More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_0744 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



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Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_0744  regulatory protein TetR  100 
 
 		 191 aa  376  1e-104  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2880  TetR family transcriptional regulator  51.08 
 
 		 195 aa  154  9e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2126  TetR family transcriptional regulator  27.62 
 
 		 212 aa  74.3  0.0000000000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00345057  n/a   
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4531  hypothetical protein  27.14 
 
 		 227 aa  72.8  0.000000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2258  transcriptional regulator, TetR family  27.14 
 
 		 212 aa  72.4  0.000000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.968255  hitchhiker  0.0010637 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2245  TetR family transcriptional regulator  27.14 
 
 		 212 aa  72.4  0.000000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2171  TetR family transcriptional regulator  27.14 
 
 		 212 aa  72.4  0.000000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.068169  normal  0.22854 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2493  TetR family transcriptional regulator  27.7 
 
 		 239 aa  70.9  0.00000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2050  TetR family transcriptional regulator  27.7 
 
 		 212 aa  70.1  0.00000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.00274298  normal  0.196014 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1925  TetR family transcriptional regulator  27.7 
 
 		 212 aa  70.1  0.00000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00396712  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2155  TetR family transcriptional regulator  27.7 
 
 		 212 aa  70.1  0.00000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.116273  normal  0.663988 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2116  regulatory protein, TetR  30.37 
 
 		 214 aa  69.3  0.00000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000000093152  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2165  transcriptional regulator, TetR family  40.19 
 
 		 263 aa  69.3  0.00000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3711  transcriptional regulator, TetR family  57.63 
 
 		 220 aa  68.9  0.00000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1888  transcriptional regulator, TetR family protein  30.34 
 
 		 213 aa  68.9  0.00000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0666  transcriptional regulator  27.72 
 
 		 205 aa  68.6  0.00000000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1033  TetR family transcriptional regulator  34.9 
 
 		 318 aa  67.8  0.00000000008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.781792  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0133  TetR family transcriptional regulator  34.9 
 
 		 318 aa  67.8  0.00000000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.221572  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1762  TetR family transcriptional regulator  34.9 
 
 		 318 aa  67.8  0.00000000008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0114483  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1275  TetR family transcriptional regulator  34.9 
 
 		 318 aa  67.8  0.00000000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.033456  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1805  TetR family transcriptional regulator  34.9 
 
 		 316 aa  67.8  0.00000000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.754817  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1958  TetR family transcriptional regulator  34.9 
 
 		 316 aa  67.8  0.00000000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00062632  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1784  TetR family transcriptional regulator  34.9 
 
 		 316 aa  67.8  0.00000000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.261379  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2528  TetR family transcriptional regulator  34.9 
 
 		 317 aa  67.8  0.0000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0660251  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1719  TetR family transcriptional regulator  35.1 
 
 		 272 aa  66.6  0.0000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.7573  hitchhiker  0.00027252 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2773  TetR family transcriptional regulator  40.54 
 
 		 295 aa  67  0.0000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00136461  normal  0.297144 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2904  TetR family transcriptional regulator  36.7 
 
 		 213 aa  65.9  0.0000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1862  TetR family transcriptional regulator  27.62 
 
 		 213 aa  65.9  0.0000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3446  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 335 aa  65.5  0.0000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.843948  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1511  TetR family transcriptional regulator  36.24 
 
 		 273 aa  65.5  0.0000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.752097  hitchhiker  0.00148325 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1677  transcriptional regulator, TetR family  39.64 
 
 		 288 aa  65.5  0.0000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.688428  normal  0.314033 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1055  TetR family transcriptional regulator  36.24 
 
 		 273 aa  65.5  0.0000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1535  TetR family transcriptional regulator  36.24 
 
 		 273 aa  65.5  0.0000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1792  regulatory protein, TetR  36.11 
 
 		 238 aa  65.1  0.0000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4675  TetR family transcriptional regulator  35.57 
 
