More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_16700 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_16700  transcriptional regulator  100 
 
 		 211 aa  423  1e-117  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3999  transcriptional regulator, TetR family  51.55 
 
 		 207 aa  168  7e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3862  regulatory protein, TetR  49.21 
 
 		 202 aa  166  2.9999999999999998e-40  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.07928  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1827  regulatory protein, TetR  48.35 
 
 		 196 aa  161  7e-39  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1833  regulatory protein, TetR  43.98 
 
 		 236 aa  155  5.0000000000000005e-37  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4009  transcriptional regulator, TetR family  40.93 
 
 		 217 aa  147  2.0000000000000003e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1851  transcriptional regulator, TetR family  46.15 
 
 		 201 aa  143  2e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.144681  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0836  transcriptional regulator, TetR family  43.52 
 
 		 203 aa  137  1e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.177404  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0817  TetR family transcriptional regulator  41.08 
 
 		 210 aa  135  5e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.577348  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3566  regulatory protein TetR  37.78 
 
 		 205 aa  123  2e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5475  putative transcriptional regulator, TetR family  32.64 
 
 		 232 aa  100  2e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0120226 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33190  transcriptional regulator  32.65 
 
 		 202 aa  97.8  1e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.284512  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1887  TetR family transcriptional regulator  33.51 
 
 		 202 aa  94.7  8e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.943502 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1958  TetR family transcriptional regulator  31.28 
 
 		 251 aa  90.9  1e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.455038  normal  0.501183 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1858  TetR family transcriptional regulator  30.06 
 
 		 234 aa  85.5  5e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.543066  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0772  transcriptional regulator, TetR family  30.96 
 
 		 223 aa  83.2  0.000000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2235  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 235 aa  81.3  0.00000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.170733  normal  0.3149 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2055  TetR family transcriptional regulator  28.99 
 
 		 206 aa  80.9  0.00000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4520  regulatory protein TetR  32.65 
 
 		 228 aa  80.5  0.00000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2869  TetR family transcriptional regulator  24.48 
 
 		 285 aa  79  0.00000000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4046  TetR family transcriptional regulator  29.48 
 
 		 212 aa  77.8  0.0000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0961065 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2996  TetR family transcriptional regulator  28.9 
 
 		 193 aa  76.3  0.0000000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.542374  normal  0.411304 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0806  transcriptional regulator, TetR family  29.26 
 
 		 202 aa  75.9  0.0000000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.265645  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0402  TetR family transcriptional regulator  27.81 
 
 		 196 aa  75.5  0.0000000000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.498778  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2162  TetR family transcriptional regulator  32.97 
 
 		 209 aa  74.3  0.000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0662359 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4824  TetR family transcriptional regulator  28.12 
 
 		 228 aa  73.6  0.000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2065  transcriptional regulator, TetR family  32.35 
 
 		 188 aa  73.2  0.000000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.704626  normal  0.605366 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0347  TetR family transcriptional regulator  30.96 
 
 		 200 aa  70.9  0.00000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0154637  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0295  transcriptional regulator, TetR family  26.63 
 
 		 220 aa  70.5  0.00000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0107513  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0452  regulatory protein TetR  27.5 
 
 		 221 aa  70.5  0.00000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4938  transcriptional regulator, TetR family  29.51 
 
 		 223 aa  69.3  0.00000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.262917  normal  0.206147 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0835  TetR family transcriptional regulator  29.51 
 
 		 201 aa  68.6  0.00000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.861936  normal  0.897725 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17960  transcriptional regulator, TetR family  32.56 
 
 		 208 aa  68.6  0.00000000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.134645  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2233  transcriptional regulator, TetR family  28.9 
 
 		 246 aa  68.6  0.00000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0329344  normal  0.539811 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4074  TetR family transcriptional regulator  30.53 
 
 		 194 aa  67.8  0.0000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.137574 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2785  TetR family transcriptional regulator  23.42 
 
 		 196 aa  66.6  0.0000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.256269 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2310  TetR family transcriptional regulator  27.38 
 
 		 220 aa  67  0.0000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.987325  decreased coverage  0.00710043 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2495  transcriptional regulator, TetR family  40.45 
 
 		 287 aa  66.2  0.0000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0937177  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1571  TetR family transcriptional regulator  29.69 
 
 		 201 aa  66.2  0.0000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.038411 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0809  regulatory protein, TetR  26.29 
 
 		 200 aa  66.2  0.0000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.732229  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2063  transcriptional regulator, TetR family  25.56 
 
 		 208 aa  65.1  0.0000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3721  transcriptional regulator, TetR family  25.73 
 
 		 260 aa  65.1  0.0000000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.249433  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10159  TetR family transcriptional regulator  26.24 
 
 		 214 aa  64.3  0.000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2055  putative transcriptional regulator, TetR family  28.8 
 
 		 229 aa  63.5  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0410393  normal  0.8778 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2271  transcriptional regulator  25.15 
 
 		 209 aa  62  0.000000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.850012 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5045  TetR family transcriptional regulator  33.6 
 
 		 197 aa  60.8  0.00000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.820553  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4073  TetR family transcriptional regulator  25.82 
 
 		 223 aa  60.8  0.00000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5264  transcriptional regulator, TetR family  40.51 
 
 		 470 aa  60.8  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.641699  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3594  TetR family transcriptional regulator  30.68 
 
 		 210 aa  60.1  0.00000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5488  TetR family transcriptional regulator  27.06 
 
 		 238 aa  60.5  0.00000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2800  TetR family transcriptional regulator  33.81 
 
