More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_4604 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013510  Tcur_4604  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 255 aa  505  9.999999999999999e-143  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26800  transcriptional regulator  38.32 
 
 		 184 aa  110  2.0000000000000002e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.463482  normal  0.288316 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0068  transcriptional regulator, TetR family  36.09 
 
 		 185 aa  92  9e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.139926 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0309  transcriptional regulator, TetR family  35.53 
 
 		 213 aa  90.9  2e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.302465  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3944  putative transcriptional regulator, TetR family  34.3 
 
 		 183 aa  85.5  7e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.000137534  hitchhiker  0.00939559 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0140  TetR family transcriptional regulator  34.59 
 
 		 176 aa  84.7  0.000000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8152  putative transcriptional regulator, TetR family  31.14 
 
 		 174 aa  84  0.000000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.687421 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5720  TetR family transcriptional regulator  34.18 
 
 		 291 aa  83.2  0.000000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.649137  normal  0.760569 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4091  TetR family transcriptional regulator  34 
 
 		 222 aa  81.3  0.00000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0267897 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1613  TetR family transcriptional regulator  31.38 
 
 		 189 aa  80.9  0.00000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.066311 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0817  TetR family transcriptional regulator  30.38 
 
 		 332 aa  79.3  0.00000000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5186  transcriptional regulator, TetR family  35.29 
 
 		 185 aa  79.3  0.00000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.225373  normal  0.188797 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3710  regulatory protein, TetR  37.24 
 
 		 230 aa  79  0.00000000000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2104  TetR family transcriptional regulator  31.4 
 
 		 191 aa  76.3  0.0000000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.230608 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6560  transcriptional regulator, TetR family  48.05 
 
 		 203 aa  74.7  0.000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1976  putative transcriptional regulator, TetR family  31.15 
 
 		 181 aa  74.7  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3798  TetR family transcriptional regulator  29.44 
 
 		 191 aa  72  0.000000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.164802  normal  0.867379 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3794  TetR family transcriptional regulator  29.67 
 
 		 191 aa  71.6  0.00000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.549336  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3867  TetR family transcriptional regulator  29.67 
 
 		 191 aa  71.6  0.00000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0211824  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10920  transcriptional regulator  32.65 
 
 		 201 aa  70.9  0.00000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0917166  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0589  TetR family transcriptional regulator  30.11 
 
 		 191 aa  69.7  0.00000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3004  transcriptional regulator, TetR family  36.28 
 
 		 186 aa  68.6  0.00000000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.519568  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1681  TetR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 217 aa  66.6  0.0000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.371055  normal  0.828695 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1044  TetR family transcriptional regulator  29.12 
 
 		 180 aa  65.5  0.0000000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0206033 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2109  TetR family transcriptional regulator  34.01 
 
 		 206 aa  65.5  0.0000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.901149 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4094  TetR family transcriptional regulator  60.78 
 
 		 204 aa  65.5  0.0000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0325183  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2116  transcriptional regulator, TetR family  47.06 
 
 		 192 aa  64.7  0.000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23110  transcriptional regulator  29.33 
 
 		 203 aa  63.9  0.000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0281  transcriptional regulator, TetR family  38.32 
 
 		 218 aa  63.9  0.000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.645912  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4115  transcriptional regulator, TetR family  29.19 
 
 		 194 aa  64.3  0.000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.1417 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1515  putative transcriptional regulator, TetR family  33.57 
 
 		 219 aa  63.9  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.254086  hitchhiker  0.00363064 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3960  TetR family transcriptional regulator  45.12 
 
 		 201 aa  62.8  0.000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.110455  normal  0.471806 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1866  TetR family transcriptional regulator  45.12 
 
 		 201 aa  62.4  0.000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.115406 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1473  TetR family transcriptional regulator  45.59 
 
 		 195 aa  61.6  0.00000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01891  transcription regulator protein  41.89 
 
 		 219 aa  61.2  0.00000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0139537  normal  0.638618 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2799  TetR family transcriptional regulator  35.65 
 
 		 217 aa  60.8  0.00000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.364827  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4218  TetR family transcriptional regulator  41.94 
 
 		 202 aa  60.5  0.00000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.135159  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4006  transcriptional regulator, TetR family  49.09 
 
 		 202 aa  60.5  0.00000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4249  TetR family transcriptional regulator  29.79 
 
 		 191 aa  59.7  0.00000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.399807  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2741  TetR family transcriptional regulator  41.35 
 
 		 215 aa  59.3  0.00000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0944  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  28.97 
 
 		 217 aa  59.3  0.00000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16700  transcriptional regulator  31.06 
 
 		 211 aa  59.3  0.00000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1606  TetR family transcriptional regulator  38.33 
 
 		 225 aa  58.9  0.00000007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.912424  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1775  transcriptional regulator, TetR family  29.06 
 
 		 207 aa  58.9  0.00000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0265  TetR family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 200 aa  58.9  0.00000007  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00630944 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0973  TetR family transcriptional regulator  29.38 
 
 		 198 aa  58.9  0.00000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5473  TetR family transcriptional regulator  39.78 
 
 		 201 aa  58.5  0.00000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.968436  normal  0.0284284 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0312  transcriptional regulator, TetR family  28.07 
 
 		 206 aa  58.2  0.0000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.00000000380117  normal  0.28635 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0104  TetR family transcriptional regulator  39.47 
 
