More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_1483 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



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Organism name
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Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009338  Mflv_1483  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 197 aa  402  1e-111  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5076  TetR family transcriptional regulator  79.17 
 
 		 215 aa  327  6e-89  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.175697 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4691  TetR family transcriptional regulator  79.17 
 
 		 205 aa  326  1.0000000000000001e-88  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.771858  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4777  TetR family transcriptional regulator  79.17 
 
 		 205 aa  326  1.0000000000000001e-88  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.681727  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5283  TetR family transcriptional regulator  79.14 
 
 		 208 aa  315  2e-85  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.261053 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13590  TetR family transcriptional regulator  76.14 
 
 		 200 aa  314  6e-85  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.332381  normal  0.0844747 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3991  regulatory protein TetR  57.14 
 
 		 197 aa  220  9.999999999999999e-57  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3833  transcriptional regulator, TetR family  51.87 
 
 		 204 aa  208  5e-53  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2765  regulatory protein, TetR  51.61 
 
 		 210 aa  207  6e-53  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.267077  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1369  transcriptional regulator, TetR family  54.71 
 
 		 197 aa  200  9.999999999999999e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.859804 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2348  transcriptional regulator, TetR family  45.21 
 
 		 222 aa  172  3.9999999999999995e-42  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0187157  normal  0.0306872 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2055  putative transcriptional regulator, TetR family  44.79 
 
 		 229 aa  170  1e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0410393  normal  0.8778 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3352  transcriptional regulator, TetR family  43.85 
 
 		 183 aa  163  1.0000000000000001e-39  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0512596  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2800  TetR family transcriptional regulator  40.31 
 
 		 224 aa  149  2e-35  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.697977  decreased coverage  0.000162176 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2601  regulatory protein, TetR  39.27 
 
 		 224 aa  147  1.0000000000000001e-34  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.354794  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2358  transcriptional regulator, TetR family  34.97 
 
 		 216 aa  128  6e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0281012 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2109  TetR family transcriptional regulator  30.65 
 
 		 206 aa  115  3e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.901149 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2269  putative transcriptional regulator  32.8 
 
 		 207 aa  90.5  1e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.629172  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2065  transcriptional regulator, TetR family  28.49 
 
 		 188 aa  88.6  5e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.704626  normal  0.605366 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26760  putative transcriptional regulator  31.18 
 
 		 198 aa  87  2e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0306  TetR family transcriptional regulator  30.85 
 
 		 219 aa  85.9  3e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0641939  normal  0.172302 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3944  TetR family transcriptional regulator  30.65 
 
 		 215 aa  85.1  6e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0806  transcriptional regulator, TetR family  27.78 
 
 		 202 aa  83.2  0.000000000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.265645  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0117  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 208 aa  81.6  0.000000000000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.966538  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2723  transcriptional regulator, TetR family  26.06 
 
 		 224 aa  80.9  0.00000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0252111  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0832  transcriptional regulator, TetR family  26.18 
 
 		 211 aa  80.1  0.00000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.933061 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1775  transcriptional regulator, TetR family  22.16 
 
 		 207 aa  79.3  0.00000000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2438  transcriptional regulator, TetR family  23.66 
 
 		 208 aa  79  0.00000000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1844  transcriptional regulator, TetR family  25.52 
 
 		 214 aa  79  0.00000000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2688  TetR family transcriptional regulator  27.96 
 
 		 207 aa  78.2  0.00000000000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.357002  normal  0.760245 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0809  regulatory protein, TetR  30.65 
 
 		 200 aa  77.4  0.0000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.732229  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1571  TetR family transcriptional regulator  28.96 
 
 		 201 aa  77.4  0.0000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.038411 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4378  transcriptional regulator, TetR family  26.74 
 
 		 200 aa  77  0.0000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.136582 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2696  TetR family transcriptional regulator  27.51 
 
 		 196 aa  75.9  0.0000000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.834085 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0595  TetR family transcriptional regulator  24.6 
 
 		 204 aa  75.1  0.0000000000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1471  TetR family transcriptional regulator  24.08 
 
 		 219 aa  74.7  0.0000000000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4824  TetR family transcriptional regulator  27.13 
 
 		 228 aa  74.3  0.000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2922  transcriptional regulator, TetR family  25.85 
 
 		 204 aa  73.2  0.000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.404278 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2499  transcriptional regulator, TetR family  23.81 
 
 		 208 aa  73.6  0.000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33190  transcriptional regulator  26.04 
 
 		 202 aa  72.8  0.000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.284512  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1603  transcriptional regulator, TetR family  26.78 
 
 		 189 aa  72  0.000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0115969  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1851  transcriptional regulator, TetR family  30.41 
 
 		 201 aa  71.6  0.000000000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.144681  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4061  TetR family transcriptional regulator  26.15 
 
 		 240 aa  72  0.000000000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0433  TetR family transcriptional regulator  24.59 
 
 		 204 aa  72  0.000000000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.376909  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3836  TetR family transcriptional regulator  24.62 
 
 		 246 aa  71.6  0.000000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.487675  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2235  transcriptional regulator, TetR family  26.57 
 
 		 235 aa  71.2  0.000000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.170733  normal  0.3149 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2628  transcriptional regulator, TetR family  27.38 
 
 		 194 aa  70.5  0.00000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00732346  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4073  TetR family transcriptional regulator  26.63 
 
 		 223 aa  70.9  0.00000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2799  TetR family transcriptional regulator  27.03 
 
 		 217 aa  69.7  0.00000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.364827  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1858  TetR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 234 aa  69.3  0.00000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.543066  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2587  TetR family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 434 aa  69.7  0.00000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.308714  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4046  TetR family transcriptional regulator  25.4 
 
