More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_0068 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_0068  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 185 aa  366  1e-101  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.139926 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26800  transcriptional regulator  53.8 
 
 		 184 aa  162  2.0000000000000002e-39  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.463482  normal  0.288316 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8152  putative transcriptional regulator, TetR family  41.62 
 
 		 174 aa  132  3.9999999999999996e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.687421 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0309  transcriptional regulator, TetR family  46.85 
 
 		 213 aa  113  2.0000000000000002e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.302465  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3004  transcriptional regulator, TetR family  42.28 
 
 		 186 aa  94.7  7e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.519568  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4604  transcriptional regulator, TetR family  36.09 
 
 		 255 aa  92  5e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4091  TetR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 222 aa  87.4  1e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0267897 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5186  transcriptional regulator, TetR family  31.46 
 
 		 185 aa  83.2  0.000000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.225373  normal  0.188797 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5720  TetR family transcriptional regulator  37.58 
 
 		 291 aa  79.7  0.00000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.649137  normal  0.760569 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3710  regulatory protein, TetR  67.31 
 
 		 230 aa  79.7  0.00000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0140  TetR family transcriptional regulator  31.46 
 
 		 176 aa  78.6  0.00000000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2104  TetR family transcriptional regulator  34.34 
 
 		 191 aa  77.4  0.0000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.230608 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3944  putative transcriptional regulator, TetR family  33.55 
 
 		 183 aa  75.9  0.0000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.000137534  hitchhiker  0.00939559 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6560  transcriptional regulator, TetR family  36.42 
 
 		 203 aa  75.5  0.0000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1044  TetR family transcriptional regulator  32.57 
 
 		 180 aa  73.9  0.000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0206033 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0817  TetR family transcriptional regulator  53.45 
 
 		 332 aa  73.6  0.000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4094  TetR family transcriptional regulator  49.41 
 
 		 204 aa  68.2  0.00000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0325183  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6913  putative transcriptional regulator, TetR family  33.13 
 
 		 183 aa  67.4  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.128918  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0589  TetR family transcriptional regulator  34.72 
 
 		 191 aa  66.6  0.0000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10920  transcriptional regulator  33.33 
 
 		 201 aa  66.6  0.0000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0917166  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1118  transcriptional regulator, TetR family  42.11 
 
 		 201 aa  63.9  0.000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00548751  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1976  putative transcriptional regulator, TetR family  34.91 
 
 		 181 aa  63.5  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3756  TetR family transcriptional regulator  31.54 
 
 		 193 aa  62.8  0.000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2475  transcriptional regulator, TetR family  45.83 
 
 		 222 aa  62  0.000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.260568  hitchhiker  0.0024636 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0973  TetR family transcriptional regulator  32.68 
 
 		 198 aa  62  0.000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2007  TetR family transcriptional regulator  30.83 
 
 		 193 aa  61.6  0.000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.382346 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2194  TetR family transcriptional regulator  46.27 
 
 		 193 aa  61.2  0.000000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.789913  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1496  transcriptional regulator, TetR family  33.96 
 
 		 206 aa  61.2  0.000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5475  putative transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 232 aa  60.5  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0120226 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1668  TetR family transcriptional regulator  32.81 
 
 		 204 aa  60.8  0.00000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1636  TetR family transcriptional regulator  31.01 
 
 		 200 aa  60.1  0.00000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0750  transcriptional regulator, TetR family  36.23 
 
 		 236 aa  59.7  0.00000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0322855 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0170  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 192 aa  60.5  0.00000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.652591  normal  0.659974 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3299  transcriptional regulator, TetR family  42.25 
 
 		 307 aa  60.5  0.00000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2799  TetR family transcriptional regulator  36.04 
 
 		 217 aa  59.3  0.00000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.364827  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0620  TetR family transcriptional regulator  29.93 
 
 		 193 aa  59.3  0.00000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0633  TetR family transcriptional regulator  29.93 
 
 		 193 aa  59.3  0.00000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1613  TetR family transcriptional regulator  50.91 
 
 		 189 aa  59.3  0.00000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.066311 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0611  TetR family transcriptional regulator  29.93 
 
 		 193 aa  59.3  0.00000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2147  TetR family transcriptional regulator  49.06 
 
 		 193 aa  58.9  0.00000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.576982  hitchhiker  0.00198138 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4378  transcriptional regulator, TetR family  48.28 
 
 		 200 aa  58.9  0.00000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.136582 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2109  TetR family transcriptional regulator  46.67 
 
 		 206 aa  58.9  0.00000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.901149 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2636  transcriptional regulator, TetR family  41.79 
 
 		 198 aa  58.5  0.00000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0571  TetR family transcriptional regulator  30.23 
 
 		 200 aa  58.5  0.00000005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.530829  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3845  transcriptional regulator, TetR family  34.15 
 
 		 209 aa  58.2  0.00000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00359694  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3641  TetR family transcriptional regulator  26.72 
 
 		 200 aa  58.2  0.00000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.798229 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4897  TetR family transcriptional regulator  27.46 
 
 		 231 aa  57.8  0.00000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.043246  normal  0.757086 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2499  transcriptional regulator, TetR family  44.83 
 
 		 208 aa  57.8  0.0000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1731  transcriptional regulator, TetR family  34.23 
 
 		 196 aa  57.4  0.0000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0465827  normal  0.0150851 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1681  TetR family transcriptional regulator  40.32 
 