 		 190 aa  58.2  0.0000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1281  TetR family transcriptional regulator  37 
 
 		 210 aa  58.5  0.0000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.781108  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3096  TetR family transcriptional regulator  43.1 
 
 		 202 aa  58.5  0.0000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0203472  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0824  TetR family transcriptional regulator  35.58 
 
 		 206 aa  58.5  0.0000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35350  transcriptional regulator, TetR family  52.83 
 
 		 223 aa  58.2  0.0000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.147408 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0620  TetR family transcriptional regulator  25.14 
 
 		 193 aa  58.2  0.0000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03670  transcriptional regulator  31.45 
 
 		 230 aa  58.2  0.0000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00912022  hitchhiker  0.0085588 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0633  TetR family transcriptional regulator  25.14 
 
 		 193 aa  58.2  0.0000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2226  TetR family transcriptional regulator  40.21 
 
 		 210 aa  58.5  0.0000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2904  TetR family transcriptional regulator  51.92 
 
 		 213 aa  58.2  0.0000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2974  transcriptional regulator, TetR family  50.75 
 
 		 199 aa  58.5  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2165  transcriptional regulator, TetR family  43.75 
 
 		 263 aa  58.5  0.0000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0611  TetR family transcriptional regulator  25.14 
 
 		 193 aa  58.2  0.0000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1061  transcriptional regulator, TetR family  45 
 
 		 196 aa  57.8  0.0000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0250707  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3316  transcriptional regulator, TetR family  39.24 
 
 		 249 aa  57.4  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.655704  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2816  hypothetical protein  37.65 
 
 		 222 aa  57.8  0.0000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0366008  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0175  TetR family transcriptional regulator  28.81 
 
 		 232 aa  57.8  0.0000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000233696  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1958  TetR family transcriptional regulator  34.91 
 
 		 251 aa  57.8  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.455038  normal  0.501183 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3046  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  27.36 
 
 		 216 aa  57.4  0.0000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.303422  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4327  regulatory protein, TetR  42.25 
 
 		 182 aa  57.4  0.0000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.809003  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0949  transcriptional regulator, TetR family  46.15 
 
 		 286 aa  57.4  0.0000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4251  transcriptional regulator, TetR family  40.91 
 
 		 216 aa  57.4  0.0000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.22701  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0167  transcriptional regulator, TetR family  38 
 
 		 200 aa  56.6  0.0000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1982  transcriptional regulator, TetR family  40.58 
 
 		 209 aa  56.6  0.0000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.142001  hitchhiker  0.0000322137 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3512  regulatory protein TetR  41.18 
 
 		 237 aa  57  0.0000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2190  TetR family transcriptional regulator  37.86 
 
 		 277 aa  57  0.0000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.168858  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6913  putative transcriptional regulator, TetR family  28.65 
 
 		 183 aa  57  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.128918  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0679  TetR family transcriptional regulator  36.17 
 
 		 211 aa  57  0.0000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0170  TetR family transcriptional regulator  38.14 
 
 		 233 aa  56.6  0.0000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000323068 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5293  TetR family transcriptional regulator  38.55 
 
 		 210 aa  57  0.0000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.199638  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3190  TetR family transcriptional regulator  40.23 
 
 		 202 aa  57  0.0000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  unclonable  0.0000000548437  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0571  TetR family transcriptional regulator  28.7 
 
 		 200 aa  57  0.0000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.530829  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2735  TetR family transcriptional regulator  40.38 
 
 		 201 aa  56.2  0.0000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5392  transcriptional regulator, TetR family protein  48.15 
 
 		 190 aa  56.6  0.0000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13530  transcriptional regulator, TetR family  29.41 
 
 		 186 aa  56.6  0.0000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00114254  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0502  TetR family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 221 aa  56.6  0.0000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1776  transcriptional regulator, TetR family  44.12 
 
 		 218 aa  56.2  0.0000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0293549  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1636  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 200 aa  56.2  0.0000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0170  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 192 aa  56.6  0.0000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.652591  normal  0.659974 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3833  transcriptional regulator, TetR family  35.8 
 
 		 212 aa  56.6  0.0000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1204  transcriptional regulator, TetR family  45.59 
 
 		 206 aa  56.6  0.0000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.260768  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0314  TetR family transcriptional regulator  36.17 
 
 		 211 aa  56.2  0.0000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1017  repressor protein  36.17 
 
 		 211 aa  56.2  0.0000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0337  transcriptional regulator, TetR family  43.64 
 
 		 204 aa  56.2  0.0000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2067  TetR family transcriptional regulator  39.39 
 
 		 216 aa  56.2  0.0000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0106  TetR family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 214 aa  56.2  0.0000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.156451  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0609  multidrug efflux pump repressor protein BpeR  36.17 
 
 		 211 aa  56.2  0.0000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.780096  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2443  multidrug efflux pump repressor protein BpeR  36.17 
 
 		 211 aa  56.2  0.0000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0852  multidrug efflux pump repressor protein BpeR  36.17 
 
 		 211 aa  56.2  0.0000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3500  transcriptional regulator, TetR family  51.92 
 
 		 209 aa  56.2  0.0000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00016281 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0857  multidrug efflux pump repressor protein BpeR  36.17 
 
 		 211 aa  56.2  0.0000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0057  multidrug efflux pump repressor protein BpeR  36.17 
 
 		 211 aa  56.2  0.0000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>