More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_13590 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



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Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009565  TBFG_13590  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 200 aa  409  1e-113  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.332381  normal  0.0844747 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5076  TetR family transcriptional regulator  81.87 
 
 		 215 aa  337  5.9999999999999996e-92  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.175697 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4691  TetR family transcriptional regulator  82.29 
 
 		 205 aa  337  9.999999999999999e-92  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.771858  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4777  TetR family transcriptional regulator  82.29 
 
 		 205 aa  337  9.999999999999999e-92  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.681727  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5283  TetR family transcriptional regulator  81.96 
 
 		 208 aa  337  9.999999999999999e-92  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.261053 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1483  TetR family transcriptional regulator  76.14 
 
 		 197 aa  314  6e-85  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3991  regulatory protein TetR  60.96 
 
 		 197 aa  232  3e-60  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3833  transcriptional regulator, TetR family  58.73 
 
 		 204 aa  230  9e-60  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2765  regulatory protein, TetR  52.38 
 
 		 210 aa  215  4e-55  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.267077  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1369  transcriptional regulator, TetR family  54.71 
 
 		 197 aa  201  4e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.859804 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2348  transcriptional regulator, TetR family  47.28 
 
 		 222 aa  174  5e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0187157  normal  0.0306872 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3352  transcriptional regulator, TetR family  46.67 
 
 		 183 aa  175  5e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0512596  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2055  putative transcriptional regulator, TetR family  43.52 
 
 		 229 aa  168  6e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0410393  normal  0.8778 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2601  regulatory protein, TetR  40.1 
 
 		 224 aa  155  5.0000000000000005e-37  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.354794  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2800  TetR family transcriptional regulator  40.1 
 
 		 224 aa  154  7e-37  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.697977  decreased coverage  0.000162176 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2358  transcriptional regulator, TetR family  35.56 
 
 		 216 aa  132  3e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0281012 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2109  TetR family transcriptional regulator  35.64 
 
 		 206 aa  132  3.9999999999999996e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.901149 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2065  transcriptional regulator, TetR family  30.32 
 
 		 188 aa  94.7  7e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.704626  normal  0.605366 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2269  putative transcriptional regulator  31.55 
 
 		 207 aa  90.1  2e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.629172  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26760  putative transcriptional regulator  31.02 
 
 		 198 aa  90.1  2e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3944  TetR family transcriptional regulator  30.41 
 
 		 215 aa  89.4  4e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0306  TetR family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 219 aa  89  4e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0641939  normal  0.172302 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0433  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 204 aa  89  4e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.376909  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2688  TetR family transcriptional regulator  29.9 
 
 		 207 aa  87.4  1e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.357002  normal  0.760245 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0117  TetR family transcriptional regulator  27.81 
 
 		 208 aa  85.5  5e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.966538  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0595  TetR family transcriptional regulator  27.37 
 
 		 204 aa  85.5  5e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2723  transcriptional regulator, TetR family  27.27 
 
 		 224 aa  85.5  5e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0252111  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1471  TetR family transcriptional regulator  28.06 
 
 		 219 aa  83.6  0.000000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4378  transcriptional regulator, TetR family  26.63 
 
 		 200 aa  80.1  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.136582 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2696  TetR family transcriptional regulator  27.18 
 
 		 196 aa  80.5  0.00000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.834085 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4824  TetR family transcriptional regulator  27.96 
 
 		 228 aa  79  0.00000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0719  TetR family transcriptional regulator  28.12 
 
 		 209 aa  78.6  0.00000000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0806  transcriptional regulator, TetR family  26.34 
 
 		 202 aa  78.6  0.00000000000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.265645  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1571  TetR family transcriptional regulator  29.95 
 
 		 201 aa  78.2  0.00000000000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.038411 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0108  TetR family transcriptional regulator  26.94 
 
 		 219 aa  78.2  0.00000000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.244027  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0117  TetR family transcriptional regulator  26.94 
 
 		 219 aa  78.2  0.00000000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0523426 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0098  TetR family transcriptional regulator  26.94 
 
 		 219 aa  78.2  0.00000000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.31231  normal  0.349087 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1844  transcriptional regulator, TetR family  22.87 
 
 		 214 aa  77.4  0.0000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0126  TetR family transcriptional regulator  28.12 
 
 		 224 aa  77.4  0.0000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2438  transcriptional regulator, TetR family  21.93 
 
 		 208 aa  77.4  0.0000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1851  transcriptional regulator, TetR family  32.29 
 
 		 201 aa  77  0.0000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.144681  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17960  transcriptional regulator, TetR family  30.81 
 
 		 208 aa  76.6  0.0000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.134645  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0832  transcriptional regulator, TetR family  26.74 
 
 		 211 aa  76.6  0.0000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.933061 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2499  transcriptional regulator, TetR family  25.54 
 
 		 208 aa  75.5  0.0000000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1775  transcriptional regulator, TetR family  22.75 
 
 		 207 aa  75.5  0.0000000000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4464  TetR family transcriptional regulator  29.59 
 
 		 204 aa  74.3  0.000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0680244 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2235  transcriptional regulator, TetR family  28.14 
 
 		 235 aa  73.2  0.000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.170733  normal  0.3149 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0809  regulatory protein, TetR  30.16 
 
 		 200 aa  72.8  0.000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.732229  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0913  TetR family transcriptional regulator  27.32 
 
 		 195 aa  72.4  0.000000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.269174  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2367  TetR family transcriptional regulator  32.03 
 
 		 202 aa  72  0.000000000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.445055  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0516  TetR family transcriptional regulator  25.74 
 
 		 195 aa  72  0.000000000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1580  TetR family transcriptional regulator  27.04 
 
