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for query gene Mesil_2065 on replicon NC_014212
Organism: Meiothermus silvanus DSM 9946



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Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014212  Mesil_2065  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 188 aa  378  1e-104  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.704626  normal  0.605366 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0117  TetR family transcriptional regulator  55.14 
 
 		 208 aa  202  2e-51  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.966538  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1571  TetR family transcriptional regulator  48.9 
 
 		 201 aa  179  2.9999999999999997e-44  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.038411 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0806  transcriptional regulator, TetR family  41.08 
 
 		 202 aa  146  1.0000000000000001e-34  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.265645  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2195  transcriptional regulator, TetR family  41.08 
 
 		 189 aa  125  4.0000000000000003e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2799  TetR family transcriptional regulator  34.76 
 
 		 217 aa  121  6e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.364827  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0832  transcriptional regulator, TetR family  35.68 
 
 		 211 aa  117  7e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.933061 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2723  transcriptional regulator, TetR family  30.6 
 
 		 224 aa  112  2.0000000000000002e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0252111  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05345  transcriptional regulator, tetR family protein  30.65 
 
 		 190 aa  112  3e-24  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  hitchhiker  0.00749651  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4824  TetR family transcriptional regulator  30.05 
 
 		 228 aa  112  5e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0347  TetR family transcriptional regulator  35.03 
 
 		 200 aa  111  8.000000000000001e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0154637  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1804  transcriptional regulator, TetR family  34.43 
 
 		 189 aa  110  2.0000000000000002e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0433  TetR family transcriptional regulator  31.67 
 
 		 204 aa  107  1e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.376909  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0595  TetR family transcriptional regulator  31.32 
 
 		 204 aa  107  1e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6295  transcriptional regulator, TetR family  29.67 
 
 		 212 aa  105  4e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.100221  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2747  TetR family transcriptional regulator  32.78 
 
 		 233 aa  100  1e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.02505  normal  0.237475 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1775  transcriptional regulator, TetR family  27.27 
 
 		 207 aa  98.6  5e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2109  TetR family transcriptional regulator  29.73 
 
 		 206 aa  97.8  9e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.901149 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0913  TetR family transcriptional regulator  33.16 
 
 		 195 aa  97.4  9e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.269174  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2765  regulatory protein, TetR  29.79 
 
 		 210 aa  97.4  1e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.267077  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1844  transcriptional regulator, TetR family  26.88 
 
 		 214 aa  96.3  2e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2499  transcriptional regulator, TetR family  29.19 
 
 		 208 aa  95.5  4e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2348  transcriptional regulator, TetR family  32.43 
 
 		 222 aa  95.1  5e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0187157  normal  0.0306872 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13590  TetR family transcriptional regulator  30.32 
 
 		 200 aa  94.7  6e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.332381  normal  0.0844747 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2055  putative transcriptional regulator, TetR family  28.88 
 
 		 229 aa  94.4  9e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0410393  normal  0.8778 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2438  transcriptional regulator, TetR family  26.94 
 
 		 208 aa  94  1e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3833  transcriptional regulator, TetR family  30.11 
 
 		 204 aa  92.8  2e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4691  TetR family transcriptional regulator  29.57 
 
 		 205 aa  92.4  3e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.771858  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4777  TetR family transcriptional regulator  29.57 
 
 		 205 aa  92.4  3e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.681727  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3991  regulatory protein TetR  28.49 
 
 		 197 aa  92.8  3e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2696  TetR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 196 aa  92.4  4e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.834085 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5076  TetR family transcriptional regulator  29.57 
 
 		 215 aa  92  4e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.175697 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5283  TetR family transcriptional regulator  29.03 
 
 		 208 aa  92  4e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.261053 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16730  transcriptional regulator, TetR family  28.33 
 
 		 213 aa  91.7  6e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3721  transcriptional regulator, TetR family  30.98 
 
 		 260 aa  91.3  8e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.249433  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6181  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 202 aa  90.1  2e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.685616  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1483  TetR family transcriptional regulator  28.49 
 
 		 197 aa  88.6  4e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1768  TetR family transcriptional regulator  27.96 
 
 		 211 aa  89  4e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.570427  normal  0.275415 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0306  TetR family transcriptional regulator  28.95 
 
 		 219 aa  88.6  5e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0641939  normal  0.172302 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1887  TetR family transcriptional regulator  32.97 
 
 		 202 aa  87.8  9e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.943502 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26580  transcriptional regulator, TetR family  30.77 
 
 		 205 aa  87.4  1e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0994293 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3836  TetR family transcriptional regulator  27.03 
 
 		 246 aa  86.7  2e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.487675  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4066  transcriptional regulator, TetR family  28.57 
 
 		 211 aa  85.5  4e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0719  TetR family transcriptional regulator  31.77 
 
 		 209 aa  85.1  5e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4061  TetR family transcriptional regulator  25.27 
 
 		 240 aa  85.1  5e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1369  transcriptional regulator, TetR family  30.81 
 
 		 197 aa  84.7  7e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.859804 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0126  TetR family transcriptional regulator  30.73 
 
 		 224 aa  84.7  8e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1898  TetR family transcriptional regulator  33.14 
 
 		 239 aa  84.3  9e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.643398 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3815  regulatory protein, TetR  29.03 
 
 		 252 aa  83.6  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00651597  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2310  TetR family transcriptional regulator  34.07 
 
 		 220 aa  83.6  0.000000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.987325  decreased coverage  0.00710043 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33190  transcriptional regulator  27.32 
 
 		 202 aa  83.2  0.000000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.284512  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0098  TetR family transcriptional regulator  30.89 
 
 		 219 aa  83.6  0.000000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.31231  normal  0.349087 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0108  TetR family transcriptional regulator  30.89 
 
