional regulator  21.48 
 
 		 209 aa  53.9  0.000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0402  TetR family transcriptional regulator  30.86 
 
 		 196 aa  54.3  0.000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.498778  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5585  TetR family transcriptional regulator  21.48 
 
 		 200 aa  53.9  0.000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3165  TetR family transcriptional regulator  32.37 
 
 		 243 aa  54.3  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.15717  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5475  putative transcriptional regulator, TetR family  29.41 
 
 		 232 aa  53.9  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0120226 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0806  transcriptional regulator, TetR family  31.94 
 
 		 202 aa  53.5  0.000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.265645  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5189  TetR family transcriptional regulator  21.48 
 
 		 209 aa  53.5  0.000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5024  TetR family transcriptional regulator  22.63 
 
 		 209 aa  53.5  0.000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5040  TetR family transcriptional regulator  21.48 
 
 		 209 aa  53.5  0.000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0033  TetR family transcriptional regulator  25.15 
 
 		 256 aa  53.5  0.000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5433  transcriptional regulator, TetR family  21.48 
 
 		 209 aa  53.5  0.000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.944120000000001e-18 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5463  transcriptional regulator, TetR family  21.48 
 
 		 209 aa  53.5  0.000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000220885  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1156  transcriptional regulator, TetR family  34.18 
 
 		 227 aa  53.5  0.000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5518  transcriptional regulator, TetR family  22.63 
 
 		 209 aa  53.5  0.000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.142065  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4897  TetR family transcriptional regulator  28.38 
 
 		 231 aa  52.8  0.000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.043246  normal  0.757086 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3449  TetR family transcriptional regulator  29.88 
 
 		 209 aa  52.8  0.000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.772262  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0835  TetR family transcriptional regulator  30.86 
 
 		 201 aa  52.8  0.000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.861936  normal  0.897725 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1867  transcriptional regulator, TetR family  32.65 
 
 		 201 aa  52.4  0.000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.129849  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1103  transcriptional regulator, TetR family  27.27 
 
 		 248 aa  52.4  0.000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.575371  normal  0.523139 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1887  TetR family transcriptional regulator  32.89 
 
 		 202 aa  52.4  0.000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.943502 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4729  TetR family transcriptional regulator  27.93 
 
 		 240 aa  52.4  0.000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0433  TetR family transcriptional regulator  28.28 
 
 		 204 aa  52.4  0.000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.376909  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2057  transcriptional regulator, TetR family  34.56 
 
 		 212 aa  51.6  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0106608  normal  1 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6295  transcriptional regulator, TetR family  24.88 
 
 		 212 aa  51.6  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.100221  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2785  TetR family transcriptional regulator  28.33 
 
 		 196 aa  51.6  0.00001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.256269 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3861  TetR family transcriptional regulator  21.48 
 
 		 209 aa  50.8  0.00002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13607  TetR family transcriptional regulator  29.2 
 
 		 295 aa  50.4  0.00002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.20276 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0748  transcriptional regulator, TetR family  27.03 
 
 		 194 aa  50.1  0.00003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.866187  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8200  putative transcriptional regulator, TetR family  32.1 
 
 		 237 aa  50.4  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.53611  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1665  transcriptional regulator, TetR family  41.07 
 
 		 223 aa  49.7  0.00004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.117381  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2669  transcriptional regulator, TetR family  25.43 
 
 		 226 aa  49.7  0.00004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00411812  normal  0.199475 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0435  TetR family transcriptional regulator  27.23 
 
 		 217 aa  49.7  0.00004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.839793 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4713  TetR family transcriptional regulator  33.01 
 
 		 218 aa  49.7  0.00004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1827  regulatory protein, TetR  29.17 
 
 		 196 aa  49.7  0.00004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4799  TetR family transcriptional regulator  33.01 
 
 		 218 aa  49.7  0.00004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5098  TetR family transcriptional regulator  33.01 
 
 		 218 aa  49.7  0.00004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.11151 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2063  transcriptional regulator, TetR family  30.47 
 
 		 208 aa  49.7  0.00004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1958  TetR family transcriptional regulator  25.15 
 
 		 251 aa  49.7  0.00005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.455038  normal  0.501183 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4061  TetR family transcriptional regulator  26.92 
 
 		 240 aa  49.3  0.00005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0331  TetR family transcriptional regulator  31.96 
 
 		 195 aa  49.3  0.00005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1473  transcriptional regulator, TetR family  28.95 
 
 		 207 aa  49.7  0.00005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.245471  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0341  TetR family transcriptional regulator  31.96 
 
 		 195 aa  49.3  0.00005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.317306 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0815  transcriptional regulator, TetR family  30.43 
 
 		 207 aa  49.3  0.00005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1150  TetR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 222 aa  49.3  0.00006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0828  transcriptional regulator, TetR family  24.64 
 
 		 195 aa  49.3  0.00006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0320  TetR family transcriptional regulator  31.96 
 
 		 195 aa  49.3  0.00006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20280  transcriptional regulator, TetR family  29.36 
 
 		 213 aa  48.9  0.00007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.612683  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6228  transcriptional regulator, TetR family  42.37 
 
 		 194 aa  48.9  0.00007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.301912  normal  0.923303 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3465  TetR family transcriptional regulator  34.29 
 
 		 217 aa  48.9  0.00007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3984  transcriptional regulator, TetR family  25.51 
 
 		 216 aa  48.9  0.00007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.765993  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5718  putative transcriptional regulator  29 
 
 		 215 aa  48.5  0.00009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1079  TetR family transcriptional regulator  25.12 
 
 		 215 aa  48.5  0.0001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31350  hypothetical protein  38.6 
 
 		 203 aa  48.1  0.0001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.112877  normal  0.357558 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4931  TetR family transcriptional regulator  25.71 
 
 		 497 aa  48.1  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.475051  normal  0.080695 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0612  TetR family transcriptional regulator  36.71 
 
 		 202 aa  48.1  0.0001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0141452  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4792  TetR family transcriptional regulator  46.15 
 
 		 184 aa  48.1  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.165855  normal  0.419651 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0429  TetR family transcriptional regulator  47.83 
 
 		 213 aa  48.5  0.0001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0148562 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2271  transcriptional regulator  29.88 
 
 		 209 aa  48.5  0.0001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.850012 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6231  transcriptional regulator, TetR family  29.85 
 
 		 197 aa  48.1  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4652  TetR family transcriptional regulator  20.69 
 
 		 195 aa  47  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1090  transcriptional regulator, TetR family  41.38 
 
 		 204 aa  47.4  0.0002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.141216  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3888  transcriptional regulator, TetR family  36.71 
 
 		 206 aa  47  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.693202 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65900  TetR family transcriptional regulator  28 
 
 		 215 aa  47.8  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0425501  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1401  TetR family transcriptional regulator  26.28 
 
 		 222 aa  47  0.0002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.513329  normal  0.505278 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0626  TetR family transcriptional regulator  26.77 
 
 		 215 aa  47.8  0.0002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5060  transcriptional regulator BetI  27.13 
 
 		 195 aa  47.4  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0255482 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0402  transcriptional regulator, TetR family  39.39 
 
 		 219 aa  47.4  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.67084  normal  0.0771341 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>