More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_13181 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009565  TBFG_13181  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 213 aa  418  1e-116  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000106336  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3892  regulatory protein TetR  36.24 
 
 		 214 aa  72  0.000000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3694  TetR family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 222 aa  65.1  0.0000000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1283  transcriptional regulator, TetR family  33.94 
 
 		 212 aa  61.6  0.000000008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0196213  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1842  TetR family transcriptional regulator  33.96 
 
 		 226 aa  61.2  0.00000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1889  TetR family transcriptional regulator  33.96 
 
 		 226 aa  61.2  0.00000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1823  TetR family transcriptional regulator  33.96 
 
 		 226 aa  61.2  0.00000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1590  transcriptional regulator, TetR family  34.16 
 
 		 231 aa  60.5  0.00000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.299217  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7768  putative transcriptional regulator, TetR family  32.65 
 
 		 194 aa  60.1  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4599  TetR family transcriptional regulator  53.45 
 
 		 220 aa  59.3  0.00000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4073  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 223 aa  58.5  0.00000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05370  transcriptional regulator, TetR family  32.58 
 
 		 205 aa  58.2  0.0000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000643211  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2799  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 217 aa  57  0.0000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.364827  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4066  transcriptional regulator, TetR family  27.06 
 
 		 211 aa  56.2  0.0000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5720  TetR family transcriptional regulator  55.77 
 
 		 291 aa  56.6  0.0000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.649137  normal  0.760569 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2545  TetR family transcriptional regulator  27.85 
 
 		 217 aa  56.2  0.0000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0577985  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2282  TetR family transcriptional regulator  28.48 
 
 		 217 aa  55.5  0.0000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0599  TetR family transcriptional regulator  50.94 
 
 		 200 aa  55.8  0.0000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.000153581  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0104  transcriptional regulator, TetR family  32.39 
 
 		 198 aa  55.8  0.0000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16700  transcriptional regulator  30.16 
 
 		 211 aa  55.8  0.0000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1538  TetR family transcriptional regulator  49.12 
 
 		 394 aa  55.5  0.0000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.112139  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3665  TetR family transcriptional regulator  48.28 
 
 		 228 aa  55.5  0.0000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1561  TetR family transcriptional regulator  49.12 
 
 		 394 aa  55.5  0.0000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.447454  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1987  TetR family transcriptional regulator  43.28 
 
 		 210 aa  55.5  0.0000006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1509  TetR family transcriptional regulator  49.12 
 
 		 394 aa  55.5  0.0000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.27867  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0295  transcriptional regulator, TetR family  25.47 
 
 		 220 aa  55.5  0.0000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0107513  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2557  transcriptional regulator, TetR family  28.48 
 
 		 217 aa  55.1  0.0000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.15322e-23 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4004  TetR family transcriptional regulator  37.62 
 
 		 196 aa  54.7  0.0000009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.638592  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3938  transcriptional regulator, TetR family  29.71 
 
 		 231 aa  54.7  0.000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.00284915  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1759  transcriptional regulator, TetR family  42.86 
 
 		 217 aa  54.3  0.000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28300  transcriptional regulator  33.56 
 
 		 280 aa  54.7  0.000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2600  transcriptional regulator, TetR family  28.48 
 
 		 217 aa  54.7  0.000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4104  TetR family transcriptional regulator  40.79 
 
 		 438 aa  54.7  0.000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2437  transcriptional regulator, TetR family  43.55 
 
 		 216 aa  53.5  0.000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000237388  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2324  TetR family transcriptional regulator  27.85 
 
 		 217 aa  53.5  0.000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000190708  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2248  TetR family transcriptional regulator  55.1 
 
 		 222 aa  53.9  0.000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0660336  normal  0.0152181 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2353  TetR family transcriptional regulator  28.03 
 
 		 217 aa  53.5  0.000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.384863  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3827  transcriptional regulator, TetR family  33.67 
 
 		 190 aa  53.5  0.000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2815  transcriptional regulator, TetR family  27.22 
 
 		 217 aa  53.5  0.000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000266483 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0740  TetR family transcriptional regulator  25.62 
 
 		 205 aa  53.9  0.000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.891023  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0835  TetR family transcriptional regulator  32.21 
 
 		 201 aa  53.1  0.000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.861936  normal  0.897725 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1864  TetR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 204 aa  53.1  0.000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.370614  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4378  transcriptional regulator, TetR family  35.16 
 
 		 200 aa  53.1  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.136582 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1640  TetR family transcriptional regulator  45 
 
 		 393 aa  52.8  0.000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.234723  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0906  transcriptional regulator, TetR family  32.38 
 
 		 232 aa  52.8  0.000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.052988  normal  0.0196 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1096  transcriptional regulator, TetR family  42.86 
 
 		 192 aa  53.5  0.000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2366  TetR family transcriptional regulator  27.85 
 
 		 217 aa  52.8  0.000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.711286  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2543  TetR family transcriptional regulator  27.85 
 
 		 217 aa  52.8  0.000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1591  TetR family transcriptional regulator  28.66 
 
 		 215 aa  52.8  0.000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.194821 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3148  transcriptional regulator, TetR family  31.91 
 
 		 310 aa  52.8  0.000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3260  putative transcriptional regulator, TetR family  55.32 
 
