More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_17960 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_17960  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 208 aa  426  1e-118  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.134645  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3594  TetR family transcriptional regulator  58.38 
 
 		 210 aa  221  7e-57  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1011  TetR family transcriptional regulator  29.76 
 
 		 770 aa  79  0.00000000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2723  transcriptional regulator, TetR family  28.65 
 
 		 224 aa  77.8  0.0000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0252111  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13590  TetR family transcriptional regulator  30.81 
 
 		 200 aa  76.6  0.0000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.332381  normal  0.0844747 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4128  TetR family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 241 aa  74.3  0.000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.860792 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4691  TetR family transcriptional regulator  28.95 
 
 		 205 aa  72.8  0.000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.771858  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4777  TetR family transcriptional regulator  28.95 
 
 		 205 aa  72.8  0.000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.681727  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5076  TetR family transcriptional regulator  28.65 
 
 		 215 aa  72.4  0.000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.175697 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1827  regulatory protein, TetR  30.81 
 
 		 196 aa  72  0.000000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2765  regulatory protein, TetR  31.11 
 
 		 210 aa  72  0.000000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.267077  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2799  TetR family transcriptional regulator  25.98 
 
 		 217 aa  70.9  0.00000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.364827  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1858  TetR family transcriptional regulator  27.22 
 
 		 234 aa  69.7  0.00000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.543066  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3352  transcriptional regulator, TetR family  31.76 
 
 		 183 aa  68.9  0.00000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0512596  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1483  TetR family transcriptional regulator  28.42 
 
 		 197 aa  68.9  0.00000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0809  regulatory protein, TetR  29.49 
 
 		 200 aa  68.9  0.00000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.732229  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4073  TetR family transcriptional regulator  28.14 
 
 		 223 aa  68.6  0.00000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16700  transcriptional regulator  32.56 
 
 		 211 aa  68.6  0.00000000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0832  transcriptional regulator, TetR family  29.38 
 
 		 211 aa  68.6  0.00000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.933061 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0684  TetR family transcriptional regulator  29.95 
 
 		 213 aa  68.6  0.00000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.974708 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5283  TetR family transcriptional regulator  27.08 
 
 		 208 aa  68.6  0.00000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.261053 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0452  regulatory protein TetR  28.5 
 
 		 221 aa  68.2  0.00000000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1369  transcriptional regulator, TetR family  29.94 
 
 		 197 aa  67.8  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.859804 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2997  transcriptional regulator, TetR family  27.45 
 
 		 213 aa  67.4  0.0000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33190  transcriptional regulator  30.57 
 
 		 202 aa  66.6  0.0000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.284512  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3833  transcriptional regulator, TetR family  27.23 
 
 		 204 aa  66.2  0.0000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4824  TetR family transcriptional regulator  27.49 
 
 		 228 aa  66.2  0.0000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10159  TetR family transcriptional regulator  27.01 
 
 		 214 aa  66.2  0.0000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1867  transcriptional regulator, TetR family  29.65 
 
 		 201 aa  66.6  0.0000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.129849  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1436  TetR family transcriptional regulator  32.54 
 
 		 197 aa  66.2  0.0000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0817  TetR family transcriptional regulator  27.01 
 
 		 210 aa  66.2  0.0000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.577348  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2055  TetR family transcriptional regulator  29.38 
 
 		 206 aa  65.5  0.0000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3991  regulatory protein TetR  30.39 
 
 		 197 aa  65.5  0.0000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2696  TetR family transcriptional regulator  29.8 
 
 		 196 aa  65.5  0.0000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.834085 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3049  transcriptional regulator, TetR family  27.44 
 
 		 214 aa  65.5  0.0000000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4061  TetR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 240 aa  65.1  0.0000000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0033  TetR family transcriptional regulator  26.06 
 
 		 256 aa  64.7  0.000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0402  TetR family transcriptional regulator  28.81 
 
 		 196 aa  64.3  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.498778  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2800  TetR family transcriptional regulator  30.62 
 
 		 224 aa  64.3  0.000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.697977  decreased coverage  0.000162176 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2495  transcriptional regulator, TetR family  29.83 
 
 		 287 aa  63.9  0.000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0937177  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4009  transcriptional regulator, TetR family  26.47 
 
 		 217 aa  63.9  0.000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3548  TetR family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 216 aa  63.5  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2055  putative transcriptional regulator, TetR family  28.72 
 
 		 229 aa  62.8  0.000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0410393  normal  0.8778 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16730  transcriptional regulator, TetR family  28.92 
 
 		 213 aa  62.4  0.000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5488  TetR family transcriptional regulator  27.14 
 
 		 238 aa  62.4  0.000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2438  transcriptional regulator, TetR family  24.44 
 
 		 208 aa  62  0.000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4897  TetR family transcriptional regulator  28.14 
 
 		 231 aa  62  0.000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.043246  normal  0.757086 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3449  TetR family transcriptional regulator  28.04 
 
 		 209 aa  61.6  0.000000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.772262  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0370  TetR family transcriptional regulator  28.19 
 
 		 223 aa  61.6  0.000000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0234884  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1887  TetR family transcriptional regulator  29.08 
 
 		 202 aa  61.2  0.00000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.943502 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3836  TetR family transcriptional regulator  27.46 
 
 		 246 aa  60.8  0.00000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.487675  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2233  transcriptional regulator, TetR family  23.94 
 
