More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_1369 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



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Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_1369  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 197 aa  399  9.999999999999999e-111  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.859804 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3833  transcriptional regulator, TetR family  61.14 
 
 		 204 aa  235  3e-61  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3991  regulatory protein TetR  57.95 
 
 		 197 aa  233  1.0000000000000001e-60  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2765  regulatory protein, TetR  57.95 
 
 		 210 aa  226  1e-58  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.267077  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5076  TetR family transcriptional regulator  56.41 
 
 		 215 aa  226  2e-58  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.175697 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4691  TetR family transcriptional regulator  56.41 
 
 		 205 aa  225  3e-58  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.771858  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4777  TetR family transcriptional regulator  56.41 
 
 		 205 aa  225  3e-58  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.681727  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13590  TetR family transcriptional regulator  55.32 
 
 		 200 aa  222  2e-57  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.332381  normal  0.0844747 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5283  TetR family transcriptional regulator  55.79 
 
 		 208 aa  221  7e-57  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.261053 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1483  TetR family transcriptional regulator  55.68 
 
 		 197 aa  217  7e-56  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2055  putative transcriptional regulator, TetR family  47.15 
 
 		 229 aa  193  1e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0410393  normal  0.8778 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3352  transcriptional regulator, TetR family  50.27 
 
 		 183 aa  187  9e-47  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0512596  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2800  TetR family transcriptional regulator  46.88 
 
 		 224 aa  177  9e-44  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.697977  decreased coverage  0.000162176 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2348  transcriptional regulator, TetR family  48.35 
 
 		 222 aa  176  1e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0187157  normal  0.0306872 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2601  regulatory protein, TetR  46.81 
 
 		 224 aa  176  1e-43  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.354794  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2358  transcriptional regulator, TetR family  41.76 
 
 		 216 aa  139  3.9999999999999997e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0281012 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2109  TetR family transcriptional regulator  33.68 
 
 		 206 aa  132  3.9999999999999996e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.901149 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2065  transcriptional regulator, TetR family  32.45 
 
 		 188 aa  99  4e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.704626  normal  0.605366 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1571  TetR family transcriptional regulator  33.16 
 
 		 201 aa  90.9  1e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.038411 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0806  transcriptional regulator, TetR family  29.53 
 
 		 202 aa  88.2  7e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.265645  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3944  TetR family transcriptional regulator  33.69 
 
 		 215 aa  86.7  2e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0117  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 208 aa  85.9  3e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.966538  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0306  TetR family transcriptional regulator  27.37 
 
 		 219 aa  83.6  0.000000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0641939  normal  0.172302 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1775  transcriptional regulator, TetR family  24.35 
 
 		 207 aa  80.1  0.00000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4824  TetR family transcriptional regulator  28.72 
 
 		 228 aa  80.1  0.00000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2799  TetR family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 217 aa  79  0.00000000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.364827  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2801  TetR family transcriptional regulator  32.28 
 
 		 209 aa  79.3  0.00000000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1804  transcriptional regulator, TetR family  28.8 
 
 		 189 aa  77.4  0.0000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2269  putative transcriptional regulator  31.55 
 
 		 207 aa  76.6  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.629172  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2688  TetR family transcriptional regulator  30.48 
 
 		 207 aa  76.3  0.0000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.357002  normal  0.760245 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0043  regulatory protein, TetR  31.72 
 
 		 211 aa  76.3  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26760  putative transcriptional regulator  30.48 
 
 		 198 aa  76.3  0.0000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2723  transcriptional regulator, TetR family  25.93 
 
 		 224 aa  75.5  0.0000000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0252111  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1436  TetR family transcriptional regulator  31.94 
 
 		 197 aa  75.1  0.0000000000007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0832  transcriptional regulator, TetR family  32.85 
 
 		 211 aa  74.3  0.000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.933061 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16730  transcriptional regulator, TetR family  28.87 
 
 		 213 aa  74.3  0.000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2200  transcriptional regulator, TetR family  26.6 
 
 		 203 aa  73.6  0.000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33190  transcriptional regulator  29.19 
 
 		 202 aa  73.6  0.000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.284512  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2367  TetR family transcriptional regulator  26.34 
 
 		 202 aa  73.2  0.000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.445055  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0110  transcriptional regulator, TetR family  31.12 
 
 		 225 aa  72.8  0.000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2499  transcriptional regulator, TetR family  26.18 
 
 		 208 aa  72.8  0.000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10159  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 214 aa  72.8  0.000000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0347  TetR family transcriptional regulator  30.73 
 
 		 200 aa  72.8  0.000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0154637  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3148  transcriptional regulator, TetR family  32.74 
 
 		 310 aa  72.4  0.000000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17960  transcriptional regulator, TetR family  30.48 
 
 		 208 aa  72.4  0.000000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.134645  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4378  transcriptional regulator, TetR family  28.35 
 
 		 200 aa  72.4  0.000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.136582 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2696  TetR family transcriptional regulator  30.41 
 
 		 196 aa  72  0.000000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.834085 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0433  TetR family transcriptional regulator  25.64 
 
 		 204 aa  72  0.000000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.376909  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2767  TetR family transcriptional regulator  29.8 
 
 		 225 aa  72  0.000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.284138 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4711  TetR family transcriptional regulator  28.79 
 
 		 228 aa  71.6  0.000000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.133874 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0293  TetR family transcriptional regulator  29.89 
 
 		 226 aa  70.9  0.00000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5293  TetR family transcriptional regulator  32.97 
 
 		 210 aa  71.2  0.00000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.199638  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6181  transcriptional regulator, TetR family  30.05 
 
 		 202 aa  70.5  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.685616  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26580  transcriptional regulator, TetR family  28.19 
 