 		 219 aa  83.6  0.000000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.244027  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0117  TetR family transcriptional regulator  30.89 
 
 		 219 aa  83.6  0.000000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0523426 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7768  putative transcriptional regulator, TetR family  25 
 
 		 194 aa  82.8  0.000000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0033  TetR family transcriptional regulator  23.66 
 
 		 256 aa  82.4  0.000000000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3352  transcriptional regulator, TetR family  27.68 
 
 		 183 aa  81.6  0.000000000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0512596  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2495  transcriptional regulator, TetR family  31.44 
 
 		 287 aa  81.3  0.000000000000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0937177  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4073  TetR family transcriptional regulator  27.17 
 
 		 223 aa  81.3  0.000000000000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4079  TetR family transcriptional regulator  28.8 
 
 		 244 aa  81.3  0.000000000000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.780842  normal  0.246764 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0370  TetR family transcriptional regulator  29.35 
 
 		 223 aa  81.3  0.000000000000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0234884  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4046  TetR family transcriptional regulator  29.83 
 
 		 212 aa  80.9  0.000000000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0961065 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1436  TetR family transcriptional regulator  30.98 
 
 		 197 aa  80.9  0.000000000000009  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2601  regulatory protein, TetR  29.03 
 
 		 224 aa  80.9  0.00000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.354794  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1909  transcriptional regulator, TetR family  32.42 
 
 		 209 aa  80.5  0.00000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0574085  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3508  TetR family transcriptional regulator  28.42 
 
 		 227 aa  80.9  0.00000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.343043  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5293  TetR family transcriptional regulator  27.81 
 
 		 210 aa  80.9  0.00000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.199638  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0295  transcriptional regulator, TetR family  32.42 
 
 		 220 aa  79.7  0.00000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0107513  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2922  transcriptional regulator, TetR family  26.37 
 
 		 204 aa  80.1  0.00000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.404278 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4464  TetR family transcriptional regulator  29.03 
 
 		 204 aa  80.1  0.00000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0680244 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10159  TetR family transcriptional regulator  30.57 
 
 		 214 aa  80.5  0.00000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1827  regulatory protein, TetR  30.18 
 
 		 196 aa  79.3  0.00000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2755  TetR family transcriptional regulator  24.58 
 
 		 200 aa  78.6  0.00000000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2688  TetR family transcriptional regulator  27.01 
 
 		 207 aa  78.2  0.00000000000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.357002  normal  0.760245 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1471  TetR family transcriptional regulator  27.51 
 
 		 219 aa  77.8  0.00000000000009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1958  TetR family transcriptional regulator  32.22 
 
 		 251 aa  77  0.0000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.455038  normal  0.501183 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2235  transcriptional regulator, TetR family  30.73 
 
 		 235 aa  77.4  0.0000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.170733  normal  0.3149 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5045  TetR family transcriptional regulator  28.66 
 
 		 197 aa  77  0.0000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.820553  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1858  TetR family transcriptional regulator  29.57 
 
 		 234 aa  76.6  0.0000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.543066  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2271  transcriptional regulator  29.31 
 
 		 209 aa  77  0.0000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.850012 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4378  transcriptional regulator, TetR family  28.57 
 
 		 200 aa  76.6  0.0000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.136582 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0043  regulatory protein, TetR  32.4 
 
 		 211 aa  76.6  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2189  TetR family transcriptional regulator  30.36 
 
 		 222 aa  76.6  0.0000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0809  regulatory protein, TetR  28.11 
 
 		 200 aa  76.3  0.0000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.732229  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2628  transcriptional regulator, TetR family  25.82 
 
 		 194 aa  75.9  0.0000000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00732346  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4711  TetR family transcriptional regulator  27.42 
 
 		 228 aa  75.9  0.0000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.133874 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2269  putative transcriptional regulator  26.37 
 
 		 207 aa  75.9  0.0000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.629172  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20320  transcriptional regulator, TetR family  30.48 
 
 		 203 aa  75.9  0.0000000000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2800  TetR family transcriptional regulator  27.42 
 
 		 224 aa  76.3  0.0000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.697977  decreased coverage  0.000162176 
 
 
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NC_009427  Saro_3449  TetR family transcriptional regulator  28.5 
 
 		 209 aa  75.1  0.0000000000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.772262  n/a   
 
 
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NC_013739  Cwoe_2358  transcriptional regulator, TetR family  26.26 
 
 		 216 aa  75.5  0.0000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0281012 
 
 
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NC_007509  Bcep18194_C7312  TetR family transcriptional regulator  30.73 
 
 		 210 aa  74.3  0.0000000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_007492  Pfl01_3944  TetR family transcriptional regulator  27.32 
 
 		 215 aa  74.3  0.0000000000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013739  Cwoe_0231  transcriptional regulator, TetR family  30 
 
 		 200 aa  73.9  0.000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.336394 
 
 
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NC_008463  PA14_26760  putative transcriptional regulator  25.82 
 
 		 198 aa  73.9  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008699  Noca_0817  TetR family transcriptional regulator  28.89 
 
 		 210 aa  73.9  0.000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.577348  n/a   
 
 
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NC_011662  Tmz1t_2997  transcriptional regulator, TetR family  27.32 
 
 		 213 aa  73.6  0.000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007643  Rru_A1934  TetR family transcriptional regulator  26.11 
 
 		 202 aa  73.2  0.000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0322407  n/a   
 
 
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NC_007650  BTH_II0293  TetR family transcriptional regulator  24.86 
 
 		 226 aa  73.2  0.000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009075  BURPS668_A2924  TetR family transcriptional regulator  26.37 
 
 		 224 aa  73.2  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.288766  n/a   
 
 
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