More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_0719 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



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Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009338  Mflv_0719  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 
209 aa  426  1e-118  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0126  TetR family transcriptional regulator  94.23 
 
 
224 aa  404  1.0000000000000001e-112  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0098  TetR family transcriptional regulator  91.58 
 
 
219 aa  380  1e-105  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.31231  normal  0.349087 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0108  TetR family transcriptional regulator  91.58 
 
 
219 aa  380  1e-105  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.244027  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0117  TetR family transcriptional regulator  91.58 
 
 
219 aa  380  1e-105  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0523426 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10159  TetR family transcriptional regulator  77.61 
 
 
214 aa  327  6e-89  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0306  TetR family transcriptional regulator  28.65 
 
 
219 aa  85.1  7e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0641939  normal  0.172302 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1571  TetR family transcriptional regulator  29.47 
 
 
201 aa  85.1  7e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.038411 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2065  transcriptional regulator, TetR family  31.77 
 
 
188 aa  85.1  7e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.704626  normal  0.605366 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1804  transcriptional regulator, TetR family  27.72 
 
 
189 aa  84  0.000000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2799  TetR family transcriptional regulator  27.98 
 
 
217 aa  82.4  0.000000000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.364827  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5488  TetR family transcriptional regulator  30.43 
 
 
238 aa  82  0.000000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3833  transcriptional regulator, TetR family  31.75 
 
 
204 aa  81.3  0.000000000000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6295  transcriptional regulator, TetR family  25.95 
 
 
212 aa  80.1  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.100221  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3604  TetR family transcriptional regulator  30.16 
 
 
207 aa  79.7  0.00000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.461648 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0913  TetR family transcriptional regulator  32.81 
 
 
195 aa  79  0.00000000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.269174  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0832  transcriptional regulator, TetR family  30.73 
 
 
211 aa  79  0.00000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.933061 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13590  TetR family transcriptional regulator  28.12 
 
 
200 aa  78.6  0.00000000000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.332381  normal  0.0844747 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0117  TetR family transcriptional regulator  31.09 
 
 
208 aa  78.6  0.00000000000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.966538  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1775  transcriptional regulator, TetR family  24.24 
 
 
207 aa  78.2  0.00000000000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2499  transcriptional regulator, TetR family  26.6 
 
 
208 aa  77.8  0.0000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4073  TetR family transcriptional regulator  26.18 
 
 
223 aa  76.3  0.0000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2723  transcriptional regulator, TetR family  28.12 
 
 
224 aa  76.3  0.0000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0252111  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0806  transcriptional regulator, TetR family  28.12 
 
 
202 aa  75.5  0.0000000000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.265645  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4691  TetR family transcriptional regulator  26.7 
 
 
205 aa  75.5  0.0000000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.771858  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5076  TetR family transcriptional regulator  27.14 
 
 
215 aa  75.5  0.0000000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.175697 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4777  TetR family transcriptional regulator  26.7 
 
 
205 aa  75.5  0.0000000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.681727  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1844  transcriptional regulator, TetR family  26.63 
 
 
214 aa  74.3  0.000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4128  TetR family transcriptional regulator  26.4 
 
 
241 aa  74.3  0.000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.860792 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1471  TetR family transcriptional regulator  27.46 
 
 
219 aa  73.6  0.000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0809  regulatory protein, TetR  29.7 
 
 
200 aa  73.6  0.000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.732229  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3991  regulatory protein TetR  28.95 
 
 
197 aa  72.4  0.000000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3548  TetR family transcriptional regulator  26.84 
 
 
216 aa  72  0.000000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2438  transcriptional regulator, TetR family  26.18 
 
 
208 aa  71.2  0.00000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5283  TetR family transcriptional regulator  25.5 
 
 
208 aa  70.9  0.00000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.261053 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4824  TetR family transcriptional regulator  27.03 
 
 
228 aa  70.1  0.00000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3594  TetR family transcriptional regulator  29.19 
 
 
210 aa  69.7  0.00000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2696  TetR family transcriptional regulator  25.13 
 
 
196 aa  69.3  0.00000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.834085 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4061  TetR family transcriptional regulator  23.28 
 
 
240 aa  68.9  0.00000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3836  TetR family transcriptional regulator  25.53 
 
 
246 aa  69.3  0.00000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.487675  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1011  TetR family transcriptional regulator  25.26 
 
 
770 aa  68.6  0.00000000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2997  transcriptional regulator, TetR family  27.98 
 
 
213 aa  68.6  0.00000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1483  TetR family transcriptional regulator  25.79 
 
 
197 aa  68.2  0.00000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS03754  transcription regulator protein  30.51 
 
 
215 aa  67.4  0.0000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.727658  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3449  TetR family transcriptional regulator  25.67 
 
 
209 aa  67.4  0.0000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.772262  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16730  transcriptional regulator, TetR family  25.67 
 
 
213 aa  67.8  0.0000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0033  TetR family transcriptional regulator  22.75 
 
 
256 aa  67.4  0.0000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2922  transcriptional regulator, TetR family  24.87 
 
 
204 aa  67.4  0.0000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.404278 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2348  transcriptional regulator, TetR family  29.95 
 
 
222 aa  66.6  0.0000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0187157  normal  0.0306872 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2502  transcriptional regulator, TetR family  37.36 
 
 
291 aa  67.4  0.0000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0607  transcriptional regulator, TetR family  26.07 
 
 
255 aa  67  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.118397  normal  0.590685 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2411  transcriptional regulator, TetR family  26.94 
 
 
236 aa  66.2  0.0000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2765  regulatory protein, TetR  27.92 
 