 		 205 aa  69.3  0.00000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0994293 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0595  TetR family transcriptional regulator  25.65 
 
 		 204 aa  69.7  0.00000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0117  transcriptional regulator, TetR family  30.61 
 
 		 225 aa  68.6  0.00000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.678219 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1768  TetR family transcriptional regulator  28.72 
 
 		 211 aa  68.6  0.00000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.570427  normal  0.275415 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4533  TetR family transcriptional regulator  30.38 
 
 		 218 aa  68.6  0.00000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.505005  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2924  TetR family transcriptional regulator  28.8 
 
 		 224 aa  68.2  0.00000000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.288766  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1145  TetR family transcriptional regulator  28.8 
 
 		 224 aa  68.2  0.00000000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.770966  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2768  TetR family transcriptional regulator  28.8 
 
 		 224 aa  67  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.379756  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3101  TetR family transcriptional regulator  33.11 
 
 		 230 aa  67.8  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.359837  normal  0.83525 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1401  TetR family transcriptional regulator  25.91 
 
 		 222 aa  67.4  0.0000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.513329  normal  0.505278 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0809  regulatory protein, TetR  28.65 
 
 		 200 aa  67.4  0.0000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.732229  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4464  TetR family transcriptional regulator  28.8 
 
 		 204 aa  67  0.0000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0680244 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2272  TetR family transcriptional regulator  32.39 
 
 		 211 aa  67  0.0000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000566042  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4158  TetR family transcriptional regulator  32.56 
 
 		 445 aa  67  0.0000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.1717  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2155  TetR family transcriptional regulator  32.48 
 
 		 195 aa  66.6  0.0000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2922  transcriptional regulator, TetR family  26.09 
 
 		 204 aa  66.6  0.0000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.404278 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4897  TetR family transcriptional regulator  26.8 
 
 		 231 aa  67  0.0000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.043246  normal  0.757086 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2575  transcriptional regulator, TetR family  31.47 
 
 		 211 aa  66.6  0.0000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000582548  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5720  TetR family transcriptional regulator  42.35 
 
 		 291 aa  66.6  0.0000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.649137  normal  0.760569 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1471  TetR family transcriptional regulator  24 
 
 		 219 aa  66.6  0.0000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2500  transcriptional regulator, TetR family  32.39 
 
 		 211 aa  67  0.0000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2434  transcriptional regulator, TetR family  32.17 
 
 		 211 aa  65.9  0.0000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0817  TetR family transcriptional regulator  46.15 
 
 		 332 aa  65.9  0.0000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11992  MarR family transcriptional regulator  34.21 
 
 		 406 aa  65.9  0.0000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2304  TetR family transcriptional regulator  31.47 
 
 		 211 aa  65.9  0.0000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.373552  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2587  TetR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 434 aa  65.9  0.0000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.308714  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2235  transcriptional regulator, TetR family  27.23 
 
 		 235 aa  65.5  0.0000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.170733  normal  0.3149 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11350  transcriptional regulator  42.11 
 
 		 220 aa  65.9  0.0000000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2479  TetR family transcriptional regulator  31.47 
 
 		 211 aa  65.9  0.0000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.660065  n/a   
 
 
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NC_007777  Francci3_2248  TetR family transcriptional regulator  29.73 
 
 		 222 aa  65.9  0.0000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0660336  normal  0.0152181 
 
 
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NC_009380  Strop_0024  TetR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 193 aa  65.9  0.0000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009921  Franean1_1887  TetR family transcriptional regulator  28.26 
 
 		 202 aa  65.9  0.0000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.943502 
 
 
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NC_013595  Sros_7768  putative transcriptional regulator, TetR family  28.5 
 
 		 194 aa  65.5  0.0000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013510  Tcur_1867  transcriptional regulator, TetR family  27.66 
 
 		 201 aa  65.5  0.0000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.129849  n/a   
 
 
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NC_013411  GYMC61_2438  transcriptional regulator, TetR family  24.35 
 
 		 208 aa  65.5  0.0000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
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NC_006274  BCZK2226  TetR family transcriptional regulator  31.69 
 
 		 211 aa  65.1  0.0000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0397604  n/a   
 
 
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NC_010184  BcerKBAB4_2285  TetR family transcriptional regulator  32.39 
 
 		 211 aa  65.1  0.0000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0118465  n/a   
 
 
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NC_003909  BCE_2510  TetR family transcriptional regulator  31.69 
 
 		 209 aa  64.7  0.0000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00262483  n/a   
 
 
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NC_009077  Mjls_0098  TetR family transcriptional regulator  27.55 
 
 		 219 aa  64.7  0.0000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.31231  normal  0.349087 
 
 
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NC_008146  Mmcs_0108  TetR family transcriptional regulator  27.55 
 
 		 219 aa  64.7  0.0000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.244027  n/a   
 
 
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NC_008705  Mkms_0117  TetR family transcriptional regulator  27.55 
 
 		 219 aa  64.7  0.0000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0523426 
 
 
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NC_002936  DET1580  TetR family transcriptional regulator  30.82 
 
 		 195 aa  63.9  0.000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000739015  n/a   
 
 
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NC_009338  Mflv_0719  TetR family transcriptional regulator  27.75 
 
 		 209 aa  63.9  0.000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008146  Mmcs_2548  TetR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 482 aa  63.9  0.000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.470429  n/a   
 
 
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NC_008705  Mkms_2593  TetR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 482 aa  63.9  0.000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008726  Mvan_0126  TetR family transcriptional regulator  27.23 
 
 		 224 aa  63.9  0.000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_012793  GWCH70_1844  transcriptional regulator, TetR family  21.69 
 
 		 214 aa  63.9  0.000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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