 		 246 aa  60.5  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0329344  normal  0.539811 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5527  transcriptional regulator, TetR family  26.73 
 
 		 210 aa  60.1  0.00000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.107312  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7768  putative transcriptional regulator, TetR family  28.87 
 
 		 194 aa  60.8  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2601  regulatory protein, TetR  30.69 
 
 		 224 aa  59.7  0.00000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.354794  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5475  putative transcriptional regulator, TetR family  27 
 
 		 232 aa  59.7  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0120226 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2235  transcriptional regulator, TetR family  27.87 
 
 		 235 aa  59.7  0.00000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.170733  normal  0.3149 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4378  transcriptional regulator, TetR family  33.67 
 
 		 200 aa  59.7  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.136582 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1844  transcriptional regulator, TetR family  24.04 
 
 		 214 aa  58.9  0.00000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0293  TetR family transcriptional regulator  26.77 
 
 		 226 aa  58.5  0.00000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0719  TetR family transcriptional regulator  26.9 
 
 		 408 aa  58.2  0.00000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0260522 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0760  TetR family transcriptional regulator  26.49 
 
 		 192 aa  58.2  0.00000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0913287  normal  0.16222 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2348  transcriptional regulator, TetR family  30.22 
 
 		 222 aa  58.2  0.00000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0187157  normal  0.0306872 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3604  TetR family transcriptional regulator  26.49 
 
 		 207 aa  58.2  0.0000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.461648 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0835  TetR family transcriptional regulator  28.41 
 
 		 201 aa  57.4  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.861936  normal  0.897725 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1571  TetR family transcriptional regulator  26.15 
 
 		 201 aa  57.8  0.0000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.038411 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6181  transcriptional regulator, TetR family  27.59 
 
 		 202 aa  57.8  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.685616  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3195  transcriptional regulator, TetR family  29.41 
 
 		 200 aa  57  0.0000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0252  TetR family transcriptional regulator  26.47 
 
 		 201 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00323074 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0098  TetR family transcriptional regulator  25.94 
 
 		 219 aa  56.2  0.0000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.31231  normal  0.349087 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0108  TetR family transcriptional regulator  25.94 
 
 		 219 aa  56.2  0.0000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.244027  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26760  putative transcriptional regulator  26.7 
 
 		 198 aa  56.6  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0117  TetR family transcriptional regulator  25.94 
 
 		 219 aa  56.2  0.0000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0523426 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2200  transcriptional regulator, TetR family  26.74 
 
 		 203 aa  56.6  0.0000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3423  TetR family transcriptional regulator  26.8 
 
 		 201 aa  56.2  0.0000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2755  TetR family transcriptional regulator  27.32 
 
 		 200 aa  55.8  0.0000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0306  TetR family transcriptional regulator  24.72 
 
 		 219 aa  55.8  0.0000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0641939  normal  0.172302 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0243  TetR family transcriptional regulator  26.8 
 
 		 201 aa  55.5  0.0000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0231  transcriptional regulator, TetR family  29.19 
 
 		 200 aa  55.5  0.0000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.336394 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1240  transcriptional regulator, TetR family  26.56 
 
 		 211 aa  55.5  0.0000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.567777  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1145  TetR family transcriptional regulator  26.26 
 
 		 224 aa  55.1  0.0000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.770966  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4802  TetR family transcriptional regulator  25.97 
 
 		 199 aa  55.1  0.0000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.386552  normal  0.120275 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20320  transcriptional regulator, TetR family  29.03 
 
 		 203 aa  55.1  0.0000008  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1909  transcriptional regulator, TetR family  27.86 
 
 		 209 aa  55.1  0.0000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0574085  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2995  TetR family transcriptional regulator  24.63 
 
 		 211 aa  55.1  0.0000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.428403  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2924  TetR family transcriptional regulator  26.26 
 
 		 224 aa  55.1  0.0000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.288766  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3368  transcriptional regulator, TetR family  29.21 
 
 		 229 aa  54.7  0.0000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.823068  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1401  TetR family transcriptional regulator  28.07 
 
 		 222 aa  54.7  0.0000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.513329  normal  0.505278 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0226  TetR family transcriptional regulator  26.53 
 
 		 201 aa  54.3  0.000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.312291  hitchhiker  0.00018932 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0913  TetR family transcriptional regulator  26.29 
 
 		 195 aa  54.7  0.000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.269174  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3212  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 		 211 aa  54.7  0.000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3944  TetR family transcriptional regulator  27.81 
 
 		 215 aa  54.3  0.000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2628  transcriptional regulator, TetR family  22.41 
 
 		 194 aa  54.7  0.000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00732346  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0153  TetR family transcriptional regulator  26.47 
 
 		 210 aa  54.3  0.000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4014  transcriptional regulator, TetR family  29.09 
 
 		 225 aa  54.3  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2269  putative transcriptional regulator  26.34 
 
 		 207 aa  54.3  0.000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.629172  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4066  transcriptional regulator, TetR family  26.88 
 
 		 211 aa  54.3  0.000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3149  TetR family transcriptional regulator  23.15 
 
 		 233 aa  53.5  0.000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2782  TetR family transcriptional regulator  26.29 
 
 		 201 aa  53.9  0.000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.522237  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0719  TetR family transcriptional regulator  25.74 
 
 		 209 aa  53.9  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>