 		 217 aa  57  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.371055  normal  0.828695 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2055  putative transcriptional regulator, TetR family  33.64 
 
 		 229 aa  56.6  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0410393  normal  0.8778 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0265  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 200 aa  57  0.0000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00630944 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4525  transcriptional regulator, TetR family  46.55 
 
 		 216 aa  56.2  0.0000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.397871 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2765  regulatory protein, TetR  40.51 
 
 		 210 aa  56.2  0.0000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.267077  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1775  transcriptional regulator, TetR family  43.33 
 
 		 207 aa  57  0.0000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03670  transcriptional regulator  45.07 
 
 		 230 aa  56.6  0.0000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00912022  hitchhiker  0.0085588 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1535  transcriptional regulator, TetR family  26.43 
 
 		 204 aa  56.2  0.0000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27670  transcriptional regulator  43.75 
 
 		 254 aa  56.2  0.0000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.208365 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23110  transcriptional regulator  44.26 
 
 		 203 aa  55.8  0.0000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3148  transcriptional regulator, TetR family  29 
 
 		 310 aa  55.5  0.0000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6231  transcriptional regulator, TetR family  34.29 
 
 		 197 aa  55.5  0.0000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2742  transcriptional regulator, TetR family  43.55 
 
 		 207 aa  55.5  0.0000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4218  TetR family transcriptional regulator  36.47 
 
 		 202 aa  55.5  0.0000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.135159  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1240  transcriptional regulator, TetR family  35.63 
 
 		 211 aa  55.1  0.0000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.567777  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1867  transcriptional regulator, TetR family  41.98 
 
 		 201 aa  55.1  0.0000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.129849  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2441  TetR family transcriptional regulator  31.62 
 
 		 217 aa  54.3  0.0000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.429129  normal  0.59735 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2372  transcriptional regulator, TetR family  33.68 
 
 		 236 aa  53.9  0.000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2672  TetR family transcriptional regulator  39.74 
 
 		 217 aa  53.9  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2066  TetR family transcriptional regulator  40.66 
 
 		 211 aa  54.3  0.000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.612632  hitchhiker  0.000107098 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4041  TetR family transcriptional regulator  30.86 
 
 		 182 aa  53.9  0.000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.449289  normal  0.0505107 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0265  TetR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 194 aa  53.9  0.000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.250901  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16730  transcriptional regulator, TetR family  39.19 
 
 		 213 aa  53.9  0.000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2723  transcriptional regulator, TetR family  49.02 
 
 		 224 aa  53.9  0.000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0252111  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4079  TetR family transcriptional regulator  34.83 
 
 		 244 aa  53.1  0.000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.780842  normal  0.246764 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1746  transcriptional regulator, TetR family  39.39 
 
 		 195 aa  53.5  0.000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3836  TetR family transcriptional regulator  37.93 
 
 		 246 aa  53.5  0.000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.487675  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0772  transcriptional regulator, TetR family  36.78 
 
 		 223 aa  53.1  0.000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1697  hypothetical protein  28.99 
 
 		 199 aa  53.5  0.000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.280342 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1502  transcriptional regulator, TetR family  30.56 
 
 		 195 aa  53.1  0.000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.385487  normal  0.318035 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2800  TetR family transcriptional regulator  33.02 
 
 		 224 aa  52.4  0.000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.697977  decreased coverage  0.000162176 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2163  TetR family transcriptional regulator  33.62 
 
 		 201 aa  52.8  0.000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0855716  normal  0.614843 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2337  TetR family transcriptional regulator  35.9 
 
 		 191 aa  52.8  0.000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000766652  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1416  TetR family transcriptional regulator  25.15 
 
 		 197 aa  52.8  0.000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.305494  hitchhiker  0.0000141576 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1719  transcriptional regulator, TetR family  29.51 
 
 		 196 aa  52.8  0.000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33190  transcriptional regulator  42.59 
 
 		 202 aa  52.4  0.000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.284512  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6490  transcriptional regulator, TetR family  44.83 
 
 		 243 aa  52.4  0.000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0105405  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1569  putative transcriptional regulator  34.02 
 
 		 212 aa  52  0.000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18080  TetR family transcriptional regulator  34.02 
 
 		 212 aa  52  0.000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1297  TetR family transcriptional regulator  33.8 
 
 		 206 aa  52  0.000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00583227  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2859  transcriptional regulator, TetR family  39.73 
 
 		 186 aa  51.6  0.000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.111234  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1247  TetR family transcriptional regulator  33.8 
 
 		 206 aa  51.6  0.000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0765  TetR family transcriptional regulator  27.34 
 
 		 228 aa  51.6  0.000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1987  TetR family transcriptional regulator  36.47 
 
 		 210 aa  51.6  0.000006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11350  transcriptional regulator  38.46 
 
 		 220 aa  51.6  0.000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01911  putative transcription regulator protein  32.29 
 
 		 191 aa  51.2  0.000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0303213 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3815  regulatory protein, TetR  41.51 
 
 		 252 aa  51.2  0.000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00651597  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1317  TetR family transcriptional regulator  33.8 
 
 		 206 aa  51.6  0.000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.237455  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2889  transcriptional regulator, TetR family  36.8 
 
 		 227 aa  51.6  0.000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3721  transcriptional regulator, TetR family  43.4 
 
 		 260 aa  51.2  0.000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.249433  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05345  transcriptional regulator, tetR family protein  27.36 
 
 		 190 aa  51.2  0.000008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  hitchhiker  0.00749651  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>