More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_3944 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_3944  putative transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 183 aa  370  1e-102  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.000137534  hitchhiker  0.00939559 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2104  TetR family transcriptional regulator  53.01 
 
 		 191 aa  204  4e-52  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.230608 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4091  TetR family transcriptional regulator  52.25 
 
 		 222 aa  189  1e-47  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0267897 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3710  regulatory protein, TetR  48.88 
 
 		 230 aa  181  4.0000000000000006e-45  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5186  transcriptional regulator, TetR family  45.05 
 
 		 185 aa  150  1e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.225373  normal  0.188797 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26800  transcriptional regulator  36.65 
 
 		 184 aa  96.3  2e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.463482  normal  0.288316 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0309  transcriptional regulator, TetR family  33.55 
 
 		 213 aa  87.8  8e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.302465  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4604  transcriptional regulator, TetR family  34.71 
 
 		 255 aa  85.9  3e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5720  TetR family transcriptional regulator  52.7 
 
 		 291 aa  84  0.000000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.649137  normal  0.760569 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8152  putative transcriptional regulator, TetR family  30.39 
 
 		 174 aa  84  0.000000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.687421 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0817  TetR family transcriptional regulator  53.52 
 
 		 332 aa  79  0.00000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0068  transcriptional regulator, TetR family  33.55 
 
 		 185 aa  75.9  0.0000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.139926 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1613  TetR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 189 aa  72.4  0.000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.066311 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3004  transcriptional regulator, TetR family  47.44 
 
 		 186 aa  72  0.000000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.519568  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10920  transcriptional regulator  35.92 
 
 		 201 aa  71.2  0.000000000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0917166  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1681  TetR family transcriptional regulator  34.87 
 
 		 217 aa  70.5  0.00000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.371055  normal  0.828695 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4094  TetR family transcriptional regulator  64.71 
 
 		 204 aa  69.3  0.00000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0325183  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4897  TetR family transcriptional regulator  55.17 
 
 		 231 aa  69.3  0.00000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.043246  normal  0.757086 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4115  transcriptional regulator, TetR family  30.85 
 
 		 194 aa  68.6  0.00000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.1417 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0477  TetR family transcriptional regulator  33.09 
 
 		 211 aa  67  0.0000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.178939  normal  0.0289146 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6560  transcriptional regulator, TetR family  54.72 
 
 		 203 aa  66.6  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0167  transcriptional regulator, TetR family  38.14 
 
 		 200 aa  65.1  0.0000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2636  transcriptional regulator, TetR family  45.61 
 
 		 198 aa  64.7  0.0000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5488  TetR family transcriptional regulator  36.29 
 
 		 238 aa  64.7  0.0000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0537  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  47.62 
 
 		 217 aa  62.8  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.355505  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0518  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  47.62 
 
 		 217 aa  62.8  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.35266  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0580  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  47.62 
 
 		 217 aa  62.8  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0809226  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1768  TetR family transcriptional regulator  39.51 
 
 		 211 aa  63.5  0.000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.570427  normal  0.275415 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0521  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  47.62 
 
 		 217 aa  62.8  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0327711  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1976  putative transcriptional regulator, TetR family  32.72 
 
 		 181 aa  62.8  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0527  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  47.62 
 
 		 217 aa  62.8  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00415  DNA-binding transcriptional repressor  44.78 
 
 		 215 aa  62.4  0.000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3146  transcriptional regulator, TetR family  44.78 
 
 		 215 aa  62.4  0.000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0376592  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0540  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  44.78 
 
 		 215 aa  62.4  0.000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2057  transcriptional regulator, TetR family  37.5 
 
 		 212 aa  62  0.000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0106608  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1590  transcriptional regulator, TetR family  46.77 
 
 		 231 aa  62.4  0.000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.299217  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0396  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  44.78 
 
 		 215 aa  62.4  0.000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0684  TetR family transcriptional regulator  32.32 
 
 		 213 aa  62  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.974708 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3152  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  44.78 
 
 		 215 aa  62.4  0.000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00420  hypothetical protein  44.78 
 
 		 215 aa  62.4  0.000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0507  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  44.78 
 
 		 215 aa  62.4  0.000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.480121  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0498  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  44.78 
 
 		 215 aa  62.4  0.000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0554  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  44.78 
 
 		 215 aa  62.4  0.000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.627816  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0973  TetR family transcriptional regulator  38.27 
 
 		 198 aa  61.6  0.000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3730  transcriptional regulator, TetR family  46.03 
 
 		 237 aa  62  0.000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5392  transcriptional regulator, TetR family protein  29.41 
 
 		 190 aa  61.6  0.000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0170  TetR family transcriptional regulator  39.24 
 
 		 192 aa  61.6  0.000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.652591  normal  0.659974 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0906  transcriptional regulator, TetR family  53.23 
 
 		 232 aa  61.2  0.000000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.052988  normal  0.0196 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0744  regulatory protein TetR  34.51 
 
 		 191 aa  61.6  0.000000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0659  transcriptional regulator TetR family  39.71 
 
 		 196 aa  61.2  0.000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6913  putative transcriptional regulator, TetR family  29.48 
 