 		 224 aa  60.5  0.00000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.697977  decreased coverage  0.000162176 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2723  transcriptional regulator, TetR family  25.26 
 
 		 224 aa  60.1  0.00000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0252111  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0184  TetR family transcriptional regulator  23.71 
 
 		 335 aa  59.7  0.00000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000505732  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4533  transcriptional regulator, TetR family  25.88 
 
 		 197 aa  59.7  0.00000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0585795  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4604  transcriptional regulator, TetR family  31.06 
 
 		 255 aa  59.7  0.00000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0098  TetR family transcriptional regulator  22.17 
 
 		 219 aa  60.1  0.00000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.31231  normal  0.349087 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0108  TetR family transcriptional regulator  22.17 
 
 		 219 aa  60.1  0.00000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.244027  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1867  transcriptional regulator, TetR family  28.02 
 
 		 201 aa  59.7  0.00000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.129849  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0117  TetR family transcriptional regulator  22.17 
 
 		 219 aa  60.1  0.00000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0523426 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4897  TetR family transcriptional regulator  26.46 
 
 		 231 aa  59.3  0.00000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.043246  normal  0.757086 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4079  TetR family transcriptional regulator  23.98 
 
 		 244 aa  59.3  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.780842  normal  0.246764 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0117  TetR family transcriptional regulator  30.23 
 
 		 208 aa  59.7  0.00000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.966538  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3352  transcriptional regulator, TetR family  29.44 
 
 		 183 aa  59.3  0.00000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0512596  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3833  transcriptional regulator, TetR family  28.64 
 
 		 204 aa  59.3  0.00000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2750  TetR family transcriptional regulator  31.88 
 
 		 205 aa  58.9  0.00000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.172363  normal  0.153941 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0719  TetR family transcriptional regulator  22.56 
 
 		 209 aa  58.5  0.00000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4369  TetR family transcriptional regulator  24.5 
 
 		 204 aa  58.2  0.00000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.645452 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1848  TetR family transcriptional regulator  27.62 
 
 		 210 aa  57.4  0.0000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0726  transcriptional regulator, TetR family  28.28 
 
 		 203 aa  57.8  0.0000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2103  TetR family transcriptional regulator  26.99 
 
 		 239 aa  57.8  0.0000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3319  transcriptional regulator, TetR family  27.27 
 
 		 205 aa  56.6  0.0000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1369  transcriptional regulator, TetR family  28.74 
 
 		 197 aa  57.4  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.859804 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26580  transcriptional regulator, TetR family  31.21 
 
 		 205 aa  57.4  0.0000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0994293 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0126  TetR family transcriptional regulator  22.99 
 
 		 224 aa  57.4  0.0000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5283  TetR family transcriptional regulator  26.55 
 
 		 208 aa  57  0.0000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.261053 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0433  TetR family transcriptional regulator  27.62 
 
 		 204 aa  57.4  0.0000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.376909  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3207  putative transcription regulator protein  27.27 
 
 		 204 aa  56.6  0.0000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00713158  normal  0.0476395 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2601  regulatory protein, TetR  32.84 
 
 		 224 aa  56.6  0.0000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.354794  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4171  TetR family transcriptional regulator  28.22 
 
 		 203 aa  56.2  0.0000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0201849  hitchhiker  0.000462956 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1483  TetR family transcriptional regulator  27.59 
 
 		 197 aa  55.8  0.0000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3512  regulatory protein TetR  38.64 
 
 		 237 aa  55.8  0.0000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2441  TetR family transcriptional regulator  26.73 
 
 		 217 aa  55.8  0.0000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.429129  normal  0.59735 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3815  regulatory protein, TetR  25.73 
 
 		 252 aa  55.8  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00651597  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2116  transcriptional regulator, TetR family  39.33 
 
 		 192 aa  55.8  0.0000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13181  TetR family transcriptional regulator  30.16 
 
 		 213 aa  55.8  0.0000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000106336  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0503  TetR family transcriptional regulator  39.68 
 
 		 376 aa  55.8  0.0000005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0719  TetR family transcriptional regulator  26.83 
 
 		 408 aa  55.5  0.0000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0260522 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2628  transcriptional regulator, TetR family  24.18 
 
 		 194 aa  55.8  0.0000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00732346  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1647  TetR family transcriptional regulator  26.52 
 
 		 215 aa  55.1  0.0000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0059  transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 194 aa  55.1  0.0000007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00007304  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1436  TetR family transcriptional regulator  28.35 
 
 		 197 aa  55.1  0.0000007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0140  TetR family transcriptional regulator  34.17 
 
 		 182 aa  55.5  0.0000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7113  TetR family transcriptional regulator  22.34 
 
 		 240 aa  55.1  0.0000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6295  transcriptional regulator, TetR family  23.66 
 
 		 212 aa  55.1  0.0000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.100221  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4061  TetR family transcriptional regulator  26.42 
 
 		 240 aa  55.1  0.0000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4128  TetR family transcriptional regulator  25.93 
 
 		 241 aa  55.1  0.0000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.860792 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0153  TetR family transcriptional regulator  27.07 
 
 		 210 aa  55.1  0.0000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2747  TetR family transcriptional regulator  24.02 
 
 		 233 aa  54.7  0.0000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.02505  normal  0.237475 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4377  transcriptional regulator, TetR family  32.62 
 
 		 205 aa  54.7  0.0000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.314155  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2155  TetR family transcriptional regulator  34.55 
 
 		 195 aa  55.1  0.0000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>