More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_A2767 on replicon NC_007951
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007951  Bxe_A2767  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 225 aa  448  1e-125  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.284138 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1768  TetR family transcriptional regulator  43.55 
 
 		 211 aa  156  3e-37  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.570427  normal  0.275415 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5293  TetR family transcriptional regulator  37.37 
 
 		 210 aa  136  3.0000000000000003e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.199638  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4464  TetR family transcriptional regulator  32.8 
 
 		 204 aa  131  6.999999999999999e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0680244 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0516  TetR family transcriptional regulator  33.16 
 
 		 195 aa  110  1.0000000000000001e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0433  TetR family transcriptional regulator  34.36 
 
 		 204 aa  111  1.0000000000000001e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.376909  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0595  TetR family transcriptional regulator  33.17 
 
 		 204 aa  108  5e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0117  transcriptional regulator, TetR family  32.09 
 
 		 225 aa  104  1e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.678219 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0110  transcriptional regulator, TetR family  34.21 
 
 		 225 aa  102  5e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7312  TetR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 210 aa  101  1e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0043  regulatory protein, TetR  35.61 
 
 		 211 aa  97.4  2e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2495  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 287 aa  89.4  4e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0937177  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1898  TetR family transcriptional regulator  31.55 
 
 		 239 aa  89.4  5e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.643398 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0293  TetR family transcriptional regulator  31.67 
 
 		 226 aa  86.3  3e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3508  TetR family transcriptional regulator  33.88 
 
 		 227 aa  86.7  3e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.343043  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2768  TetR family transcriptional regulator  31.07 
 
 		 224 aa  84.3  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.379756  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1571  TetR family transcriptional regulator  27.13 
 
 		 201 aa  84.3  0.000000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.038411 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1145  TetR family transcriptional regulator  31.07 
 
 		 224 aa  84  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.770966  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2924  TetR family transcriptional regulator  31.07 
 
 		 224 aa  84  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.288766  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3833  transcriptional regulator, TetR family  32.67 
 
 		 204 aa  82  0.000000000000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2688  TetR family transcriptional regulator  29.7 
 
 		 207 aa  81.3  0.00000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.357002  normal  0.760245 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3944  TetR family transcriptional regulator  30.65 
 
 		 215 aa  80.5  0.00000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26760  putative transcriptional regulator  30.26 
 
 		 198 aa  80.5  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2269  putative transcriptional regulator  29.15 
 
 		 207 aa  79  0.00000000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.629172  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3920  TetR family transcriptional regulator  29.79 
 
 		 227 aa  78.2  0.00000000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.62554  normal  0.13671 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0117  TetR family transcriptional regulator  26.94 
 
 		 208 aa  76.3  0.0000000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.966538  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2801  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 209 aa  76.6  0.0000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2233  transcriptional regulator, TetR family  29.91 
 
 		 246 aa  76.3  0.0000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0329344  normal  0.539811 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5045  TetR family transcriptional regulator  28.9 
 
 		 197 aa  75.5  0.0000000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.820553  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2109  TetR family transcriptional regulator  30.57 
 
 		 206 aa  75.1  0.0000000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.901149 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0806  transcriptional regulator, TetR family  26.88 
 
 		 202 aa  74.3  0.000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.265645  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2765  regulatory protein, TetR  29.25 
 
 		 210 aa  72  0.000000000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.267077  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3991  regulatory protein TetR  29.85 
 
 		 197 aa  71.6  0.000000000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11992  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 406 aa  70.9  0.00000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33190  transcriptional regulator  29.23 
 
 		 202 aa  70.9  0.00000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.284512  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2065  transcriptional regulator, TetR family  28.95 
 
 		 188 aa  70.1  0.00000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.704626  normal  0.605366 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2235  transcriptional regulator, TetR family  29.23 
 
 		 235 aa  70.1  0.00000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.170733  normal  0.3149 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13590  TetR family transcriptional regulator  27.84 
 
 		 200 aa  68.6  0.00000000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.332381  normal  0.0844747 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2551  TetR family transcriptional regulator  27.57 
 
 		 206 aa  67  0.0000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.48532  normal  0.51431 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0684  TetR family transcriptional regulator  31.07 
 
 		 213 aa  67.4  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.974708 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0370  TetR family transcriptional regulator  27.66 
 
 		 223 aa  67  0.0000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0234884  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5283  TetR family transcriptional regulator  26.24 
 
 		 208 aa  67  0.0000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.261053 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1987  TetR family transcriptional regulator  37.19 
 
 		 210 aa  66.6  0.0000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0626  TetR family transcriptional regulator  30.15 
 
 		 215 aa  66.2  0.0000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1369  transcriptional regulator, TetR family  30.05 
 
 		 197 aa  65.5  0.0000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.859804 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0347  TetR family transcriptional regulator  27.72 
 
 		 200 aa  65.5  0.0000000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0154637  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4092  TetR family transcriptional regulator  30.72 
 
 		 206 aa  65.1  0.0000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14200  transcriptional regulator, TetR family  45.76 
 
 		 227 aa  64.7  0.000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.0000918467  decreased coverage  0.00704922 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2348  transcriptional regulator, TetR family  28.19 
 
 		 222 aa  64.3  0.000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0187157  normal  0.0306872 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6231  transcriptional regulator, TetR family  28.95 
 