 
210 aa  66.6  0.0000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.267077  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0648  transcriptional regulator, TetR family  25.23 
 
 
247 aa  65.9  0.0000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0672593 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7113  TetR family transcriptional regulator  27.32 
 
 
240 aa  65.5  0.0000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2747  TetR family transcriptional regulator  25.67 
 
 
233 aa  65.1  0.0000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.02505  normal  0.237475 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4897  TetR family transcriptional regulator  25.62 
 
 
231 aa  64.3  0.000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.043246  normal  0.757086 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1867  transcriptional regulator, TetR family  26.6 
 
 
201 aa  64.3  0.000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.129849  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2995  TetR family transcriptional regulator  26.2 
 
 
211 aa  63.5  0.000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.428403  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2017  transcriptional regulator, TetR family  26.94 
 
 
236 aa  63.5  0.000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0445  transcriptional regulator, TetR family  29.79 
 
 
209 aa  62.8  0.000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.740524  decreased coverage  0.00376288 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0231  transcriptional regulator, TetR family  27.42 
 
 
200 aa  62.8  0.000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.336394 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3490  transcriptional regulator, TetR family  28.86 
 
 
207 aa  61.6  0.000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.20919 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4562  transcriptional regulator, TetR family  28.86 
 
 
207 aa  61.6  0.000000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.602927 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33190  transcriptional regulator  25.93 
 
 
202 aa  61.6  0.000000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.284512  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2213  putative transcription regulator transcription regulator protein  25.81 
 
 
236 aa  61.2  0.000000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3149  TetR family transcriptional regulator  26.29 
 
 
233 aa  61.2  0.00000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1851  transcriptional regulator, TetR family  26.63 
 
 
201 aa  60.5  0.00000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.144681  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0698  putative transcription regulator protein  24.06 
 
 
264 aa  60.1  0.00000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00682473  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0153  TetR family transcriptional regulator  25.93 
 
 
210 aa  60.5  0.00000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2109  TetR family transcriptional regulator  22.65 
 
 
206 aa  60.5  0.00000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.901149 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1240  transcriptional regulator, TetR family  28.88 
 
 
211 aa  60.5  0.00000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.567777  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3721  transcriptional regulator, TetR family  24.24 
 
 
260 aa  59.7  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.249433  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4711  TetR family transcriptional regulator  23.2 
 
 
228 aa  60.1  0.00000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.133874 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3375  TetR family transcriptional regulator  28.64 
 
 
206 aa  59.3  0.00000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0949  transcriptional regulator, TetR family  35.16 
 
 
286 aa  58.9  0.00000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0370  TetR family transcriptional regulator  28.27 
 
 
223 aa  58.9  0.00000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0234884  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0024  TetR family transcriptional regulator  48.98 
 
 
193 aa  58.5  0.00000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3212  TetR family transcriptional regulator  27.01 
 
 
211 aa  58.5  0.00000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2162  TetR family transcriptional regulator  26.63 
 
 
209 aa  58.5  0.00000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.0662359 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16700  transcriptional regulator  22.56 
 
 
211 aa  58.5  0.00000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2863  TetR family transcriptional regulator  26.13 
 
 
204 aa  58.2  0.00000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000603343 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7768  putative transcriptional regulator, TetR family  22.87 
 
 
194 aa  58.2  0.00000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3668  transcriptional regulator, TetR family  26.56 
 
 
202 aa  58.2  0.00000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.0040426  hitchhiker  0.0000000599644 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2441  TetR family transcriptional regulator  23.21 
 
 
205 aa  58.2  0.0000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.21008  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2423  transcriptional regulator, TetR family  23.81 
 
 
207 aa  57.8  0.0000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2176  TetR family transcriptional regulator  23.81 
 
 
209 aa  57.4  0.0000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000096918  n/a   
 
 
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NC_013739  Cwoe_4481  transcriptional regulator, TetR family  46.15 
 
 
216 aa  57.8  0.0000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.918639  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1603  transcriptional regulator, TetR family  24.73 
 
 
189 aa  58.2  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0115969  n/a   
 
 
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NC_007958  RPD_0043  regulatory protein, TetR  26.94 
 
 
211 aa  57.8  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
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NC_009953  Sare_0030  TetR family transcriptional regulator  48.98 
 
 
193 aa  57.8  0.0000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.19641  normal 
 
 
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NC_008578  Acel_1436  TetR family transcriptional regulator  26.8 
 
 
197 aa  57.8  0.0000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
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NC_005945  BAS2242  TetR family transcriptional regulator  22.62 
 
 
209 aa  56.6  0.0000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.640782  n/a   
 
 
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NC_006274  BCZK2162  TetR family transcriptional regulator  23.81 
 
 
207 aa  57  0.0000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.116975  n/a   
 
 
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NC_013739  Cwoe_2235  transcriptional regulator, TetR family  28.57 
 
 
235 aa  57  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.170733  normal  0.3149 
 
 
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NC_013411  GYMC61_1468  transcriptional regulator, TetR family  25.91 
 
 
190 aa  57  0.0000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
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NC_007530  GBAA_2406  TetR family transcriptional regulator  22.62 
 
 
209 aa  56.6  0.0000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_010084  Bmul_0226  TetR family transcriptional regulator  28.5 
 
 
201 aa  57  0.0000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.312291  hitchhiker  0.00018932 
 
 
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NC_007908  Rfer_3897  TetR family transcriptional regulator  25.52 
 
 
213 aa  57  0.0000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_010002  Daci_0571  TetR family transcriptional regulator  29.8 
 
 
219 aa  57  0.0000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.22949  normal 
 
 
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