 		 273 aa  64.7  0.0000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.104564 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1417  TetR family transcriptional regulator  35.86 
 
 		 272 aa  64.3  0.0000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.702279  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2158  transcriptional regulator, TetR family  41.18 
 
 		 244 aa  64.3  0.000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2052  TetR family transcriptional regulator  31.94 
 
 		 212 aa  63.9  0.000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00634978  normal  0.379689 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1457  TetR family transcriptional regulator  34.44 
 
 		 276 aa  64.3  0.000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.166824  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2129  TetR family transcriptional regulator  38.05 
 
 		 229 aa  63.9  0.000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.101154  normal  0.382383 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1588  TetR family transcriptional regulator  42.5 
 
 		 235 aa  63.9  0.000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.472704 
 
 
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NC_011071  Smal_1655  transcriptional regulator, TetR family  30.66 
 
 		 222 aa  63.5  0.000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.721526  normal  0.229233 
 
 
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NC_007298  Daro_1543  TetR family transcriptional regulator  46.77 
 
 		 238 aa  63.5  0.000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.176522 
 
 
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NC_009831  Ssed_2066  TetR family transcriptional regulator  26.21 
 
 		 211 aa  63.2  0.000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.612632  hitchhiker  0.000107098 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3323  TetR family transcriptional regulator  35.96 
 
 		 227 aa  63.2  0.000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.481358  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3211  regulatory protein, TetR  54.24 
 
 		 221 aa  63.5  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.878438  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5974  TetR family transcriptional regulator  35.4 
 
 		 227 aa  63.2  0.000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0426648  hitchhiker  0.00085933 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2259  TetR family transcriptional regulator  54.24 
 
 		 221 aa  63.2  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.289727  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1768  regulatory protein, TetR  33.74 
 
 		 226 aa  62.8  0.000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1742  transcriptional regulator, TetR family  36.23 
 
 		 235 aa  62.8  0.000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.666045  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1888  TetR family transcriptional regulator  33.88 
 
 		 204 aa  62.4  0.000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1982  transcriptional regulator, TetR family  32.29 
 
 		 209 aa  62  0.000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.142001  hitchhiker  0.0000322137 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01051  transcriptional regulator TetR family  28.71 
 
 		 210 aa  61.6  0.000000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.250197  n/a   
 
 
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NC_007973  Rmet_3595  TetR family transcriptional regulator  33.79 
 
 		 313 aa  61.6  0.000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_014210  Ndas_3489  transcriptional regulator, TetR family  45.45 
 
 		 230 aa  61.6  0.000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008312  Tery_1790  TetR family transcriptional regulator  31.54 
 
 		 220 aa  61.6  0.000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.536923  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06115  transcriptional regulator TetR family  28.71 
 
 		 210 aa  61.6  0.000000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.131749  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1790  transcriptional regulator, TetR family  39.8 
 
 		 224 aa  61.6  0.000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.121253  normal  0.33193 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2153  transcriptional regulator PsrA  45.21 
 
 		 233 aa  61.6  0.000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.64739  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1699  TetR family transcriptional regulator  36.89 
 
 		 290 aa  61.2  0.000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0964215  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25180  transcriptional regulator PsrA  45.21 
 
 		 233 aa  61.2  0.000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3944  putative transcriptional regulator, TetR family  34.51 
 
 		 183 aa  61.2  0.000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.000137534  hitchhiker  0.00939559 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2144  TetR family transcriptional regulator  45.71 
 
 		 235 aa  60.5  0.00000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0903799 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3711  transcriptional regulator, TetR family  55.74 
 
 		 207 aa  60.5  0.00000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.644349  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1660  TetR family transcriptional regulator  45.71 
 
 		 235 aa  60.5  0.00000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.903697  normal  0.835101 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3483  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 218 aa  60.8  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.961452  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3598  TetR family transcriptional regulator  45.71 
 
 		 235 aa  60.5  0.00000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.153473  normal  0.929745 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5106  TetR family transcriptional regulator  36.13 
 