 		 197 aa  64.7  0.000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1858  TetR family transcriptional regulator  25.38 
 
 		 234 aa  63.5  0.000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.543066  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0033  TetR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 256 aa  63.9  0.000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2723  transcriptional regulator, TetR family  24.02 
 
 		 224 aa  63.9  0.000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0252111  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26580  transcriptional regulator, TetR family  25 
 
 		 205 aa  63.5  0.000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0994293 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4061  TetR family transcriptional regulator  25.53 
 
 		 240 aa  63.2  0.000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6181  transcriptional regulator, TetR family  27.81 
 
 		 202 aa  63.5  0.000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.685616  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1827  regulatory protein, TetR  26.56 
 
 		 196 aa  63.2  0.000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0906  transcriptional regulator, TetR family  40.21 
 
 		 232 aa  62.8  0.000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.052988  normal  0.0196 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5475  putative transcriptional regulator, TetR family  35 
 
 		 232 aa  62.8  0.000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0120226 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5380  TetR family transcriptional regulator  34.91 
 
 		 197 aa  62.4  0.000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.768843  normal  0.61228 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1469  transcriptional regulator, TetR family  33.57 
 
 		 197 aa  62.4  0.000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10308  TetR/AcrR family transcriptional regulator  40.85 
 
 		 210 aa  62.4  0.000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000336223  normal  0.125099 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2155  TetR family transcriptional regulator  30.63 
 
 		 195 aa  62.4  0.000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1436  TetR family transcriptional regulator  26.9 
 
 		 197 aa  62.4  0.000000006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30540  transcriptional regulator, TetR family  28.88 
 
 		 195 aa  62  0.000000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6560  transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 203 aa  61.6  0.000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5076  TetR family transcriptional regulator  24.08 
 
 		 215 aa  61.6  0.000000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.175697 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2104  TetR family transcriptional regulator  47.37 
 
 		 191 aa  61.6  0.000000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.230608 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2055  putative transcriptional regulator, TetR family  26.79 
 
 		 229 aa  61.6  0.000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0410393  normal  0.8778 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4711  TetR family transcriptional regulator  25.79 
 
 		 228 aa  61.6  0.00000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.133874 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5527  transcriptional regulator, TetR family  32.16 
 
 		 210 aa  61.2  0.00000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.107312  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4691  TetR family transcriptional regulator  24.08 
 
 		 205 aa  61.6  0.00000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.771858  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0452  regulatory protein TetR  30.11 
 
 		 221 aa  61.6  0.00000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4777  TetR family transcriptional regulator  24.08 
 
 		 205 aa  61.6  0.00000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.681727  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5488  TetR family transcriptional regulator  32.21 
 
 		 238 aa  60.1  0.00000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3483  TetR family transcriptional regulator  32.3 
 
 		 218 aa  60.5  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.961452  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12528  TetR family transcriptional regulator  32.87 
 
 		 215 aa  60.5  0.00000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0275989 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3353  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 195 aa  59.7  0.00000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4073  TetR family transcriptional regulator  27.19 
 
 		 223 aa  59.7  0.00000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3632  TetR family transcriptional regulator  27.08 
 
 		 207 aa  59.3  0.00000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0140  TetR family transcriptional regulator  32.59 
 
 		 182 aa  59.3  0.00000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6078  TetR family transcriptional regulator  30.06 
 
 		 190 aa  59.3  0.00000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0977252 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3705  TetR family transcriptional regulator  27.08 
 
 		 207 aa  59.3  0.00000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1887  TetR family transcriptional regulator  27.91 
 
 		 202 aa  59.7  0.00000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.943502 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3148  transcriptional regulator, TetR family  30.93 
 
 		 310 aa  59.3  0.00000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28060  transcriptional regulator  31.69 
 
 		 204 aa  59.3  0.00000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.633688  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3665  TetR family transcriptional regulator  45 
 
 		 228 aa  59.3  0.00000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0659  transcriptional regulator TetR family  38.64 
 
 		 196 aa  59.3  0.00000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4066  transcriptional regulator, TetR family  25.95 
 
 		 211 aa  58.9  0.00000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1283  transcriptional regulator, TetR family  30.5 
 
 		 212 aa  58.9  0.00000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0196213  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4938  transcriptional regulator, TetR family  25 
 
 		 223 aa  58.5  0.00000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.262917  normal  0.206147 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6888  TetR family transcriptional regulator  30.81 
 
 		 254 aa  58.5  0.00000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3944  putative transcriptional regulator, TetR family  48.15 
 
 		 183 aa  58.5  0.00000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.000137534  hitchhiker  0.00939559 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2179  transcriptional regulator, TetR family  29.7 
 
 		 192 aa  58.2  0.00000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05345  transcriptional regulator, tetR family protein  24.74 
 
 		 190 aa  58.2  0.0000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  hitchhiker  0.00749651  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0231  transcriptional regulator, TetR family  27.36 
 
 		 200 aa  57.8  0.0000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.336394 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1960  transcriptional regulator, TetR family  29.27 
 
 		 199 aa  57.8  0.0000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3637  TetR family transcriptional regulator  27.03 
 
 		 207 aa  58.2  0.0000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.262942  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0894  TetR family transcriptional regulator  28.32 
 
 		 260 aa  58.2  0.0000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1864  TetR family transcriptional regulator  45.28 
 
 		 204 aa  57.4  0.0000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.370614  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>