 		 212 aa  69.3  0.00000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0961065 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17960  transcriptional regulator, TetR family  28.42 
 
 		 208 aa  68.9  0.00000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.134645  normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5293  TetR family transcriptional regulator  30.15 
 
 		 210 aa  69.3  0.00000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.199638  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2548  TetR family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 482 aa  68.6  0.00000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.470429  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0347  TetR family transcriptional regulator  27.37 
 
 		 200 aa  68.6  0.00000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0154637  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2593  TetR family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 482 aa  68.6  0.00000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16730  transcriptional regulator, TetR family  26.88 
 
 		 213 aa  68.2  0.00000000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2755  TetR family transcriptional regulator  25.77 
 
 		 200 aa  68.2  0.00000000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0719  TetR family transcriptional regulator  25.79 
 
 		 209 aa  68.2  0.00000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4464  TetR family transcriptional regulator  28.92 
 
 		 204 aa  68.2  0.00000000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0680244 
 
 
-
 
NC_002936  DET1580  TetR family transcriptional regulator  29.05 
 
 		 195 aa  67.4  0.0000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000739015  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0033  TetR family transcriptional regulator  26.42 
 
 		 256 aa  67.8  0.0000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0098  TetR family transcriptional regulator  24.74 
 
 		 219 aa  66.6  0.0000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.31231  normal  0.349087 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0108  TetR family transcriptional regulator  24.74 
 
 		 219 aa  66.6  0.0000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.244027  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1804  transcriptional regulator, TetR family  22.35 
 
 		 189 aa  66.6  0.0000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0117  TetR family transcriptional regulator  24.74 
 
 		 219 aa  66.6  0.0000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0523426 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0913  TetR family transcriptional regulator  24.74 
 
 		 195 aa  66.6  0.0000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.269174  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26580  transcriptional regulator, TetR family  25.4 
 
 		 205 aa  65.9  0.0000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0994293 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1457  transcription regulator, TetR family  28.3 
 
 		 195 aa  66.2  0.0000000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.00000222834  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2200  transcriptional regulator, TetR family  28.1 
 
 		 203 aa  66.2  0.0000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1401  TetR family transcriptional regulator  25.75 
 
 		 222 aa  66.2  0.0000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.513329  normal  0.505278 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2801  TetR family transcriptional regulator  28.49 
 
 		 209 aa  65.5  0.0000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1436  TetR family transcriptional regulator  28.26 
 
 		 197 aa  65.5  0.0000000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4938  transcriptional regulator, TetR family  26.06 
 
 		 223 aa  65.5  0.0000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.262917  normal  0.206147 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0126  TetR family transcriptional regulator  25.26 
 
 		 224 aa  65.5  0.0000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4066  transcriptional regulator, TetR family  23.5 
 
 		 211 aa  65.5  0.0000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5045  TetR family transcriptional regulator  34.65 
 
 		 197 aa  65.5  0.0000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.820553  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0452  regulatory protein TetR  26.47 
 
 		 221 aa  64.7  0.0000000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1768  TetR family transcriptional regulator  29.07 
 
 		 211 aa  64.7  0.0000000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.570427  normal  0.275415 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4158  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 445 aa  64.7  0.0000000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.1717  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3781  TetR family transcriptional regulator  30.82 
 
 		 214 aa  64.3  0.000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2233  transcriptional regulator, TetR family  29.41 
 
 		 246 aa  63.9  0.000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0329344  normal  0.539811 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0626  TetR family transcriptional regulator  26.23 
 
 		 215 aa  63.5  0.000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0516  TetR family transcriptional regulator  24.75 
 
 		 195 aa  63.5  0.000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2602  transcriptional regulator, TetR family  27.03 
 
 		 214 aa  63.5  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.157273  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6181  transcriptional regulator, TetR family  28.25 
 
 		 202 aa  63.9  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.685616  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2695  transcriptional regulator, TetR family  27.03 
 
 		 226 aa  63.2  0.000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7312  TetR family transcriptional regulator  29.65 
 
 		 210 aa  63.2  0.000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5138  TetR family transcriptional regulator  24.42 
 
 		 209 aa  62.8  0.000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013947  Snas_1156  transcriptional regulator, TetR family  27.96 
 
 		 227 aa  62.8  0.000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1014  TetR family transcriptional regulator  27.5 
 
 		 212 aa  62.4  0.000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009511  Swit_3604  TetR family transcriptional regulator  25.65 
 
 		 207 aa  62  0.000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.461648 
 
 
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NC_009720  Xaut_4711  TetR family transcriptional regulator  22.99 
 
 		 228 aa  61.6  0.000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.133874 
 
 
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NC_009455  DehaBAV1_1327  TetR family transcriptional regulator  26.42 
 
 		 191 aa  61.6  0.000000007  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00385081  n/a   
 
 
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NC_008699  Noca_1827  regulatory protein, TetR  26.84 
 
 		 196 aa  61.6  0.000000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_012803  Mlut_20320  transcriptional regulator, TetR family  25 
 
 		 203 aa  61.6  0.000000008  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007958  RPD_0043  regulatory protein, TetR  30.43 
 
 		 211 aa  61.6  0.000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_010338  Caul_1053  TetR family transcriptional regulator  29.33 
 
 		 200 aa  60.8  0.00000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.853566  normal  1 
 
 
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NC_010184  BcerKBAB4_2285  TetR family transcriptional regulator  29.73 
 
 		 211 aa  60.8  0.00000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0118465  n/a   
 
 
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