 		 183 aa  61.2  0.000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.128918  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2799  TetR family transcriptional regulator  47.54 
 
 		 217 aa  61.2  0.000000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.364827  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4218  TetR family transcriptional regulator  38.27 
 
 		 202 aa  61.2  0.000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.135159  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0944  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  44.44 
 
 		 217 aa  60.8  0.000000009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2205  TetR family transcriptional regulator  47.54 
 
 		 202 aa  60.8  0.000000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.270822 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0788  TetR family transcriptional regulator  42.03 
 
 		 221 aa  60.8  0.00000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.796627 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3240  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  39.08 
 
 		 213 aa  60.8  0.00000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.501766  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0496  TetR family transcriptional regulator  48.39 
 
 		 202 aa  60.8  0.00000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.250936 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3046  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  36.67 
 
 		 216 aa  59.7  0.00000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.303422  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2530  TetR family transcriptional regulator  30.82 
 
 		 213 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.704068 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0265  TetR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 200 aa  59.7  0.00000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00630944 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0707  TetR family transcriptional regulator  31.62 
 
 		 219 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4165  TetR family transcriptional regulator  32.99 
 
 		 232 aa  59.7  0.00000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.367589  normal  0.612517 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1924  TetR family transcriptional regulator  46.48 
 
 		 189 aa  60.1  0.00000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.147097  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2800  TetR family transcriptional regulator  31.3 
 
 		 224 aa  60.1  0.00000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.697977  decreased coverage  0.000162176 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1260  transcriptional regulator, TetR family  42.11 
 
 		 222 aa  60.1  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.194739 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2657  TetR family transcriptional regulator  30.82 
 
 		 213 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3692  TetR family transcriptional regulator  32.99 
 
 		 244 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.674174  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4079  TetR family transcriptional regulator  29.61 
 
 		 244 aa  59.3  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.780842  normal  0.246764 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0097  transcriptional regulator, TetR family  35.51 
 
 		 215 aa  59.3  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.56928  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1775  transcriptional regulator, TetR family  43.75 
 
 		 207 aa  58.9  0.00000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5941  TetR family transcriptional regulator  30.82 
 
 		 213 aa  58.5  0.00000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.272965 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4249  TetR family transcriptional regulator  53.85 
 
 		 191 aa  58.9  0.00000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.399807  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3014  TetR family transcriptional regulator  29.81 
 
 		 195 aa  58.5  0.00000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0679  TetR family transcriptional regulator  32.28 
 
 		 211 aa  58.5  0.00000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3259  transcriptional regulator, TetR family  30.83 
 
 		 219 aa  58.5  0.00000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.147915  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0985  transcriptional regulator, TetR family  35.9 
 
 		 222 aa  58.5  0.00000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0314  TetR family transcriptional regulator  32.28 
 
 		 211 aa  58.2  0.00000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1017  repressor protein  32.28 
 
 		 211 aa  58.2  0.00000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4006  transcriptional regulator, TetR family  47.69 
 
 		 202 aa  58.2  0.00000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1012  transcriptional regulator, TetR family  38.89 
 
 		 212 aa  58.2  0.00000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.156612  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0852  multidrug efflux pump repressor protein BpeR  32.28 
 
 		 211 aa  58.2  0.00000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2767  TetR family transcriptional regulator  48.15 
 
 		 225 aa  58.5  0.00000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.284138 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2773  TetR family transcriptional regulator  30.92 
 
 		 295 aa  58.2  0.00000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00136461  normal  0.297144 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0857  multidrug efflux pump repressor protein BpeR  32.28 
 
 		 211 aa  58.2  0.00000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0057  multidrug efflux pump repressor protein BpeR  32.28 
 
 		 211 aa  58.2  0.00000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0571  TetR family transcriptional regulator  47.17 
 
 		 200 aa  58.2  0.00000006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.530829  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1071  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  36.26 
 
 		 213 aa  58.5  0.00000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0117133  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0609  multidrug efflux pump repressor protein BpeR  32.28 
 
 		 211 aa  58.2  0.00000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.780096  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2443  multidrug efflux pump repressor protein BpeR  32.28 
 
 		 211 aa  58.2  0.00000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2644  putative transcriptional regulator, TetR family  37.5 
 
 		 205 aa  58.2  0.00000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3148  transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 310 aa  57.8  0.00000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0312  TetR family transcriptional regulator  49.09 
 
 		 182 aa  57.8  0.00000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1636  TetR family transcriptional regulator  47.17 
 
 		 200 aa  57.8  0.00000008  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4464  TetR family transcriptional regulator  43.86 
 
 		 204 aa  57.8  0.00000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0680244 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1657  regulatory protein, TetR  39.81 
 
 		 220 aa  57.8  0.00000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.184352 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1291  transcriptional regulator, TetR family  47.46 
 
 		 190 aa  57.8  0.00000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.170651  normal  0.326718 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2880  TetR family transcriptional regulator  40.26 
 
 		 195 aa  57.8  0.00000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5885  TetR family transcriptional regulator  49.06 
 
 		 203 aa  57.4  0.0000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.687121 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0666  transcriptional regulator  39.06 
 
 		 205 aa  57  0.0000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>