More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_0175 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009943  Dole_0175  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 232 aa  482  1e-135  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000233696  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1313  TetR family transcriptional regulator  34.74 
 
 		 231 aa  130  2.0000000000000002e-29  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3108  TetR family transcriptional regulator  32.88 
 
 		 234 aa  120  1.9999999999999998e-26  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0928  TetR family transcriptional regulator  31.55 
 
 		 461 aa  110  2.0000000000000002e-23  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.0000000384359  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1260  transcriptional regulator, TetR family  33.59 
 
 		 222 aa  59.7  0.00000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.194739 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4604  transcriptional regulator, TetR family  28.81 
 
 		 255 aa  57.8  0.0000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3958  transcriptional regulator, TetR family  28.7 
 
 		 242 aa  56.6  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5392  transcriptional regulator, TetR family protein  40 
 
 		 190 aa  56.2  0.0000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4003  transcriptional regulator, TetR family  28.7 
 
 		 242 aa  56.2  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0952  TetR family transcriptional regulator  33.64 
 
 		 210 aa  56.2  0.0000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0602788  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2510  TetR family transcriptional regulator  28.79 
 
 		 245 aa  55.8  0.0000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1758  transcriptional regulator of TetR family protein  33.33 
 
 		 220 aa  55.8  0.0000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.77056  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4071  TetR family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 235 aa  55.1  0.0000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.365856  normal  0.0686473 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2889  TetR family transcriptional regulator  35.21 
 
 		 216 aa  54.3  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00514184  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5667  TetR family transcriptional regulator  32.73 
 
 		 210 aa  54.7  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2364  TetR family transcriptional regulator  33.64 
 
 		 210 aa  53.9  0.000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9138  putative transcriptional regulator, TetR family  32.43 
 
 		 217 aa  53.1  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10145  TetR family transcriptional regulator  33.71 
 
 		 280 aa  53.5  0.000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0339  TetR family transcriptional regulator  36.27 
 
 		 205 aa  53.1  0.000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0413  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 227 aa  52.8  0.000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24490  transcriptional regulator  42.37 
 
 		 213 aa  53.1  0.000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0312  transcriptional regulator, TetR family  28.19 
 
 		 206 aa  53.1  0.000004  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.00000000380117  normal  0.28635 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3309  TetR family transcriptional regulator  33.64 
 
 		 210 aa  52.8  0.000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0176  transcriptional regulator, TetR family  26.52 
 
 		 263 aa  52.4  0.000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.99928  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1237  transcriptional regulator, TetR family  33.64 
 
 		 210 aa  52.4  0.000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.665439 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1713  TetR family transcriptional regulator  32.73 
 
 		 210 aa  52.4  0.000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.312899  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2325  TetR family transcriptional regulator  32.73 
 
 		 210 aa  52.4  0.000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2751  TetR family transcriptional regulator  31.46 
 
 		 232 aa  52.4  0.000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2776  TetR family transcriptional regulator  23.89 
 
 		 213 aa  52.4  0.000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.556184  normal  0.492186 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0104  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 190 aa  52.4  0.000007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2165  transcriptional regulator, TetR family  25.89 
 
 		 263 aa  51.6  0.000009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0103  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 190 aa  51.6  0.000009  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2181  transcriptional regulator, TetR family  31.19 
 
 		 189 aa  51.2  0.00001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000940073  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3173  TetR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 245 aa  51.2  0.00001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2095  TetR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 210 aa  50.4  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0799745 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1963  transcriptional regulator, TetR family  28.68 
 
 		 201 aa  50.4  0.00002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000168283 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3212  TetR family transcriptional regulator  27.03 
 
 		 223 aa  50.4  0.00002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.59703  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3085  TetR family transcriptional regulator  28.31 
 
 		 215 aa  50.8  0.00002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0170  TetR family transcriptional regulator  25.89 
 
 		 233 aa  50.4  0.00002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000323068 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1808  TetR family transcriptional regulator  22.58 
 
 		 233 aa  50.8  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5451  transcriptional regulator TetR family  28 
 
 		 241 aa  50.4  0.00002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2892  TetR family transcriptional regulator  29.21 
 
 		 227 aa  50.4  0.00002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0741527  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1164  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 184 aa  50.8  0.00002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00000872016  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2576  TetR family transcriptional regulator  26.55 
 
 		 233 aa  50.8  0.00002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2643  TetR family transcriptional regulator  26.55 
 
 		 233 aa  50.8  0.00002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1059  TetR family transcriptional regulator  21.76 
 
 		 212 aa  51.2  0.00002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.659814 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1419  TetR family transcriptional regulator  27.97 
 
 		 232 aa  50.4  0.00002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5697  TetR family transcriptional regulator  28.69 
 
 		 220 aa  50.1  0.00003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.197583  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02063  putative transcription regulator transcription regulator protein  26.51 
 
 		 224 aa  50.1  0.00003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0495626  normal  0.936254 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1548  TetR family transcriptional regulator  26.92 
 
 		 233 aa  50.1  0.00003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1521  TetR family transcriptional regulator  26.92 
 
 		 233 aa  50.1  0.00003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2834  transcriptional regulator, TetR family  26.92 
 