 		 223 aa  60.8  0.00000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.146428  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0538  putative transcription regulator protein  35.14 
 
 		 340 aa  60.1  0.00000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0548249  normal  0.54431 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3723  transcriptional regulator, TetR family  41.67 
 
 		 187 aa  60.1  0.00000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.000000134359  n/a   
 
 
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NC_007925  RPC_3587  TetR family transcriptional regulator  42.42 
 
 		 208 aa  59.7  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.997688  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3894  TetR family transcriptional regulator  51.72 
 
 		 223 aa  60.5  0.00000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0466911 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01897  transcriptional regulator, TetR family protein  36.56 
 
 		 207 aa  60.5  0.00000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0111118  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1938  TetR family transcriptional regulator  27.49 
 
 		 225 aa  59.3  0.00000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3871  TetR family transcriptional regulator  46.03 
 
 		 235 aa  59.7  0.00000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1684  TetR family transcriptional regulator  44.29 
 
 		 235 aa  59.3  0.00000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.46279  normal  0.0995016 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0388  TetR family transcriptional regulator  39.36 
 
 		 249 aa  59.3  0.00000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.190078  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1816  TetR family transcriptional regulator  27.57 
 
 		 228 aa  59.3  0.00000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0241637  normal  0.594701 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0804  transcriptional regulator, TetR family  32.57 
 
 		 227 aa  58.9  0.00000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4073  TetR family transcriptional regulator  32.79 
 
 		 245 aa  58.9  0.00000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2959  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 204 aa  58.5  0.00000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.878802  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3003  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 204 aa  58.5  0.00000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.384269 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2205  TetR family transcriptional regulator  45.16 
 
 		 202 aa  58.5  0.00000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.270822 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4057  TetR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 227 aa  58.5  0.00000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0267673  normal  0.603769 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1586  TetR family transcriptional regulator  26.09 
 
 		 215 aa  58.2  0.00000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.377059  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3282  regulatory protein, TetR  44.29 
 
 		 238 aa  57.8  0.00000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7459  TetR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 233 aa  58.2  0.00000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.626167  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5743  regulatory protein TetR  40.91 
 
 		 208 aa  58.2  0.00000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.405607  normal  1 
 
 
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NC_010682  Rpic_0418  transcriptional regulator, TetR family  33.93 
 
 		 352 aa  58.2  0.00000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.340149  hitchhiker  0.000146207 
 
 
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NC_012856  Rpic12D_0433  transcriptional regulator, TetR family  30.59 
 
 		 354 aa  57.8  0.00000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.425009  normal  1 
 
 
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NC_009077  Mjls_2974  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 204 aa  57.8  0.0000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.329725  normal  0.021189 
 
 
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NC_009457  VC0395_A1341  TetR family transcriptional regulator  32.61 
 
 		 224 aa  57.4  0.0000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013165  Shel_28060  transcriptional regulator  39.51 
 
 		 204 aa  57.4  0.0000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.633688  normal  1 
 
 
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NC_008726  Mvan_3298  TetR family transcriptional regulator  36.25 
 
 		 206 aa  57  0.0000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.436817  normal  1 
 
 
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NC_014165  Tbis_3408  TetR family transcriptional regulator  36.96 
 
 		 205 aa  57.8  0.0000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.954504  normal  1 
 
 
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NC_009831  Ssed_2917  TetR family transcriptional regulator  36.23 
 
 		 218 aa  57.4  0.0000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008699  Noca_0477  TetR family transcriptional regulator  51.79 
 
 		 202 aa  57.4  0.0000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_004578  PSPTO_3508  transcriptional regulator PsrA  44.44 
 
 		 238 aa  57  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009921  Franean1_3239  TetR family transcriptional regulator  47.37 
 
 		 200 aa  57  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.845515  normal  1 
 
 
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NC_012560  Avin_14520  Transcriptional regulator PsrA  37.63 
 
 		 239 aa  57  0.0000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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