 		 309 aa  52.8  0.000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.235559  hitchhiker  0.000147183 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3730  transcriptional regulator, TetR family  44.44 
 
 		 237 aa  52.4  0.000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0868  transcriptional regulator, TetR family  42.59 
 
 		 222 aa  52.4  0.000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000000486929  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26580  transcriptional regulator, TetR family  28.24 
 
 		 205 aa  52.4  0.000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0994293 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5076  TetR family transcriptional regulator  28.74 
 
 		 209 aa  52  0.000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5784  TetR family transcriptional regulator  28.74 
 
 		 209 aa  52  0.000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.907377 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1344  TetR family transcriptional regulator  26.19 
 
 		 208 aa  52  0.000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000662672 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0772  transcriptional regulator, TetR family  43.55 
 
 		 223 aa  52  0.000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1353  regulatory protein TetR  46.67 
 
 		 210 aa  52  0.000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.273808  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4394  TetR family transcriptional regulator  27.98 
 
 		 198 aa  52  0.000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0855  transcriptional regulator, TetR family  49.02 
 
 		 223 aa  52  0.000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.835032 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2271  transcriptional regulator  31.08 
 
 		 209 aa  52  0.000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.850012 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2995  TetR family transcriptional regulator  26.9 
 
 		 211 aa  51.6  0.000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.428403  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2358  transcriptional regulator, TetR family  30.99 
 
 		 216 aa  51.6  0.000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0281012 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1710  transcriptional regulator, TetR family  25 
 
 		 200 aa  51.6  0.000009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000037358  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2155  TetR family transcriptional regulator  54.17 
 
 		 195 aa  51.6  0.000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2816  hypothetical protein  54.9 
 
 		 222 aa  51.6  0.00001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0366008  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2190  TetR family transcriptional regulator  40.26 
 
 		 277 aa  50.8  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.168858  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13590  TetR family transcriptional regulator  26.75 
 
 		 200 aa  51.2  0.00001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.332381  normal  0.0844747 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1493  TetR family transcriptional regulator  39.06 
 
 		 200 aa  50.8  0.00001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3004  transcriptional regulator, TetR family  46.43 
 
 		 186 aa  51.2  0.00001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.519568  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0140  TetR family transcriptional regulator  46.94 
 
 		 182 aa  50.8  0.00001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4505  regulatory protein TetR  46.3 
 
 		 390 aa  51.2  0.00001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.215764  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0012  putative AcrAB operon repressor transcription regulator protein  47.54 
 
 		 219 aa  50.8  0.00002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.631075  normal  0.0464367 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2750  TetR family transcriptional regulator  28.16 
 
 		 205 aa  50.4  0.00002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.172363  normal  0.153941 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0340  transcriptional regulator, TetR family  50 
 
 		 388 aa  50.4  0.00002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1344  transcriptional regulator, TetR family  29.09 
 
 		 205 aa  50.1  0.00002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.592645 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3772  TetR family transcriptional regulator  25.93 
 
 		 201 aa  50.1  0.00002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.392718  normal  0.705056 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16730  transcriptional regulator, TetR family  29.22 
 
 		 213 aa  50.4  0.00002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1887  TetR family transcriptional regulator  32 
 
 		 202 aa  50.8  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.943502 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6560  transcriptional regulator, TetR family  40.62 
 
 		 203 aa  50.4  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2148  TetR family transcriptional regulator  37.35 
 
 		 228 aa  50.8  0.00002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.726576 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28480  transcriptional regulator  40.98 
 
 		 326 aa  50.1  0.00002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.552525 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1384  TetR family transcriptional regulator  45.83 
 
 		 225 aa  50.4  0.00002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00670258  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4794  transcriptional regulator, TetR family  45.28 
 
 		 187 aa  50.8  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0765  TetR family transcriptional regulator  42.31 
 
 		 228 aa  50.1  0.00002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0266  TetR family transcriptional regulator  45.1 
 
 		 207 aa  50.8  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.437766  hitchhiker  0.000931508 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4588  transcriptional regulator, TetR family  30.08 
 
 		 206 aa  50.4  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.112472 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1903  transcriptional regulator, TetR family  35.37 
 
 		 192 aa  50.4  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0461172  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2508  transcriptional regulator, TetR family  26.95 
 
 		 217 aa  50.4  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5351  TetR family transcriptional regulator  26.92 
 
 		 195 aa  50.1  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0124857 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2696  TetR family transcriptional regulator  32.95 
 
 		 196 aa  50.4  0.00002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.834085 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4681  TetR family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 283 aa  49.7  0.00003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.433841  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5475  putative transcriptional regulator, TetR family  45.61 
 
 		 232 aa  50.1  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0120226 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3184  TetR family transcriptional regulator  25.84 
 
 		 186 aa  49.7  0.00003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0269  TetR family transcriptional regulator  45.1 
 
 		 207 aa  50.1  0.00003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.60794  normal  0.358976 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2162  TetR family transcriptional regulator  29.8 
 
 		 209 aa  49.7  0.00003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0662359 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4464  TetR family transcriptional regulator  38.96 
 
 		 278 aa  49.7  0.00003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0186  TetR family transcriptional regulator  47.17 
 
 		 410 aa  50.1  0.00003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.291821  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3625  TetR family transcriptional regulator  38.96 
 
 		 278 aa  49.7  0.00003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.662049  normal  0.863638 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>