 		 195 aa  70.9  0.00000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000739015  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2200  transcriptional regulator, TetR family  25.13 
 
 		 203 aa  71.2  0.00000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1827  regulatory protein, TetR  29.69 
 
 		 196 aa  70.9  0.00000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1804  transcriptional regulator, TetR family  23.89 
 
 		 189 aa  70.1  0.00000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2548  TetR family transcriptional regulator  33.97 
 
 		 482 aa  70.1  0.00000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.470429  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7768  putative transcriptional regulator, TetR family  26.06 
 
 		 194 aa  69.7  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2593  TetR family transcriptional regulator  33.97 
 
 		 482 aa  70.1  0.00000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2922  transcriptional regulator, TetR family  24.75 
 
 		 204 aa  69.3  0.00000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.404278 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4046  TetR family transcriptional regulator  26.97 
 
 		 212 aa  69.3  0.00000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0961065 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1457  transcription regulator, TetR family  26.47 
 
 		 195 aa  69.3  0.00000000004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.00000222834  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0347  TetR family transcriptional regulator  27.14 
 
 		 200 aa  69.3  0.00000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0154637  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2801  TetR family transcriptional regulator  30.48 
 
 		 209 aa  68.9  0.00000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4066  transcriptional regulator, TetR family  24.32 
 
 		 211 aa  68.9  0.00000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2767  TetR family transcriptional regulator  27.84 
 
 		 225 aa  68.9  0.00000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.284138 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2575  transcriptional regulator, TetR family  31.13 
 
 		 211 aa  68.6  0.00000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000582548  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4073  TetR family transcriptional regulator  28.27 
 
 		 223 aa  68.9  0.00000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1858  TetR family transcriptional regulator  26 
 
 		 234 aa  68.9  0.00000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.543066  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33190  transcriptional regulator  26.86 
 
 		 202 aa  68.9  0.00000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.284512  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0626  TetR family transcriptional regulator  27.03 
 
 		 215 aa  68.6  0.00000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1436  TetR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 197 aa  68.2  0.00000000008  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2755  TetR family transcriptional regulator  23.76 
 
 		 200 aa  68.2  0.00000000009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5475  putative transcriptional regulator, TetR family  27.62 
 
 		 232 aa  67.8  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0120226 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2226  TetR family transcriptional regulator  30.26 
 
 		 211 aa  67.8  0.0000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0397604  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2799  TetR family transcriptional regulator  27.37 
 
 		 217 aa  67.4  0.0000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.364827  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1768  TetR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 211 aa  67.8  0.0000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.570427  normal  0.275415 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1887  TetR family transcriptional regulator  26.55 
 
 		 202 aa  67.8  0.0000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.943502 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2587  TetR family transcriptional regulator  30.81 
 
 		 434 aa  67.8  0.0000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.308714  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2304  TetR family transcriptional regulator  30.26 
 
 		 211 aa  66.6  0.0000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.373552  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2272  TetR family transcriptional regulator  30.26 
 
 		 211 aa  67  0.0000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000566042  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2500  transcriptional regulator, TetR family  30.26 
 
 		 211 aa  67  0.0000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2479  TetR family transcriptional regulator  30.26 
 
 		 211 aa  66.6  0.0000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.660065  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2510  TetR family transcriptional regulator  29.61 
 
 		 209 aa  66.2  0.0000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00262483  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6181  transcriptional regulator, TetR family  30.89 
 
 		 202 aa  66.2  0.0000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.685616  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2434  transcriptional regulator, TetR family  29.38 
 
 		 211 aa  66.2  0.0000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16730  transcriptional regulator, TetR family  25.41 
 
 		 213 aa  65.9  0.0000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1922  transcriptional regulator, TetR family  35.92 
 
 		 201 aa  65.9  0.0000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2285  TetR family transcriptional regulator  29.8 
 
 		 211 aa  65.5  0.0000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0118465  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2628  transcriptional regulator, TetR family  26.88 
 
 		 194 aa  65.5  0.0000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00732346  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1401  TetR family transcriptional regulator  26.99 
 
 		 222 aa  65.5  0.0000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.513329  normal  0.505278 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4938  transcriptional regulator, TetR family  26.28 
 
 		 223 aa  65.5  0.0000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.262917  normal  0.206147 
 
 
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NC_013757  Gobs_1909  transcriptional regulator, TetR family  27.07 
 
 		 209 aa  65.5  0.0000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0574085  n/a   
 
 
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NC_013093  Amir_1603  transcriptional regulator, TetR family  24.86 
 
 		 189 aa  65.5  0.0000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0115969  n/a   
 
 
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NC_012793  GWCH70_3148  transcriptional regulator, TetR family  32.97 
 
 		 310 aa  64.7  0.0000000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013510  Tcur_1867  transcriptional regulator, TetR family  23.76 
 
 		 201 aa  63.9  0.000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.129849  n/a   
 
 
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NC_013159  Svir_26580  transcriptional regulator, TetR family  25.27 
 
 		 205 aa  64.3  0.000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0994293 
 
 
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NC_007950  Bpro_5293  TetR family transcriptional regulator  29.23 
 
 		 210 aa  63.9  0.000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.199638  normal  1 
 
 
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NC_009455  DehaBAV1_1327  TetR family transcriptional regulator  26.59 
 
 		 191 aa  63.9  0.000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00385081  n/a   
 
 
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NC_009565  TBFG_10159  TetR family transcriptional regulator  25.52 
 
 		 214 aa  63.9  0.000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013517  Sterm_3170  transcriptional regulator, TetR family  29.41 
 
 		 216 aa  63.5  0.000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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