 		 233 aa  50.1  0.00003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.170846  normal  0.770206 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1512  TetR family transcriptional regulator  26.92 
 
 		 233 aa  50.1  0.00003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0851  TetR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 241 aa  50.1  0.00003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3949  TetR family transcriptional regulator  27.12 
 
 		 212 aa  49.7  0.00004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.549729 
 
 
-
 
NC_004310  BR0280  TetR family transcriptional regulator  26.98 
 
 		 227 aa  49.7  0.00004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.980178  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1745  TetR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 195 aa  49.7  0.00004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0399082  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3694  TetR family transcriptional regulator  26.36 
 
 		 222 aa  49.7  0.00004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0294  TetR family transcriptional regulator  26.98 
 
 		 227 aa  49.7  0.00004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.136884  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1742  transcriptional regulator, TetR family  27.83 
 
 		 235 aa  49.7  0.00004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.666045  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2064  TetR family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 211 aa  49.7  0.00004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5749  TetR family transcriptional regulator  30.53 
 
 		 225 aa  49.7  0.00004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.147109  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5516  TetR family transcriptional regulator  30.53 
 
 		 270 aa  49.7  0.00004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.165925  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1888  TetR family transcriptional regulator  27.12 
 
 		 212 aa  49.3  0.00005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1561  TetR family transcriptional regulator  32.61 
 
 		 214 aa  49.3  0.00005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1714  transcriptional regulator, TetR family  43.55 
 
 		 211 aa  49.3  0.00005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.058675  normal  0.0438262 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3584  TetR family transcriptional regulator  27.12 
 
 		 212 aa  49.3  0.00005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5928  transcriptional regulator, TetR family  26.52 
 
 		 215 aa  49.3  0.00005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.511087  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2497  TetR family transcriptional regulator  25.15 
 
 		 201 aa  49.3  0.00005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.55388 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6560  transcriptional regulator, TetR family  31.25 
 
 		 203 aa  49.3  0.00005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3312  transcriptional regulator UidR  40.32 
 
 		 198 aa  48.9  0.00006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1807  TetR family transcriptional regulator  30.34 
 
 		 218 aa  48.9  0.00007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.237257  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2285  TetR family transcriptional regulator  32.79 
 
 		 233 aa  48.9  0.00007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.522027  normal  0.380806 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05966  hypothetical protein  28.08 
 
 		 241 aa  48.9  0.00007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3709  TetR family transcriptional regulator  24.74 
 
 		 221 aa  48.9  0.00007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0975739  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1512  regulatory protein, TetR  35.71 
 
 		 246 aa  48.9  0.00007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2369  TetR family transcriptional regulator  27.83 
 
 		 202 aa  48.5  0.00008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1473  TetR family transcriptional regulator  22.67 
 
 		 195 aa  48.5  0.00008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10920  transcriptional regulator  28.32 
 
 		 201 aa  48.5  0.00009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0917166  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000229  transcriptional regulator  26.35 
 
 		 242 aa  48.5  0.00009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0175  TetR family transcriptional regulator  24.85 
 
 		 203 aa  48.1  0.0001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11567  transcriptional regulator  29.52 
 
 		 225 aa  48.1  0.0001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3988  regulatory protein, TetR  24.53 
 
 		 233 aa  48.5  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.100564  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2653  TetR family transcriptional regulator  28.04 
 
 		 186 aa  47.8  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0876  TetR family transcriptional regulator  28.78 
 
 		 226 aa  48.1  0.0001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.140831 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1684  TetR family transcriptional regulator  32.53 
 
 		 227 aa  47.8  0.0001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2624  TetR family transcriptional regulator  28.04 
 
 		 186 aa  47.8  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.184874  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7226  putative transcriptional regulator, TetR family  23.61 
 
 		 209 aa  48.1  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.373834 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4630  TetR family transcriptional regulator  26.95 
 
 		 206 aa  48.1  0.0001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.110827  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2668  TetR family transcriptional regulator  28.04 
 
 		 186 aa  47.8  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.323955  normal  0.884032 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0349  TetR family transcriptional regulator  26.32 
 
 		 232 aa  48.1  0.0001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4181  transcriptional regulator, TetR family  28.69 
 
 		 227 aa  48.1  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000221958 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0533  TetR family transcriptional regulator  27.05 
 
 		 208 aa  48.1  0.0001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0518509 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0744  TetR family transcriptional regulator  34.18 
 
 		 217 aa  47.4  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1788  TetR family transcriptional regulator  29.81 
 
 		 195 aa  47.4  0.0002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000202922  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2034  TetR family transcriptional regulator  31.33 
 
 		 216 aa  47  0.0002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.480509  normal  0.0875613 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3892  regulatory protein TetR  28.26 
 
 		 214 aa  47.4  0.0002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0444  TetR family transcriptional regulator  24.03 
 
 		 220 aa  47  0.0002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.275459  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2580  TetR family transcriptional regulator  30.7 
 
 		 211 aa  47.4  0.0002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.257801 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0077  TetR family transcriptional regulator  31.46 
 
 		 211 aa  47.4  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.397741 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>